Doublet Group distance statistics: 55206

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 7, 14, 12, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.025, 0.069, 0.113, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.069 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.013, 0.134, 0.254, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.134 std_dev=0.120
C2'	A	0, 0.027, 0.150, 0.273, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.150 std_dev=0.123
O2'	B	0, 0.166, 0.314, 0.462, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.314 std_dev=0.148
C2'	B	0, 0.191, 0.369, 0.546, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.369 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.026, 0.230, 0.434, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.230 std_dev=0.204
C3'	A	0, 0.013, 0.246, 0.479, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.246 std_dev=0.233
O2'	A	0, -0.017, 0.223, 0.463, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.223 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.211, 0.461, 0.711, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.461 std_dev=0.250
C5'	A	0, 0.092, 0.366, 0.640, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.366 std_dev=0.274
O5'	A	0, 0.093, 0.376, 0.660, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.376 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.154, 0.495, 0.836, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.495 std_dev=0.341
P	A	0, 0.075, 0.453, 0.831, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.453 std_dev=0.378
O3'	B	0, 0.103, 0.485, 0.868, 2.552 max_d=2.552 avg_d=0.485 std_dev=0.382
O4'	B	0, 0.212, 0.596, 0.980, 2.084 max_d=2.084 avg_d=0.596 std_dev=0.384
O3'	A	0, -0.001, 0.393, 0.787, 2.798 max_d=2.798 avg_d=0.393 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.192, 0.622, 1.051, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.622 std_dev=0.430
OP1	A	0, 0.072, 0.542, 1.012, 2.523 max_d=2.523 avg_d=0.542 std_dev=0.470
N9	B	0, 0.165, 0.635, 1.105, 2.299 max_d=2.299 avg_d=0.635 std_dev=0.470
OP2	A	0, -0.002, 0.517, 1.035, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.517 std_dev=0.519
N3	B	0, 0.162, 0.706, 1.249, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.706 std_dev=0.544
C4	B	0, 0.150, 0.725, 1.300, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.725 std_dev=0.575
C5'	B	0, 0.213, 0.891, 1.570, 3.449 max_d=3.449 avg_d=0.891 std_dev=0.678
C8	B	0, 0.118, 0.825, 1.532, 3.313 max_d=3.313 avg_d=0.825 std_dev=0.707
C2	B	0, 0.118, 0.887, 1.656, 3.478 max_d=3.478 avg_d=0.887 std_dev=0.769
O5'	B	0, 0.226, 1.002, 1.778, 3.869 max_d=3.869 avg_d=1.002 std_dev=0.776
C5	B	0, 0.103, 0.931, 1.759, 3.719 max_d=3.719 avg_d=0.931 std_dev=0.828
N2	B	0, 0.089, 0.969, 1.850, 3.892 max_d=3.892 avg_d=0.969 std_dev=0.880
N7	B	0, 0.088, 0.990, 1.892, 4.039 max_d=4.039 avg_d=0.990 std_dev=0.902
N1	B	0, 0.091, 1.056, 2.020, 4.337 max_d=4.337 avg_d=1.056 std_dev=0.964
C6	B	0, 0.083, 1.100, 2.117, 4.515 max_d=4.515 avg_d=1.100 std_dev=1.017
P	B	0, 0.195, 1.268, 2.341, 4.792 max_d=4.792 avg_d=1.268 std_dev=1.073
OP1	B	0, 0.158, 1.298, 2.439, 5.169 max_d=5.169 avg_d=1.298 std_dev=1.141
OP2	B	0, 0.237, 1.448, 2.659, 5.251 max_d=5.251 avg_d=1.448 std_dev=1.211
O6	B	0, 0.060, 1.304, 2.548, 5.438 max_d=5.438 avg_d=1.304 std_dev=1.244

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.11	0.03	0.01	0.16	0.15	0.21	0.13
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.20	0.19	0.34	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.07	0.03	0.07	0.13	0.00	0.02	0.07	0.01	0.18	0.25	0.32	0.22
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.13	0.09	0.13	0.10	0.02	0.01	0.17	0.02	0.08	0.16	0.15	0.09
C4	0.03	0.01	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.11	0.01	0.03	0.26	0.30	0.48	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.05	0.11	0.02	0.10	0.00	0.02	0.12	0.06	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.01	0.04	0.27	0.31	0.46	0.33
C5'	0.04	0.10	0.08	0.02	0.18	0.01	0.20	0.00	0.17	0.10	0.14	0.07	0.06	0.08	0.20	0.02	0.01	0.15	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.25	0.24	0.37	0.26
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.02	0.20	0.18	0.31	0.19
N3	0.03	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.01	0.03	0.22	0.24	0.42	0.27
O2	0.04	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.15	0.02	0.06	0.18	0.16	0.31	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.13	0.11	0.13	0.06	0.11	0.07	0.11	0.12	0.00	0.06	0.14	0.08	0.13	0.25	0.33	0.22
O3'	0.11	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.08	0.10	0.06	0.09	0.15	0.06	0.00	0.13	0.08	0.20	0.25	0.20	0.20
O4	0.03	0.01	0.07	0.17	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.13	0.00	0.04	0.27	0.34	0.53	0.36
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.08	0.08	0.04	0.00	0.17	0.14	0.14	0.11
O5'	0.16	0.20	0.18	0.08	0.26	0.02	0.27	0.01	0.25	0.20	0.22	0.18	0.13	0.20	0.27	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.19	0.25	0.16	0.30	0.12	0.31	0.15	0.24	0.18	0.24	0.16	0.25	0.25	0.34	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.34	0.32	0.15	0.48	0.06	0.46	0.06	0.37	0.31	0.42	0.31	0.33	0.20	0.53	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.20	0.22	0.09	0.33	0.08	0.33	0.01	0.26	0.19	0.27	0.17	0.22	0.20	0.36	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.63	0.17	0.16	0.44	0.16	0.52	0.17	0.63	0.34	0.67	0.70	0.49	0.45	0.31	0.17	0.21	0.14	0.20	0.67	0.33	0.32	0.24
C2	0.25	0.75	0.20	0.18	0.58	0.13	0.72	0.16	0.86	0.52	0.87	0.78	0.57	0.67	0.44	0.15	0.15	0.19	0.28	0.94	0.29	0.46	0.34
C2'	0.22	0.59	0.22	0.25	0.45	0.21	0.54	0.26	0.64	0.42	0.66	0.65	0.47	0.51	0.35	0.17	0.27	0.19	0.34	0.69	0.50	0.49	0.40
C3'	0.20	0.49	0.20	0.21	0.36	0.21	0.41	0.23	0.49	0.29	0.52	0.55	0.40	0.37	0.26	0.21	0.25	0.18	0.26	0.52	0.43	0.33	0.30
C4	0.31	0.66	0.24	0.28	0.62	0.24	0.81	0.32	0.92	0.65	0.85	0.53	0.50	0.80	0.52	0.17	0.21	0.30	0.45	1.00	0.42	0.64	0.52
C4'	0.17	0.49	0.17	0.18	0.33	0.21	0.35	0.24	0.43	0.22	0.49	0.56	0.40	0.28	0.22	0.18	0.24	0.17	0.23	0.44	0.41	0.26	0.26
C5	0.28	0.52	0.23	0.27	0.54	0.23	0.67	0.29	0.73	0.57	0.65	0.40	0.43	0.68	0.46	0.17	0.21	0.27	0.40	0.78	0.37	0.55	0.46
C5'	0.20	0.42	0.21	0.20	0.29	0.22	0.29	0.25	0.35	0.20	0.40	0.48	0.37	0.24	0.22	0.24	0.24	0.20	0.25	0.35	0.44	0.28	0.29
C6	0.22	0.53	0.20	0.20	0.47	0.15	0.57	0.19	0.63	0.45	0.61	0.50	0.44	0.55	0.38	0.17	0.16	0.19	0.28	0.67	0.29	0.42	0.33
N1	0.21	0.65	0.19	0.17	0.50	0.13	0.61	0.15	0.71	0.44	0.73	0.68	0.51	0.56	0.38	0.16	0.16	0.16	0.24	0.77	0.28	0.39	0.28
N3	0.29	0.75	0.22	0.23	0.63	0.18	0.80	0.24	0.94	0.61	0.92	0.72	0.56	0.77	0.50	0.15	0.16	0.25	0.37	1.04	0.35	0.58	0.44
O2	0.24	0.80	0.19	0.17	0.59	0.13	0.73	0.14	0.90	0.51	0.93	0.86	0.60	0.67	0.44	0.15	0.16	0.18	0.25	0.98	0.28	0.44	0.31
O2'	0.20	0.65	0.22	0.25	0.48	0.22	0.58	0.28	0.70	0.43	0.72	0.72	0.50	0.55	0.36	0.17	0.28	0.17	0.36	0.76	0.55	0.54	0.44
O3'	0.22	0.49	0.24	0.27	0.36	0.27	0.41	0.31	0.49	0.30	0.52	0.55	0.40	0.37	0.28	0.23	0.31	0.23	0.31	0.52	0.49	0.37	0.35
O4	0.34	0.61	0.26	0.33	0.64	0.31	0.88	0.41	1.01	0.73	0.90	0.41	0.46	0.90	0.56	0.18	0.26	0.36	0.55	1.13	0.53	0.77	0.64
O4'	0.16	0.53	0.16	0.18	0.35	0.22	0.38	0.24	0.47	0.22	0.54	0.61	0.43	0.30	0.23	0.19	0.26	0.17	0.20	0.49	0.34	0.23	0.21
O5'	0.35	0.34	0.36	0.36	0.35	0.33	0.37	0.33	0.37	0.38	0.35	0.33	0.33	0.39	0.36	0.35	0.34	0.34	0.40	0.38	0.46	0.44	0.41
OP1	0.43	0.31	0.43	0.59	0.41	0.55	0.48	0.64	0.45	0.58	0.36	0.26	0.32	0.58	0.47	0.30	0.61	0.49	0.74	0.49	0.89	0.86	0.81
OP2	0.40	0.52	0.41	0.42	0.54	0.30	0.61	0.36	0.62	0.60	0.58	0.48	0.49	0.65	0.52	0.27	0.29	0.35	0.53	0.66	0.54	0.66	0.55
P	0.41	0.34	0.43	0.54	0.43	0.45	0.48	0.50	0.46	0.55	0.39	0.29	0.35	0.55	0.47	0.28	0.53	0.43	0.61	0.49	0.66	0.69	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.18	0.15
C2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.12	0.04	0.12	0.02	0.15	0.23	0.19
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.09	0.13	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.09	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.10	0.08	0.11	0.08	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.09	0.17	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.12	0.01	0.14	0.22	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.07	0.05	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.08	0.05	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.15	0.01	0.17	0.24	0.20
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.09	0.07	0.06	0.15	0.07	0.06	0.06	0.02	0.01	0.15	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.16	0.01	0.19	0.25	0.22
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.15	0.03	0.16	0.23	0.19
N1	0.04	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.02	0.14	0.02	0.17	0.24	0.20
N2	0.06	0.01	0.13	0.11	0.02	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.06	0.12	0.02	0.14	0.22	0.19
N3	0.05	0.01	0.10	0.08	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.04	0.11	0.01	0.14	0.22	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.05	0.17	0.03	0.19	0.25	0.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.11	0.02	0.13	0.21	0.17
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.13	0.20	0.14	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.08	0.12	0.07	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.09	0.11	0.10	0.15	0.11	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.15	0.11	0.29	0.20	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.06	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.10	0.04	0.15	0.21	0.19
O5'	0.07	0.12	0.05	0.09	0.12	0.02	0.15	0.01	0.16	0.15	0.14	0.12	0.11	0.17	0.11	0.05	0.15	0.10	0.00	0.19	0.02	0.03	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.11	0.04	0.19	0.00	0.22	0.27	0.24
OP1	0.10	0.15	0.10	0.17	0.14	0.08	0.17	0.09	0.19	0.16	0.17	0.14	0.14	0.19	0.13	0.12	0.29	0.15	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.23	0.09	0.11	0.22	0.05	0.24	0.02	0.25	0.23	0.24	0.22	0.22	0.25	0.21	0.07	0.20	0.21	0.03	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.19	0.06	0.09	0.18	0.05	0.20	0.02	0.22	0.19	0.20	0.19	0.18	0.21	0.17	0.06	0.19	0.19	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00