Doublet Group distance statistics: 55217

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.020, 0.048, 0.075, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.048 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.017, 0.087, 0.157, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.087 std_dev=0.070
C2'	B	0, 0.425, 0.801, 1.177, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.801 std_dev=0.376
C2'	A	0, 0.484, 0.913, 1.342, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.913 std_dev=0.429
O2'	B	0, 0.612, 1.073, 1.533, 1.518 max_d=1.518 avg_d=1.073 std_dev=0.461
O4'	A	0, 0.474, 0.993, 1.513, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.993 std_dev=0.519
O2'	A	0, 0.627, 1.167, 1.706, 1.673 max_d=1.673 avg_d=1.167 std_dev=0.540
O4'	B	0, 0.634, 1.209, 1.785, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.209 std_dev=0.575
C1'	B	0, 0.905, 1.576, 2.247, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.576 std_dev=0.671
C3'	A	0, 0.798, 1.537, 2.276, 1.985 max_d=1.985 avg_d=1.537 std_dev=0.739
C3'	B	0, 0.944, 1.729, 2.514, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.729 std_dev=0.785
C4'	A	0, 0.764, 1.592, 2.419, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.592 std_dev=0.828
O3'	A	0, 1.006, 1.855, 2.704, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.855 std_dev=0.849
C4'	B	0, 1.000, 1.893, 2.785, 2.722 max_d=2.722 avg_d=1.893 std_dev=0.892
C8	B	0, 1.411, 2.652, 3.893, 3.858 max_d=3.858 avg_d=2.652 std_dev=1.241
N9	B	0, 1.421, 2.677, 3.933, 3.728 max_d=3.728 avg_d=2.677 std_dev=1.256
C5'	A	0, 1.254, 2.596, 3.939, 3.481 max_d=3.481 avg_d=2.596 std_dev=1.343
O5'	A	0, 1.227, 2.631, 4.036, 3.557 max_d=3.557 avg_d=2.631 std_dev=1.405
O5'	B	0, 1.526, 2.962, 4.398, 3.965 max_d=3.965 avg_d=2.962 std_dev=1.436
O3'	B	0, 1.396, 2.882, 4.367, 3.853 max_d=3.853 avg_d=2.882 std_dev=1.486
C5'	B	0, 1.558, 3.060, 4.563, 4.238 max_d=4.238 avg_d=3.060 std_dev=1.503
N7	B	0, 2.155, 4.232, 6.308, 5.980 max_d=5.980 avg_d=4.232 std_dev=2.077
P	A	0, 1.784, 3.896, 6.007, 5.224 max_d=5.224 avg_d=3.896 std_dev=2.112
P	B	0, 2.119, 4.322, 6.525, 5.799 max_d=5.799 avg_d=4.322 std_dev=2.203
C4	B	0, 2.227, 4.436, 6.646, 6.033 max_d=6.033 avg_d=4.436 std_dev=2.209
OP2	B	0, 2.324, 4.762, 7.200, 6.416 max_d=6.416 avg_d=4.762 std_dev=2.438
OP2	A	0, 2.192, 4.713, 7.235, 6.337 max_d=6.337 avg_d=4.713 std_dev=2.521
C5	B	0, 2.618, 5.279, 7.940, 7.253 max_d=7.253 avg_d=5.279 std_dev=2.661
N3	B	0, 2.624, 5.289, 7.955, 7.070 max_d=7.070 avg_d=5.289 std_dev=2.666
OP1	A	0, 2.484, 5.574, 8.663, 7.459 max_d=7.459 avg_d=5.574 std_dev=3.089
OP1	B	0, 2.999, 6.224, 9.450, 8.331 max_d=8.331 avg_d=6.224 std_dev=3.226
C2	B	0, 3.414, 6.990, 10.566, 9.334 max_d=9.334 avg_d=6.990 std_dev=3.576
C6	B	0, 3.457, 7.125, 10.793, 9.669 max_d=9.669 avg_d=7.125 std_dev=3.668
N1	B	0, 3.794, 7.841, 11.888, 10.495 max_d=10.495 avg_d=7.841 std_dev=4.047
N2	B	0, 3.952, 8.100, 12.247, 10.822 max_d=10.822 avg_d=8.100 std_dev=4.148
O6	B	0, 3.933, 8.165, 12.397, 11.105 max_d=11.105 avg_d=8.165 std_dev=4.232

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.01	0.10	0.25	0.06	0.20
C2	0.01	0.00	0.16	0.25	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.23	0.01	0.06	0.16	0.26	0.34	0.12
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.03	0.06	0.02	0.08	0.05	0.15	0.24	0.00	0.04	0.12	0.01	0.09	0.11	0.08	0.09
C3'	0.01	0.25	0.01	0.00	0.34	0.01	0.31	0.03	0.25	0.19	0.31	0.23	0.02	0.01	0.39	0.01	0.11	0.34	0.25	0.19
C4	0.01	0.01	0.09	0.34	0.00	0.15	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.25	0.00	0.02	0.31	0.36	0.51	0.19
C4'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.15	0.00	0.18	0.01	0.16	0.08	0.10	0.06	0.19	0.03	0.17	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.31	0.00	0.18	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.21	0.00	0.04	0.31	0.41	0.39	0.23
C5'	0.02	0.09	0.02	0.03	0.24	0.01	0.27	0.00	0.23	0.11	0.16	0.03	0.15	0.12	0.27	0.03	0.01	0.03	0.12	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.25	0.00	0.16	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.23	0.38	0.22	0.23
N1	0.00	0.00	0.05	0.19	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.01	0.14	0.30	0.20	0.17
N3	0.01	0.00	0.15	0.31	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.25	0.01	0.05	0.25	0.30	0.48	0.14
O2	0.01	0.00	0.24	0.23	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.34	0.01	0.10	0.10	0.21	0.32	0.10
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.18	0.19	0.16	0.15	0.14	0.12	0.18	0.16	0.00	0.09	0.18	0.13	0.05	0.30	0.14	0.09
O3'	0.16	0.23	0.04	0.01	0.25	0.03	0.21	0.12	0.14	0.10	0.25	0.34	0.09	0.00	0.32	0.08	0.28	0.77	0.54	0.48
O4	0.01	0.01	0.12	0.39	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.32	0.00	0.03	0.37	0.35	0.64	0.22
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.01	0.05	0.10	0.13	0.08	0.03	0.00	0.14	0.38	0.14	0.28
O5'	0.10	0.16	0.09	0.11	0.31	0.01	0.31	0.01	0.23	0.14	0.25	0.10	0.05	0.28	0.37	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.25	0.26	0.11	0.34	0.36	0.07	0.41	0.03	0.38	0.30	0.30	0.21	0.30	0.77	0.35	0.38	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.34	0.08	0.25	0.51	0.05	0.39	0.12	0.22	0.20	0.48	0.32	0.14	0.54	0.64	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.12	0.09	0.19	0.19	0.03	0.23	0.02	0.23	0.17	0.14	0.10	0.09	0.48	0.22	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.15	0.17	0.34	0.11	0.37	0.11	0.47	0.10	0.15	0.11	0.21	0.15	0.14	0.13	0.18	0.47	0.21	0.43	0.10	0.71	0.43	0.49
C2	0.13	0.70	0.11	0.35	0.40	0.57	0.42	0.69	0.56	0.17	0.69	0.84	0.55	0.27	0.21	0.23	0.55	0.32	0.48	0.58	0.83	0.33	0.54
C2'	0.35	0.47	0.36	0.40	0.41	0.43	0.44	0.46	0.48	0.36	0.49	0.48	0.43	0.40	0.37	0.37	0.41	0.36	0.46	0.50	0.63	0.51	0.51
C3'	0.20	0.48	0.19	0.14	0.34	0.15	0.38	0.15	0.47	0.22	0.51	0.52	0.39	0.30	0.24	0.27	0.10	0.18	0.21	0.50	0.36	0.38	0.28
C4	0.16	1.31	0.15	0.38	0.79	0.76	0.84	0.89	1.11	0.36	1.32	1.55	1.03	0.59	0.42	0.32	0.63	0.44	0.53	1.14	0.91	0.30	0.58
C4'	0.28	0.14	0.21	0.09	0.08	0.19	0.09	0.10	0.17	0.07	0.18	0.17	0.13	0.06	0.14	0.44	0.09	0.31	0.11	0.23	0.37	0.30	0.20
C5	0.15	1.11	0.14	0.41	0.68	0.73	0.69	0.84	0.89	0.28	1.07	1.29	0.91	0.46	0.36	0.29	0.66	0.40	0.53	0.89	0.87	0.31	0.57
C5'	0.46	0.14	0.41	0.26	0.17	0.41	0.09	0.24	0.15	0.18	0.15	0.17	0.20	0.07	0.26	0.70	0.22	0.51	0.06	0.21	0.26	0.28	0.10
C6	0.13	0.66	0.11	0.40	0.39	0.58	0.37	0.69	0.49	0.14	0.62	0.79	0.56	0.22	0.20	0.20	0.63	0.29	0.49	0.48	0.81	0.35	0.54
N1	0.14	0.50	0.13	0.36	0.28	0.51	0.26	0.62	0.36	0.12	0.46	0.61	0.41	0.16	0.16	0.19	0.56	0.27	0.47	0.35	0.79	0.37	0.52
N3	0.15	1.06	0.11	0.35	0.63	0.68	0.68	0.81	0.90	0.28	1.07	1.26	0.82	0.47	0.33	0.28	0.59	0.39	0.51	0.94	0.88	0.30	0.56
O2	0.14	0.57	0.12	0.33	0.32	0.53	0.34	0.65	0.46	0.14	0.57	0.69	0.44	0.22	0.17	0.22	0.51	0.30	0.46	0.47	0.82	0.34	0.53
O2'	0.35	0.63	0.34	0.30	0.48	0.33	0.51	0.34	0.59	0.36	0.65	0.69	0.54	0.43	0.39	0.36	0.26	0.32	0.36	0.62	0.48	0.42	0.39
O3'	0.34	0.79	0.31	0.27	0.55	0.27	0.59	0.25	0.74	0.38	0.83	0.88	0.64	0.48	0.40	0.35	0.28	0.31	0.24	0.78	0.21	0.40	0.25
O4	0.20	1.65	0.19	0.37	0.99	0.83	1.09	0.97	1.44	0.48	1.69	1.94	1.27	0.79	0.53	0.35	0.62	0.51	0.54	1.51	0.93	0.31	0.59
O4'	0.29	0.25	0.20	0.24	0.22	0.23	0.15	0.33	0.14	0.18	0.18	0.31	0.29	0.16	0.22	0.35	0.40	0.27	0.34	0.12	0.66	0.40	0.42
O5'	0.24	0.08	0.23	0.07	0.06	0.12	0.09	0.03	0.14	0.06	0.13	0.10	0.09	0.09	0.10	0.45	0.01	0.21	0.13	0.20	0.38	0.35	0.25
OP1	0.03	0.10	0.10	0.04	0.08	0.10	0.14	0.28	0.18	0.11	0.15	0.10	0.06	0.16	0.05	0.22	0.01	0.06	0.40	0.22	0.72	0.69	0.59
OP2	0.06	0.12	0.15	0.06	0.10	0.11	0.19	0.26	0.22	0.17	0.18	0.13	0.09	0.23	0.07	0.27	0.03	0.09	0.38	0.28	0.55	0.64	0.52
P	0.09	0.10	0.14	0.01	0.07	0.03	0.13	0.17	0.16	0.08	0.14	0.10	0.07	0.13	0.03	0.27	0.00	0.02	0.28	0.20	0.50	0.51	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.16	0.12
C2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.13	0.04	0.19	0.01	0.26	0.43	0.32
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.08	0.05	0.04
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.14	0.13	0.10
C4	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.03	0.19	0.01	0.25	0.39	0.30
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.02	0.01	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.03	0.24	0.01	0.36	0.48	0.37
C5'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.17	0.13	0.07	0.07	0.19	0.10	0.05	0.06	0.00	0.01	0.19	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.26	0.00	0.40	0.53	0.41
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.24	0.01	0.31	0.35	0.31
N1	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.04	0.23	0.01	0.34	0.50	0.38
N2	0.01	0.01	0.11	0.10	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.05	0.17	0.01	0.23	0.42	0.30
N3	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.10	0.04	0.16	0.01	0.20	0.37	0.27
N7	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.27	0.01	0.41	0.49	0.39
N9	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.01	0.20	0.29	0.24
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.05	0.09	0.01	0.12	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.09	0.14	0.05	0.04
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.06	0.11	0.05	0.13	0.15	0.10	0.06	0.03	0.04	0.00	0.02	0.13	0.12	0.28	0.26	0.20
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.10	0.08
O5'	0.08	0.19	0.03	0.07	0.19	0.02	0.24	0.01	0.26	0.24	0.23	0.17	0.16	0.27	0.17	0.03	0.13	0.03	0.00	0.28	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.28	0.00	0.47	0.58	0.45
OP1	0.06	0.26	0.08	0.14	0.25	0.08	0.36	0.07	0.40	0.31	0.34	0.23	0.20	0.41	0.20	0.14	0.28	0.04	0.01	0.47	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.43	0.05	0.13	0.39	0.02	0.48	0.02	0.53	0.35	0.50	0.42	0.37	0.49	0.29	0.05	0.26	0.10	0.02	0.58	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.32	0.04	0.10	0.30	0.01	0.37	0.01	0.41	0.31	0.38	0.30	0.27	0.39	0.24	0.04	0.20	0.08	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00