Doublet Group distance statistics: 55247

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 14, 9, 7, 8, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.020, 0.032, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.032 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.025, 0.038, 0.051, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.015, 0.030, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.036, 0.072, 0.108, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.072 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.025, 0.063, 0.101, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.063 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.070, 0.166, 0.261, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.166 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.090, 0.199, 0.308, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.199 std_dev=0.109
O4'	A	0, 0.049, 0.175, 0.301, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.175 std_dev=0.126
C2	B	0, 0.203, 0.351, 0.498, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.351 std_dev=0.148
C4	B	0, 0.204, 0.365, 0.527, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.365 std_dev=0.161
C3'	A	0, 0.125, 0.300, 0.475, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.300 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.212, 0.389, 0.567, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.389 std_dev=0.177
N1	B	0, 0.157, 0.345, 0.533, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.345 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.101, 0.290, 0.478, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.290 std_dev=0.189
C5	B	0, 0.342, 0.533, 0.724, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.533 std_dev=0.191
C6	B	0, 0.337, 0.549, 0.762, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.549 std_dev=0.212
N4	B	0, 0.236, 0.449, 0.662, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.449 std_dev=0.213
O2	B	0, 0.304, 0.530, 0.755, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.530 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.194, 0.421, 0.648, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.421 std_dev=0.227
O5'	A	0, 0.128, 0.374, 0.621, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.374 std_dev=0.247
C1'	B	0, 0.163, 0.414, 0.665, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.414 std_dev=0.251
O3'	A	0, 0.224, 0.476, 0.728, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.476 std_dev=0.252
C3'	B	0, 0.177, 0.436, 0.696, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.436 std_dev=0.260
P	A	0, 0.198, 0.463, 0.728, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.463 std_dev=0.265
O2'	B	0, 0.227, 0.494, 0.760, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.494 std_dev=0.267
O3'	B	0, 0.203, 0.485, 0.767, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.485 std_dev=0.282
OP2	A	0, 0.242, 0.540, 0.838, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.540 std_dev=0.298
C5'	A	0, 0.081, 0.380, 0.678, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.380 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.182, 0.485, 0.787, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.485 std_dev=0.303
C4'	B	0, 0.163, 0.509, 0.855, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.509 std_dev=0.346
OP1	A	0, 0.199, 0.549, 0.899, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.549 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.164, 0.602, 1.039, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.602 std_dev=0.438
O5'	B	0, 0.260, 0.743, 1.227, 2.115 max_d=2.115 avg_d=0.743 std_dev=0.483
P	B	0, 0.508, 1.159, 1.810, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.159 std_dev=0.651
OP1	B	0, 0.594, 1.352, 2.110, 3.744 max_d=3.744 avg_d=1.352 std_dev=0.758
OP2	B	0, 0.704, 1.602, 2.500, 5.331 max_d=5.331 avg_d=1.602 std_dev=0.898

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.08	0.07	0.16	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.10	0.03	0.16	0.14	0.22	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.10	0.00	0.02	0.01	0.13	0.14	0.11	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.10	0.06	0.10	0.12	0.11	0.02	0.01	0.01	0.17	0.19	0.11	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.23	0.24	0.30	0.23
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.05	0.07	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.24	0.24	0.29	0.23
C5'	0.02	0.08	0.02	0.03	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.11	0.15	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.08	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.20	0.17	0.21	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.15	0.12	0.19	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.20	0.20	0.27	0.20
N4	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.16	0.03	0.25	0.28	0.34	0.27
O2	0.05	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.12	0.06	0.14	0.12	0.20	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.07	0.11	0.00	0.04	0.04	0.07	0.12	0.10	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.14	0.02	0.14	0.04	0.12	0.06	0.13	0.16	0.12	0.04	0.00	0.02	0.16	0.23	0.14	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.08	0.09	0.19	0.11
O5'	0.08	0.16	0.13	0.17	0.23	0.02	0.24	0.01	0.20	0.15	0.20	0.25	0.14	0.07	0.16	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.14	0.19	0.24	0.07	0.24	0.08	0.17	0.12	0.20	0.28	0.12	0.12	0.23	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.22	0.11	0.11	0.30	0.15	0.29	0.18	0.21	0.19	0.27	0.34	0.20	0.10	0.14	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.09	0.13	0.23	0.03	0.23	0.02	0.17	0.13	0.20	0.27	0.13	0.06	0.15	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.16	0.17	0.16	0.18	0.15	0.19	0.18	0.17	0.14	0.18	0.22	0.26	0.30	0.18	0.16	0.31	0.46	0.47	0.34
C2	0.16	0.17	0.16	0.15	0.20	0.14	0.22	0.22	0.18	0.13	0.19	0.26	0.28	0.26	0.17	0.13	0.39	0.53	0.63	0.45
C2'	0.15	0.16	0.14	0.13	0.17	0.12	0.18	0.17	0.15	0.11	0.17	0.22	0.26	0.28	0.16	0.12	0.32	0.53	0.51	0.38
C3'	0.13	0.17	0.14	0.15	0.16	0.13	0.17	0.20	0.15	0.11	0.18	0.20	0.27	0.26	0.19	0.11	0.34	0.58	0.50	0.41
C4	0.15	0.19	0.17	0.18	0.16	0.19	0.22	0.32	0.20	0.15	0.20	0.20	0.27	0.22	0.20	0.16	0.48	0.63	0.76	0.57
C4'	0.15	0.20	0.14	0.11	0.17	0.12	0.16	0.14	0.14	0.13	0.21	0.20	0.30	0.26	0.15	0.12	0.27	0.48	0.41	0.31
C5	0.17	0.18	0.19	0.20	0.13	0.20	0.20	0.32	0.20	0.15	0.18	0.17	0.25	0.24	0.21	0.18	0.46	0.62	0.69	0.53
C5'	0.22	0.26	0.22	0.17	0.20	0.19	0.18	0.18	0.18	0.20	0.24	0.21	0.35	0.31	0.19	0.20	0.27	0.51	0.40	0.32
C6	0.16	0.17	0.19	0.17	0.14	0.16	0.18	0.25	0.18	0.13	0.16	0.18	0.26	0.26	0.18	0.15	0.39	0.54	0.57	0.44
N1	0.16	0.16	0.17	0.15	0.17	0.14	0.19	0.21	0.17	0.13	0.17	0.22	0.27	0.27	0.17	0.14	0.36	0.50	0.55	0.41
N3	0.15	0.19	0.16	0.16	0.19	0.15	0.23	0.27	0.19	0.14	0.19	0.25	0.28	0.24	0.18	0.14	0.44	0.59	0.72	0.53
N4	0.16	0.20	0.17	0.20	0.18	0.22	0.24	0.37	0.22	0.16	0.23	0.22	0.26	0.21	0.22	0.19	0.53	0.70	0.85	0.65
O2	0.18	0.18	0.17	0.16	0.22	0.14	0.23	0.20	0.18	0.15	0.20	0.29	0.28	0.28	0.17	0.15	0.38	0.50	0.61	0.43
O2'	0.19	0.19	0.17	0.15	0.20	0.16	0.19	0.17	0.17	0.16	0.20	0.24	0.27	0.29	0.18	0.17	0.30	0.48	0.46	0.34
O3'	0.14	0.17	0.14	0.15	0.16	0.14	0.18	0.20	0.15	0.11	0.17	0.21	0.27	0.26	0.19	0.12	0.34	0.61	0.51	0.42
O4'	0.15	0.19	0.15	0.15	0.18	0.15	0.17	0.16	0.15	0.12	0.21	0.21	0.29	0.28	0.19	0.14	0.28	0.43	0.40	0.30
O5'	0.16	0.20	0.19	0.07	0.21	0.07	0.21	0.11	0.19	0.16	0.21	0.24	0.26	0.29	0.02	0.11	0.31	0.55	0.43	0.37
OP1	0.05	0.13	0.09	0.02	0.16	0.08	0.18	0.17	0.15	0.07	0.15	0.20	0.19	0.15	0.03	0.05	0.31	0.62	0.55	0.43
OP2	0.11	0.17	0.14	0.07	0.23	0.15	0.25	0.29	0.22	0.14	0.21	0.26	0.18	0.16	0.03	0.12	0.36	0.70	0.52	0.49
P	0.05	0.12	0.10	0.02	0.16	0.06	0.18	0.15	0.15	0.08	0.15	0.20	0.17	0.15	0.01	0.03	0.30	0.58	0.44	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.13	0.15	0.26	0.17
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.11	0.03	0.27	0.25	0.46	0.30
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.14	0.01	0.02	0.01	0.15	0.23	0.21	0.14
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.10	0.06	0.11	0.11	0.13	0.02	0.01	0.01	0.22	0.31	0.22	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.38	0.37	0.66	0.43
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.09	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.13	0.19	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.05	0.40	0.38	0.66	0.45
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.19	0.01	0.22	0.00	0.19	0.11	0.14	0.21	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.12	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.05	0.35	0.31	0.52	0.37
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.26	0.23	0.41	0.28
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.33	0.31	0.57	0.37
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.04	0.41	0.41	0.74	0.48
O2	0.04	0.00	0.14	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.15	0.06	0.22	0.22	0.39	0.25
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.04	0.08	0.08	0.13	0.00	0.04	0.05	0.09	0.23	0.20	0.10
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.11	0.06	0.12	0.14	0.15	0.04	0.00	0.02	0.25	0.43	0.34	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.13	0.18	0.27	0.20
O5'	0.13	0.27	0.15	0.22	0.38	0.02	0.40	0.01	0.35	0.26	0.33	0.41	0.22	0.09	0.25	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.25	0.23	0.31	0.37	0.13	0.38	0.12	0.31	0.23	0.31	0.41	0.22	0.23	0.43	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.46	0.21	0.22	0.66	0.19	0.66	0.22	0.52	0.41	0.57	0.74	0.39	0.20	0.34	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.30	0.14	0.20	0.43	0.06	0.45	0.02	0.37	0.28	0.37	0.48	0.25	0.10	0.28	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00