Doublet Group distance statistics: 55232

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O2	A	0, -0.006, 0.025, 0.057, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.002, 0.043, 0.089, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.043 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.034, 0.125, 0.216, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.125 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.018, 0.110, 0.203, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.110 std_dev=0.092
C3'	A	0, 0.033, 0.138, 0.243, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.138 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.069, 0.235, 0.401, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.235 std_dev=0.166
C5'	A	0, 0.051, 0.227, 0.404, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.227 std_dev=0.176
O3'	A	0, 0.028, 0.209, 0.390, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.209 std_dev=0.181
C5'	B	0, 0.067, 0.263, 0.458, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.263 std_dev=0.195
O5'	B	0, 0.073, 0.316, 0.560, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.316 std_dev=0.244
OP1	B	0, 0.102, 0.348, 0.594, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.348 std_dev=0.246
P	B	0, 0.097, 0.355, 0.613, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.355 std_dev=0.258
C4'	B	0, 0.107, 0.367, 0.627, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.367 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.109, 0.373, 0.637, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.373 std_dev=0.264
O3'	B	0, 0.093, 0.384, 0.676, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.384 std_dev=0.292
OP1	A	0, 0.070, 0.364, 0.658, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.364 std_dev=0.294
O5'	A	0, 0.056, 0.351, 0.647, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.351 std_dev=0.296
P	A	0, 0.063, 0.363, 0.663, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.363 std_dev=0.300
O4'	B	0, 0.130, 0.450, 0.769, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.450 std_dev=0.320
OP2	B	0, 0.133, 0.454, 0.774, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.454 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.144, 0.494, 0.844, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.494 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.149, 0.509, 0.869, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.509 std_dev=0.360
OP2	A	0, 0.082, 0.460, 0.837, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.460 std_dev=0.377
N9	B	0, 0.148, 0.535, 0.922, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.535 std_dev=0.387
C8	B	0, 0.159, 0.566, 0.973, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.566 std_dev=0.407
C4	B	0, 0.165, 0.614, 1.064, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.614 std_dev=0.449
N7	B	0, 0.173, 0.641, 1.109, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.641 std_dev=0.468
N3	B	0, 0.172, 0.646, 1.121, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.646 std_dev=0.474
O2'	B	0, 0.178, 0.660, 1.142, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.660 std_dev=0.482
C5	B	0, 0.177, 0.673, 1.169, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.673 std_dev=0.496
C2	B	0, 0.190, 0.731, 1.273, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.731 std_dev=0.541
N2	B	0, 0.204, 0.773, 1.342, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.773 std_dev=0.569
C6	B	0, 0.196, 0.770, 1.344, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.770 std_dev=0.574
N1	B	0, 0.200, 0.789, 1.378, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.789 std_dev=0.589
O6	B	0, 0.208, 0.840, 1.472, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.840 std_dev=0.632

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.06	0.02	0.03
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.21	0.16	0.11	0.15
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.28	0.21	0.18	0.21
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.06	0.06	0.05	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01
C5	0.02	0.02	0.03	0.06	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.29	0.21	0.18	0.22
C5'	0.04	0.12	0.01	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.17	0.13	0.15	0.11	0.01	0.02	0.17	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.28	0.18	0.12	0.17
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.21	0.14	0.08	0.13
N3	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.25	0.19	0.15	0.18
O2	0.05	0.01	0.05	0.06	0.02	0.05	0.03	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.19	0.14	0.09	0.13
O2'	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.02
O3'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.07	0.02	0.07	0.04	0.03	0.05	0.03	0.00	0.05	0.03	0.07	0.02	0.07	0.04
O4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.28	0.22	0.21	0.22
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.00	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02
O5'	0.10	0.21	0.03	0.03	0.28	0.01	0.29	0.00	0.28	0.21	0.25	0.19	0.00	0.07	0.28	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.06	0.16	0.03	0.01	0.21	0.04	0.21	0.04	0.18	0.14	0.19	0.14	0.02	0.02	0.22	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.02	0.11	0.04	0.07	0.18	0.04	0.18	0.02	0.12	0.08	0.15	0.09	0.05	0.07	0.21	0.06	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.03	0.15	0.01	0.04	0.21	0.01	0.22	0.01	0.17	0.13	0.18	0.13	0.02	0.04	0.22	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.04	0.06	0.05	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.06	0.05	0.02	0.03	0.07	0.04	0.08	0.08	0.00	0.17	0.20	0.13
C2	0.06	0.08	0.09	0.08	0.07	0.06	0.08	0.04	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.07	0.19	0.09	0.06	0.04	0.08	0.12	0.14	0.08
C2'	0.07	0.03	0.08	0.07	0.03	0.08	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.05	0.04	0.03	0.03	0.06	0.07	0.08	0.09	0.03	0.19	0.26	0.17
C3'	0.07	0.03	0.10	0.09	0.03	0.09	0.03	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.08	0.10	0.09	0.07	0.05	0.18	0.28	0.16
C4	0.11	0.13	0.15	0.14	0.12	0.10	0.12	0.08	0.13	0.11	0.14	0.13	0.13	0.11	0.11	0.22	0.16	0.11	0.08	0.13	0.11	0.12	0.08
C4'	0.06	0.03	0.08	0.08	0.03	0.08	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.09	0.08	0.07	0.05	0.19	0.27	0.16
C5	0.10	0.12	0.13	0.13	0.11	0.10	0.12	0.08	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.18	0.15	0.11	0.09	0.12	0.11	0.13	0.09
C5'	0.05	0.06	0.07	0.07	0.05	0.05	0.05	0.03	0.06	0.04	0.07	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.18	0.33	0.18
C6	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.07	0.09	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.08	0.14	0.10	0.10	0.07	0.09	0.12	0.14	0.09
N1	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.14	0.06	0.07	0.05	0.07	0.12	0.15	0.08
N3	0.08	0.11	0.13	0.11	0.10	0.08	0.10	0.06	0.11	0.10	0.12	0.11	0.11	0.10	0.09	0.22	0.13	0.08	0.05	0.10	0.11	0.12	0.07
O2	0.05	0.08	0.09	0.07	0.06	0.05	0.07	0.03	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.06	0.19	0.09	0.05	0.04	0.07	0.13	0.14	0.08
O2'	0.05	0.02	0.07	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.03	0.17	0.23	0.16
O3'	0.04	0.05	0.07	0.07	0.04	0.05	0.07	0.01	0.08	0.05	0.08	0.04	0.03	0.08	0.03	0.08	0.08	0.05	0.03	0.09	0.15	0.26	0.14
O4	0.12	0.16	0.18	0.16	0.14	0.11	0.14	0.09	0.15	0.13	0.17	0.16	0.16	0.13	0.13	0.25	0.18	0.13	0.09	0.15	0.11	0.12	0.09
O4'	0.08	0.04	0.09	0.08	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.04	0.05	0.09	0.08	0.06	0.01	0.13	0.19	0.11
O5'	0.04	0.07	0.02	0.03	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.02	0.06	0.07	0.06	0.03	0.04	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.14	0.30	0.12
OP1	0.04	0.09	0.07	0.03	0.06	0.04	0.04	0.09	0.05	0.01	0.07	0.10	0.08	0.01	0.04	0.13	0.01	0.04	0.05	0.03	0.10	0.23	0.07
OP2	0.02	0.06	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.11	0.00	0.03	0.03	0.03	0.14	0.25	0.10
P	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.02	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.25	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06
C2	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02	0.07	0.01	0.09	0.14	0.12
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.03	0.08	0.04	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.07	0.14	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.19	0.08
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.11	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.16	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.02	0.03	0.08	0.04	0.10	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.13	0.17	0.15
C8	0.01	0.00	0.08	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.10	0.02	0.12	0.11	0.13
N1	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02	0.09	0.01	0.12	0.17	0.14
N2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.13	0.11
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.11	0.11
N7	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.02	0.04	0.11	0.02	0.15	0.16	0.16
N9	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.04	0.08	0.10	0.10	0.10	0.11	0.07	0.08	0.07	0.05	0.10	0.05	0.00	0.02	0.09	0.05	0.12	0.06	0.09	0.06
O3'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.14	0.23	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06
O5'	0.02	0.07	0.04	0.06	0.07	0.02	0.09	0.00	0.09	0.10	0.09	0.05	0.06	0.11	0.06	0.05	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.02	0.01	0.09	0.00	0.14	0.18	0.14
OP1	0.02	0.09	0.07	0.10	0.08	0.03	0.12	0.02	0.13	0.12	0.12	0.07	0.07	0.15	0.07	0.06	0.14	0.02	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.14	0.14	0.19	0.11	0.05	0.16	0.03	0.17	0.11	0.17	0.13	0.11	0.16	0.08	0.09	0.23	0.03	0.03	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.12	0.04	0.08	0.11	0.01	0.14	0.02	0.15	0.13	0.14	0.11	0.11	0.16	0.10	0.06	0.11	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00