Doublet Group distance statistics: 55231

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.015
N1	A	0, -0.002, 0.014, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C6	A	0, -0.003, 0.014, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.001, 0.020, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.021
C4	A	0, -0.004, 0.017, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.006, 0.036, 0.067, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.036 std_dev=0.031
O4	A	0, -0.011, 0.045, 0.101, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.045 std_dev=0.056
C2'	A	0, -0.023, 0.139, 0.301, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.139 std_dev=0.162
O4'	A	0, -0.035, 0.139, 0.312, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.139 std_dev=0.174
O5'	A	0, 0.079, 0.276, 0.472, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.276 std_dev=0.197
O2'	A	0, -0.041, 0.194, 0.428, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.194 std_dev=0.234
C3'	A	0, -0.033, 0.229, 0.490, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.229 std_dev=0.261
C4'	A	0, -0.047, 0.221, 0.489, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.221 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.108, 0.392, 0.676, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.392 std_dev=0.284
P	A	0, 0.112, 0.402, 0.692, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.402 std_dev=0.290
OP2	A	0, 0.119, 0.418, 0.717, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.418 std_dev=0.299
O3'	B	0, 0.115, 0.427, 0.739, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.427 std_dev=0.312
O3'	A	0, -0.036, 0.343, 0.721, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.343 std_dev=0.379
C3'	B	0, 0.107, 0.492, 0.876, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.492 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.117, 0.512, 0.907, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.512 std_dev=0.395
C5'	A	0, -0.081, 0.326, 0.732, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.326 std_dev=0.406
OP1	A	0, 0.184, 0.645, 1.106, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.645 std_dev=0.461
C4'	B	0, 0.092, 0.651, 1.209, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.651 std_dev=0.559
C1'	B	0, 0.089, 0.682, 1.276, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.682 std_dev=0.594
O4'	B	0, 0.025, 0.704, 1.383, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.704 std_dev=0.679
C5'	B	0, 0.184, 0.885, 1.586, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.885 std_dev=0.701
N9	B	0, 0.117, 0.850, 1.583, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.850 std_dev=0.733
N3	B	0, 0.266, 1.039, 1.811, 1.851 max_d=1.851 avg_d=1.039 std_dev=0.772
C4	B	0, 0.210, 1.003, 1.797, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.003 std_dev=0.793
C8	B	0, 0.107, 0.956, 1.804, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.956 std_dev=0.848
C2	B	0, 0.322, 1.206, 2.090, 2.096 max_d=2.096 avg_d=1.206 std_dev=0.884
N2	B	0, 0.365, 1.281, 2.196, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.281 std_dev=0.915
C5	B	0, 0.246, 1.166, 2.086, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.166 std_dev=0.920
N7	B	0, 0.207, 1.154, 2.100, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.154 std_dev=0.946
N1	B	0, 0.349, 1.346, 2.344, 2.384 max_d=2.384 avg_d=1.346 std_dev=0.997
C6	B	0, 0.329, 1.355, 2.381, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.355 std_dev=1.026
O6	B	0, 0.392, 1.545, 2.698, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.545 std_dev=1.153
O5'	B	0, 0.006, 1.506, 3.006, 3.554 max_d=3.554 avg_d=1.506 std_dev=1.500
P	B	0, 0.168, 1.880, 3.591, 4.140 max_d=4.140 avg_d=1.880 std_dev=1.712
OP1	B	0, 0.253, 1.981, 3.709, 4.211 max_d=4.211 avg_d=1.981 std_dev=1.728
OP2	B	0, 0.254, 2.075, 3.896, 4.433 max_d=4.433 avg_d=2.075 std_dev=1.821

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03
C2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.03
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.11	0.13	0.00	0.01	0.11	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.12	0.02	0.00	0.11	0.00	0.04	0.03	0.07	0.04
C4	0.03	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.01	0.02	0.08	0.13	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.13	0.07
C5'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.09	0.03
N1	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02
N3	0.02	0.01	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.05
O2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.16	0.01	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.09	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.12	0.15	0.00	0.02	0.11	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.14	0.16	0.02	0.00	0.13	0.00	0.06	0.04	0.08	0.05
O4	0.04	0.02	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.02	0.03	0.10	0.14	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.11	0.02	0.07
O5'	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.01	0.03	0.03	0.08	0.07	0.08	0.07	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.10	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.09	0.06	0.07	0.13	0.02	0.13	0.00	0.09	0.07	0.12	0.08	0.06	0.08	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.03	0.01	0.04	0.07	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.08	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.28	0.23	0.16	0.22	0.18	0.25	0.17	0.19	0.41	0.25	0.51	0.15	0.36	0.33	0.13	0.08	0.26	0.67	0.19	0.66	0.59	0.64
C2	0.44	0.07	0.29	0.21	0.39	0.28	0.43	0.27	0.25	0.59	0.06	0.39	0.18	0.56	0.50	0.19	0.08	0.40	0.94	0.23	0.93	0.90	0.93
C2'	0.28	0.28	0.22	0.13	0.22	0.14	0.26	0.13	0.21	0.41	0.27	0.48	0.16	0.37	0.32	0.15	0.03	0.23	0.66	0.22	0.66	0.59	0.63
C3'	0.23	0.31	0.20	0.09	0.11	0.09	0.15	0.05	0.14	0.36	0.27	0.52	0.16	0.29	0.24	0.18	0.02	0.16	0.58	0.14	0.59	0.47	0.55
C4	0.34	0.37	0.22	0.17	0.25	0.24	0.31	0.27	0.16	0.58	0.37	0.53	0.19	0.54	0.41	0.16	0.07	0.33	1.07	0.13	1.09	1.06	1.08
C4'	0.22	0.32	0.20	0.10	0.09	0.10	0.11	0.05	0.13	0.32	0.27	0.51	0.18	0.25	0.22	0.19	0.01	0.16	0.48	0.12	0.49	0.35	0.44
C5	0.20	0.51	0.14	0.10	0.09	0.16	0.08	0.23	0.24	0.42	0.48	0.64	0.31	0.32	0.23	0.11	0.04	0.20	0.95	0.22	0.98	0.87	0.94
C5'	0.18	0.35	0.19	0.09	0.03	0.09	0.02	0.05	0.12	0.28	0.29	0.52	0.23	0.20	0.16	0.21	0.07	0.13	0.40	0.11	0.42	0.23	0.36
C6	0.19	0.49	0.12	0.12	0.03	0.15	0.04	0.20	0.17	0.37	0.41	0.66	0.30	0.28	0.21	0.09	0.03	0.18	0.81	0.15	0.83	0.70	0.78
N1	0.32	0.30	0.22	0.17	0.20	0.21	0.24	0.21	0.12	0.47	0.25	0.56	0.08	0.40	0.36	0.14	0.06	0.29	0.82	0.12	0.81	0.73	0.79
N3	0.44	0.20	0.29	0.21	0.40	0.30	0.46	0.29	0.24	0.65	0.14	0.41	0.22	0.63	0.52	0.20	0.09	0.42	1.05	0.19	1.05	1.04	1.05
O2	0.48	0.18	0.31	0.23	0.49	0.31	0.52	0.29	0.41	0.62	0.25	0.14	0.34	0.61	0.55	0.21	0.09	0.44	0.93	0.40	0.91	0.91	0.92
O2'	0.30	0.31	0.23	0.14	0.28	0.15	0.31	0.12	0.30	0.41	0.32	0.45	0.22	0.39	0.34	0.16	0.03	0.24	0.60	0.31	0.60	0.55	0.58
O3'	0.23	0.31	0.20	0.09	0.12	0.08	0.16	0.02	0.15	0.35	0.28	0.50	0.17	0.29	0.24	0.19	0.04	0.15	0.54	0.16	0.55	0.43	0.51
O4	0.36	0.37	0.23	0.17	0.30	0.25	0.38	0.28	0.29	0.62	0.40	0.49	0.24	0.61	0.43	0.18	0.09	0.35	1.14	0.28	1.19	1.20	1.19
O4'	0.25	0.31	0.21	0.13	0.11	0.14	0.14	0.12	0.13	0.33	0.26	0.51	0.17	0.26	0.24	0.16	0.08	0.20	0.53	0.13	0.53	0.41	0.50
O5'	0.11	0.43	0.12	0.05	0.09	0.04	0.03	0.07	0.19	0.26	0.36	0.59	0.31	0.17	0.11	0.11	0.01	0.06	0.49	0.17	0.54	0.30	0.45
OP1	0.01	0.44	0.03	0.03	0.18	0.09	0.15	0.14	0.25	0.20	0.39	0.57	0.36	0.17	0.05	0.10	0.01	0.06	0.32	0.25	0.40	0.25	0.32
OP2	0.06	0.49	0.08	0.00	0.23	0.11	0.23	0.19	0.34	0.27	0.46	0.59	0.39	0.23	0.12	0.05	0.01	0.03	0.63	0.35	0.73	0.35	0.58
P	0.03	0.45	0.05	0.00	0.17	0.06	0.13	0.09	0.25	0.21	0.40	0.57	0.36	0.15	0.05	0.06	0.00	0.02	0.43	0.24	0.50	0.20	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.15	0.03	0.11
C2	0.06	0.00	0.29	0.36	0.01	0.22	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.32	0.43	0.06	0.29	0.00	0.25	0.23	0.26
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.15	0.02	0.10	0.00	0.16	0.06	0.24	0.34	0.28	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.25	0.14	0.26	0.07	0.21
C3'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.17	0.00	0.12	0.01	0.20	0.13	0.30	0.42	0.32	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.35	0.17	0.35	0.09	0.28
C4	0.03	0.01	0.15	0.17	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.18	0.03	0.34	0.00	0.31	0.23	0.30
C4'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.13	0.06	0.19	0.26	0.19	0.02	0.03	0.11	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.20	0.01
C5	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.12	0.02	0.46	0.01	0.42	0.37	0.43
C5'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.16	0.00	0.14	0.00	0.20	0.06	0.26	0.31	0.23	0.05	0.06	0.11	0.04	0.01	0.00	0.18	0.14	0.33	0.01
C6	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.13	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.23	0.03	0.46	0.00	0.43	0.41	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.02	0.50	0.02	0.45	0.33	0.44
N1	0.04	0.00	0.24	0.30	0.01	0.19	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.26	0.36	0.05	0.38	0.00	0.34	0.33	0.36
N2	0.07	0.00	0.34	0.42	0.02	0.26	0.00	0.31	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.39	0.54	0.08	0.23	0.01	0.21	0.20	0.22
N3	0.05	0.01	0.28	0.32	0.00	0.19	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.28	0.37	0.05	0.25	0.00	0.22	0.17	0.22
N7	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.55	0.02	0.52	0.46	0.52
N9	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.33	0.00	0.30	0.17	0.28
O2'	0.02	0.32	0.01	0.04	0.15	0.11	0.12	0.11	0.18	0.03	0.26	0.39	0.28	0.03	0.03	0.00	0.06	0.07	0.15	0.16	0.20	0.03	0.15
O3'	0.02	0.43	0.02	0.00	0.18	0.00	0.12	0.04	0.23	0.15	0.36	0.54	0.37	0.07	0.01	0.06	0.00	0.01	0.32	0.20	0.37	0.12	0.29
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.02	0.06	0.19	0.05
O5'	0.14	0.29	0.25	0.35	0.34	0.01	0.46	0.00	0.46	0.50	0.38	0.23	0.25	0.55	0.33	0.15	0.32	0.07	0.00	0.52	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.14	0.17	0.00	0.11	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.16	0.20	0.02	0.52	0.00	0.50	0.50	0.51
OP1	0.15	0.25	0.26	0.35	0.31	0.08	0.42	0.14	0.43	0.45	0.34	0.21	0.22	0.52	0.30	0.20	0.37	0.06	0.01	0.50	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.23	0.07	0.09	0.23	0.20	0.37	0.33	0.41	0.33	0.33	0.20	0.17	0.46	0.17	0.03	0.12	0.19	0.01	0.50	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.26	0.21	0.28	0.30	0.01	0.43	0.01	0.44	0.44	0.36	0.22	0.22	0.52	0.28	0.15	0.29	0.05	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00