Doublet Group distance statistics: 55212

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 0, 2, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.028 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.028, 0.060, 0.093, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.060 std_dev=0.032
O4	A	0, -0.011, 0.058, 0.127, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.058 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.115, 0.253, 0.390, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.253 std_dev=0.137
O4'	A	0, 0.060, 0.227, 0.393, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.227 std_dev=0.166
O2'	A	0, 0.160, 0.369, 0.578, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.369 std_dev=0.209
O2'	B	0, 0.256, 0.512, 0.768, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.512 std_dev=0.256
C2'	B	0, 0.245, 0.525, 0.804, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.525 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.111, 0.396, 0.680, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.396 std_dev=0.285
C4'	A	0, 0.111, 0.407, 0.703, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.407 std_dev=0.296
O3'	B	0, 0.253, 0.582, 0.911, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.582 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.240, 0.597, 0.955, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.597 std_dev=0.357
C1'	B	0, 0.247, 0.611, 0.975, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.611 std_dev=0.364
O3'	A	0, 0.210, 0.613, 1.015, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.613 std_dev=0.403
N9	B	0, 0.236, 0.655, 1.074, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.655 std_dev=0.419
C4'	B	0, 0.254, 0.680, 1.105, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.680 std_dev=0.425
C4	B	0, 0.250, 0.692, 1.134, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.692 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.236, 0.679, 1.122, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.679 std_dev=0.443
O5'	A	0, 0.204, 0.654, 1.103, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.654 std_dev=0.449
N3	B	0, 0.239, 0.715, 1.191, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.715 std_dev=0.476
C5'	A	0, 0.165, 0.652, 1.139, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.652 std_dev=0.487
C8	B	0, 0.253, 0.758, 1.264, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.758 std_dev=0.506
O5'	B	0, 0.323, 0.843, 1.363, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.843 std_dev=0.520
C5	B	0, 0.236, 0.765, 1.294, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.765 std_dev=0.529
N7	B	0, 0.245, 0.806, 1.367, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.806 std_dev=0.561
C5'	B	0, 0.248, 0.812, 1.376, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.812 std_dev=0.564
C2	B	0, 0.212, 0.824, 1.436, 2.156 max_d=2.156 avg_d=0.824 std_dev=0.612
C6	B	0, 0.240, 0.858, 1.476, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.858 std_dev=0.618
N1	B	0, 0.226, 0.887, 1.547, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.887 std_dev=0.660
O6	B	0, 0.271, 0.954, 1.638, 2.147 max_d=2.147 avg_d=0.954 std_dev=0.683
P	B	0, 0.387, 1.104, 1.821, 2.208 max_d=2.208 avg_d=1.104 std_dev=0.717
N2	B	0, 0.179, 0.922, 1.665, 2.780 max_d=2.780 avg_d=0.922 std_dev=0.743
OP1	A	0, 0.290, 1.039, 1.789, 2.191 max_d=2.191 avg_d=1.039 std_dev=0.749
OP1	B	0, 0.401, 1.170, 1.939, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.170 std_dev=0.769
P	A	0, 0.209, 0.984, 1.759, 2.748 max_d=2.748 avg_d=0.984 std_dev=0.775
OP2	B	0, 0.397, 1.176, 1.956, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.176 std_dev=0.779
OP2	A	0, 0.138, 1.188, 2.238, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.188 std_dev=1.050

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.00	0.23	0.22	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.09	0.02	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.07	0.51	0.49	0.42	0.48
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.08	0.03	0.05	0.08	0.01	0.04	0.08	0.01	0.15	0.19	0.16	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.03	0.08	0.07	0.12	0.10	0.03	0.01	0.14	0.02	0.14	0.18	0.15	0.08
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.00	0.05	0.49	0.47	0.43	0.46
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.14	0.11	0.03	0.07	0.00	0.02	0.12	0.26	0.11
C5	0.01	0.02	0.08	0.11	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.01	0.05	0.41	0.36	0.30	0.32
C5'	0.01	0.14	0.03	0.03	0.11	0.01	0.06	0.00	0.03	0.05	0.15	0.21	0.10	0.08	0.13	0.01	0.01	0.26	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.05	0.35	0.30	0.23	0.23
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.38	0.34	0.24	0.28
N3	0.02	0.00	0.05	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.01	0.05	0.53	0.53	0.50	0.54
O2	0.03	0.00	0.08	0.10	0.02	0.14	0.02	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.13	0.58	0.59	0.54	0.60
O2'	0.03	0.09	0.01	0.03	0.11	0.11	0.09	0.10	0.07	0.06	0.11	0.10	0.00	0.05	0.14	0.07	0.10	0.15	0.14	0.02
O3'	0.06	0.09	0.04	0.01	0.11	0.03	0.07	0.08	0.05	0.03	0.12	0.11	0.05	0.00	0.13	0.04	0.17	0.08	0.12	0.15
O4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.00	0.05	0.51	0.50	0.49	0.51
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.13	0.07	0.04	0.05	0.00	0.25	0.23	0.22	0.10
O5'	0.23	0.51	0.15	0.14	0.49	0.02	0.41	0.01	0.35	0.38	0.53	0.58	0.10	0.17	0.51	0.25	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.49	0.19	0.18	0.47	0.12	0.36	0.26	0.30	0.34	0.53	0.59	0.15	0.08	0.50	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.42	0.16	0.15	0.43	0.26	0.30	0.27	0.23	0.24	0.50	0.54	0.14	0.12	0.49	0.22	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.48	0.10	0.08	0.46	0.11	0.32	0.02	0.23	0.28	0.54	0.60	0.02	0.15	0.51	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.35	0.12	0.08	0.26	0.15	0.26	0.17	0.30	0.17	0.34	0.40	0.31	0.21	0.20	0.13	0.15	0.16	0.13	0.31	0.16	0.10	0.14
C2	0.18	0.34	0.13	0.15	0.23	0.20	0.21	0.24	0.26	0.15	0.32	0.42	0.30	0.16	0.18	0.16	0.22	0.17	0.20	0.26	0.29	0.18	0.23
C2'	0.25	0.34	0.20	0.12	0.31	0.16	0.32	0.14	0.34	0.27	0.35	0.35	0.32	0.30	0.27	0.19	0.08	0.21	0.17	0.36	0.13	0.15	0.16
C3'	0.20	0.32	0.13	0.10	0.25	0.17	0.28	0.16	0.33	0.21	0.34	0.34	0.27	0.25	0.21	0.16	0.11	0.20	0.14	0.35	0.13	0.12	0.14
C4	0.18	0.24	0.15	0.20	0.16	0.24	0.14	0.32	0.16	0.17	0.21	0.31	0.22	0.15	0.16	0.19	0.25	0.20	0.26	0.15	0.38	0.27	0.32
C4'	0.16	0.54	0.12	0.05	0.38	0.10	0.41	0.11	0.50	0.25	0.56	0.62	0.44	0.34	0.26	0.07	0.13	0.11	0.06	0.53	0.10	0.07	0.07
C5	0.18	0.20	0.15	0.20	0.15	0.24	0.14	0.31	0.14	0.17	0.17	0.25	0.18	0.15	0.16	0.19	0.23	0.21	0.26	0.13	0.35	0.26	0.30
C5'	0.17	0.64	0.14	0.06	0.43	0.10	0.47	0.12	0.59	0.28	0.66	0.74	0.51	0.38	0.29	0.09	0.13	0.10	0.06	0.62	0.12	0.07	0.07
C6	0.17	0.22	0.14	0.17	0.16	0.22	0.14	0.27	0.16	0.15	0.19	0.26	0.20	0.14	0.15	0.18	0.21	0.19	0.22	0.15	0.28	0.21	0.25
N1	0.18	0.30	0.13	0.14	0.21	0.20	0.19	0.23	0.23	0.15	0.28	0.35	0.26	0.15	0.17	0.16	0.20	0.17	0.19	0.23	0.25	0.17	0.21
N3	0.18	0.30	0.14	0.18	0.20	0.22	0.18	0.28	0.21	0.15	0.28	0.38	0.26	0.14	0.16	0.17	0.24	0.18	0.23	0.20	0.34	0.23	0.28
O2	0.20	0.42	0.14	0.13	0.29	0.19	0.28	0.22	0.34	0.18	0.41	0.50	0.36	0.22	0.22	0.16	0.21	0.18	0.18	0.34	0.26	0.16	0.20
O2'	0.33	0.41	0.25	0.13	0.38	0.18	0.37	0.16	0.39	0.32	0.40	0.42	0.42	0.35	0.35	0.24	0.13	0.27	0.17	0.38	0.12	0.15	0.16
O3'	0.24	0.19	0.15	0.15	0.15	0.25	0.17	0.23	0.22	0.14	0.22	0.21	0.17	0.16	0.16	0.28	0.17	0.28	0.16	0.27	0.15	0.11	0.15
O4	0.18	0.23	0.16	0.22	0.16	0.26	0.14	0.34	0.15	0.19	0.19	0.30	0.20	0.17	0.17	0.19	0.26	0.21	0.29	0.13	0.42	0.31	0.35
O4'	0.17	0.49	0.11	0.08	0.33	0.16	0.34	0.19	0.41	0.20	0.48	0.57	0.41	0.26	0.22	0.10	0.17	0.14	0.13	0.42	0.18	0.11	0.15
O5'	0.22	0.34	0.14	0.11	0.26	0.15	0.27	0.14	0.32	0.22	0.35	0.39	0.29	0.24	0.22	0.15	0.12	0.21	0.13	0.33	0.09	0.12	0.13
OP1	0.20	0.36	0.11	0.08	0.25	0.17	0.27	0.18	0.34	0.20	0.39	0.43	0.28	0.24	0.20	0.11	0.10	0.24	0.15	0.37	0.12	0.14	0.15
OP2	0.46	0.34	0.29	0.28	0.35	0.47	0.34	0.49	0.33	0.41	0.34	0.37	0.34	0.37	0.40	0.32	0.19	0.56	0.43	0.34	0.38	0.39	0.44
P	0.34	0.29	0.19	0.18	0.27	0.32	0.27	0.33	0.28	0.30	0.30	0.33	0.27	0.28	0.30	0.21	0.12	0.41	0.29	0.28	0.25	0.28	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.04	0.15	0.01	0.18	0.22	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.06	0.11	0.13	0.11	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.08	0.04	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.14	0.01	0.17	0.19	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.18	0.01	0.21	0.24	0.19
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.08	0.07	0.04	0.04	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.19	0.00	0.23	0.27	0.21
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.16	0.01	0.17	0.16	0.15
N1	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.18	0.01	0.22	0.26	0.19
N2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.05	0.14	0.02	0.17	0.22	0.14
N3	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.13	0.01	0.15	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.19	0.01	0.22	0.23	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.06	0.05	0.05
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.11	0.07	0.13	0.16	0.12	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.07	0.05
O5'	0.06	0.15	0.02	0.05	0.14	0.01	0.18	0.01	0.19	0.16	0.18	0.14	0.13	0.19	0.12	0.04	0.12	0.06	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.20	0.00	0.26	0.30	0.23
OP1	0.08	0.18	0.07	0.08	0.17	0.06	0.21	0.08	0.23	0.17	0.22	0.17	0.15	0.22	0.13	0.06	0.12	0.08	0.02	0.26	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.22	0.05	0.04	0.19	0.03	0.24	0.02	0.27	0.16	0.26	0.22	0.18	0.23	0.13	0.05	0.11	0.07	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.15	0.03	0.05	0.14	0.01	0.19	0.01	0.21	0.15	0.19	0.14	0.12	0.20	0.11	0.05	0.12	0.05	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00