Doublet Group distance statistics: 55204

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 5, 5, 6, 11, 5, 1, 6, 3, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.011, 0.030, 0.050, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.037, 0.085, 0.133, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.085 std_dev=0.048
O4	A	0, 0.035, 0.166, 0.296, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.166 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.027, 0.186, 0.346, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.186 std_dev=0.160
C2'	A	0, 0.006, 0.172, 0.338, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.172 std_dev=0.166
O3'	B	0, 0.244, 0.450, 0.655, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.450 std_dev=0.205
P	A	0, 0.113, 0.327, 0.541, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.327 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.040, 0.273, 0.506, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.273 std_dev=0.233
O5'	A	0, 0.062, 0.305, 0.547, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.305 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.032, 0.280, 0.528, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.280 std_dev=0.248
O2'	B	0, 0.284, 0.552, 0.820, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.552 std_dev=0.268
C3'	B	0, 0.252, 0.521, 0.791, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.521 std_dev=0.270
O2'	A	0, -0.054, 0.227, 0.508, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.227 std_dev=0.281
OP1	A	0, 0.106, 0.389, 0.672, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.389 std_dev=0.283
C1'	B	0, 0.292, 0.581, 0.869, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.581 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.293, 0.583, 0.873, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.583 std_dev=0.290
C5'	A	0, 0.107, 0.424, 0.741, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.424 std_dev=0.317
C4'	B	0, 0.277, 0.611, 0.944, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.611 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.329, 0.689, 1.050, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.689 std_dev=0.360
OP2	A	0, 0.117, 0.479, 0.842, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.479 std_dev=0.363
O3'	A	0, 0.024, 0.407, 0.791, 2.616 max_d=2.616 avg_d=0.407 std_dev=0.383
N9	B	0, 0.352, 0.761, 1.170, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.761 std_dev=0.409
C4	B	0, 0.290, 0.723, 1.155, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.723 std_dev=0.433
C5'	B	0, 0.190, 0.648, 1.106, 2.008 max_d=2.008 avg_d=0.648 std_dev=0.458
C5	B	0, 0.415, 0.974, 1.534, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.974 std_dev=0.559
N3	B	0, -0.111, 0.522, 1.155, 4.649 max_d=4.649 avg_d=0.522 std_dev=0.633
C8	B	0, 0.456, 1.094, 1.731, 2.080 max_d=2.080 avg_d=1.094 std_dev=0.638
C6	B	0, 0.374, 1.024, 1.674, 3.296 max_d=3.296 avg_d=1.024 std_dev=0.650
N7	B	0, 0.486, 1.208, 1.931, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.208 std_dev=0.723
O6	B	0, 0.476, 1.244, 2.012, 2.936 max_d=2.936 avg_d=1.244 std_dev=0.768
N1	B	0, 0.006, 0.802, 1.598, 5.741 max_d=5.741 avg_d=0.802 std_dev=0.796
C2	B	0, -0.278, 0.577, 1.431, 6.330 max_d=6.330 avg_d=0.577 std_dev=0.854
O5'	B	0, 0.678, 1.854, 3.030, 3.800 max_d=3.800 avg_d=1.854 std_dev=1.176
N2	B	0, -0.665, 0.530, 1.726, 8.787 max_d=8.787 avg_d=0.530 std_dev=1.196
OP1	B	0, 0.942, 2.785, 4.628, 7.611 max_d=7.611 avg_d=2.785 std_dev=1.843
P	B	0, 0.835, 2.755, 4.675, 6.219 max_d=6.219 avg_d=2.755 std_dev=1.920
OP2	B	0, 1.043, 3.569, 6.094, 7.423 max_d=7.423 avg_d=3.569 std_dev=2.526

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.06	0.10	0.17	0.12
C2	0.03	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.01	0.03	0.11	0.12	0.26	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.07	0.02	0.07	0.14	0.00	0.01	0.07	0.01	0.14	0.13	0.21	0.15
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.10	0.07	0.12	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.05	0.04	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.02	0.14	0.17	0.35	0.21
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.06	0.10	0.02	0.05	0.00	0.01	0.06	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.03	0.14	0.16	0.32	0.19
C5'	0.03	0.05	0.07	0.02	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.06	0.06	0.05	0.08	0.09	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.03	0.11	0.12	0.25	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.01	0.08	0.11	0.22	0.15
N3	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.09	0.01	0.02	0.13	0.15	0.31	0.19
O2	0.05	0.00	0.14	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.02	0.05	0.10	0.12	0.24	0.16
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.13	0.10	0.12	0.05	0.10	0.07	0.12	0.11	0.00	0.04	0.15	0.07	0.11	0.10	0.24	0.14
O3'	0.10	0.08	0.01	0.01	0.09	0.02	0.09	0.08	0.09	0.05	0.09	0.13	0.04	0.00	0.11	0.07	0.12	0.12	0.17	0.13
O4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.11	0.00	0.03	0.16	0.19	0.39	0.23
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.07	0.07	0.03	0.00	0.09	0.14	0.19	0.17
O5'	0.06	0.11	0.14	0.05	0.14	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.13	0.10	0.11	0.12	0.16	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.12	0.13	0.04	0.17	0.06	0.16	0.06	0.12	0.11	0.15	0.12	0.10	0.12	0.19	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.26	0.21	0.08	0.35	0.05	0.32	0.02	0.25	0.22	0.31	0.24	0.24	0.17	0.39	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.15	0.05	0.21	0.05	0.19	0.02	0.16	0.15	0.19	0.16	0.14	0.13	0.23	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.29	0.21	0.22	0.21	0.27	0.19	0.31	0.19	0.24	0.24	0.37	0.26	0.22	0.21	0.19	0.22	0.34	0.74	0.18	1.35	0.86	1.23
C2	0.19	0.49	0.18	0.18	0.25	0.23	0.20	0.29	0.26	0.21	0.40	0.66	0.42	0.18	0.18	0.19	0.18	0.30	0.56	0.22	1.21	0.87	1.19
C2'	0.19	0.33	0.17	0.18	0.20	0.24	0.17	0.27	0.20	0.19	0.28	0.42	0.28	0.16	0.17	0.14	0.17	0.31	0.68	0.18	1.30	0.70	1.09
C3'	0.09	0.26	0.09	0.10	0.14	0.15	0.12	0.21	0.16	0.10	0.23	0.33	0.22	0.10	0.09	0.12	0.09	0.19	0.54	0.16	1.04	0.58	0.77
C4	0.15	0.62	0.15	0.15	0.30	0.19	0.22	0.25	0.32	0.20	0.51	0.82	0.53	0.16	0.16	0.20	0.17	0.22	0.24	0.26	0.80	0.53	0.82
C4'	0.12	0.14	0.13	0.14	0.11	0.17	0.10	0.23	0.11	0.13	0.13	0.18	0.13	0.12	0.11	0.14	0.14	0.21	0.61	0.10	1.02	0.60	0.77
C5	0.16	0.49	0.16	0.14	0.26	0.18	0.19	0.22	0.25	0.19	0.39	0.62	0.44	0.15	0.16	0.19	0.17	0.23	0.23	0.21	0.72	0.37	0.71
C5'	0.11	0.11	0.10	0.12	0.10	0.18	0.11	0.25	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.11	0.12	0.08	0.18	0.43	0.12	0.60	0.81	0.38
C6	0.20	0.37	0.18	0.17	0.22	0.20	0.18	0.24	0.21	0.20	0.30	0.47	0.33	0.18	0.18	0.19	0.18	0.29	0.41	0.18	0.90	0.49	0.87
N1	0.20	0.38	0.19	0.19	0.23	0.24	0.19	0.28	0.22	0.22	0.31	0.50	0.34	0.19	0.19	0.19	0.19	0.32	0.58	0.19	1.16	0.75	1.11
N3	0.17	0.59	0.16	0.16	0.29	0.21	0.21	0.27	0.30	0.20	0.49	0.80	0.50	0.16	0.17	0.19	0.17	0.26	0.40	0.26	1.02	0.75	1.04
O2	0.20	0.49	0.19	0.19	0.25	0.25	0.20	0.31	0.26	0.22	0.41	0.66	0.41	0.19	0.19	0.19	0.19	0.32	0.67	0.23	1.37	1.04	1.34
O2'	0.23	0.33	0.19	0.20	0.24	0.26	0.22	0.30	0.24	0.24	0.29	0.42	0.30	0.22	0.22	0.17	0.19	0.34	0.83	0.23	1.53	0.95	1.30
O3'	0.09	0.24	0.11	0.11	0.14	0.14	0.14	0.20	0.18	0.12	0.23	0.31	0.20	0.14	0.10	0.19	0.11	0.17	0.56	0.18	1.02	0.68	0.72
O4	0.14	0.75	0.15	0.15	0.35	0.22	0.26	0.27	0.38	0.22	0.61	0.99	0.62	0.18	0.17	0.21	0.17	0.18	0.14	0.33	0.66	0.46	0.69
O4'	0.23	0.18	0.24	0.25	0.19	0.25	0.19	0.28	0.17	0.25	0.17	0.22	0.18	0.23	0.22	0.25	0.27	0.30	0.71	0.17	1.20	0.70	1.05
O5'	0.04	0.15	0.04	0.05	0.10	0.10	0.11	0.15	0.13	0.09	0.15	0.19	0.13	0.11	0.07	0.12	0.01	0.11	0.34	0.14	0.49	0.90	0.28
OP1	0.09	0.17	0.12	0.07	0.12	0.10	0.14	0.18	0.15	0.17	0.15	0.22	0.15	0.18	0.12	0.21	0.03	0.05	0.44	0.16	0.36	1.62	0.63
OP2	0.16	0.36	0.13	0.06	0.27	0.06	0.28	0.06	0.31	0.23	0.34	0.41	0.32	0.27	0.21	0.18	0.02	0.14	0.28	0.32	0.35	1.16	0.28
P	0.08	0.16	0.08	0.02	0.13	0.05	0.14	0.08	0.15	0.13	0.15	0.18	0.14	0.15	0.11	0.15	0.01	0.07	0.31	0.17	0.31	1.16	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.35	0.02	0.42	0.54	0.24
C2	0.05	0.00	0.19	0.17	0.01	0.22	0.01	0.46	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.09	0.13	0.52	0.01	0.62	0.90	0.68
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.09	0.09	0.10	0.15	0.23	0.19	0.07	0.03	0.00	0.03	0.03	0.49	0.07	0.52	1.09	0.54
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.03	0.08	0.08	0.13	0.22	0.16	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.31	0.07	0.32	0.91	0.31
C4	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.07	0.42	0.01	0.49	0.62	0.42
C4'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.11	0.00	0.09	0.01	0.12	0.13	0.18	0.28	0.21	0.12	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.12	0.33	0.21	0.22
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.09	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.05	0.47	0.01	0.57	0.70	0.49
C5'	0.08	0.46	0.09	0.03	0.27	0.01	0.29	0.00	0.34	0.34	0.40	0.56	0.41	0.34	0.20	0.08	0.03	0.03	0.01	0.35	0.39	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.12	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.07	0.48	0.00	0.59	0.79	0.55
C8	0.01	0.02	0.10	0.08	0.01	0.13	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.07	0.54	0.02	0.69	0.76	0.58
N1	0.04	0.00	0.15	0.13	0.01	0.18	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.09	0.11	0.50	0.01	0.61	0.87	0.64
N2	0.06	0.01	0.23	0.22	0.02	0.28	0.01	0.56	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.11	0.16	0.62	0.02	0.77	1.10	0.87
N3	0.04	0.01	0.19	0.16	0.00	0.21	0.00	0.41	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.08	0.13	0.47	0.01	0.52	0.74	0.55
N7	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.12	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.06	0.53	0.02	0.69	0.77	0.58
N9	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.43	0.02	0.51	0.58	0.38
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.08	0.08	0.14	0.12	0.22	0.16	0.13	0.04	0.00	0.06	0.01	0.51	0.08	0.54	1.36	0.64
O3'	0.04	0.09	0.03	0.01	0.07	0.03	0.07	0.03	0.08	0.06	0.09	0.11	0.08	0.07	0.06	0.06	0.00	0.07	0.21	0.08	0.41	0.74	0.19
O4'	0.01	0.13	0.03	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.11	0.16	0.13	0.06	0.03	0.01	0.07	0.00	0.27	0.07	0.38	0.20	0.26
O5'	0.35	0.52	0.49	0.31	0.42	0.03	0.47	0.01	0.48	0.54	0.50	0.62	0.47	0.53	0.43	0.51	0.21	0.27	0.00	0.51	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.12	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.07	0.51	0.00	0.63	0.83	0.59
OP1	0.42	0.62	0.52	0.32	0.49	0.33	0.57	0.39	0.59	0.69	0.61	0.77	0.52	0.69	0.51	0.54	0.41	0.38	0.03	0.63	0.00	0.02	0.01
OP2	0.54	0.90	1.09	0.91	0.62	0.21	0.70	0.23	0.79	0.76	0.87	1.10	0.74	0.77	0.58	1.36	0.74	0.20	0.02	0.83	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.68	0.54	0.31	0.42	0.22	0.49	0.02	0.55	0.58	0.64	0.87	0.55	0.58	0.38	0.64	0.19	0.26	0.01	0.59	0.01	0.01	0.00