Doublet Group distance statistics: 55224

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.001, 0.016, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.001, 0.032, 0.062, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.032 std_dev=0.030
O4	A	0, -0.001, 0.029, 0.060, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.029 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.017, 0.115, 0.213, 0.262 max_d=0.262 avg_d=0.115 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.020, 0.145, 0.270, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.145 std_dev=0.125
O2'	A	0, 0.043, 0.179, 0.314, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.179 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.027, 0.209, 0.390, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.209 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.021, 0.214, 0.407, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.214 std_dev=0.193
O5'	A	0, 0.052, 0.322, 0.593, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.322 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.025, 0.307, 0.589, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.307 std_dev=0.282
C5'	A	0, 0.058, 0.347, 0.635, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.347 std_dev=0.288
C3'	B	0, 0.068, 0.358, 0.648, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.358 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.068, 0.394, 0.719, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.394 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.077, 0.413, 0.748, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.413 std_dev=0.335
O3'	B	0, 0.083, 0.436, 0.789, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.436 std_dev=0.353
P	A	0, 0.071, 0.460, 0.849, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.460 std_dev=0.389
N9	B	0, 0.095, 0.485, 0.875, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.485 std_dev=0.390
C4'	B	0, 0.101, 0.496, 0.890, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.496 std_dev=0.394
O4'	B	0, 0.102, 0.516, 0.930, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.516 std_dev=0.414
OP2	A	0, 0.035, 0.460, 0.886, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.460 std_dev=0.426
O2'	B	0, 0.098, 0.543, 0.987, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.543 std_dev=0.444
C8	B	0, 0.089, 0.569, 1.050, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.569 std_dev=0.480
C4	B	0, 0.109, 0.603, 1.098, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.603 std_dev=0.494
C5'	B	0, 0.130, 0.648, 1.165, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.648 std_dev=0.518
O5'	B	0, 0.029, 0.564, 1.099, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.564 std_dev=0.535
N3	B	0, 0.065, 0.639, 1.213, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.639 std_dev=0.574
N7	B	0, 0.136, 0.719, 1.302, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.719 std_dev=0.583
C5	B	0, 0.147, 0.743, 1.338, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.743 std_dev=0.595
OP1	A	0, 0.090, 0.754, 1.419, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.754 std_dev=0.665
C2	B	0, 0.102, 0.808, 1.513, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.808 std_dev=0.706
C6	B	0, 0.178, 0.921, 1.665, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.921 std_dev=0.744
N1	B	0, 0.161, 0.940, 1.719, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.940 std_dev=0.779
OP1	B	0, 0.098, 0.893, 1.688, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.893 std_dev=0.795
N2	B	0, 0.081, 0.898, 1.715, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.898 std_dev=0.817
P	B	0, -0.028, 0.816, 1.660, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.816 std_dev=0.844
O6	B	0, 0.214, 1.075, 1.936, 1.857 max_d=1.857 avg_d=1.075 std_dev=0.861
OP2	B	0, -0.008, 1.034, 2.076, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.034 std_dev=1.042

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.03	0.18	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.01	0.10	0.15	0.32	0.15
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.10	0.00	0.03	0.07	0.01	0.05	0.06	0.15	0.06
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.12	0.01	0.02	0.06	0.02	0.06	0.08	0.10	0.06
C4	0.02	0.03	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.09	0.01	0.01	0.12	0.28	0.42	0.24
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01
C5	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.11	0.24	0.39	0.22
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.06	0.06	0.03	0.09	0.01	0.00	0.11	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.15	0.29	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.09	0.11	0.27	0.12
N3	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.11	0.03	0.01	0.12	0.23	0.39	0.21
O2	0.04	0.01	0.10	0.12	0.04	0.07	0.04	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.07	0.14	0.05	0.03	0.09	0.12	0.30	0.13
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.06	0.07	0.00	0.05	0.07	0.06	0.04	0.07	0.13	0.05
O3'	0.03	0.11	0.03	0.02	0.09	0.01	0.05	0.03	0.03	0.06	0.11	0.14	0.05	0.00	0.10	0.02	0.05	0.09	0.05	0.05
O4	0.03	0.04	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.10	0.00	0.01	0.12	0.33	0.44	0.27
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.05	0.10	0.10	0.03
O5'	0.04	0.10	0.05	0.06	0.12	0.01	0.11	0.00	0.09	0.09	0.12	0.09	0.04	0.05	0.12	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.03	0.15	0.06	0.08	0.28	0.08	0.24	0.11	0.15	0.11	0.23	0.12	0.07	0.09	0.33	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.32	0.15	0.10	0.42	0.06	0.39	0.01	0.29	0.27	0.39	0.30	0.13	0.05	0.44	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.15	0.06	0.06	0.24	0.01	0.22	0.01	0.16	0.12	0.21	0.13	0.05	0.05	0.27	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.58	0.07	0.13	0.44	0.06	0.60	0.22	0.74	0.37	0.74	0.52	0.40	0.53	0.27	0.43	0.08	0.05	0.39	0.81	0.30	0.59	0.43
C2	0.09	0.28	0.16	0.12	0.36	0.14	0.61	0.34	0.74	0.46	0.58	0.12	0.18	0.64	0.28	0.42	0.07	0.15	0.52	0.87	0.53	0.80	0.63
C2'	0.01	0.57	0.08	0.11	0.43	0.05	0.60	0.22	0.76	0.36	0.75	0.54	0.39	0.54	0.26	0.43	0.06	0.04	0.42	0.86	0.33	0.65	0.47
C3'	0.03	0.50	0.10	0.08	0.36	0.02	0.49	0.19	0.62	0.27	0.63	0.49	0.35	0.42	0.20	0.42	0.05	0.03	0.38	0.70	0.26	0.54	0.39
C4	0.11	0.24	0.24	0.09	0.13	0.17	0.32	0.41	0.28	0.38	0.07	0.39	0.23	0.50	0.16	0.39	0.12	0.19	0.57	0.43	0.64	0.88	0.72
C4'	0.07	0.52	0.09	0.06	0.34	0.08	0.42	0.09	0.56	0.19	0.60	0.55	0.38	0.32	0.16	0.42	0.06	0.08	0.24	0.61	0.09	0.37	0.22
C5	0.04	0.08	0.24	0.06	0.09	0.15	0.27	0.39	0.25	0.30	0.09	0.19	0.09	0.38	0.12	0.38	0.11	0.17	0.55	0.34	0.54	0.75	0.63
C5'	0.13	0.38	0.15	0.02	0.22	0.12	0.26	0.05	0.36	0.09	0.41	0.42	0.28	0.16	0.09	0.39	0.08	0.13	0.17	0.39	0.07	0.24	0.12
C6	0.01	0.20	0.18	0.09	0.26	0.11	0.41	0.32	0.44	0.32	0.34	0.10	0.13	0.42	0.19	0.42	0.08	0.12	0.47	0.51	0.42	0.65	0.52
N1	0.03	0.36	0.14	0.12	0.37	0.10	0.56	0.30	0.66	0.39	0.57	0.21	0.23	0.55	0.26	0.43	0.07	0.10	0.47	0.74	0.42	0.69	0.53
N3	0.12	0.17	0.22	0.10	0.24	0.16	0.51	0.38	0.58	0.45	0.30	0.33	0.19	0.62	0.24	0.42	0.09	0.18	0.56	0.75	0.61	0.87	0.70
O2	0.11	0.41	0.13	0.14	0.41	0.14	0.68	0.34	0.85	0.49	0.73	0.24	0.26	0.69	0.31	0.41	0.07	0.15	0.52	1.01	0.53	0.82	0.63
O2'	0.05	0.68	0.07	0.12	0.46	0.09	0.63	0.17	0.82	0.36	0.85	0.69	0.46	0.55	0.27	0.42	0.08	0.08	0.35	0.93	0.24	0.58	0.38
O3'	0.04	0.53	0.09	0.06	0.37	0.04	0.50	0.17	0.65	0.26	0.66	0.54	0.37	0.42	0.20	0.40	0.06	0.05	0.35	0.73	0.22	0.50	0.34
O4	0.14	0.45	0.26	0.11	0.19	0.19	0.21	0.44	0.15	0.35	0.32	0.58	0.37	0.44	0.16	0.37	0.14	0.22	0.60	0.21	0.73	0.96	0.79
O4'	0.02	0.57	0.05	0.13	0.40	0.06	0.50	0.14	0.62	0.27	0.65	0.56	0.42	0.41	0.22	0.43	0.09	0.04	0.29	0.66	0.16	0.44	0.29
O5'	0.09	0.30	0.11	0.10	0.22	0.09	0.25	0.24	0.30	0.14	0.32	0.30	0.25	0.19	0.14	0.26	0.01	0.10	0.33	0.32	0.18	0.36	0.29
OP1	0.02	0.22	0.04	0.02	0.13	0.06	0.19	0.12	0.21	0.24	0.20	0.27	0.19	0.27	0.11	0.08	0.02	0.04	0.20	0.24	0.26	0.32	0.21
OP2	0.16	0.38	0.25	0.03	0.33	0.22	0.38	0.48	0.41	0.28	0.41	0.38	0.33	0.35	0.26	0.21	0.01	0.12	0.44	0.42	0.45	0.36	0.42
P	0.06	0.18	0.11	0.02	0.14	0.10	0.17	0.22	0.18	0.17	0.18	0.20	0.16	0.19	0.12	0.12	0.01	0.06	0.25	0.20	0.08	0.23	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.07	0.17	0.11
C2	0.03	0.00	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.11	0.20	0.03	0.08	0.01	0.07	0.21	0.11
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.15	0.14	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.08	0.14	0.06
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.13	0.11	0.17	0.14	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.07	0.13	0.16	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.02	0.04	0.19	0.10
C4'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.05	0.08	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.05	0.02	0.04	0.19	0.10
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.09	0.05	0.09	0.07	0.08	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.11	0.02	0.05	0.01	0.06	0.21	0.11
C8	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.02	0.10	0.05	0.02	0.14	0.07
N1	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.16	0.02	0.06	0.01	0.07	0.21	0.12
N2	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.12	0.25	0.03	0.08	0.01	0.08	0.22	0.12
N3	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.19	0.03	0.08	0.00	0.07	0.20	0.11
N7	0.00	0.02	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.01	0.08	0.05	0.04	0.16	0.10
N9	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.04	0.03	0.17	0.08
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.08	0.12	0.11	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.10	0.11	0.05
O3'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.09	0.01	0.08	0.03	0.11	0.14	0.16	0.25	0.19	0.12	0.04	0.03	0.00	0.01	0.14	0.11	0.20	0.20	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.04	0.13	0.21	0.17
O5'	0.07	0.08	0.05	0.10	0.06	0.02	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06	0.08	0.08	0.08	0.05	0.03	0.14	0.16	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01
O6	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.06	0.11	0.04	0.06	0.00	0.08	0.20	0.12
OP1	0.07	0.07	0.08	0.13	0.04	0.10	0.04	0.09	0.06	0.02	0.07	0.08	0.07	0.04	0.03	0.10	0.20	0.13	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.21	0.14	0.16	0.19	0.07	0.19	0.03	0.21	0.14	0.21	0.22	0.20	0.16	0.17	0.11	0.20	0.21	0.03	0.20	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.11	0.06	0.09	0.10	0.04	0.10	0.01	0.11	0.07	0.12	0.12	0.11	0.10	0.08	0.05	0.13	0.17	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00