Doublet Group distance statistics: 55230

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.003, 0.022, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.004, 0.026, 0.047, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.002, 0.029, 0.055, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.002, 0.032, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.032 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.014, 0.049, 0.085, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.049 std_dev=0.036
C4	B	0, 0.082, 0.274, 0.467, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.274 std_dev=0.192
C1'	B	0, 0.089, 0.311, 0.533, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.311 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.049, 0.297, 0.545, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.297 std_dev=0.248
N9	B	0, 0.088, 0.339, 0.591, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.339 std_dev=0.251
O2'	B	0, 0.067, 0.338, 0.609, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.338 std_dev=0.271
C5	B	0, 0.073, 0.388, 0.703, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.388 std_dev=0.315
C2'	A	0, 0.058, 0.375, 0.692, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.375 std_dev=0.317
O4'	A	0, 0.029, 0.369, 0.709, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.369 std_dev=0.340
OP1	A	0, 0.092, 0.441, 0.790, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.441 std_dev=0.349
C3'	B	0, 0.079, 0.459, 0.840, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.459 std_dev=0.381
O4'	B	0, 0.095, 0.486, 0.877, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.486 std_dev=0.391
C4'	A	0, 0.043, 0.445, 0.846, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.445 std_dev=0.402
C6	B	0, 0.065, 0.472, 0.880, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.472 std_dev=0.408
P	A	0, 0.083, 0.505, 0.926, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.505 std_dev=0.422
C4'	B	0, 0.109, 0.565, 1.022, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.565 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.080, 0.542, 1.005, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.542 std_dev=0.462
N3	B	0, 0.046, 0.535, 1.025, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.535 std_dev=0.489
O2'	A	0, 0.050, 0.549, 1.048, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.549 std_dev=0.499
C3'	A	0, 0.049, 0.559, 1.070, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.559 std_dev=0.510
O5'	A	0, 0.076, 0.616, 1.157, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.616 std_dev=0.540
O6	B	0, -0.020, 0.542, 1.104, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.542 std_dev=0.562
C8	B	0, 0.104, 0.685, 1.267, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.685 std_dev=0.581
N7	B	0, 0.106, 0.692, 1.278, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.692 std_dev=0.586
N1	B	0, 0.071, 0.673, 1.275, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.673 std_dev=0.602
C5'	B	0, 0.107, 0.793, 1.479, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.793 std_dev=0.686
C2	B	0, 0.037, 0.743, 1.449, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.743 std_dev=0.706
OP2	A	0, 0.049, 0.770, 1.490, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.770 std_dev=0.721
O3'	A	0, 0.041, 0.791, 1.541, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.791 std_dev=0.750
C5'	A	0, 0.086, 0.905, 1.725, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.905 std_dev=0.820
O5'	B	0, 0.110, 0.961, 1.811, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.961 std_dev=0.851
N2	B	0, 0.004, 1.105, 2.207, 2.699 max_d=2.699 avg_d=1.105 std_dev=1.101
P	B	0, 0.104, 1.358, 2.612, 2.620 max_d=2.620 avg_d=1.358 std_dev=1.254
OP1	B	0, 0.149, 1.528, 2.906, 2.911 max_d=2.911 avg_d=1.528 std_dev=1.378
OP2	B	0, 0.126, 1.509, 2.893, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.509 std_dev=1.384

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.17	0.53	0.22
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.03	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.02	0.31	0.16	0.39	0.13
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.10	0.02	0.14	0.01	0.14	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.34	0.13	0.33	0.05
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.14	0.01	0.22	0.01	0.23	0.09	0.09	0.20	0.02	0.01	0.14	0.01	0.47	0.36	0.18	0.21
C4	0.03	0.03	0.10	0.14	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.03	0.01	0.03	0.09	0.18	0.02	0.05	0.45	0.19	0.20	0.16
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.08	0.07	0.08	0.03	0.07	0.01	0.02	0.03	0.49	0.15
C5	0.01	0.01	0.14	0.22	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.26	0.00	0.09	0.46	0.18	0.16	0.16
C5'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.05	0.14	0.12	0.08	0.04	0.15	0.01	0.02	0.22	0.42	0.02
C6	0.02	0.01	0.14	0.23	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.25	0.00	0.09	0.42	0.15	0.28	0.11
N1	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.04	0.32	0.14	0.41	0.12
N3	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.36	0.18	0.32	0.13
O2	0.04	0.01	0.15	0.20	0.03	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.22	0.02	0.03	0.25	0.15	0.44	0.15
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.09	0.08	0.07	0.08	0.06	0.03	0.07	0.12	0.00	0.03	0.08	0.05	0.20	0.09	0.38	0.12
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.18	0.03	0.26	0.04	0.25	0.08	0.10	0.22	0.03	0.00	0.18	0.02	0.44	0.50	0.08	0.26
O4	0.01	0.02	0.08	0.14	0.02	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.00	0.07	0.46	0.20	0.17	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.09	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.07	0.00	0.08	0.28	0.69	0.38
O5'	0.15	0.31	0.34	0.47	0.45	0.02	0.46	0.02	0.42	0.32	0.36	0.25	0.20	0.44	0.46	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01
OP1	0.17	0.16	0.13	0.36	0.19	0.03	0.18	0.22	0.15	0.14	0.18	0.15	0.09	0.50	0.20	0.28	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.53	0.39	0.33	0.18	0.20	0.49	0.16	0.42	0.28	0.41	0.32	0.44	0.38	0.08	0.17	0.69	0.04	0.02	0.00	0.00
P	0.22	0.13	0.05	0.21	0.16	0.15	0.16	0.02	0.11	0.12	0.13	0.15	0.12	0.26	0.18	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.53	0.01	0.27	0.10	0.26	0.06	0.42	0.08	0.29	0.34	0.79	0.42	0.28	0.09	0.17	0.31	0.14	0.06	0.04	0.10	0.19	0.04
C2	0.08	0.60	0.12	0.12	0.16	0.15	0.04	0.32	0.14	0.25	0.46	0.81	0.45	0.27	0.07	0.23	0.13	0.09	0.32	0.04	0.29	0.15	0.27
C2'	0.01	0.43	0.06	0.12	0.08	0.13	0.08	0.27	0.03	0.25	0.26	0.68	0.34	0.27	0.05	0.22	0.16	0.05	0.20	0.08	0.12	0.08	0.11
C3'	0.22	0.53	0.29	0.12	0.24	0.08	0.08	0.11	0.14	0.11	0.35	0.75	0.50	0.16	0.12	0.47	0.12	0.15	0.32	0.11	0.17	0.17	0.18
C4	0.16	0.44	0.22	0.13	0.10	0.19	0.08	0.30	0.23	0.33	0.39	0.55	0.32	0.36	0.13	0.27	0.08	0.19	0.46	0.28	0.49	0.35	0.43
C4'	0.20	0.60	0.27	0.05	0.25	0.09	0.08	0.30	0.16	0.17	0.39	0.85	0.56	0.20	0.10	0.51	0.12	0.07	0.09	0.09	0.16	0.41	0.16
C5	0.16	0.36	0.23	0.15	0.05	0.21	0.19	0.34	0.25	0.41	0.31	0.47	0.27	0.44	0.15	0.27	0.10	0.21	0.38	0.32	0.40	0.18	0.32
C5'	0.45	0.68	0.57	0.28	0.39	0.21	0.19	0.16	0.25	0.09	0.46	0.91	0.70	0.17	0.27	0.86	0.30	0.31	0.18	0.20	0.15	0.51	0.19
C6	0.12	0.39	0.18	0.13	0.06	0.21	0.17	0.36	0.16	0.40	0.27	0.54	0.32	0.40	0.14	0.26	0.06	0.17	0.24	0.22	0.23	0.03	0.16
N1	0.06	0.53	0.11	0.14	0.12	0.18	0.06	0.35	0.10	0.30	0.36	0.73	0.43	0.30	0.07	0.24	0.14	0.10	0.22	0.08	0.19	0.02	0.15
N3	0.11	0.54	0.15	0.10	0.14	0.16	0.03	0.31	0.17	0.28	0.46	0.70	0.39	0.30	0.10	0.23	0.08	0.14	0.40	0.09	0.41	0.29	0.38
O2	0.07	0.65	0.09	0.14	0.18	0.14	0.10	0.31	0.19	0.22	0.51	0.93	0.47	0.24	0.07	0.22	0.18	0.06	0.30	0.13	0.25	0.14	0.25
O2'	0.18	0.24	0.18	0.32	0.09	0.31	0.21	0.40	0.15	0.36	0.13	0.51	0.15	0.37	0.21	0.08	0.36	0.23	0.06	0.23	0.07	0.19	0.07
O3'	0.17	0.43	0.23	0.10	0.17	0.09	0.05	0.11	0.09	0.13	0.27	0.65	0.40	0.18	0.08	0.40	0.12	0.13	0.32	0.09	0.19	0.23	0.21
O4	0.17	0.38	0.23	0.16	0.09	0.20	0.07	0.29	0.27	0.30	0.39	0.48	0.26	0.31	0.14	0.26	0.11	0.22	0.54	0.37	0.62	0.53	0.56
O4'	0.10	0.63	0.16	0.24	0.23	0.24	0.06	0.46	0.16	0.25	0.41	0.89	0.58	0.24	0.04	0.41	0.33	0.07	0.07	0.08	0.25	0.43	0.21
O5'	0.16	0.59	0.24	0.09	0.32	0.09	0.21	0.24	0.32	0.05	0.48	0.74	0.53	0.05	0.15	0.27	0.00	0.04	0.09	0.26	0.18	0.35	0.15
OP1	0.27	0.12	0.13	0.18	0.20	0.43	0.32	0.54	0.24	0.55	0.12	0.25	0.09	0.52	0.33	0.09	0.02	0.39	0.52	0.30	0.63	0.85	0.67
OP2	0.04	0.13	0.05	0.03	0.12	0.09	0.24	0.18	0.22	0.34	0.14	0.19	0.11	0.37	0.14	0.10	0.02	0.07	0.28	0.29	0.29	0.31	0.23
P	0.06	0.22	0.03	0.04	0.08	0.19	0.16	0.29	0.12	0.32	0.14	0.34	0.19	0.31	0.13	0.09	0.00	0.13	0.09	0.16	0.15	0.43	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.02	0.15	0.11	0.20
C2	0.05	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.02	0.09	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.05	0.33	0.03	0.32	0.38	0.38
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.06	0.11	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.03	0.14	0.10	0.18
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.02	0.11	0.19	0.08	0.11	0.08	0.19	0.09	0.02	0.00	0.01	0.24	0.13	0.19	0.08	0.17
C4	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.03	0.30	0.01	0.29	0.31	0.35
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.10	0.18	0.06	0.04	0.02	0.18	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.13	0.05	0.19	0.01
C5	0.02	0.02	0.02	0.13	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.31	0.00	0.33	0.37	0.39
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.13	0.00	0.23	0.00	0.22	0.28	0.16	0.05	0.06	0.30	0.14	0.04	0.04	0.02	0.02	0.26	0.16	0.35	0.03
C6	0.03	0.03	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.04	0.33	0.00	0.37	0.43	0.42
C8	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.18	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.21	0.06	0.23	0.00	0.25	0.22	0.31
N1	0.05	0.01	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.14	0.10	0.05	0.33	0.02	0.35	0.42	0.40
N2	0.06	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.20	0.06	0.34	0.03	0.32	0.39	0.37
N3	0.05	0.01	0.10	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.05	0.31	0.01	0.28	0.31	0.34
N7	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.18	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.06	0.27	0.00	0.32	0.33	0.38
N9	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.25	0.01	0.23	0.22	0.29
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.10	0.05	0.14	0.21	0.16	0.02	0.01	0.00	0.09	0.08	0.04	0.08	0.07	0.10	0.02
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.14	0.04	0.13	0.21	0.10	0.20	0.13	0.22	0.08	0.09	0.00	0.01	0.14	0.16	0.10	0.18	0.05
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.08	0.01	0.00	0.09	0.05	0.11	0.03	0.13
O5'	0.18	0.33	0.21	0.24	0.30	0.02	0.31	0.02	0.33	0.23	0.33	0.34	0.31	0.27	0.25	0.04	0.14	0.09	0.00	0.33	0.01	0.04	0.00
O6	0.02	0.03	0.03	0.13	0.01	0.13	0.00	0.26	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.16	0.05	0.33	0.00	0.40	0.47	0.44
OP1	0.15	0.32	0.14	0.19	0.29	0.05	0.33	0.16	0.37	0.25	0.35	0.32	0.28	0.32	0.23	0.07	0.10	0.11	0.01	0.40	0.00	0.03	0.01
OP2	0.11	0.38	0.10	0.08	0.31	0.19	0.37	0.35	0.43	0.22	0.42	0.39	0.31	0.33	0.22	0.10	0.18	0.03	0.04	0.47	0.03	0.00	0.00
P	0.20	0.38	0.18	0.17	0.35	0.01	0.39	0.03	0.42	0.31	0.40	0.37	0.34	0.38	0.29	0.02	0.05	0.13	0.00	0.44	0.01	0.00	0.00