Doublet Group distance statistics: 55215

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.011, 0.021, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.016, 0.034, 0.052, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.018, 0.055, 0.092, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.055 std_dev=0.037
O3'	B	0, 0.190, 0.426, 0.662, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.426 std_dev=0.236
N9	B	0, 0.178, 0.429, 0.680, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.429 std_dev=0.251
C4	B	0, 0.239, 0.494, 0.748, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.494 std_dev=0.255
C2'	B	0, 0.260, 0.517, 0.774, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.517 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.093, 0.354, 0.614, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.354 std_dev=0.261
C8	B	0, 0.253, 0.537, 0.820, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.537 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.284, 0.581, 0.879, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.581 std_dev=0.298
N3	B	0, 0.230, 0.528, 0.826, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.528 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.271, 0.572, 0.874, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.572 std_dev=0.301
C5	B	0, 0.264, 0.578, 0.893, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.578 std_dev=0.315
N7	B	0, 0.275, 0.599, 0.924, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.599 std_dev=0.324
O4'	A	0, 0.099, 0.456, 0.814, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.456 std_dev=0.358
O2'	B	0, 0.286, 0.646, 1.006, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.646 std_dev=0.360
P	A	0, 0.203, 0.590, 0.977, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.590 std_dev=0.387
C6	B	0, 0.303, 0.700, 1.098, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.700 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.309, 0.723, 1.138, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.723 std_dev=0.415
C2	B	0, 0.252, 0.667, 1.081, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.667 std_dev=0.415
C2'	A	0, 0.089, 0.507, 0.924, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.507 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.294, 0.744, 1.194, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.744 std_dev=0.450
O6	B	0, 0.303, 0.789, 1.274, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.789 std_dev=0.485
O5'	A	0, 0.132, 0.618, 1.105, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.618 std_dev=0.486
N2	B	0, 0.201, 0.764, 1.326, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.764 std_dev=0.563
OP1	A	0, 0.210, 0.787, 1.364, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.787 std_dev=0.577
C4'	A	0, 0.156, 0.762, 1.367, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.762 std_dev=0.605
C5'	A	0, 0.164, 0.801, 1.437, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.801 std_dev=0.636
C5'	B	0, 0.382, 1.035, 1.688, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.035 std_dev=0.653
OP2	A	0, 0.307, 0.993, 1.678, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.993 std_dev=0.686
C3'	A	0, 0.154, 0.884, 1.614, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.884 std_dev=0.730
O2'	A	0, 0.173, 1.011, 1.849, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.011 std_dev=0.838
O3'	A	0, 0.205, 1.523, 2.841, 2.994 max_d=2.994 avg_d=1.523 std_dev=1.318
O5'	B	0, 0.556, 2.232, 3.907, 4.166 max_d=4.166 avg_d=2.232 std_dev=1.675
P	B	0, 0.635, 3.415, 6.195, 6.771 max_d=6.771 avg_d=3.415 std_dev=2.780
OP1	B	0, 0.722, 3.814, 6.906, 7.469 max_d=7.469 avg_d=3.814 std_dev=3.092
OP2	B	0, 0.556, 4.161, 7.766, 8.514 max_d=8.514 avg_d=4.161 std_dev=3.605

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.10	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.32	0.02	0.00	0.20	0.14	0.28	0.17
C2	0.02	0.00	0.14	0.27	0.02	0.07	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.25	0.10	0.02	0.06	0.08	0.06	0.43	0.18
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.13	0.24	0.16	0.02	0.10	0.27	0.00	0.03	0.06	0.01	0.50	0.47	0.65	0.53
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.35	0.00	0.31	0.01	0.24	0.22	0.33	0.23	0.01	0.01	0.39	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05
C4	0.02	0.02	0.05	0.35	0.00	0.11	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.38	0.14	0.00	0.03	0.14	0.17	0.60	0.26
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.10	0.07	0.09	0.06	0.30	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.06	0.04
C5	0.02	0.02	0.13	0.31	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.36	0.16	0.00	0.04	0.14	0.15	0.54	0.23
C5'	0.10	0.06	0.24	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.11	0.07	0.06	0.06	0.06	0.24	0.10	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.16	0.24	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.10	0.01	0.06	0.12	0.08	0.39	0.15
N1	0.00	0.01	0.02	0.22	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.09	0.02	0.01	0.10	0.07	0.36	0.15
N3	0.02	0.01	0.10	0.33	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.33	0.06	0.02	0.05	0.10	0.11	0.54	0.22
O2	0.03	0.00	0.27	0.23	0.02	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.21	0.03	0.09	0.10	0.05	0.41	0.18
O2'	0.02	0.25	0.00	0.01	0.38	0.30	0.36	0.06	0.29	0.21	0.33	0.16	0.00	0.03	0.41	0.22	0.40	0.35	0.76	0.48
O3'	0.32	0.10	0.03	0.01	0.14	0.01	0.16	0.24	0.10	0.09	0.06	0.21	0.03	0.00	0.19	0.24	0.26	0.26	0.34	0.26
O4	0.02	0.02	0.06	0.39	0.00	0.12	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.41	0.19	0.00	0.03	0.17	0.22	0.68	0.30
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.09	0.22	0.24	0.03	0.00	0.04	0.21	0.13	0.13
O5'	0.20	0.08	0.50	0.05	0.14	0.01	0.14	0.01	0.12	0.10	0.10	0.10	0.40	0.26	0.17	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.06	0.47	0.11	0.17	0.07	0.15	0.05	0.08	0.07	0.11	0.05	0.35	0.26	0.22	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.43	0.65	0.02	0.60	0.06	0.54	0.15	0.39	0.36	0.54	0.41	0.76	0.34	0.68	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.18	0.53	0.05	0.26	0.04	0.23	0.01	0.15	0.15	0.22	0.18	0.48	0.26	0.30	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.20	0.26	0.31	0.18	0.40	0.18	0.49	0.17	0.23	0.19	0.25	0.18	0.21	0.21	0.30	0.28	0.28	0.69	0.17	2.02	1.48	1.63
C2	0.22	0.13	0.23	0.27	0.15	0.41	0.16	0.46	0.13	0.22	0.13	0.20	0.12	0.20	0.20	0.33	0.25	0.32	0.62	0.14	1.76	1.28	1.47
C2'	0.36	0.24	0.44	0.39	0.29	0.31	0.29	0.33	0.26	0.35	0.24	0.22	0.27	0.32	0.33	0.54	0.41	0.32	0.32	0.26	1.62	1.00	1.18
C3'	0.11	0.20	0.13	0.17	0.15	0.17	0.15	0.22	0.17	0.10	0.20	0.23	0.17	0.11	0.11	0.16	0.17	0.15	0.31	0.17	1.56	0.95	1.12
C4	0.21	0.07	0.19	0.22	0.15	0.39	0.14	0.39	0.10	0.21	0.08	0.14	0.09	0.18	0.20	0.34	0.20	0.36	0.41	0.10	1.26	0.80	1.06
C4'	0.16	0.17	0.20	0.26	0.15	0.21	0.16	0.28	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.17	0.16	0.21	0.24	0.22	0.38	0.16	1.74	1.07	1.23
C5	0.22	0.11	0.21	0.23	0.14	0.39	0.14	0.39	0.10	0.20	0.11	0.18	0.10	0.18	0.19	0.33	0.20	0.35	0.38	0.11	1.23	0.73	1.00
C5'	0.26	0.26	0.23	0.23	0.26	0.26	0.26	0.23	0.26	0.27	0.26	0.25	0.26	0.27	0.26	0.29	0.21	0.35	0.11	0.26	1.33	0.57	0.80
C6	0.22	0.16	0.24	0.27	0.15	0.40	0.15	0.43	0.14	0.21	0.15	0.21	0.14	0.19	0.19	0.32	0.24	0.31	0.50	0.14	1.51	0.97	1.22
N1	0.22	0.17	0.24	0.29	0.16	0.40	0.16	0.46	0.15	0.22	0.16	0.23	0.15	0.20	0.20	0.32	0.27	0.31	0.61	0.15	1.77	1.25	1.45
N3	0.21	0.09	0.21	0.24	0.14	0.40	0.15	0.43	0.12	0.21	0.10	0.16	0.10	0.19	0.19	0.34	0.23	0.34	0.53	0.13	1.53	1.06	1.29
O2	0.21	0.14	0.23	0.28	0.15	0.41	0.16	0.48	0.14	0.22	0.14	0.19	0.12	0.20	0.20	0.33	0.26	0.32	0.68	0.16	1.91	1.46	1.60
O2'	0.37	0.46	0.45	0.34	0.40	0.30	0.40	0.40	0.42	0.37	0.45	0.50	0.44	0.38	0.38	0.65	0.36	0.27	0.54	0.42	2.01	1.41	1.54
O3'	0.11	0.13	0.24	0.26	0.11	0.16	0.10	0.22	0.11	0.09	0.12	0.14	0.12	0.09	0.10	0.34	0.26	0.13	0.36	0.11	1.69	1.03	1.18
O4	0.22	0.07	0.17	0.19	0.18	0.38	0.16	0.36	0.11	0.22	0.07	0.08	0.15	0.19	0.21	0.33	0.19	0.37	0.32	0.10	1.06	0.62	0.89
O4'	0.20	0.26	0.27	0.39	0.19	0.40	0.19	0.51	0.21	0.21	0.25	0.31	0.22	0.20	0.19	0.24	0.35	0.24	0.72	0.21	2.08	1.47	1.62
O5'	0.10	0.12	0.07	0.03	0.09	0.17	0.10	0.15	0.11	0.10	0.12	0.13	0.10	0.10	0.09	0.21	0.02	0.21	0.19	0.12	0.90	0.29	0.47
OP1	0.10	0.21	0.27	0.04	0.17	0.42	0.19	0.46	0.22	0.15	0.22	0.22	0.17	0.18	0.14	0.60	0.03	0.30	0.64	0.24	0.30	0.57	0.27
OP2	0.43	0.79	0.32	0.06	0.68	0.09	0.70	0.21	0.77	0.53	0.81	0.82	0.73	0.61	0.56	0.58	0.02	0.19	0.46	0.78	0.45	0.52	0.18
P	0.15	0.31	0.21	0.02	0.26	0.19	0.27	0.23	0.30	0.20	0.32	0.33	0.28	0.23	0.21	0.42	0.01	0.10	0.38	0.31	0.50	0.34	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.37	0.01	0.10	0.71	0.22
C2	0.03	0.00	0.13	0.05	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.07	0.12	0.26	0.01	0.20	0.64	0.21
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.06	0.07	0.04	0.11	0.14	0.12	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.66	0.05	0.39	1.00	0.49
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.39	0.02	0.44	0.47	0.13
C4	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.04	0.06	0.41	0.01	0.23	0.97	0.43
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.12	0.07	0.13	0.09	0.09	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.50	0.32	0.29
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.52	0.02	0.56	1.32	0.74
C5'	0.05	0.08	0.06	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.12	0.23	0.09	0.10	0.07	0.22	0.12	0.06	0.01	0.02	0.01	0.13	0.20	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.06	0.45	0.00	0.52	1.22	0.67
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.08	0.76	0.03	0.83	1.65	1.07
N1	0.03	0.00	0.11	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.06	0.09	0.34	0.01	0.26	0.90	0.39
N2	0.03	0.00	0.14	0.06	0.01	0.13	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.09	0.14	0.20	0.02	0.39	0.44	0.27
N3	0.03	0.00	0.12	0.05	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.11	0.26	0.01	0.19	0.61	0.18
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05	0.71	0.03	0.92	1.73	1.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.52	0.02	0.33	1.10	0.57
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.12	0.01	0.07	0.06	0.12	0.09	0.20	0.29	0.22	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.70	0.09	0.47	1.12	0.54
O3'	0.05	0.07	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.05	0.04	0.03	0.00	0.05	0.20	0.05	0.72	0.22	0.32
O4'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.06	0.08	0.09	0.14	0.11	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.30	0.43	0.25
O5'	0.37	0.26	0.66	0.39	0.41	0.02	0.52	0.01	0.45	0.76	0.34	0.20	0.26	0.71	0.52	0.70	0.20	0.05	0.00	0.49	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.05	0.06	0.49	0.00	0.70	1.38	0.81
OP1	0.10	0.20	0.39	0.44	0.23	0.50	0.56	0.20	0.52	0.83	0.26	0.39	0.19	0.92	0.33	0.47	0.72	0.30	0.02	0.70	0.00	0.02	0.01
OP2	0.71	0.64	1.00	0.47	0.97	0.32	1.32	0.31	1.22	1.65	0.90	0.44	0.61	1.73	1.10	1.12	0.22	0.43	0.02	1.38	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.21	0.49	0.13	0.43	0.29	0.74	0.01	0.67	1.07	0.39	0.27	0.18	1.11	0.57	0.54	0.32	0.25	0.01	0.81	0.01	0.01	0.00