Doublet Group distance statistics: 55248

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 11, 12, 8, 3, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.015, 0.022, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.017, 0.026, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.014, 0.024, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.019, 0.028, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.020, 0.031, 0.041, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.024, 0.035, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.035 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.045, 0.071, 0.096, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.071 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.031, 0.063, 0.096, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.063 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.050, 0.154, 0.258, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.154 std_dev=0.104
O4'	A	0, 0.110, 0.217, 0.324, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.217 std_dev=0.107
C2	B	0, 0.183, 0.356, 0.529, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.356 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.192, 0.375, 0.558, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.375 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.105, 0.300, 0.495, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.300 std_dev=0.195
O2'	A	0, 0.060, 0.256, 0.453, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.256 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.194, 0.395, 0.596, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.395 std_dev=0.201
O3'	B	0, 0.291, 0.501, 0.711, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.501 std_dev=0.210
C3'	B	0, 0.240, 0.450, 0.660, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.450 std_dev=0.210
C2'	B	0, 0.257, 0.468, 0.680, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.468 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.283, 0.496, 0.709, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.496 std_dev=0.213
O2	B	0, 0.241, 0.458, 0.675, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.458 std_dev=0.217
O5'	A	0, 0.195, 0.427, 0.658, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.427 std_dev=0.231
C3'	A	0, 0.067, 0.301, 0.534, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.301 std_dev=0.234
C6	B	0, 0.227, 0.462, 0.698, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.462 std_dev=0.236
P	A	0, 0.200, 0.441, 0.681, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.441 std_dev=0.240
C5	B	0, 0.295, 0.536, 0.777, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.536 std_dev=0.241
C5'	A	0, 0.208, 0.467, 0.726, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.467 std_dev=0.259
C1'	B	0, 0.229, 0.495, 0.761, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.495 std_dev=0.266
OP2	A	0, 0.253, 0.525, 0.798, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.525 std_dev=0.272
N4	B	0, 0.386, 0.668, 0.949, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.668 std_dev=0.282
OP1	A	0, 0.290, 0.602, 0.915, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.602 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.388, 0.724, 1.061, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.724 std_dev=0.336
C4'	B	0, 0.375, 0.721, 1.067, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.721 std_dev=0.346
O4'	B	0, 0.296, 0.658, 1.019, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.658 std_dev=0.362
O3'	A	0, 0.048, 0.446, 0.844, 2.850 max_d=2.850 avg_d=0.446 std_dev=0.398
O5'	B	0, 0.466, 0.962, 1.457, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.962 std_dev=0.495
C5'	B	0, 0.475, 0.973, 1.471, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.973 std_dev=0.498
P	B	0, 0.772, 1.412, 2.051, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.412 std_dev=0.639
OP1	B	0, 0.889, 1.656, 2.423, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.656 std_dev=0.767
OP2	B	0, 0.771, 1.599, 2.427, 5.244 max_d=5.244 avg_d=1.599 std_dev=0.828

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.10	0.12	0.19	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.13	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.15	0.00	0.15	0.01	0.14	0.09	0.13	0.16	0.11	0.02	0.01	0.01	0.07	0.15	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.13	0.03	0.14	0.18	0.25	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.09	0.06	0.10	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.04	0.14	0.18	0.24	0.19
C5'	0.02	0.07	0.04	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.14	0.07	0.07	0.07	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.14	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.04	0.12	0.13	0.19	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.02	0.09	0.10	0.17	0.13
N3	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.10	0.02	0.12	0.15	0.23	0.17
N4	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.15	0.04	0.15	0.22	0.28	0.22
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.13	0.04	0.10	0.11	0.18	0.14
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.10	0.10	0.09	0.07	0.07	0.06	0.11	0.12	0.12	0.00	0.04	0.08	0.05	0.11	0.12	0.06
O3'	0.07	0.08	0.01	0.01	0.13	0.02	0.15	0.07	0.12	0.04	0.10	0.15	0.13	0.04	0.00	0.05	0.15	0.28	0.24	0.20
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.08	0.05	0.00	0.08	0.09	0.12	0.10
O5'	0.07	0.10	0.09	0.07	0.14	0.01	0.14	0.01	0.12	0.09	0.12	0.15	0.10	0.05	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.12	0.12	0.15	0.18	0.08	0.18	0.08	0.13	0.10	0.15	0.22	0.11	0.11	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.19	0.13	0.12	0.25	0.03	0.24	0.02	0.19	0.17	0.23	0.28	0.18	0.12	0.24	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.10	0.09	0.20	0.02	0.19	0.02	0.15	0.13	0.17	0.22	0.14	0.06	0.20	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.22	0.22	0.18	0.18	0.18	0.17	0.20	0.19	0.21	0.21	0.19	0.27	0.31	0.20	0.21	0.34	0.42	0.38	0.32
C2	0.20	0.19	0.20	0.21	0.18	0.20	0.18	0.26	0.18	0.19	0.19	0.20	0.23	0.25	0.21	0.19	0.41	0.47	0.56	0.43
C2'	0.21	0.20	0.19	0.13	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.17	0.20	0.18	0.26	0.31	0.16	0.16	0.33	0.45	0.40	0.33
C3'	0.19	0.20	0.18	0.10	0.19	0.09	0.18	0.16	0.18	0.17	0.20	0.21	0.25	0.31	0.10	0.13	0.31	0.47	0.40	0.33
C4	0.18	0.15	0.19	0.23	0.14	0.24	0.19	0.33	0.20	0.18	0.13	0.15	0.17	0.20	0.22	0.21	0.48	0.53	0.71	0.53
C4'	0.22	0.21	0.20	0.11	0.17	0.13	0.16	0.13	0.18	0.19	0.20	0.18	0.26	0.33	0.14	0.18	0.27	0.41	0.33	0.28
C5	0.18	0.13	0.19	0.23	0.12	0.24	0.15	0.32	0.18	0.16	0.13	0.15	0.16	0.20	0.22	0.20	0.46	0.50	0.62	0.48
C5'	0.24	0.22	0.23	0.11	0.19	0.13	0.19	0.12	0.20	0.20	0.21	0.19	0.28	0.35	0.11	0.18	0.26	0.41	0.33	0.28
C6	0.20	0.18	0.20	0.21	0.15	0.21	0.16	0.26	0.18	0.18	0.17	0.16	0.21	0.23	0.21	0.19	0.40	0.45	0.48	0.39
N1	0.21	0.20	0.21	0.20	0.17	0.19	0.16	0.24	0.18	0.19	0.19	0.18	0.24	0.26	0.21	0.19	0.39	0.44	0.47	0.38
N3	0.19	0.18	0.20	0.22	0.18	0.22	0.19	0.30	0.20	0.19	0.17	0.20	0.21	0.22	0.22	0.19	0.45	0.51	0.67	0.49
N4	0.20	0.17	0.20	0.25	0.16	0.27	0.23	0.37	0.23	0.20	0.15	0.15	0.18	0.19	0.24	0.24	0.52	0.59	0.83	0.60
O2	0.22	0.21	0.21	0.20	0.20	0.19	0.19	0.24	0.19	0.20	0.21	0.23	0.25	0.27	0.21	0.20	0.40	0.46	0.54	0.41
O2'	0.25	0.23	0.22	0.15	0.18	0.16	0.16	0.17	0.18	0.21	0.22	0.19	0.30	0.34	0.16	0.21	0.30	0.42	0.37	0.30
O3'	0.19	0.17	0.19	0.11	0.16	0.11	0.17	0.19	0.17	0.15	0.17	0.19	0.24	0.33	0.13	0.13	0.32	0.51	0.44	0.37
O4'	0.24	0.21	0.21	0.18	0.18	0.18	0.17	0.18	0.20	0.20	0.21	0.18	0.27	0.32	0.21	0.21	0.31	0.40	0.32	0.29
O5'	0.21	0.20	0.25	0.08	0.18	0.07	0.19	0.11	0.20	0.19	0.19	0.18	0.25	0.32	0.02	0.14	0.28	0.45	0.33	0.30
OP1	0.06	0.09	0.10	0.03	0.13	0.11	0.18	0.23	0.16	0.07	0.10	0.16	0.16	0.18	0.02	0.07	0.31	0.52	0.48	0.39
OP2	0.08	0.13	0.09	0.06	0.22	0.17	0.26	0.30	0.22	0.14	0.17	0.25	0.13	0.10	0.02	0.13	0.36	0.55	0.45	0.40
P	0.06	0.08	0.11	0.02	0.13	0.08	0.18	0.18	0.16	0.08	0.10	0.16	0.13	0.16	0.01	0.04	0.28	0.48	0.37	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.15	0.22	0.20	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.29	0.34	0.43	0.31
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.16	0.24	0.15	0.12
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.07	0.08	0.13	0.02	0.01	0.01	0.21	0.30	0.16	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.40	0.45	0.69	0.46
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.23	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.42	0.46	0.71	0.49
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.10	0.13	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.13	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.04	0.38	0.39	0.53	0.40
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.28	0.32	0.38	0.29
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.35	0.40	0.57	0.39
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.04	0.42	0.49	0.79	0.51
O2	0.05	0.01	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.15	0.05	0.24	0.30	0.34	0.25
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.02	0.07	0.06	0.13	0.00	0.04	0.04	0.06	0.20	0.23	0.09
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.04	0.12	0.04	0.08	0.10	0.15	0.04	0.00	0.02	0.23	0.39	0.31	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.14	0.20	0.24	0.17
O5'	0.15	0.29	0.16	0.21	0.40	0.01	0.42	0.01	0.38	0.28	0.35	0.42	0.24	0.06	0.23	0.14	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.34	0.24	0.30	0.45	0.13	0.46	0.13	0.39	0.32	0.40	0.49	0.30	0.20	0.39	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.43	0.15	0.16	0.69	0.23	0.71	0.27	0.53	0.38	0.57	0.79	0.34	0.23	0.31	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.31	0.12	0.17	0.46	0.04	0.49	0.02	0.40	0.29	0.39	0.51	0.25	0.09	0.26	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00