Doublet Group distance statistics: 55251

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 2, 6, 5, 2, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.009, 0.014, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.023, 0.046, 0.069, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.046 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.047, 0.137, 0.228, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.137 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.083, 0.185, 0.286, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.185 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.141, 0.277, 0.412, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.277 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.117, 0.268, 0.419, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.268 std_dev=0.151
C3'	A	0, 0.150, 0.302, 0.455, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.302 std_dev=0.153
C2	B	0, 0.270, 0.442, 0.615, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.442 std_dev=0.172
O5'	A	0, 0.197, 0.370, 0.542, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.370 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.286, 0.475, 0.664, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.475 std_dev=0.189
P	A	0, 0.232, 0.427, 0.621, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.427 std_dev=0.195
O2	B	0, 0.246, 0.470, 0.694, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.470 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.298, 0.522, 0.746, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.522 std_dev=0.224
C5'	A	0, 0.212, 0.441, 0.670, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.441 std_dev=0.229
OP2	A	0, 0.219, 0.456, 0.694, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.456 std_dev=0.238
OP1	A	0, 0.270, 0.510, 0.749, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.510 std_dev=0.239
C2'	B	0, 0.250, 0.490, 0.730, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.490 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.265, 0.507, 0.749, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.507 std_dev=0.242
C4	B	0, 0.359, 0.611, 0.862, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.611 std_dev=0.252
C1'	B	0, 0.299, 0.557, 0.816, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.557 std_dev=0.258
C3'	B	0, 0.296, 0.557, 0.818, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.557 std_dev=0.261
O3'	B	0, 0.337, 0.612, 0.887, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.612 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.406, 0.687, 0.968, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.687 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.371, 0.654, 0.937, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.654 std_dev=0.283
C5	B	0, 0.443, 0.739, 1.034, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.739 std_dev=0.296
N4	B	0, 0.406, 0.714, 1.022, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.714 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.334, 0.681, 1.028, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.681 std_dev=0.347
C4'	B	0, 0.347, 0.703, 1.059, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.703 std_dev=0.356
C5'	B	0, 0.400, 0.843, 1.285, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.843 std_dev=0.442
O5'	B	0, 1.012, 1.747, 2.483, 2.915 max_d=2.915 avg_d=1.747 std_dev=0.735
P	B	0, 1.636, 2.902, 4.167, 4.761 max_d=4.761 avg_d=2.902 std_dev=1.265
OP1	B	0, 2.195, 3.569, 4.943, 5.258 max_d=5.258 avg_d=3.569 std_dev=1.374
OP2	B	0, 2.248, 3.784, 5.321, 5.733 max_d=5.733 avg_d=3.784 std_dev=1.536

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.05	0.06	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.03	0.11	0.12	0.16	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.09	0.10	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.16	0.19	0.22	0.18
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.17	0.19	0.22	0.19
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.14	0.15	0.16	0.15
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.10	0.11	0.14	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.14	0.15	0.20	0.16
N4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.17	0.21	0.25	0.20
O2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.09	0.05	0.08	0.09	0.14	0.11
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.00	0.07	0.05	0.03	0.10	0.05	0.04
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.10	0.05	0.11	0.14	0.09	0.07	0.00	0.02	0.08	0.21	0.16	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.05	0.07	0.12	0.11
O5'	0.05	0.11	0.04	0.04	0.16	0.01	0.17	0.01	0.14	0.10	0.14	0.17	0.08	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.12	0.10	0.13	0.19	0.06	0.19	0.05	0.15	0.11	0.15	0.21	0.09	0.10	0.21	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.16	0.07	0.09	0.22	0.03	0.22	0.02	0.16	0.14	0.20	0.25	0.14	0.05	0.16	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.04	0.06	0.18	0.02	0.19	0.01	0.15	0.12	0.16	0.20	0.11	0.04	0.13	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.20	0.16	0.21	0.22	0.19	0.26	0.26	0.25	0.19	0.21	0.22	0.28	0.21	0.20	0.18	0.53	0.38	0.89	0.63
C2	0.17	0.19	0.15	0.21	0.24	0.24	0.29	0.36	0.27	0.20	0.20	0.24	0.24	0.18	0.19	0.22	0.62	0.63	1.05	0.85
C2'	0.15	0.19	0.13	0.15	0.22	0.15	0.25	0.23	0.24	0.17	0.22	0.24	0.27	0.22	0.13	0.14	0.53	0.41	0.94	0.65
C3'	0.14	0.18	0.14	0.10	0.16	0.09	0.20	0.17	0.20	0.14	0.19	0.18	0.29	0.24	0.07	0.10	0.48	0.37	0.88	0.56
C4	0.20	0.20	0.19	0.23	0.14	0.29	0.25	0.44	0.25	0.20	0.18	0.16	0.25	0.20	0.19	0.28	0.69	0.83	1.16	1.01
C4'	0.16	0.18	0.14	0.11	0.16	0.09	0.20	0.14	0.20	0.15	0.19	0.18	0.28	0.25	0.12	0.11	0.42	0.26	0.73	0.42
C5	0.20	0.19	0.20	0.23	0.13	0.29	0.23	0.42	0.24	0.18	0.17	0.17	0.27	0.22	0.20	0.27	0.68	0.72	1.12	0.93
C5'	0.22	0.23	0.22	0.09	0.18	0.10	0.20	0.08	0.21	0.19	0.21	0.18	0.32	0.32	0.07	0.15	0.35	0.29	0.63	0.29
C6	0.18	0.18	0.19	0.22	0.14	0.25	0.24	0.36	0.24	0.17	0.15	0.16	0.28	0.22	0.19	0.22	0.62	0.55	1.00	0.78
N1	0.17	0.19	0.16	0.21	0.19	0.22	0.26	0.32	0.25	0.18	0.18	0.20	0.27	0.20	0.19	0.20	0.59	0.52	0.99	0.76
N3	0.19	0.19	0.16	0.22	0.20	0.27	0.29	0.41	0.27	0.20	0.18	0.20	0.23	0.19	0.18	0.25	0.66	0.77	1.13	0.96
N4	0.23	0.22	0.20	0.23	0.18	0.32	0.25	0.48	0.26	0.22	0.22	0.22	0.25	0.21	0.20	0.31	0.70	0.98	1.22	1.10
O2	0.17	0.21	0.15	0.22	0.30	0.23	0.32	0.34	0.28	0.22	0.26	0.32	0.22	0.18	0.19	0.21	0.60	0.60	1.03	0.82
O2'	0.16	0.21	0.15	0.17	0.25	0.15	0.27	0.21	0.24	0.18	0.25	0.28	0.27	0.25	0.16	0.15	0.50	0.33	0.89	0.59
O3'	0.15	0.18	0.15	0.09	0.17	0.08	0.20	0.14	0.19	0.14	0.19	0.19	0.28	0.27	0.07	0.10	0.45	0.39	0.86	0.52
O4'	0.15	0.18	0.14	0.20	0.18	0.17	0.22	0.22	0.22	0.16	0.19	0.19	0.29	0.21	0.22	0.14	0.46	0.27	0.75	0.49
O5'	0.18	0.24	0.21	0.08	0.18	0.06	0.19	0.12	0.18	0.17	0.23	0.19	0.33	0.27	0.02	0.10	0.41	0.32	0.73	0.41
OP1	0.06	0.15	0.10	0.01	0.13	0.07	0.17	0.18	0.15	0.07	0.15	0.16	0.26	0.17	0.01	0.04	0.37	0.46	0.62	0.28
OP2	0.09	0.17	0.09	0.07	0.23	0.17	0.27	0.30	0.24	0.15	0.20	0.26	0.21	0.08	0.02	0.16	0.58	0.57	0.87	0.60
P	0.05	0.15	0.10	0.01	0.15	0.07	0.18	0.16	0.16	0.08	0.15	0.17	0.23	0.14	0.00	0.04	0.41	0.36	0.65	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.22	0.26	0.11
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.29	0.29	0.58	0.38
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.05	0.15	0.00	0.02	0.01	0.18	0.19	0.30	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.08	0.07	0.16	0.02	0.00	0.02	0.25	0.17	0.33	0.16
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.39	0.54	0.86	0.61
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.26	0.16	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.38	0.57	0.88	0.62
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.08	0.12	0.15	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.08	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.32	0.41	0.68	0.47
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.26	0.25	0.51	0.32
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.35	0.41	0.74	0.51
N4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.42	0.63	0.97	0.69
O2	0.02	0.01	0.15	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.19	0.03	0.25	0.24	0.50	0.30
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.04	0.04	0.07	0.40	0.19	0.11
O3'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.08	0.01	0.12	0.03	0.11	0.03	0.09	0.09	0.19	0.04	0.00	0.01	0.24	0.34	0.38	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.09	0.27	0.15	0.09
O5'	0.12	0.29	0.18	0.25	0.39	0.01	0.38	0.01	0.32	0.26	0.35	0.42	0.25	0.07	0.24	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.29	0.19	0.17	0.54	0.26	0.57	0.08	0.41	0.25	0.41	0.63	0.24	0.40	0.34	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.58	0.30	0.33	0.86	0.16	0.88	0.22	0.68	0.51	0.74	0.97	0.50	0.19	0.38	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.38	0.11	0.16	0.61	0.09	0.62	0.02	0.47	0.32	0.51	0.69	0.30	0.11	0.12	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00