Doublet Group distance statistics: 55203

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 12, 10, 1, 7, 2, 3, 1, 2, 3, 8, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.044 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.016, 0.086, 0.156, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.086 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.022, 0.129, 0.236, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.129 std_dev=0.107
O4'	A	0, -0.031, 0.098, 0.228, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.098 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.041, 0.181, 0.322, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.181 std_dev=0.141
C3'	A	0, -0.004, 0.203, 0.410, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.203 std_dev=0.207
C4'	A	0, -0.060, 0.156, 0.372, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.156 std_dev=0.216
O5'	A	0, 0.051, 0.322, 0.593, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.322 std_dev=0.271
O3'	A	0, 0.045, 0.330, 0.616, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.330 std_dev=0.285
O2'	B	0, 0.115, 0.428, 0.741, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.428 std_dev=0.313
OP1	A	0, 0.153, 0.475, 0.797, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.475 std_dev=0.322
P	A	0, 0.137, 0.460, 0.784, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.460 std_dev=0.324
C5'	A	0, -0.077, 0.285, 0.647, 2.260 max_d=2.260 avg_d=0.285 std_dev=0.362
O3'	B	0, 0.152, 0.536, 0.920, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.536 std_dev=0.384
C2'	B	0, 0.124, 0.563, 1.002, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.563 std_dev=0.439
OP2	A	0, 0.167, 0.643, 1.118, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.643 std_dev=0.475
C3'	B	0, 0.139, 0.640, 1.140, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.640 std_dev=0.500
C1'	B	0, 0.126, 0.742, 1.358, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.742 std_dev=0.616
C4'	B	0, 0.142, 0.761, 1.380, 2.059 max_d=2.059 avg_d=0.761 std_dev=0.619
O4'	B	0, 0.145, 0.835, 1.524, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.835 std_dev=0.690
N9	B	0, 0.127, 0.863, 1.599, 2.450 max_d=2.450 avg_d=0.863 std_dev=0.736
C5'	B	0, 0.138, 0.902, 1.666, 2.721 max_d=2.721 avg_d=0.902 std_dev=0.764
N3	B	0, 0.059, 0.854, 1.650, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.854 std_dev=0.796
C8	B	0, 0.183, 0.986, 1.789, 2.823 max_d=2.823 avg_d=0.986 std_dev=0.803
C4	B	0, 0.099, 0.913, 1.727, 2.711 max_d=2.711 avg_d=0.913 std_dev=0.814
C2	B	0, 0.052, 0.944, 1.835, 2.923 max_d=2.923 avg_d=0.944 std_dev=0.891
N2	B	0, 0.048, 0.942, 1.836, 2.870 max_d=2.870 avg_d=0.942 std_dev=0.894
O5'	B	0, 0.108, 1.005, 1.902, 3.837 max_d=3.837 avg_d=1.005 std_dev=0.897
N7	B	0, 0.186, 1.091, 1.996, 3.249 max_d=3.249 avg_d=1.091 std_dev=0.905
C5	B	0, 0.134, 1.049, 1.964, 3.200 max_d=3.200 avg_d=1.049 std_dev=0.915
N1	B	0, 0.073, 1.071, 2.068, 3.416 max_d=3.416 avg_d=1.071 std_dev=0.997
C6	B	0, 0.121, 1.134, 2.147, 3.576 max_d=3.576 avg_d=1.134 std_dev=1.013
OP1	B	0, 0.255, 1.297, 2.339, 4.687 max_d=4.687 avg_d=1.297 std_dev=1.042
P	B	0, 0.174, 1.253, 2.333, 4.930 max_d=4.930 avg_d=1.253 std_dev=1.079
O6	B	0, 0.157, 1.269, 2.380, 4.027 max_d=4.027 avg_d=1.269 std_dev=1.111
OP2	B	0, 0.098, 1.437, 2.775, 7.765 max_d=7.765 avg_d=1.437 std_dev=1.338

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.14	0.12	0.25	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.02	0.19	0.16	0.33	0.20
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.05	0.09	0.01	0.02	0.07	0.01	0.13	0.19	0.17	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.11	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.16	0.24	0.12	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.04	0.23	0.22	0.37	0.25
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.08	0.07	0.06	0.02	0.10	0.00	0.02	0.12	0.16	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.04	0.24	0.21	0.35	0.24
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.18	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.16	0.12	0.06	0.04	0.21	0.02	0.01	0.14	0.18	0.03
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.02	0.04	0.23	0.17	0.30	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.19	0.15	0.30	0.18
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.03	0.21	0.19	0.36	0.23
O2	0.04	0.01	0.09	0.12	0.02	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.13	0.02	0.04	0.18	0.16	0.33	0.19
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.06	0.10	0.00	0.05	0.05	0.06	0.05	0.16	0.16	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.04	0.10	0.05	0.11	0.13	0.05	0.00	0.16	0.02	0.16	0.32	0.16	0.19
O4	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.21	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.16	0.00	0.05	0.22	0.26	0.39	0.27
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.05	0.00	0.13	0.13	0.26	0.15
O5'	0.14	0.19	0.13	0.16	0.23	0.02	0.24	0.01	0.23	0.19	0.21	0.18	0.05	0.16	0.22	0.13	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.12	0.16	0.19	0.24	0.22	0.12	0.21	0.14	0.17	0.15	0.19	0.16	0.16	0.32	0.26	0.13	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.33	0.17	0.12	0.37	0.16	0.35	0.18	0.30	0.30	0.36	0.33	0.16	0.16	0.39	0.26	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.20	0.11	0.14	0.25	0.04	0.24	0.03	0.20	0.18	0.23	0.19	0.07	0.19	0.27	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.19	0.10	0.10	0.15	0.13	0.16	0.14	0.18	0.15	0.20	0.22	0.16	0.16	0.14	0.13	0.15	0.14	0.14	0.20	0.26	0.18	0.16
C2	0.17	0.26	0.17	0.18	0.21	0.15	0.21	0.15	0.24	0.18	0.26	0.29	0.23	0.20	0.18	0.13	0.21	0.17	0.17	0.25	0.20	0.23	0.17
C2'	0.15	0.20	0.13	0.09	0.17	0.11	0.19	0.10	0.20	0.18	0.21	0.23	0.18	0.19	0.16	0.16	0.10	0.14	0.11	0.22	0.25	0.15	0.13
C3'	0.22	0.19	0.21	0.16	0.21	0.16	0.22	0.14	0.22	0.25	0.20	0.20	0.19	0.25	0.22	0.25	0.13	0.20	0.16	0.23	0.27	0.18	0.16
C4	0.32	0.35	0.30	0.29	0.33	0.28	0.31	0.29	0.31	0.29	0.32	0.37	0.37	0.29	0.32	0.24	0.28	0.31	0.31	0.31	0.27	0.38	0.31
C4'	0.23	0.18	0.18	0.12	0.19	0.16	0.20	0.15	0.20	0.23	0.19	0.20	0.19	0.22	0.21	0.26	0.09	0.21	0.17	0.21	0.32	0.24	0.21
C5	0.28	0.23	0.28	0.27	0.24	0.27	0.22	0.27	0.22	0.23	0.22	0.23	0.26	0.21	0.25	0.25	0.27	0.29	0.27	0.23	0.24	0.32	0.27
C5'	0.29	0.19	0.25	0.19	0.22	0.24	0.22	0.20	0.20	0.26	0.19	0.19	0.20	0.24	0.25	0.35	0.15	0.28	0.20	0.21	0.31	0.24	0.21
C6	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.18	0.17	0.17	0.19	0.16	0.19	0.20	0.17	0.16	0.15	0.16	0.22	0.18	0.17	0.20	0.19	0.20	0.17
N1	0.14	0.20	0.14	0.14	0.16	0.13	0.17	0.13	0.19	0.15	0.20	0.23	0.17	0.16	0.14	0.11	0.19	0.14	0.14	0.21	0.20	0.18	0.14
N3	0.25	0.33	0.24	0.24	0.29	0.22	0.28	0.22	0.30	0.25	0.32	0.37	0.32	0.26	0.26	0.18	0.25	0.24	0.25	0.31	0.23	0.32	0.25
O2	0.15	0.27	0.16	0.16	0.20	0.13	0.21	0.14	0.25	0.18	0.27	0.31	0.23	0.20	0.17	0.12	0.19	0.15	0.15	0.27	0.21	0.22	0.16
O2'	0.18	0.19	0.14	0.12	0.15	0.20	0.17	0.21	0.18	0.19	0.19	0.23	0.16	0.18	0.16	0.20	0.14	0.21	0.20	0.20	0.37	0.24	0.24
O3'	0.25	0.20	0.24	0.20	0.23	0.21	0.25	0.19	0.25	0.29	0.22	0.20	0.20	0.29	0.25	0.29	0.18	0.23	0.21	0.27	0.35	0.25	0.23
O4	0.40	0.48	0.35	0.33	0.43	0.35	0.40	0.35	0.40	0.38	0.43	0.54	0.49	0.38	0.40	0.29	0.30	0.39	0.39	0.39	0.33	0.48	0.40
O4'	0.19	0.23	0.14	0.12	0.20	0.15	0.21	0.16	0.22	0.20	0.23	0.25	0.21	0.21	0.19	0.18	0.16	0.18	0.18	0.23	0.30	0.23	0.21
O5'	0.19	0.20	0.20	0.09	0.18	0.10	0.18	0.08	0.17	0.20	0.18	0.23	0.20	0.20	0.18	0.26	0.02	0.15	0.14	0.18	0.30	0.23	0.18
OP1	0.08	0.22	0.08	0.08	0.19	0.07	0.23	0.12	0.26	0.22	0.24	0.23	0.19	0.26	0.16	0.11	0.02	0.08	0.25	0.28	0.41	0.43	0.31
OP2	0.11	0.26	0.13	0.05	0.16	0.05	0.16	0.09	0.17	0.17	0.22	0.31	0.24	0.18	0.12	0.22	0.03	0.07	0.19	0.18	0.29	0.32	0.21
P	0.05	0.15	0.07	0.02	0.09	0.03	0.11	0.05	0.12	0.15	0.13	0.19	0.13	0.15	0.08	0.13	0.01	0.03	0.16	0.14	0.30	0.28	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.06	0.17	0.09
C2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.05	0.17	0.01	0.17	0.37	0.21
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.10	0.08	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.06	0.13	0.16	0.09
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.11	0.08	0.11	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.19	0.18	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.18	0.01	0.16	0.37	0.21
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.09	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.23	0.01	0.21	0.49	0.28
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.07	0.06	0.14	0.08	0.06	0.05	0.01	0.01	0.14	0.10	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.03	0.23	0.01	0.23	0.52	0.30
C8	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.05	0.24	0.02	0.18	0.45	0.27
N1	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.04	0.20	0.01	0.21	0.46	0.26
N2	0.05	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.14	0.07	0.15	0.02	0.17	0.34	0.19
N3	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.05	0.15	0.01	0.14	0.32	0.18
N7	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.26	0.02	0.23	0.55	0.32
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.17	0.02	0.12	0.32	0.18
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.10	0.14	0.10	0.05	0.02	0.00	0.06	0.06	0.05	0.08	0.12	0.09	0.05
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.09	0.12	0.09	0.14	0.10	0.12	0.05	0.06	0.00	0.02	0.14	0.10	0.27	0.20	0.16
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.07	0.04	0.08	0.14	0.09
O5'	0.08	0.17	0.09	0.12	0.18	0.01	0.23	0.01	0.23	0.24	0.20	0.15	0.15	0.26	0.17	0.05	0.14	0.07	0.00	0.25	0.03	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.10	0.04	0.25	0.00	0.27	0.58	0.34
OP1	0.06	0.17	0.13	0.19	0.16	0.09	0.21	0.10	0.23	0.18	0.21	0.17	0.14	0.23	0.12	0.12	0.27	0.08	0.03	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.37	0.16	0.18	0.37	0.04	0.49	0.03	0.52	0.45	0.46	0.34	0.32	0.55	0.32	0.09	0.20	0.14	0.03	0.58	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.09	0.13	0.21	0.02	0.28	0.02	0.30	0.27	0.26	0.19	0.18	0.32	0.18	0.05	0.16	0.09	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00