Doublet Group distance statistics: 55205

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 11, 11, 6, 5, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.025 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.021, 0.054, 0.087, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.054 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.017, 0.077, 0.137, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.077 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.078, 0.143, 0.208, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.143 std_dev=0.065
O4'	A	0, 0.022, 0.098, 0.173, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.098 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.119, 0.212, 0.305, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.212 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.070, 0.163, 0.257, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.163 std_dev=0.093
C3'	A	0, 0.090, 0.195, 0.300, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.195 std_dev=0.105
O5'	A	0, 0.106, 0.245, 0.384, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.245 std_dev=0.139
O3'	B	0, 0.157, 0.300, 0.444, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.300 std_dev=0.143
P	A	0, 0.133, 0.278, 0.423, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.278 std_dev=0.145
C3'	B	0, 0.151, 0.300, 0.448, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.300 std_dev=0.149
C2'	B	0, 0.166, 0.324, 0.482, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.324 std_dev=0.158
C5'	A	0, 0.075, 0.235, 0.394, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.235 std_dev=0.159
O3'	A	0, 0.133, 0.293, 0.453, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.293 std_dev=0.160
O2'	B	0, 0.201, 0.383, 0.564, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.383 std_dev=0.181
O4'	B	0, 0.262, 0.443, 0.625, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.443 std_dev=0.182
C4'	B	0, 0.172, 0.357, 0.542, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.357 std_dev=0.185
OP1	A	0, 0.134, 0.326, 0.517, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.326 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.182, 0.376, 0.570, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.376 std_dev=0.194
OP2	A	0, 0.203, 0.411, 0.619, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.411 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.447, 0.672, 0.896, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.672 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.279, 0.524, 0.769, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.524 std_dev=0.245
C4	B	0, 0.419, 0.672, 0.926, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.672 std_dev=0.254
C5'	B	0, 0.223, 0.481, 0.739, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.481 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.565, 0.860, 1.155, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.860 std_dev=0.295
C8	B	0, 0.298, 0.616, 0.934, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.616 std_dev=0.318
N2	B	0, 0.556, 0.879, 1.202, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.879 std_dev=0.323
C5	B	0, 0.493, 0.848, 1.202, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.848 std_dev=0.354
N7	B	0, 0.423, 0.805, 1.188, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.805 std_dev=0.382
N1	B	0, 0.654, 1.049, 1.444, 2.171 max_d=2.171 avg_d=1.049 std_dev=0.395
C6	B	0, 0.627, 1.065, 1.502, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.065 std_dev=0.438
O6	B	0, 0.715, 1.269, 1.824, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.269 std_dev=0.555
OP1	B	0, 0.384, 0.943, 1.502, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.943 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.438, 1.053, 1.669, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.053 std_dev=0.616
P	B	0, -0.177, 1.047, 2.270, 3.877 max_d=3.877 avg_d=1.047 std_dev=1.224
OP2	B	0, -0.051, 1.950, 3.952, 6.461 max_d=6.461 avg_d=1.950 std_dev=2.002

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.09	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.03	0.14	0.13	0.16	0.13
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.05	0.10	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.06	0.10	0.05
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.09	0.01	0.05	0.18	0.17	0.23	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04
C5	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.06	0.17	0.17	0.22	0.17
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.09	0.07	0.05	0.03	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.06	0.15	0.13	0.17	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.12	0.11	0.14	0.11
N3	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.02	0.04	0.17	0.15	0.20	0.16
O2	0.04	0.01	0.07	0.09	0.03	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.04	0.03	0.13	0.12	0.15	0.12
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.08	0.00	0.05	0.06	0.04	0.04	0.07	0.09	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.07	0.04	0.10	0.10	0.05	0.00	0.11	0.02	0.08	0.10	0.13	0.09
O4	0.03	0.03	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.11	0.00	0.06	0.19	0.19	0.26	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.00	0.07	0.11	0.12	0.11
O5'	0.07	0.14	0.04	0.05	0.18	0.02	0.17	0.01	0.15	0.12	0.17	0.13	0.04	0.08	0.19	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.13	0.05	0.06	0.17	0.07	0.17	0.07	0.13	0.11	0.15	0.12	0.07	0.10	0.19	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.16	0.10	0.10	0.23	0.05	0.22	0.02	0.17	0.14	0.20	0.15	0.09	0.13	0.26	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.04	0.05	0.17	0.04	0.17	0.02	0.13	0.11	0.16	0.12	0.06	0.09	0.19	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.15	0.17	0.15	0.21	0.15	0.31	0.14	0.16	0.15	0.18	0.15	0.15	0.16	0.16	0.14	0.18	0.29	0.14	0.58	0.32	0.59
C2	0.16	0.19	0.15	0.16	0.17	0.20	0.17	0.28	0.18	0.16	0.19	0.21	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.28	0.18	0.59	0.47	0.68
C2'	0.13	0.16	0.11	0.14	0.13	0.18	0.13	0.30	0.14	0.13	0.16	0.18	0.14	0.13	0.12	0.13	0.10	0.16	0.27	0.14	0.53	0.28	0.47
C3'	0.11	0.17	0.09	0.11	0.13	0.15	0.14	0.27	0.16	0.12	0.17	0.20	0.14	0.13	0.12	0.14	0.09	0.13	0.28	0.16	0.42	0.46	0.25
C4	0.16	0.20	0.16	0.17	0.18	0.21	0.18	0.26	0.19	0.17	0.20	0.21	0.19	0.18	0.17	0.22	0.18	0.19	0.27	0.19	0.50	0.44	0.59
C4'	0.10	0.14	0.10	0.13	0.11	0.17	0.11	0.30	0.12	0.11	0.13	0.16	0.12	0.11	0.10	0.12	0.10	0.13	0.33	0.12	0.41	0.46	0.24
C5	0.15	0.16	0.15	0.17	0.16	0.21	0.16	0.24	0.15	0.16	0.15	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.18	0.18	0.22	0.15	0.47	0.32	0.50
C5'	0.08	0.14	0.08	0.11	0.10	0.17	0.10	0.28	0.11	0.09	0.13	0.17	0.12	0.09	0.08	0.10	0.07	0.12	0.39	0.12	0.37	0.82	0.22
C6	0.15	0.15	0.15	0.16	0.14	0.20	0.14	0.25	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15	0.15	0.18	0.15	0.17	0.22	0.14	0.50	0.27	0.51
N1	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.20	0.15	0.28	0.15	0.16	0.16	0.18	0.15	0.15	0.15	0.17	0.14	0.17	0.26	0.15	0.56	0.35	0.60
N3	0.16	0.21	0.15	0.16	0.18	0.21	0.18	0.27	0.20	0.17	0.21	0.22	0.19	0.18	0.17	0.20	0.17	0.18	0.28	0.20	0.56	0.50	0.67
O2	0.16	0.20	0.15	0.17	0.17	0.21	0.17	0.29	0.18	0.17	0.20	0.22	0.18	0.17	0.16	0.18	0.15	0.18	0.30	0.19	0.63	0.53	0.73
O2'	0.15	0.16	0.14	0.17	0.14	0.22	0.14	0.35	0.14	0.15	0.15	0.18	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.17	0.31	0.14	0.58	0.34	0.54
O3'	0.11	0.19	0.10	0.11	0.14	0.16	0.16	0.28	0.18	0.13	0.20	0.22	0.16	0.15	0.12	0.15	0.09	0.12	0.33	0.20	0.40	0.60	0.20
O4	0.16	0.23	0.17	0.17	0.20	0.23	0.21	0.27	0.22	0.19	0.23	0.23	0.21	0.21	0.19	0.23	0.19	0.21	0.29	0.23	0.46	0.48	0.57
O4'	0.17	0.14	0.17	0.18	0.15	0.21	0.15	0.31	0.14	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.16	0.18	0.16	0.17	0.29	0.14	0.50	0.23	0.44
O5'	0.07	0.18	0.06	0.06	0.12	0.09	0.13	0.17	0.16	0.10	0.17	0.21	0.15	0.12	0.09	0.13	0.02	0.09	0.35	0.16	0.35	0.89	0.19
OP1	0.11	0.18	0.12	0.07	0.16	0.08	0.19	0.17	0.20	0.18	0.20	0.19	0.16	0.20	0.15	0.19	0.03	0.06	0.52	0.21	0.52	1.52	0.67
OP2	0.21	0.27	0.16	0.06	0.25	0.09	0.28	0.06	0.30	0.27	0.29	0.27	0.24	0.29	0.24	0.21	0.02	0.19	0.33	0.32	0.39	1.07	0.34
P	0.10	0.17	0.08	0.03	0.14	0.03	0.16	0.08	0.17	0.15	0.18	0.19	0.15	0.16	0.12	0.13	0.01	0.08	0.38	0.18	0.38	1.10	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.27	0.02	0.39	0.43	0.16
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.17	0.26	0.02	0.33	0.47	0.38
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.06	0.05	0.07	0.08	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.41	0.06	0.45	0.97	0.45
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.09	0.06	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.35	0.03	0.42	0.89	0.35
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.10	0.28	0.01	0.31	0.40	0.23
C4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.11	0.12	0.17	0.13	0.11	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.12	0.40	0.26	0.15
C5	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.09	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.09	0.07	0.30	0.01	0.27	0.50	0.25
C5'	0.06	0.23	0.07	0.03	0.20	0.01	0.26	0.00	0.28	0.28	0.26	0.24	0.19	0.31	0.18	0.07	0.04	0.02	0.01	0.32	0.41	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.11	0.01	0.28	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.11	0.11	0.30	0.00	0.27	0.56	0.32
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.11	0.01	0.28	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.07	0.35	0.03	0.31	0.52	0.25
N1	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.12	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.14	0.15	0.28	0.01	0.31	0.55	0.37
N2	0.04	0.01	0.08	0.09	0.01	0.17	0.01	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.17	0.20	0.26	0.03	0.37	0.50	0.45
N3	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.14	0.16	0.26	0.01	0.34	0.37	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.11	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.05	0.34	0.03	0.26	0.53	0.25
N9	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.02	0.30	0.02	0.33	0.42	0.18
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.12	0.02	0.12	0.07	0.15	0.11	0.19	0.23	0.18	0.11	0.06	0.00	0.06	0.02	0.44	0.15	0.49	1.20	0.55
O3'	0.05	0.15	0.03	0.01	0.10	0.03	0.09	0.04	0.11	0.05	0.14	0.17	0.14	0.06	0.07	0.06	0.00	0.07	0.27	0.10	0.37	0.74	0.16
O4'	0.01	0.17	0.03	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.11	0.07	0.15	0.20	0.16	0.05	0.02	0.02	0.07	0.00	0.31	0.10	0.42	0.25	0.29
O5'	0.27	0.26	0.41	0.35	0.28	0.02	0.30	0.01	0.30	0.35	0.28	0.26	0.26	0.34	0.30	0.44	0.27	0.31	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.03	0.01	0.12	0.01	0.32	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.15	0.10	0.10	0.31	0.00	0.26	0.63	0.34
OP1	0.39	0.33	0.45	0.42	0.31	0.40	0.27	0.41	0.27	0.31	0.31	0.37	0.34	0.26	0.33	0.49	0.37	0.42	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.47	0.97	0.89	0.40	0.26	0.50	0.30	0.56	0.52	0.55	0.50	0.37	0.53	0.42	1.20	0.74	0.25	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.38	0.45	0.35	0.23	0.15	0.25	0.02	0.32	0.25	0.37	0.45	0.31	0.25	0.18	0.55	0.16	0.29	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00