Doublet Group distance statistics: 55252

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 1, 2, 2, 6, 2, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.020, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.005, 0.048, 0.091, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.048 std_dev=0.043
N4	A	0, -0.002, 0.048, 0.098, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.048 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.061, 0.211, 0.362, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.211 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.098, 0.249, 0.401, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.249 std_dev=0.151
O4'	A	0, 0.038, 0.208, 0.377, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.208 std_dev=0.170
N1	B	0, 0.256, 0.472, 0.689, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.472 std_dev=0.217
C4	B	0, 0.285, 0.512, 0.739, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.512 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.232, 0.464, 0.695, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.464 std_dev=0.232
C2'	B	0, 0.240, 0.485, 0.729, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.485 std_dev=0.245
C6	B	0, 0.201, 0.447, 0.693, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.447 std_dev=0.246
C4'	A	0, 0.075, 0.324, 0.572, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.324 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.094, 0.347, 0.600, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.347 std_dev=0.253
C1'	B	0, 0.267, 0.527, 0.787, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.527 std_dev=0.260
C2	B	0, 0.287, 0.549, 0.811, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.549 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.300, 0.573, 0.846, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.573 std_dev=0.273
N4	B	0, 0.304, 0.591, 0.878, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.591 std_dev=0.287
OP2	A	0, 0.271, 0.558, 0.845, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.558 std_dev=0.287
O2'	B	0, 0.268, 0.569, 0.871, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.569 std_dev=0.301
C3'	B	0, 0.219, 0.523, 0.828, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.523 std_dev=0.305
P	A	0, 0.174, 0.506, 0.838, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.506 std_dev=0.332
O4'	B	0, 0.242, 0.588, 0.933, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.588 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.242, 0.592, 0.942, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.592 std_dev=0.350
O2	B	0, 0.304, 0.665, 1.025, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.665 std_dev=0.361
O3'	A	0, 0.199, 0.573, 0.947, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.573 std_dev=0.374
C4'	B	0, 0.214, 0.596, 0.977, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.596 std_dev=0.382
O5'	A	0, 0.010, 0.404, 0.798, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.404 std_dev=0.394
OP1	A	0, 0.207, 0.610, 1.013, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.610 std_dev=0.403
C5'	A	0, 0.079, 0.489, 0.899, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.489 std_dev=0.410
O5'	B	0, 0.172, 0.657, 1.143, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.657 std_dev=0.485
C5'	B	0, 0.157, 0.660, 1.162, 2.094 max_d=2.094 avg_d=0.660 std_dev=0.502
P	B	0, 0.165, 0.732, 1.299, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.732 std_dev=0.567
OP2	B	0, 0.087, 0.813, 1.539, 2.785 max_d=2.785 avg_d=0.813 std_dev=0.726
OP1	B	0, 0.202, 0.939, 1.676, 2.797 max_d=2.797 avg_d=0.939 std_dev=0.737

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.08	0.13	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.05	0.11	0.13	0.18	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.08	0.07	0.14	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.12	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.10	0.05	0.10	0.11	0.12	0.02	0.01	0.01	0.09	0.20	0.17	0.13
C4	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.05	0.15	0.20	0.24	0.20
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.16	0.20	0.24	0.21
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.12	0.06	0.14	0.16	0.19	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.10	0.12	0.17	0.14
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.05	0.13	0.16	0.22	0.18
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.05	0.17	0.23	0.27	0.23
O2	0.02	0.01	0.14	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.15	0.08	0.09	0.11	0.17	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.03	0.07	0.07	0.13	0.00	0.06	0.06	0.06	0.13	0.11	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.03	0.13	0.03	0.12	0.05	0.12	0.15	0.15	0.06	0.00	0.02	0.13	0.33	0.27	0.22
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.05	0.08	0.06	0.02	0.00	0.08	0.12	0.16	0.16
O5'	0.07	0.11	0.06	0.09	0.15	0.02	0.16	0.01	0.14	0.10	0.13	0.17	0.09	0.06	0.13	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.13	0.14	0.20	0.20	0.07	0.20	0.06	0.16	0.12	0.16	0.23	0.11	0.13	0.33	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.18	0.12	0.17	0.24	0.05	0.24	0.02	0.19	0.17	0.22	0.27	0.17	0.11	0.27	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.07	0.13	0.20	0.03	0.21	0.02	0.17	0.14	0.18	0.23	0.13	0.07	0.22	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.23	0.20	0.21	0.25	0.20	0.24	0.21	0.21	0.17	0.26	0.29	0.34	0.26	0.25	0.18	0.23	0.29	0.32	0.24
C2	0.21	0.21	0.22	0.21	0.22	0.20	0.25	0.20	0.23	0.17	0.21	0.28	0.36	0.28	0.22	0.19	0.22	0.35	0.42	0.25
C2'	0.14	0.23	0.13	0.12	0.25	0.11	0.24	0.13	0.20	0.15	0.26	0.30	0.34	0.22	0.13	0.12	0.20	0.26	0.31	0.22
C3'	0.15	0.25	0.14	0.09	0.24	0.09	0.23	0.11	0.21	0.17	0.26	0.28	0.35	0.23	0.06	0.12	0.20	0.26	0.28	0.22
C4	0.22	0.23	0.23	0.23	0.20	0.22	0.29	0.24	0.28	0.21	0.23	0.23	0.33	0.26	0.22	0.22	0.27	0.40	0.53	0.31
C4'	0.17	0.27	0.14	0.09	0.24	0.08	0.21	0.09	0.19	0.19	0.28	0.27	0.36	0.24	0.12	0.12	0.17	0.21	0.23	0.17
C5	0.22	0.23	0.22	0.24	0.23	0.25	0.30	0.28	0.31	0.22	0.24	0.24	0.30	0.23	0.23	0.25	0.31	0.38	0.51	0.34
C5'	0.29	0.34	0.29	0.15	0.28	0.16	0.25	0.11	0.26	0.28	0.32	0.29	0.41	0.37	0.07	0.23	0.17	0.23	0.21	0.16
C6	0.22	0.26	0.23	0.25	0.25	0.24	0.28	0.27	0.29	0.23	0.27	0.27	0.34	0.24	0.24	0.24	0.30	0.34	0.43	0.31
N1	0.19	0.23	0.21	0.22	0.24	0.20	0.26	0.22	0.24	0.18	0.25	0.28	0.35	0.26	0.23	0.19	0.24	0.32	0.39	0.26
N3	0.23	0.24	0.24	0.22	0.20	0.21	0.27	0.22	0.25	0.21	0.22	0.26	0.37	0.28	0.22	0.21	0.24	0.39	0.49	0.28
N4	0.23	0.25	0.24	0.23	0.18	0.23	0.30	0.26	0.29	0.22	0.24	0.18	0.32	0.26	0.23	0.23	0.28	0.44	0.60	0.33
O2	0.21	0.19	0.22	0.20	0.21	0.19	0.23	0.19	0.20	0.16	0.19	0.30	0.34	0.29	0.22	0.19	0.20	0.35	0.39	0.23
O2'	0.20	0.25	0.19	0.18	0.26	0.18	0.24	0.18	0.21	0.19	0.27	0.31	0.35	0.29	0.20	0.19	0.21	0.25	0.30	0.22
O3'	0.18	0.25	0.18	0.13	0.24	0.13	0.24	0.14	0.22	0.19	0.26	0.28	0.35	0.27	0.11	0.15	0.23	0.30	0.29	0.25
O4'	0.13	0.26	0.14	0.20	0.25	0.17	0.21	0.19	0.18	0.16	0.28	0.28	0.35	0.22	0.28	0.13	0.22	0.27	0.27	0.23
O5'	0.20	0.26	0.22	0.09	0.20	0.09	0.20	0.08	0.19	0.20	0.25	0.22	0.34	0.29	0.01	0.14	0.15	0.25	0.23	0.16
OP1	0.05	0.13	0.09	0.02	0.10	0.09	0.14	0.18	0.13	0.05	0.12	0.13	0.22	0.16	0.02	0.05	0.19	0.47	0.28	0.23
OP2	0.09	0.15	0.10	0.08	0.16	0.15	0.20	0.24	0.19	0.11	0.16	0.18	0.21	0.12	0.02	0.14	0.27	0.36	0.32	0.26
P	0.05	0.12	0.09	0.02	0.10	0.06	0.14	0.13	0.13	0.06	0.12	0.13	0.21	0.15	0.01	0.03	0.16	0.34	0.24	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.25	0.11	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.04	0.11	0.40	0.27	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.04	0.05	0.13	0.01	0.02	0.01	0.04	0.14	0.12	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.06	0.07	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.14	0.52	0.41	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.05	0.14	0.52	0.41	0.19
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.11	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.06	0.12	0.45	0.29	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.10	0.37	0.22	0.13
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.03	0.13	0.47	0.35	0.17
N4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.15	0.55	0.47	0.21
O2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.15	0.07	0.10	0.36	0.22	0.13
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.05	0.05	0.12	0.00	0.06	0.04	0.04	0.11	0.10	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.10	0.03	0.07	0.08	0.15	0.06	0.00	0.02	0.08	0.27	0.17	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.07	0.23	0.11	0.10
O5'	0.06	0.11	0.04	0.06	0.14	0.02	0.14	0.01	0.12	0.10	0.13	0.15	0.10	0.04	0.08	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.25	0.40	0.14	0.14	0.52	0.08	0.52	0.11	0.45	0.37	0.47	0.55	0.36	0.11	0.27	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.27	0.12	0.12	0.41	0.12	0.41	0.19	0.29	0.22	0.35	0.47	0.22	0.10	0.17	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.07	0.19	0.02	0.19	0.01	0.16	0.13	0.17	0.21	0.13	0.05	0.11	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00