Doublet Group distance statistics: 55244

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 17, 20, 26, 18, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.016, 0.025, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.035, 0.057, 0.078, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.057 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.029, 0.059, 0.088, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.059 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.105, 0.205, 0.305, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.205 std_dev=0.100
O4'	A	0, 0.060, 0.163, 0.267, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.163 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.267, 0.393, 0.518, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.393 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.118, 0.265, 0.412, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.265 std_dev=0.147
C5	B	0, 0.362, 0.515, 0.668, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.515 std_dev=0.153
C3'	A	0, 0.153, 0.311, 0.468, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.311 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.331, 0.490, 0.648, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.490 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.348, 0.515, 0.682, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.515 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.293, 0.464, 0.634, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.464 std_dev=0.171
C2	B	0, 0.260, 0.450, 0.639, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.450 std_dev=0.189
N3	B	0, 0.291, 0.483, 0.675, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.483 std_dev=0.192
N4	B	0, 0.396, 0.595, 0.795, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.595 std_dev=0.200
O2	B	0, 0.271, 0.473, 0.676, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.473 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.315, 0.527, 0.739, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.527 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.305, 0.518, 0.731, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.518 std_dev=0.213
C3'	B	0, 0.277, 0.492, 0.707, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.492 std_dev=0.215
O4'	B	0, 0.330, 0.566, 0.802, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.566 std_dev=0.236
O3'	A	0, 0.249, 0.485, 0.720, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.485 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.180, 0.419, 0.658, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.419 std_dev=0.239
C4'	B	0, 0.312, 0.565, 0.817, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.565 std_dev=0.252
OP2	A	0, 0.253, 0.520, 0.786, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.520 std_dev=0.266
O3'	B	0, 0.267, 0.545, 0.823, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.545 std_dev=0.278
C5'	B	0, 0.332, 0.614, 0.897, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.614 std_dev=0.282
P	A	0, 0.209, 0.507, 0.805, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.507 std_dev=0.298
O5'	A	0, 0.146, 0.451, 0.756, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.451 std_dev=0.305
O2'	B	0, 0.347, 0.654, 0.961, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.654 std_dev=0.307
O5'	B	0, 0.342, 0.670, 0.998, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.670 std_dev=0.328
OP1	A	0, 0.231, 0.617, 1.003, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.617 std_dev=0.386
P	B	0, 0.356, 0.744, 1.131, 2.134 max_d=2.134 avg_d=0.744 std_dev=0.387
OP2	B	0, 0.329, 0.816, 1.302, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.816 std_dev=0.487
OP1	B	0, 0.289, 0.872, 1.455, 3.292 max_d=3.292 avg_d=0.872 std_dev=0.583

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.15	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.15	0.13	0.19	0.13
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.09	0.00	0.03	0.01	0.09	0.12	0.14	0.08
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.08	0.10	0.09	0.02	0.01	0.01	0.14	0.16	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.20	0.19	0.24	0.18
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.21	0.18	0.23	0.18
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.12	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.18	0.14	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.14	0.12	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.18	0.16	0.22	0.16
N4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.04	0.22	0.22	0.26	0.21
O2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.04	0.13	0.12	0.19	0.12
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.07	0.06	0.10	0.00	0.06	0.05	0.07	0.13	0.12	0.06
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.10	0.06	0.11	0.13	0.11	0.06	0.00	0.02	0.17	0.22	0.18	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.10	0.12	0.16	0.10
O5'	0.08	0.15	0.09	0.14	0.20	0.02	0.21	0.01	0.18	0.14	0.18	0.22	0.13	0.07	0.17	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.13	0.12	0.16	0.19	0.10	0.18	0.12	0.14	0.12	0.16	0.22	0.12	0.13	0.22	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.19	0.14	0.13	0.24	0.12	0.23	0.13	0.19	0.17	0.22	0.26	0.19	0.12	0.18	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.08	0.11	0.18	0.03	0.18	0.02	0.14	0.11	0.16	0.21	0.12	0.06	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.20	0.16	0.14	0.19	0.14	0.16	0.14	0.15	0.16	0.22	0.22	0.26	0.25	0.14	0.16	0.28	0.39	0.37	0.29
C2	0.17	0.17	0.16	0.14	0.20	0.14	0.19	0.17	0.17	0.15	0.20	0.24	0.22	0.24	0.14	0.15	0.32	0.45	0.46	0.34
C2'	0.16	0.19	0.14	0.11	0.17	0.11	0.14	0.13	0.13	0.14	0.20	0.20	0.26	0.25	0.13	0.13	0.26	0.42	0.40	0.30
C3'	0.15	0.16	0.15	0.13	0.15	0.13	0.14	0.15	0.14	0.13	0.17	0.17	0.23	0.26	0.15	0.13	0.24	0.44	0.40	0.30
C4	0.15	0.13	0.17	0.16	0.14	0.16	0.17	0.22	0.16	0.13	0.14	0.18	0.18	0.22	0.16	0.15	0.36	0.50	0.53	0.39
C4'	0.15	0.17	0.14	0.11	0.14	0.12	0.12	0.11	0.13	0.13	0.18	0.16	0.24	0.25	0.13	0.13	0.21	0.36	0.31	0.24
C5	0.15	0.14	0.19	0.16	0.13	0.17	0.15	0.21	0.15	0.13	0.15	0.16	0.18	0.23	0.17	0.16	0.36	0.49	0.49	0.38
C5'	0.19	0.20	0.19	0.14	0.16	0.16	0.15	0.14	0.16	0.17	0.19	0.16	0.25	0.29	0.16	0.18	0.19	0.36	0.28	0.23
C6	0.17	0.17	0.19	0.15	0.16	0.16	0.15	0.18	0.15	0.15	0.18	0.17	0.21	0.26	0.16	0.16	0.32	0.45	0.43	0.34
N1	0.17	0.18	0.17	0.14	0.18	0.14	0.17	0.16	0.16	0.15	0.20	0.21	0.23	0.25	0.14	0.15	0.31	0.43	0.42	0.32
N3	0.16	0.15	0.16	0.14	0.18	0.15	0.19	0.19	0.17	0.14	0.17	0.23	0.20	0.23	0.15	0.15	0.35	0.48	0.51	0.38
N4	0.15	0.14	0.17	0.17	0.13	0.18	0.18	0.25	0.17	0.14	0.15	0.16	0.19	0.21	0.18	0.16	0.38	0.54	0.57	0.43
O2	0.18	0.19	0.16	0.14	0.22	0.14	0.20	0.17	0.17	0.16	0.22	0.27	0.23	0.24	0.14	0.16	0.32	0.44	0.45	0.33
O2'	0.19	0.22	0.16	0.13	0.20	0.14	0.16	0.13	0.15	0.16	0.24	0.23	0.29	0.25	0.14	0.17	0.25	0.40	0.37	0.28
O3'	0.16	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.16	0.17	0.16	0.13	0.17	0.17	0.24	0.25	0.18	0.14	0.24	0.47	0.42	0.33
O4'	0.17	0.19	0.15	0.14	0.17	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.20	0.19	0.25	0.25	0.15	0.16	0.25	0.36	0.31	0.26
O5'	0.18	0.17	0.19	0.08	0.18	0.08	0.21	0.07	0.20	0.17	0.18	0.19	0.21	0.26	0.02	0.13	0.24	0.41	0.33	0.28
OP1	0.06	0.10	0.10	0.03	0.13	0.07	0.17	0.16	0.15	0.07	0.11	0.16	0.15	0.18	0.02	0.05	0.21	0.47	0.34	0.30
OP2	0.09	0.17	0.09	0.07	0.22	0.11	0.24	0.21	0.21	0.14	0.20	0.24	0.19	0.12	0.02	0.11	0.32	0.53	0.41	0.39
P	0.06	0.10	0.09	0.02	0.13	0.04	0.17	0.12	0.15	0.08	0.12	0.15	0.15	0.15	0.01	0.03	0.22	0.43	0.31	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.10	0.10	0.17	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.20	0.24	0.29	0.19
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.05	0.12	0.00	0.02	0.01	0.12	0.17	0.15	0.10
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.06	0.07	0.11	0.02	0.01	0.01	0.16	0.24	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.29	0.36	0.42	0.29
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.11	0.14	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.04	0.31	0.36	0.42	0.30
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.14	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.16	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.27	0.28	0.32	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.19	0.20	0.25	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.25	0.31	0.37	0.24
N4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.04	0.31	0.41	0.48	0.32
O2	0.03	0.01	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.14	0.04	0.16	0.20	0.26	0.16
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.06	0.13	0.00	0.05	0.05	0.06	0.15	0.12	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.03	0.12	0.04	0.08	0.10	0.14	0.05	0.00	0.02	0.15	0.33	0.20	0.18
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.07	0.09	0.20	0.13
O5'	0.10	0.20	0.12	0.16	0.29	0.02	0.31	0.01	0.27	0.19	0.25	0.31	0.16	0.06	0.15	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.24	0.17	0.24	0.36	0.11	0.36	0.16	0.28	0.20	0.31	0.41	0.20	0.15	0.33	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.29	0.15	0.14	0.42	0.14	0.42	0.18	0.32	0.25	0.37	0.48	0.26	0.12	0.20	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.10	0.13	0.29	0.03	0.30	0.02	0.23	0.17	0.24	0.32	0.16	0.06	0.18	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00