Doublet Group distance statistics: 55211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 5, 3, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.013, 0.019, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.019 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.031 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.027, 0.044, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.044 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.027, 0.046, 0.064, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.046 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.040 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.056, 0.093, 0.130, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.093 std_dev=0.037
O4	A	0, 0.062, 0.111, 0.160, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.111 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.301, 0.448, 0.596, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.448 std_dev=0.148
O4'	A	0, 0.253, 0.406, 0.560, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.406 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.183, 0.365, 0.546, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.365 std_dev=0.181
N3	B	0, 0.315, 0.546, 0.778, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.546 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.457, 0.699, 0.942, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.699 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.483, 0.733, 0.984, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.733 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.225, 0.482, 0.739, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.482 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.347, 0.607, 0.866, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.607 std_dev=0.259
C2	B	0, 0.395, 0.662, 0.929, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.662 std_dev=0.267
C4	B	0, 0.251, 0.520, 0.790, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.520 std_dev=0.269
O2'	B	0, 0.553, 0.822, 1.092, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.822 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.407, 0.685, 0.964, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.685 std_dev=0.278
N1	B	0, 0.365, 0.646, 0.928, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.646 std_dev=0.281
N2	B	0, 0.639, 0.935, 1.232, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.935 std_dev=0.296
OP2	A	0, 0.308, 0.613, 0.918, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.613 std_dev=0.305
N9	B	0, 0.296, 0.606, 0.915, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.606 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.364, 0.679, 0.995, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.679 std_dev=0.315
O6	B	0, 0.518, 0.838, 1.159, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.838 std_dev=0.320
C3'	B	0, 0.561, 0.884, 1.207, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.884 std_dev=0.323
P	A	0, 0.480, 0.816, 1.151, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.816 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.754, 1.115, 1.477, 1.570 max_d=1.570 avg_d=1.115 std_dev=0.362
O3'	B	0, 0.681, 1.054, 1.427, 1.512 max_d=1.512 avg_d=1.054 std_dev=0.373
O4'	B	0, 0.679, 1.061, 1.444, 1.611 max_d=1.611 avg_d=1.061 std_dev=0.382
C5'	A	0, 0.677, 1.064, 1.450, 1.559 max_d=1.559 avg_d=1.064 std_dev=0.387
O5'	A	0, 0.675, 1.114, 1.554, 1.811 max_d=1.811 avg_d=1.114 std_dev=0.440
N7	B	0, 0.487, 0.931, 1.375, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.931 std_dev=0.444
C8	B	0, 0.439, 0.883, 1.327, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.883 std_dev=0.444
C4'	B	0, 0.823, 1.271, 1.719, 1.843 max_d=1.843 avg_d=1.271 std_dev=0.448
OP1	A	0, 0.329, 0.783, 1.237, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.783 std_dev=0.454
O5'	B	0, 0.729, 1.283, 1.838, 2.179 max_d=2.179 avg_d=1.283 std_dev=0.554
C5'	B	0, 1.283, 2.065, 2.847, 2.800 max_d=2.800 avg_d=2.065 std_dev=0.782
P	B	0, 0.830, 1.799, 2.768, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.799 std_dev=0.969
OP1	B	0, 1.443, 2.540, 3.638, 4.115 max_d=4.115 avg_d=2.540 std_dev=1.097
OP2	B	0, 0.802, 1.961, 3.121, 3.810 max_d=3.810 avg_d=1.961 std_dev=1.160

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.09	0.17	0.09
C2	0.03	0.00	0.03	0.10	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.02	0.16	0.16	0.21	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.06	0.02	0.09	0.14	0.15	0.08
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.14	0.01	0.14	0.02	0.12	0.08	0.13	0.09	0.02	0.01	0.16	0.02	0.16	0.18	0.14	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.16	0.00	0.02	0.25	0.25	0.30	0.23
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.10	0.00	0.10	0.01	0.09	0.06	0.08	0.05	0.08	0.02	0.11	0.00	0.02	0.11	0.10	0.04
C5	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.01	0.03	0.26	0.25	0.28	0.23
C5'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.14	0.08	0.12	0.06	0.07	0.04	0.17	0.02	0.01	0.12	0.08	0.02
C6	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.03	0.22	0.18	0.21	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.02	0.15	0.14	0.19	0.12
N3	0.03	0.00	0.04	0.13	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.01	0.02	0.20	0.21	0.26	0.19
O2	0.04	0.01	0.05	0.09	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.09	0.02	0.04	0.12	0.14	0.20	0.12
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.07	0.08	0.05	0.07	0.04	0.03	0.08	0.11	0.00	0.05	0.07	0.07	0.05	0.17	0.12	0.05
O3'	0.03	0.09	0.03	0.01	0.16	0.02	0.16	0.04	0.13	0.07	0.13	0.09	0.05	0.00	0.19	0.02	0.19	0.26	0.19	0.17
O4	0.03	0.01	0.06	0.16	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.19	0.00	0.02	0.27	0.30	0.35	0.27
O4'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.02	0.00	0.12	0.11	0.20	0.13
O5'	0.06	0.16	0.09	0.16	0.25	0.02	0.26	0.01	0.22	0.15	0.20	0.12	0.05	0.19	0.27	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.14	0.18	0.25	0.11	0.25	0.12	0.18	0.14	0.21	0.14	0.17	0.26	0.30	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.21	0.15	0.14	0.30	0.10	0.28	0.08	0.21	0.19	0.26	0.20	0.12	0.19	0.35	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.08	0.12	0.23	0.04	0.23	0.02	0.16	0.12	0.19	0.12	0.05	0.17	0.27	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.34	0.16	0.23	0.25	0.15	0.29	0.27	0.35	0.27	0.37	0.40	0.25	0.29	0.25	0.24	0.27	0.19	0.50	0.38	0.63	0.65	0.60
C2	0.19	0.13	0.10	0.22	0.20	0.18	0.26	0.35	0.30	0.26	0.24	0.16	0.13	0.28	0.22	0.21	0.25	0.16	0.61	0.36	0.97	0.77	0.77
C2'	0.27	0.31	0.20	0.22	0.25	0.16	0.29	0.29	0.33	0.30	0.34	0.37	0.24	0.31	0.27	0.28	0.23	0.20	0.55	0.37	0.66	0.73	0.67
C3'	0.31	0.33	0.28	0.22	0.28	0.19	0.29	0.28	0.32	0.33	0.34	0.40	0.28	0.31	0.30	0.36	0.22	0.24	0.52	0.34	0.57	0.69	0.63
C4	0.18	0.21	0.11	0.21	0.22	0.24	0.25	0.44	0.21	0.28	0.17	0.27	0.21	0.30	0.23	0.20	0.23	0.19	0.69	0.25	1.20	0.82	0.89
C4'	0.31	0.38	0.26	0.18	0.30	0.15	0.30	0.19	0.33	0.30	0.37	0.45	0.33	0.29	0.29	0.36	0.22	0.23	0.40	0.34	0.40	0.55	0.46
C5	0.17	0.15	0.09	0.21	0.20	0.24	0.25	0.42	0.21	0.29	0.16	0.20	0.15	0.30	0.23	0.19	0.24	0.18	0.66	0.24	1.01	0.78	0.82
C5'	0.35	0.39	0.34	0.19	0.31	0.19	0.30	0.18	0.31	0.31	0.36	0.44	0.36	0.29	0.32	0.45	0.19	0.27	0.35	0.31	0.39	0.50	0.40
C6	0.19	0.18	0.09	0.22	0.20	0.19	0.25	0.35	0.25	0.29	0.22	0.21	0.14	0.29	0.24	0.21	0.25	0.16	0.59	0.28	0.81	0.72	0.71
N1	0.21	0.23	0.12	0.22	0.22	0.17	0.27	0.33	0.31	0.27	0.29	0.25	0.17	0.29	0.24	0.22	0.25	0.16	0.57	0.34	0.81	0.72	0.69
N3	0.18	0.14	0.10	0.22	0.19	0.21	0.24	0.41	0.23	0.26	0.12	0.23	0.17	0.28	0.22	0.20	0.24	0.17	0.66	0.31	1.14	0.81	0.85
O2	0.20	0.18	0.11	0.21	0.21	0.16	0.27	0.33	0.33	0.25	0.30	0.17	0.15	0.29	0.22	0.22	0.25	0.16	0.59	0.41	0.95	0.76	0.75
O2'	0.24	0.34	0.16	0.17	0.26	0.10	0.30	0.20	0.36	0.27	0.38	0.41	0.26	0.29	0.25	0.27	0.22	0.17	0.45	0.40	0.54	0.64	0.55
O3'	0.33	0.35	0.31	0.22	0.29	0.20	0.30	0.26	0.33	0.34	0.36	0.42	0.30	0.32	0.31	0.40	0.21	0.25	0.51	0.35	0.54	0.68	0.61
O4	0.20	0.31	0.13	0.21	0.28	0.27	0.32	0.48	0.31	0.31	0.30	0.34	0.28	0.35	0.26	0.20	0.23	0.23	0.72	0.31	1.37	0.85	0.95
O4'	0.28	0.39	0.21	0.23	0.29	0.15	0.30	0.23	0.35	0.29	0.39	0.45	0.33	0.29	0.28	0.27	0.29	0.22	0.43	0.36	0.47	0.57	0.49
O5'	0.37	0.40	0.41	0.13	0.33	0.12	0.31	0.13	0.33	0.33	0.38	0.45	0.38	0.30	0.33	0.52	0.02	0.24	0.35	0.32	0.43	0.54	0.45
OP1	0.07	0.27	0.15	0.04	0.12	0.19	0.13	0.33	0.18	0.18	0.24	0.36	0.22	0.17	0.09	0.24	0.02	0.12	0.35	0.19	0.51	0.58	0.44
OP2	0.10	0.30	0.14	0.08	0.22	0.24	0.26	0.45	0.28	0.26	0.30	0.33	0.25	0.28	0.19	0.18	0.02	0.16	0.55	0.30	0.58	0.66	0.67
P	0.11	0.25	0.19	0.02	0.14	0.11	0.15	0.25	0.18	0.19	0.23	0.31	0.21	0.18	0.12	0.26	0.01	0.04	0.35	0.19	0.46	0.52	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.12	0.03	0.29	0.19	0.14
C2	0.05	0.00	0.16	0.16	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.22	0.04	0.38	0.02	0.88	0.55	0.51
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.10	0.02	0.08	0.03	0.11	0.06	0.14	0.18	0.16	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.16	0.10	0.22	0.28	0.19
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.09	0.15	0.13	0.20	0.15	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.19	0.09	0.29	0.29	0.23
C4	0.03	0.01	0.10	0.09	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.09	0.02	0.37	0.01	0.83	0.50	0.47
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.15	0.06	0.10	0.07	0.14	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.10	0.18	0.20	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.09	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.08	0.04	0.47	0.01	1.10	0.65	0.63
C5'	0.05	0.16	0.03	0.04	0.19	0.01	0.28	0.00	0.29	0.32	0.23	0.13	0.12	0.35	0.19	0.06	0.04	0.02	0.01	0.33	0.30	0.32	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.09	0.01	0.08	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.22	0.11	0.04	0.50	0.00	1.21	0.72	0.69
C8	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.15	0.01	0.32	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.05	0.42	0.03	0.90	0.53	0.52
N1	0.04	0.01	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.28	0.18	0.04	0.45	0.02	1.08	0.66	0.63
N2	0.06	0.01	0.18	0.20	0.01	0.10	0.01	0.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.34	0.29	0.05	0.35	0.03	0.81	0.52	0.47
N3	0.05	0.01	0.16	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.20	0.04	0.32	0.01	0.72	0.45	0.41
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.14	0.00	0.35	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.05	0.50	0.03	1.17	0.69	0.67
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.31	0.02	0.66	0.39	0.37
O2'	0.02	0.31	0.01	0.02	0.18	0.05	0.17	0.06	0.22	0.04	0.28	0.34	0.28	0.09	0.07	0.00	0.05	0.07	0.13	0.21	0.19	0.24	0.14
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.09	0.02	0.08	0.04	0.11	0.16	0.18	0.29	0.20	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.20	0.11	0.50	0.36	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.07	0.05	0.15	0.17	0.11
O5'	0.12	0.38	0.16	0.19	0.37	0.03	0.47	0.01	0.50	0.42	0.45	0.35	0.32	0.50	0.31	0.13	0.20	0.07	0.00	0.54	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.09	0.01	0.10	0.01	0.33	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.21	0.11	0.05	0.54	0.00	1.36	0.80	0.78
OP1	0.29	0.88	0.22	0.29	0.83	0.18	1.10	0.30	1.21	0.90	1.08	0.81	0.72	1.17	0.66	0.19	0.50	0.15	0.02	1.36	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.55	0.28	0.29	0.50	0.20	0.65	0.32	0.72	0.53	0.66	0.52	0.45	0.69	0.39	0.24	0.36	0.17	0.02	0.80	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.51	0.19	0.23	0.47	0.04	0.63	0.02	0.69	0.52	0.63	0.47	0.41	0.67	0.37	0.14	0.28	0.11	0.01	0.78	0.01	0.00	0.00