Doublet Group distance statistics: 55213

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 6, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.042, 0.070, 0.098, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.070 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.052, 0.101, 0.150, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.101 std_dev=0.049
C2'	B	0, 0.238, 0.401, 0.564, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.401 std_dev=0.163
N2	B	0, 0.261, 0.455, 0.650, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.455 std_dev=0.194
C3'	B	0, 0.295, 0.501, 0.706, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.501 std_dev=0.205
O4'	A	0, -0.003, 0.205, 0.413, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.205 std_dev=0.208
O3'	B	0, 0.282, 0.501, 0.720, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.501 std_dev=0.219
C4'	B	0, 0.450, 0.689, 0.927, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.689 std_dev=0.239
C2'	A	0, 0.033, 0.274, 0.515, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.274 std_dev=0.241
O4'	B	0, 0.376, 0.621, 0.865, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.621 std_dev=0.244
N3	B	0, 0.229, 0.474, 0.719, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.474 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.209, 0.483, 0.757, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.483 std_dev=0.274
C2	B	0, 0.272, 0.549, 0.826, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.549 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.048, 0.357, 0.666, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.357 std_dev=0.309
C4'	A	0, 0.019, 0.333, 0.648, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.333 std_dev=0.315
O2'	B	0, 0.063, 0.408, 0.754, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.408 std_dev=0.345
C4	B	0, 0.336, 0.692, 1.048, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.692 std_dev=0.356
N9	B	0, 0.337, 0.709, 1.081, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.709 std_dev=0.372
P	A	0, 0.197, 0.581, 0.965, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.581 std_dev=0.384
O3'	A	0, 0.072, 0.463, 0.854, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.463 std_dev=0.391
O5'	A	0, 0.176, 0.575, 0.974, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.575 std_dev=0.399
N1	B	0, 0.453, 0.854, 1.255, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.854 std_dev=0.401
C5'	B	0, 0.794, 1.219, 1.643, 1.563 max_d=1.563 avg_d=1.219 std_dev=0.425
O2'	A	0, -0.020, 0.414, 0.849, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.414 std_dev=0.434
OP2	A	0, 0.303, 0.744, 1.185, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.744 std_dev=0.441
C5'	A	0, 0.070, 0.529, 0.988, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.529 std_dev=0.459
C5	B	0, 0.543, 1.028, 1.513, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.028 std_dev=0.485
C8	B	0, 0.525, 1.015, 1.506, 1.818 max_d=1.818 avg_d=1.015 std_dev=0.490
C6	B	0, 0.620, 1.139, 1.658, 1.941 max_d=1.941 avg_d=1.139 std_dev=0.519
OP1	A	0, 0.115, 0.636, 1.158, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.636 std_dev=0.522
N7	B	0, 0.658, 1.226, 1.794, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.226 std_dev=0.568
O5'	B	0, 0.382, 0.952, 1.522, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.952 std_dev=0.570
O6	B	0, 0.819, 1.460, 2.102, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.460 std_dev=0.641
OP1	B	0, 0.454, 1.279, 2.104, 3.433 max_d=3.433 avg_d=1.279 std_dev=0.825
P	B	0, 0.155, 1.196, 2.236, 2.968 max_d=2.968 avg_d=1.196 std_dev=1.040
OP2	B	0, 0.187, 1.903, 3.618, 5.052 max_d=5.052 avg_d=1.903 std_dev=1.715

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.01	0.10	0.10	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.18	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.02	0.03	0.21	0.17	0.27	0.18
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.08	0.02	0.07	0.18	0.01	0.02	0.06	0.01	0.17	0.17	0.25	0.19
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.16	0.00	0.10	0.02	0.07	0.11	0.19	0.22	0.02	0.01	0.17	0.02	0.09	0.08	0.16	0.11
C4	0.02	0.02	0.05	0.16	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.15	0.01	0.02	0.27	0.22	0.41	0.26
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.08	0.10	0.16	0.01	0.08	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.09	0.02	0.03	0.24	0.19	0.38	0.24
C5'	0.03	0.07	0.07	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.07	0.10	0.08	0.07	0.08	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02
C6	0.02	0.02	0.08	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.05	0.02	0.04	0.19	0.15	0.26	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.06	0.02	0.01	0.17	0.13	0.20	0.14
N3	0.02	0.01	0.07	0.19	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.16	0.17	0.02	0.02	0.25	0.21	0.36	0.23
O2	0.05	0.01	0.18	0.22	0.03	0.10	0.03	0.10	0.03	0.03	0.02	0.00	0.13	0.18	0.03	0.06	0.20	0.17	0.24	0.17
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.17	0.16	0.14	0.08	0.11	0.09	0.16	0.13	0.00	0.02	0.19	0.12	0.11	0.09	0.28	0.14
O3'	0.05	0.14	0.02	0.01	0.15	0.01	0.09	0.07	0.05	0.06	0.17	0.18	0.02	0.00	0.16	0.03	0.14	0.08	0.20	0.14
O4	0.03	0.02	0.06	0.17	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.03	0.19	0.16	0.00	0.03	0.29	0.25	0.46	0.28
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.12	0.03	0.03	0.00	0.11	0.14	0.13	0.13
O5'	0.10	0.21	0.17	0.09	0.27	0.01	0.24	0.01	0.19	0.17	0.25	0.20	0.11	0.14	0.29	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.17	0.08	0.22	0.07	0.19	0.08	0.15	0.13	0.21	0.17	0.09	0.08	0.25	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.27	0.25	0.16	0.41	0.05	0.38	0.02	0.26	0.20	0.36	0.24	0.28	0.20	0.46	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.18	0.19	0.11	0.26	0.02	0.24	0.02	0.18	0.14	0.23	0.17	0.14	0.14	0.28	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.04	0.07	0.06	0.10	0.07	0.10	0.13	0.07	0.13	0.04	0.08	0.06	0.12	0.12	0.12	0.07	0.08	0.15	0.07	0.77	0.41	0.56
C2	0.11	0.07	0.11	0.06	0.15	0.07	0.14	0.11	0.10	0.16	0.07	0.04	0.12	0.15	0.16	0.20	0.10	0.08	0.21	0.09	0.67	0.50	0.57
C2'	0.14	0.11	0.16	0.17	0.13	0.19	0.13	0.23	0.11	0.14	0.11	0.15	0.12	0.14	0.14	0.21	0.16	0.14	0.18	0.11	0.67	0.30	0.41
C3'	0.12	0.14	0.10	0.14	0.13	0.18	0.14	0.24	0.14	0.14	0.14	0.17	0.13	0.15	0.13	0.06	0.11	0.15	0.27	0.14	0.64	0.49	0.33
C4	0.15	0.10	0.16	0.08	0.19	0.05	0.17	0.09	0.12	0.20	0.08	0.04	0.17	0.18	0.20	0.28	0.11	0.09	0.29	0.10	0.55	0.71	0.56
C4'	0.09	0.10	0.09	0.10	0.09	0.15	0.10	0.23	0.09	0.11	0.09	0.14	0.09	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.29	0.09	0.64	0.55	0.33
C5	0.15	0.03	0.16	0.07	0.15	0.06	0.13	0.09	0.08	0.18	0.03	0.10	0.09	0.15	0.18	0.27	0.11	0.09	0.24	0.07	0.57	0.61	0.51
C5'	0.12	0.13	0.11	0.16	0.11	0.25	0.11	0.33	0.11	0.12	0.12	0.18	0.12	0.12	0.11	0.10	0.11	0.19	0.46	0.11	0.63	0.74	0.36
C6	0.12	0.04	0.11	0.06	0.11	0.07	0.10	0.10	0.06	0.14	0.03	0.11	0.06	0.12	0.14	0.20	0.10	0.09	0.17	0.06	0.65	0.44	0.51
N1	0.10	0.04	0.09	0.06	0.12	0.07	0.11	0.12	0.07	0.14	0.04	0.07	0.08	0.13	0.13	0.17	0.08	0.08	0.16	0.07	0.70	0.42	0.54
N3	0.13	0.10	0.14	0.07	0.18	0.06	0.17	0.09	0.12	0.19	0.09	0.04	0.16	0.17	0.19	0.25	0.10	0.09	0.26	0.10	0.60	0.63	0.58
O2	0.10	0.08	0.10	0.07	0.14	0.08	0.14	0.12	0.11	0.15	0.08	0.04	0.12	0.14	0.15	0.18	0.10	0.07	0.20	0.09	0.70	0.48	0.58
O2'	0.11	0.20	0.11	0.09	0.16	0.10	0.16	0.15	0.17	0.13	0.20	0.26	0.18	0.14	0.14	0.20	0.08	0.07	0.23	0.17	0.88	0.53	0.63
O3'	0.17	0.17	0.16	0.17	0.18	0.18	0.19	0.24	0.18	0.20	0.17	0.18	0.16	0.20	0.18	0.16	0.15	0.17	0.35	0.19	0.63	0.69	0.36
O4	0.16	0.15	0.19	0.09	0.23	0.05	0.21	0.08	0.16	0.22	0.13	0.07	0.22	0.21	0.23	0.32	0.12	0.09	0.34	0.13	0.50	0.84	0.58
O4'	0.12	0.06	0.12	0.11	0.10	0.08	0.11	0.14	0.08	0.13	0.05	0.11	0.07	0.12	0.12	0.15	0.15	0.08	0.17	0.08	0.73	0.38	0.46
O5'	0.10	0.18	0.07	0.05	0.15	0.11	0.17	0.19	0.19	0.15	0.18	0.22	0.16	0.16	0.13	0.13	0.02	0.06	0.34	0.20	0.62	0.58	0.29
OP1	0.14	0.21	0.16	0.06	0.19	0.13	0.21	0.22	0.23	0.19	0.22	0.24	0.19	0.21	0.17	0.29	0.02	0.06	0.51	0.25	0.67	0.86	0.45
OP2	0.30	0.41	0.19	0.05	0.40	0.06	0.43	0.05	0.45	0.37	0.44	0.41	0.39	0.41	0.36	0.25	0.01	0.21	0.29	0.47	0.59	0.35	0.27
P	0.15	0.22	0.11	0.02	0.20	0.06	0.22	0.12	0.23	0.20	0.23	0.24	0.20	0.22	0.18	0.17	0.01	0.07	0.35	0.25	0.61	0.51	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.12	0.08	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.20	0.04	0.44	0.56	0.22
C2	0.08	0.00	0.08	0.11	0.01	0.16	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.13	0.17	0.37	0.03	0.39	0.95	0.40
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.13	0.08	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.09	0.52	0.28	0.13
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.07	0.17	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.05	0.56	0.26	0.22
C4	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.08	0.34	0.03	0.40	0.90	0.35
C4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.12	0.22	0.15	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.48	0.34	0.22
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.04	0.39	0.03	0.43	1.02	0.40
C5'	0.04	0.19	0.06	0.02	0.12	0.01	0.11	0.00	0.12	0.10	0.16	0.23	0.17	0.11	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.11	0.44	0.33	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.12	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.12	0.07	0.07	0.41	0.01	0.40	1.11	0.44
C8	0.03	0.02	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.34	0.06	0.51	0.86	0.33
N1	0.06	0.01	0.05	0.07	0.01	0.12	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.13	0.10	0.13	0.41	0.02	0.38	1.06	0.43
N2	0.12	0.01	0.13	0.17	0.03	0.22	0.01	0.23	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.21	0.20	0.21	0.38	0.02	0.42	0.93	0.42
N3	0.08	0.01	0.08	0.11	0.00	0.15	0.01	0.17	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.14	0.11	0.16	0.33	0.04	0.40	0.86	0.36
N7	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.07	0.02	0.39	0.06	0.51	0.99	0.39
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.31	0.05	0.44	0.78	0.29
O2'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.05	0.12	0.11	0.13	0.21	0.14	0.11	0.04	0.00	0.03	0.02	0.37	0.15	0.55	0.34	0.21
O3'	0.05	0.13	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.07	0.08	0.10	0.20	0.11	0.07	0.05	0.03	0.00	0.06	0.23	0.07	0.61	0.24	0.28
O4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.13	0.21	0.16	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.29	0.04	0.40	0.76	0.38
O5'	0.20	0.37	0.31	0.32	0.34	0.02	0.39	0.01	0.41	0.34	0.41	0.38	0.33	0.39	0.31	0.37	0.23	0.29	0.00	0.43	0.02	0.03	0.01
O6	0.04	0.03	0.09	0.05	0.03	0.04	0.03	0.11	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.15	0.07	0.04	0.43	0.00	0.42	1.19	0.48
OP1	0.44	0.39	0.52	0.56	0.40	0.48	0.43	0.44	0.40	0.51	0.38	0.42	0.40	0.51	0.44	0.55	0.61	0.40	0.02	0.42	0.00	0.03	0.02
OP2	0.56	0.95	0.28	0.26	0.90	0.34	1.02	0.33	1.11	0.86	1.06	0.93	0.86	0.99	0.78	0.34	0.24	0.76	0.03	1.19	0.03	0.00	0.02
P	0.22	0.40	0.13	0.22	0.35	0.22	0.40	0.02	0.44	0.33	0.43	0.42	0.36	0.39	0.29	0.21	0.28	0.38	0.01	0.48	0.02	0.02	0.00