Doublet Group distance statistics: 55225

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.031 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.011, 0.031, 0.052, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.016, 0.039, 0.062, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.022, 0.064, 0.106, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.064 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.227, 0.560, 0.892, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.560 std_dev=0.332
O3'	B	0, 0.263, 0.632, 1.001, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.632 std_dev=0.369
C2'	A	0, 0.216, 0.591, 0.965, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.591 std_dev=0.374
C3'	B	0, 0.301, 0.716, 1.131, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.716 std_dev=0.415
C2'	B	0, 0.324, 0.795, 1.266, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.795 std_dev=0.471
O2'	B	0, 0.334, 0.884, 1.433, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.884 std_dev=0.549
C4'	B	0, 0.377, 0.927, 1.476, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.927 std_dev=0.550
C1'	B	0, 0.394, 0.982, 1.570, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.982 std_dev=0.588
C4'	A	0, 0.392, 0.996, 1.600, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.996 std_dev=0.604
C5'	B	0, 0.441, 1.070, 1.698, 1.525 max_d=1.525 avg_d=1.070 std_dev=0.629
O4'	B	0, 0.414, 1.051, 1.688, 1.664 max_d=1.664 avg_d=1.051 std_dev=0.637
C3'	A	0, 0.406, 1.096, 1.786, 1.709 max_d=1.709 avg_d=1.096 std_dev=0.690
C5'	A	0, 0.514, 1.217, 1.919, 1.661 max_d=1.661 avg_d=1.217 std_dev=0.703
O5'	A	0, 0.455, 1.172, 1.889, 1.949 max_d=1.949 avg_d=1.172 std_dev=0.717
O5'	B	0, 0.413, 1.134, 1.855, 1.985 max_d=1.985 avg_d=1.134 std_dev=0.721
N9	B	0, 0.510, 1.234, 1.957, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.234 std_dev=0.723
O2'	A	0, 0.185, 0.918, 1.650, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.918 std_dev=0.732
C4	B	0, 0.472, 1.275, 2.078, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.275 std_dev=0.803
P	A	0, 0.442, 1.259, 2.077, 2.289 max_d=2.289 avg_d=1.259 std_dev=0.818
N3	B	0, 0.261, 1.141, 2.022, 2.469 max_d=2.469 avg_d=1.141 std_dev=0.880
C5	B	0, 0.637, 1.599, 2.562, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.599 std_dev=0.963
C8	B	0, 0.585, 1.573, 2.560, 2.595 max_d=2.595 avg_d=1.573 std_dev=0.987
P	B	0, 0.427, 1.464, 2.501, 2.930 max_d=2.930 avg_d=1.464 std_dev=1.037
N7	B	0, 0.723, 1.801, 2.879, 2.838 max_d=2.838 avg_d=1.801 std_dev=1.078
OP2	B	0, 0.638, 1.731, 2.824, 3.009 max_d=3.009 avg_d=1.731 std_dev=1.093
C2	B	0, 0.160, 1.293, 2.425, 3.111 max_d=3.111 avg_d=1.293 std_dev=1.133
C6	B	0, 0.566, 1.711, 2.856, 3.174 max_d=3.174 avg_d=1.711 std_dev=1.145
OP2	A	0, 0.505, 1.686, 2.867, 3.339 max_d=3.339 avg_d=1.686 std_dev=1.181
O3'	A	0, 0.617, 1.807, 2.997, 2.923 max_d=2.923 avg_d=1.807 std_dev=1.190
OP1	A	0, 0.497, 1.713, 2.928, 3.436 max_d=3.436 avg_d=1.713 std_dev=1.216
N1	B	0, 0.239, 1.488, 2.737, 3.446 max_d=3.446 avg_d=1.488 std_dev=1.249
N2	B	0, 0.199, 1.461, 2.723, 3.480 max_d=3.480 avg_d=1.461 std_dev=1.262
O6	B	0, 0.719, 2.019, 3.320, 3.558 max_d=3.558 avg_d=2.019 std_dev=1.301
OP1	B	0, 0.257, 1.672, 3.086, 3.916 max_d=3.916 avg_d=1.672 std_dev=1.414

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.30	0.01	0.00	0.12	0.06	0.31	0.17
C2	0.02	0.00	0.07	0.16	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.22	0.01	0.04	0.05	0.10	0.45	0.16
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.21	0.11	0.02	0.04	0.14	0.00	0.02	0.04	0.02	0.45	0.42	0.58	0.50
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.27	0.00	0.29	0.02	0.25	0.17	0.22	0.11	0.01	0.00	0.29	0.01	0.08	0.15	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.27	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.34	0.09	0.00	0.03	0.13	0.18	0.54	0.18
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.05	0.03	0.26	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.09	0.29	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.14	0.01	0.01	0.15	0.17	0.47	0.16
C5'	0.08	0.06	0.21	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.07	0.06	0.04	0.18	0.09	0.01	0.01	0.05	0.18	0.03
C6	0.02	0.01	0.11	0.25	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.26	0.09	0.01	0.01	0.10	0.12	0.39	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.12	0.01	0.01	0.03	0.08	0.38	0.14
N3	0.02	0.00	0.04	0.22	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.30	0.13	0.01	0.04	0.08	0.14	0.51	0.16
O2	0.04	0.00	0.14	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.37	0.02	0.06	0.07	0.07	0.44	0.17
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.34	0.26	0.32	0.04	0.26	0.20	0.30	0.16	0.00	0.02	0.36	0.18	0.37	0.30	0.64	0.46
O3'	0.30	0.22	0.02	0.00	0.09	0.02	0.14	0.18	0.09	0.12	0.13	0.37	0.02	0.00	0.12	0.22	0.14	0.13	0.46	0.21
O4	0.01	0.01	0.04	0.29	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.36	0.12	0.00	0.03	0.16	0.20	0.58	0.20
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.18	0.22	0.03	0.00	0.06	0.18	0.06	0.02
O5'	0.12	0.05	0.45	0.08	0.13	0.01	0.15	0.01	0.10	0.03	0.08	0.07	0.37	0.14	0.16	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.10	0.42	0.15	0.18	0.06	0.17	0.05	0.12	0.08	0.14	0.07	0.30	0.13	0.20	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.45	0.58	0.08	0.54	0.11	0.47	0.18	0.39	0.38	0.51	0.44	0.64	0.46	0.58	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.17	0.16	0.50	0.07	0.18	0.03	0.16	0.03	0.13	0.14	0.16	0.17	0.46	0.21	0.20	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.65	0.33	0.24	0.57	0.19	0.59	0.14	0.64	0.47	0.67	0.67	0.60	0.53	0.48	0.36	0.25	0.29	0.19	0.66	0.36	0.20	0.21
C2	0.23	0.57	0.26	0.14	0.44	0.17	0.48	0.21	0.56	0.34	0.60	0.62	0.48	0.42	0.33	0.41	0.15	0.13	0.22	0.58	0.34	0.14	0.22
C2'	0.45	0.56	0.43	0.44	0.52	0.40	0.52	0.39	0.54	0.45	0.56	0.58	0.55	0.48	0.48	0.40	0.44	0.42	0.17	0.54	0.07	0.15	0.11
C3'	0.13	0.24	0.04	0.10	0.18	0.23	0.18	0.24	0.20	0.12	0.23	0.27	0.22	0.14	0.15	0.17	0.06	0.23	0.29	0.20	0.36	0.43	0.30
C4	0.18	0.43	0.22	0.15	0.28	0.39	0.32	0.41	0.40	0.22	0.45	0.52	0.32	0.27	0.20	0.44	0.13	0.40	0.19	0.42	0.26	0.14	0.18
C4'	0.48	0.62	0.28	0.27	0.58	0.43	0.60	0.39	0.63	0.52	0.64	0.62	0.59	0.56	0.53	0.16	0.23	0.54	0.22	0.64	0.38	0.31	0.22
C5	0.16	0.47	0.23	0.14	0.32	0.33	0.34	0.33	0.41	0.23	0.46	0.53	0.39	0.28	0.22	0.44	0.13	0.31	0.17	0.42	0.25	0.14	0.17
C5'	0.56	0.65	0.35	0.35	0.62	0.54	0.62	0.48	0.64	0.54	0.66	0.65	0.64	0.57	0.58	0.21	0.31	0.64	0.24	0.64	0.36	0.35	0.23
C6	0.25	0.55	0.27	0.15	0.44	0.16	0.45	0.18	0.50	0.32	0.55	0.59	0.50	0.38	0.34	0.40	0.15	0.12	0.16	0.51	0.28	0.14	0.18
N1	0.29	0.60	0.29	0.16	0.49	0.11	0.51	0.13	0.57	0.38	0.61	0.64	0.54	0.44	0.39	0.39	0.18	0.12	0.20	0.59	0.33	0.16	0.21
N3	0.17	0.50	0.23	0.12	0.34	0.31	0.39	0.34	0.48	0.26	0.53	0.57	0.39	0.33	0.24	0.43	0.12	0.28	0.21	0.50	0.30	0.12	0.20
O2	0.26	0.59	0.27	0.15	0.47	0.13	0.52	0.18	0.60	0.38	0.63	0.63	0.50	0.46	0.36	0.40	0.17	0.12	0.24	0.63	0.38	0.15	0.24
O2'	0.49	0.76	0.47	0.42	0.64	0.34	0.64	0.30	0.70	0.51	0.75	0.81	0.70	0.56	0.55	0.51	0.43	0.39	0.15	0.70	0.26	0.18	0.15
O3'	0.11	0.35	0.14	0.07	0.23	0.21	0.22	0.21	0.28	0.10	0.34	0.42	0.30	0.14	0.15	0.36	0.10	0.28	0.39	0.27	0.58	0.61	0.44
O4	0.25	0.31	0.20	0.18	0.21	0.49	0.25	0.51	0.31	0.22	0.35	0.41	0.20	0.24	0.20	0.45	0.14	0.55	0.19	0.34	0.24	0.19	0.18
O4'	0.52	0.77	0.35	0.24	0.70	0.27	0.73	0.20	0.79	0.61	0.80	0.76	0.72	0.68	0.62	0.33	0.23	0.45	0.23	0.80	0.45	0.25	0.26
O5'	0.07	0.23	0.04	0.02	0.13	0.10	0.10	0.09	0.14	0.02	0.20	0.28	0.21	0.03	0.07	0.12	0.01	0.11	0.46	0.12	0.47	0.60	0.46
OP1	0.10	0.15	0.09	0.08	0.09	0.19	0.07	0.20	0.08	0.09	0.12	0.19	0.14	0.09	0.08	0.17	0.02	0.16	0.73	0.07	0.63	0.86	0.70
OP2	0.17	0.45	0.16	0.03	0.27	0.03	0.25	0.07	0.29	0.29	0.38	0.58	0.41	0.28	0.21	0.26	0.02	0.08	0.43	0.28	0.44	0.74	0.51
P	0.07	0.25	0.08	0.01	0.13	0.08	0.10	0.09	0.13	0.12	0.20	0.32	0.22	0.11	0.07	0.15	0.00	0.06	0.49	0.11	0.45	0.69	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.53	0.03	0.54	0.31	0.45
C2	0.03	0.00	0.15	0.07	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.35	0.19	0.24	0.53	0.01	0.59	0.62	0.53
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.03	0.16	0.10	0.20	0.15	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01	0.43	0.03	0.52	0.15	0.34
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.11	0.04	0.10	0.07	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.21	0.34	0.10
C4	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.10	0.13	0.66	0.01	0.68	0.64	0.63
C4'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.03	0.14	0.19	0.15	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.23	0.23	0.02
C5	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.78	0.01	0.81	0.81	0.77
C5'	0.01	0.22	0.03	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.15	0.05	0.20	0.25	0.19	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.15	0.35	0.33	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.11	0.75	0.00	0.81	0.85	0.77
C8	0.01	0.01	0.16	0.11	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.04	0.11	0.90	0.02	0.87	0.77	0.85
N1	0.03	0.01	0.10	0.04	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.15	0.19	0.64	0.01	0.70	0.75	0.66
N2	0.03	0.00	0.20	0.10	0.01	0.19	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.45	0.23	0.29	0.44	0.01	0.51	0.55	0.45
N3	0.03	0.00	0.15	0.07	0.00	0.15	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.18	0.24	0.51	0.00	0.56	0.53	0.49
N7	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.02	0.04	0.89	0.02	0.91	0.89	0.90
N9	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.72	0.02	0.71	0.57	0.65
O2'	0.01	0.35	0.00	0.01	0.15	0.00	0.05	0.04	0.12	0.21	0.26	0.45	0.34	0.15	0.02	0.00	0.00	0.01	0.38	0.07	0.49	0.19	0.33
O3'	0.06	0.19	0.01	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.15	0.23	0.18	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.20	0.07	0.18	0.40	0.21
O4'	0.00	0.24	0.01	0.01	0.13	0.00	0.07	0.01	0.11	0.11	0.19	0.29	0.24	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.43	0.09	0.46	0.22	0.36
O5'	0.53	0.53	0.43	0.07	0.66	0.03	0.78	0.01	0.75	0.90	0.64	0.44	0.51	0.89	0.72	0.38	0.20	0.43	0.00	0.80	0.01	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.07	0.09	0.80	0.00	0.87	0.93	0.84
OP1	0.54	0.59	0.52	0.21	0.68	0.23	0.81	0.35	0.81	0.87	0.70	0.51	0.56	0.91	0.71	0.49	0.18	0.46	0.01	0.87	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.62	0.15	0.34	0.64	0.23	0.81	0.33	0.85	0.77	0.75	0.55	0.53	0.89	0.57	0.19	0.40	0.22	0.03	0.93	0.01	0.00	0.00
P	0.45	0.53	0.34	0.10	0.63	0.02	0.77	0.01	0.77	0.85	0.66	0.45	0.49	0.90	0.65	0.33	0.21	0.36	0.01	0.84	0.00	0.00	0.00