Doublet Group distance statistics: 55234

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
C2'	B	0, 0.000, 0.478, 0.956, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.478 std_dev=0.478
O2'	B	0, 0.000, 0.551, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.551 std_dev=0.551
C1'	B	0, 0.000, 0.586, 1.172, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.586 std_dev=0.586
C3'	B	0, 0.000, 0.618, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.618 std_dev=0.618
O4'	A	0, 0.000, 0.704, 1.408, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.704 std_dev=0.704
O3'	B	0, 0.000, 0.841, 1.682, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.841 std_dev=0.841
C2'	A	0, 0.000, 0.905, 1.810, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.905 std_dev=0.905
O4'	B	0, 0.000, 1.070, 2.141, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.070 std_dev=1.070
C4'	A	0, 0.000, 1.175, 2.349, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.175 std_dev=1.175
N9	B	0, 0.000, 1.210, 2.420, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.210 std_dev=1.210
C4'	B	0, 0.000, 1.281, 2.562, 2.562 max_d=2.562 avg_d=1.281 std_dev=1.281
C3'	A	0, 0.000, 1.490, 2.980, 2.980 max_d=2.980 avg_d=1.490 std_dev=1.490
O2'	A	0, 0.000, 1.515, 3.031, 3.031 max_d=3.031 avg_d=1.515 std_dev=1.515
N3	B	0, 0.000, 1.528, 3.057, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.528 std_dev=1.528
C8	B	0, 0.000, 1.577, 3.153, 3.153 max_d=3.153 avg_d=1.577 std_dev=1.577
C4	B	0, 0.000, 1.654, 3.307, 3.307 max_d=3.307 avg_d=1.654 std_dev=1.654
P	A	0, 0.000, 1.732, 3.464, 3.464 max_d=3.464 avg_d=1.732 std_dev=1.732
C5'	B	0, 0.000, 1.938, 3.877, 3.877 max_d=3.877 avg_d=1.938 std_dev=1.938
O5'	B	0, 0.000, 1.997, 3.994, 3.994 max_d=3.994 avg_d=1.997 std_dev=1.997
OP2	A	0, 0.000, 2.028, 4.057, 4.057 max_d=4.057 avg_d=2.028 std_dev=2.028
O3'	A	0, 0.000, 2.084, 4.168, 4.168 max_d=4.168 avg_d=2.084 std_dev=2.084
C2	B	0, 0.000, 2.100, 4.200, 4.200 max_d=4.200 avg_d=2.100 std_dev=2.100
N2	B	0, 0.000, 2.107, 4.214, 4.214 max_d=4.214 avg_d=2.107 std_dev=2.107
OP1	A	0, 0.000, 2.151, 4.302, 4.302 max_d=4.302 avg_d=2.151 std_dev=2.151
N7	B	0, 0.000, 2.181, 4.362, 4.362 max_d=4.362 avg_d=2.181 std_dev=2.181
C5'	A	0, 0.000, 2.241, 4.483, 4.483 max_d=4.483 avg_d=2.241 std_dev=2.241
C5	B	0, 0.000, 2.255, 4.511, 4.511 max_d=4.511 avg_d=2.255 std_dev=2.255
O5'	A	0, 0.000, 2.327, 4.654, 4.654 max_d=4.654 avg_d=2.327 std_dev=2.327
N1	B	0, 0.000, 2.725, 5.450, 5.450 max_d=5.450 avg_d=2.725 std_dev=2.725
C6	B	0, 0.000, 2.849, 5.699, 5.699 max_d=5.699 avg_d=2.849 std_dev=2.849
P	B	0, 0.000, 2.886, 5.772, 5.772 max_d=5.772 avg_d=2.886 std_dev=2.886
OP2	B	0, 0.000, 3.138, 6.277, 6.277 max_d=6.277 avg_d=3.138 std_dev=3.138
OP1	B	0, 0.000, 3.153, 6.306, 6.306 max_d=6.306 avg_d=3.153 std_dev=3.153
O6	B	0, 0.000, 3.424, 6.848, 6.848 max_d=6.848 avg_d=3.424 std_dev=3.424

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.01	0.14	0.21	0.03	0.18
C2	0.01	0.00	0.20	0.05	0.00	0.16	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.11	0.00	0.12	0.11	0.09	0.26	0.13
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.06	0.01	0.23	0.11	0.27	0.03	0.11	0.40	0.00	0.03	0.06	0.03	0.07	0.11	0.35	0.15
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.43	0.01	0.62	0.03	0.60	0.24	0.20	0.22	0.00	0.00	0.45	0.00	0.10	0.41	0.78	0.50
C4	0.00	0.00	0.06	0.43	0.00	0.34	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.34	0.00	0.03	0.33	0.04	0.36	0.03
C4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.34	0.00	0.39	0.00	0.35	0.20	0.25	0.05	0.16	0.02	0.37	0.00	0.05	0.04	0.37	0.12
C5	0.00	0.00	0.23	0.62	0.00	0.39	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.06	0.32	0.02	0.32	0.02
C5'	0.02	0.32	0.11	0.03	0.59	0.00	0.62	0.00	0.49	0.30	0.47	0.19	0.02	0.04	0.65	0.00	0.04	0.02	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.27	0.60	0.00	0.35	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.54	0.01	0.09	0.17	0.08	0.24	0.10
N1	0.00	0.00	0.03	0.24	0.00	0.20	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.13	0.01	0.02	0.05	0.14	0.21	0.15
N3	0.01	0.00	0.11	0.20	0.00	0.25	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.06	0.00	0.10	0.24	0.01	0.34	0.07
O2	0.01	0.00	0.40	0.22	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.42	0.00	0.18	0.03	0.12	0.24	0.15
O2'	0.02	0.49	0.00	0.00	0.24	0.16	0.00	0.02	0.09	0.15	0.44	0.77	0.00	0.02	0.27	0.19	0.11	0.32	0.68	0.36
O3'	0.08	0.11	0.03	0.00	0.34	0.02	0.58	0.04	0.54	0.13	0.06	0.42	0.02	0.00	0.38	0.03	0.29	0.79	1.43	0.90
O4	0.00	0.00	0.06	0.45	0.00	0.37	0.00	0.65	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.38	0.00	0.04	0.41	0.10	0.39	0.02
O4'	0.01	0.12	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.18	0.19	0.03	0.04	0.00	0.24	0.38	0.12	0.35
O5'	0.14	0.11	0.07	0.10	0.33	0.05	0.32	0.04	0.17	0.05	0.24	0.03	0.11	0.29	0.41	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.09	0.11	0.41	0.04	0.04	0.02	0.02	0.08	0.14	0.01	0.12	0.32	0.79	0.10	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.26	0.35	0.78	0.36	0.37	0.32	0.10	0.24	0.21	0.34	0.24	0.68	1.43	0.39	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.13	0.15	0.50	0.03	0.12	0.02	0.01	0.10	0.15	0.07	0.15	0.36	0.90	0.02	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.38	0.00	0.38	0.23	0.76	0.26	0.87	0.35	0.08	0.41	0.44	0.29	0.17	0.09	0.35	0.35	0.55	0.57	0.37	1.02	0.39	0.70
C2	0.02	0.38	0.03	0.30	0.24	0.65	0.27	0.74	0.35	0.12	0.40	0.45	0.29	0.20	0.12	0.29	0.21	0.50	0.45	0.37	0.80	0.19	0.50
C2'	0.49	0.82	0.61	0.22	0.77	0.17	0.83	0.23	0.90	0.70	0.89	0.79	0.76	0.79	0.66	0.95	0.13	0.01	0.10	0.94	0.35	0.32	0.01
C3'	0.93	1.14	1.00	0.65	1.14	0.32	1.18	0.22	1.22	1.07	1.20	1.07	1.11	1.14	1.06	1.27	0.55	0.51	0.50	1.25	0.05	0.59	0.32
C4	0.03	0.23	0.06	0.16	0.18	0.43	0.20	0.47	0.22	0.13	0.24	0.24	0.20	0.17	0.13	0.20	0.03	0.35	0.24	0.22	0.45	0.05	0.21
C4'	0.31	0.61	0.26	0.01	0.50	0.20	0.50	0.34	0.57	0.35	0.61	0.64	0.56	0.42	0.39	0.47	0.01	0.00	0.18	0.57	0.74	0.20	0.39
C5	0.01	0.19	0.05	0.17	0.15	0.44	0.16	0.46	0.18	0.09	0.19	0.19	0.18	0.13	0.10	0.20	0.03	0.38	0.25	0.18	0.45	0.00	0.23
C5'	0.46	0.71	0.24	0.14	0.60	0.18	0.57	0.07	0.63	0.42	0.68	0.74	0.68	0.47	0.50	0.22	0.14	0.36	0.07	0.61	0.45	0.05	0.12
C6	0.04	0.27	0.01	0.28	0.17	0.61	0.18	0.64	0.24	0.07	0.27	0.29	0.22	0.13	0.08	0.26	0.17	0.48	0.39	0.24	0.67	0.16	0.42
N1	0.05	0.35	0.01	0.33	0.21	0.69	0.24	0.76	0.32	0.09	0.37	0.41	0.28	0.17	0.09	0.29	0.26	0.52	0.48	0.33	0.84	0.25	0.55
N3	0.01	0.33	0.05	0.23	0.22	0.54	0.25	0.61	0.31	0.14	0.34	0.38	0.26	0.20	0.13	0.24	0.12	0.42	0.35	0.32	0.63	0.05	0.35
O2	0.02	0.43	0.02	0.33	0.26	0.69	0.30	0.81	0.40	0.13	0.45	0.50	0.32	0.23	0.13	0.30	0.26	0.52	0.50	0.43	0.91	0.24	0.58
O2'	0.43	0.63	0.66	0.27	0.65	0.22	0.73	0.29	0.77	0.66	0.72	0.55	0.58	0.74	0.59	1.04	0.20	0.10	0.09	0.82	0.34	0.34	0.02
O3'	1.14	1.22	1.32	0.96	1.31	0.55	1.39	0.45	1.40	1.34	1.32	1.10	1.21	1.40	1.27	1.63	0.82	0.70	0.78	1.45	0.22	0.88	0.58
O4	0.07	0.14	0.08	0.09	0.15	0.30	0.17	0.34	0.17	0.15	0.15	0.09	0.14	0.17	0.14	0.16	0.05	0.24	0.14	0.16	0.29	0.18	0.07
O4'	0.35	0.11	0.37	0.68	0.09	0.97	0.09	1.10	0.01	0.28	0.09	0.21	0.01	0.20	0.24	0.06	0.63	0.75	0.89	0.01	1.37	0.82	1.05
O5'	0.20	0.35	0.04	0.01	0.27	0.15	0.23	0.04	0.27	0.12	0.32	0.39	0.34	0.15	0.20	0.13	0.00	0.23	0.08	0.25	0.56	0.31	0.29
OP1	0.07	0.05	0.35	0.00	0.10	0.38	0.15	0.39	0.13	0.20	0.09	0.02	0.05	0.20	0.13	0.59	0.01	0.23	0.04	0.15	0.22	0.37	0.14
OP2	0.24	0.28	0.22	0.05	0.27	0.06	0.27	0.19	0.27	0.25	0.28	0.28	0.27	0.26	0.26	0.44	0.01	0.12	0.14	0.27	0.03	0.01	0.07
P	0.03	0.01	0.19	0.01	0.02	0.17	0.04	0.17	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.05	0.36	0.00	0.10	0.03	0.03	0.25	0.19	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.17	0.09
C2	0.03	0.00	0.13	0.02	0.01	0.26	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.15	0.32	0.11	0.01	0.06	0.30	0.04
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.02	0.13	0.05	0.15	0.05	0.15	0.12	0.12	0.09	0.07	0.00	0.05	0.02	0.08	0.15	0.03	0.12	0.07
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.19	0.04	0.07
C4	0.01	0.01	0.12	0.02	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.17	0.16	0.01	0.00	0.08	0.36	0.16
C4'	0.00	0.26	0.02	0.00	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.15	0.20	0.35	0.24	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.06	0.01
C5	0.00	0.00	0.13	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.17	0.07	0.10	0.01	0.24	0.50	0.29
C5'	0.01	0.30	0.05	0.00	0.11	0.01	0.03	0.00	0.10	0.21	0.23	0.40	0.27	0.15	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.00
C6	0.00	0.00	0.15	0.05	0.00	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.18	0.13	0.06	0.00	0.22	0.52	0.27
C8	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.15	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.26	0.02	0.37	0.53	0.43
N1	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.20	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.17	0.24	0.04	0.01	0.07	0.41	0.14
N2	0.05	0.00	0.12	0.06	0.01	0.35	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.30	0.13	0.39	0.18	0.01	0.18	0.24	0.05
N3	0.03	0.01	0.12	0.02	0.00	0.24	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.16	0.30	0.10	0.01	0.08	0.26	0.03
N7	0.01	0.00	0.09	0.08	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.16	0.08	0.23	0.02	0.42	0.62	0.45
N9	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.16	0.00	0.09	0.01	0.13	0.33	0.21
O2'	0.02	0.29	0.00	0.00	0.19	0.02	0.18	0.04	0.24	0.00	0.28	0.30	0.25	0.08	0.06	0.00	0.03	0.03	0.11	0.23	0.02	0.17	0.10
O3'	0.14	0.15	0.05	0.00	0.17	0.01	0.17	0.03	0.18	0.15	0.17	0.13	0.16	0.16	0.16	0.03	0.00	0.08	0.03	0.18	0.34	0.09	0.14
O4'	0.01	0.32	0.02	0.00	0.16	0.00	0.07	0.01	0.13	0.15	0.24	0.39	0.30	0.08	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.10	0.02	0.21	0.13
O5'	0.03	0.11	0.08	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.06	0.26	0.04	0.18	0.10	0.23	0.09	0.11	0.03	0.06	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.15	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.18	0.10	0.11	0.00	0.32	0.60	0.35
OP1	0.02	0.06	0.03	0.19	0.08	0.10	0.24	0.05	0.22	0.37	0.07	0.18	0.08	0.42	0.13	0.02	0.34	0.02	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.30	0.12	0.04	0.36	0.06	0.50	0.03	0.52	0.53	0.41	0.24	0.26	0.62	0.33	0.17	0.09	0.21	0.02	0.60	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.04	0.07	0.07	0.16	0.01	0.29	0.00	0.27	0.43	0.14	0.05	0.03	0.45	0.21	0.10	0.14	0.13	0.01	0.35	0.01	0.00	0.00