Doublet Group distance statistics: 55254

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.041 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.014, 0.051, 0.087, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.051 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.024, 0.122, 0.219, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.122 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.023, 0.124, 0.225, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.124 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.049, 0.208, 0.368, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.208 std_dev=0.160
C4'	A	0, 0.108, 0.268, 0.429, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.268 std_dev=0.161
C3'	A	0, 0.118, 0.279, 0.440, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.279 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.203, 0.456, 0.710, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.456 std_dev=0.254
N1	B	0, 0.350, 0.606, 0.862, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.606 std_dev=0.256
C1'	B	0, 0.281, 0.556, 0.832, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.556 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.364, 0.650, 0.936, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.650 std_dev=0.286
O2	B	0, 0.367, 0.655, 0.943, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.655 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.194, 0.483, 0.773, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.483 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.378, 0.683, 0.988, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.683 std_dev=0.305
C5'	A	0, 0.090, 0.398, 0.705, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.398 std_dev=0.308
OP2	A	0, 0.156, 0.477, 0.798, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.477 std_dev=0.321
C3'	B	0, 0.190, 0.530, 0.870, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.530 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.280, 0.632, 0.985, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.632 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.392, 0.757, 1.123, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.757 std_dev=0.366
O2'	B	0, 0.155, 0.528, 0.901, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.528 std_dev=0.373
C5	B	0, 0.398, 0.773, 1.148, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.773 std_dev=0.375
C4	B	0, 0.410, 0.804, 1.198, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.804 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.206, 0.619, 1.032, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.619 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.410, 0.830, 1.251, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.830 std_dev=0.421
OP2	B	0, 0.549, 0.972, 1.394, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.972 std_dev=0.422
O3'	B	0, 0.102, 0.536, 0.970, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.536 std_dev=0.434
C5'	B	0, 0.329, 0.777, 1.224, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.777 std_dev=0.448
P	B	0, 0.539, 0.991, 1.442, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.991 std_dev=0.451
N4	B	0, 0.492, 0.946, 1.400, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.946 std_dev=0.454
OP1	B	0, 0.483, 1.037, 1.591, 1.994 max_d=1.994 avg_d=1.037 std_dev=0.554
O5'	A	0, -0.096, 0.551, 1.198, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.551 std_dev=0.647
P	A	0, -0.179, 0.724, 1.627, 3.018 max_d=3.018 avg_d=0.724 std_dev=0.903
OP1	A	0, -0.469, 1.118, 2.705, 5.221 max_d=5.221 avg_d=1.118 std_dev=1.587

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.43	0.26	0.03
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.04	0.13	0.85	0.24	0.23
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.17	0.46	0.11	0.20
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.07	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.33	0.47	0.03	0.32
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.03	0.27	1.21	0.22	0.43
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.04	0.04	0.07	0.04	0.04	0.03	0.00	0.01	0.15	0.13	0.00
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.02	0.30	1.24	0.22	0.45
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.16	0.00	0.17	0.00	0.16	0.10	0.12	0.17	0.09	0.04	0.05	0.01	0.01	0.12	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.23	1.00	0.23	0.33
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.12	0.77	0.24	0.20
N3	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.09	0.04	0.20	1.05	0.23	0.33
N4	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.07	0.02	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.09	0.03	0.31	1.34	0.22	0.50
O2	0.05	0.00	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.09	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.05	0.10	0.07	0.08	0.70	0.24	0.16
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.02	0.02	0.06	0.21	0.12	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.03	0.08	0.05	0.08	0.03	0.09	0.09	0.10	0.02	0.00	0.02	0.42	0.33	0.15	0.39
O4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.02	0.02	0.00	0.23	0.19	0.33	0.17
O5'	0.07	0.13	0.17	0.33	0.27	0.01	0.30	0.01	0.23	0.12	0.20	0.31	0.08	0.06	0.42	0.23	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.43	0.85	0.46	0.47	1.21	0.15	1.24	0.12	1.00	0.77	1.05	1.34	0.70	0.21	0.33	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.24	0.11	0.03	0.22	0.13	0.22	0.11	0.23	0.24	0.23	0.22	0.24	0.12	0.15	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.23	0.20	0.32	0.43	0.00	0.45	0.01	0.33	0.20	0.33	0.50	0.16	0.06	0.39	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.25	0.23	0.22	0.21	0.23	0.22	0.24	0.24	0.25	0.23	0.20	0.27	0.25	0.19	0.24	0.28	0.34	0.37	0.32
C2	0.20	0.21	0.19	0.20	0.23	0.21	0.23	0.24	0.23	0.21	0.22	0.23	0.20	0.19	0.18	0.22	0.28	0.35	0.39	0.33
C2'	0.23	0.24	0.21	0.18	0.20	0.20	0.18	0.19	0.20	0.22	0.23	0.20	0.29	0.25	0.16	0.22	0.24	0.31	0.33	0.27
C3'	0.17	0.17	0.18	0.15	0.14	0.15	0.13	0.14	0.12	0.14	0.16	0.18	0.23	0.24	0.15	0.16	0.18	0.27	0.28	0.22
C4	0.23	0.21	0.23	0.25	0.18	0.27	0.22	0.30	0.24	0.23	0.19	0.15	0.20	0.23	0.24	0.27	0.34	0.41	0.45	0.40
C4'	0.13	0.14	0.16	0.12	0.16	0.13	0.13	0.11	0.09	0.10	0.15	0.20	0.20	0.24	0.13	0.13	0.14	0.22	0.21	0.16
C5	0.24	0.19	0.25	0.29	0.11	0.29	0.17	0.33	0.22	0.22	0.14	0.11	0.20	0.25	0.28	0.29	0.37	0.44	0.47	0.43
C5'	0.07	0.17	0.11	0.10	0.27	0.10	0.25	0.09	0.16	0.11	0.24	0.32	0.19	0.22	0.16	0.09	0.10	0.18	0.12	0.09
C6	0.25	0.20	0.26	0.28	0.14	0.29	0.19	0.31	0.23	0.23	0.15	0.15	0.21	0.26	0.27	0.28	0.35	0.42	0.45	0.40
N1	0.23	0.22	0.23	0.23	0.20	0.24	0.21	0.26	0.23	0.23	0.20	0.19	0.22	0.23	0.21	0.24	0.31	0.37	0.40	0.35
N3	0.21	0.21	0.20	0.21	0.22	0.23	0.24	0.26	0.24	0.22	0.21	0.22	0.20	0.20	0.20	0.23	0.30	0.37	0.41	0.36
N4	0.25	0.23	0.24	0.27	0.22	0.29	0.26	0.33	0.27	0.25	0.21	0.18	0.22	0.24	0.26	0.30	0.36	0.44	0.48	0.42
O2	0.18	0.22	0.16	0.16	0.25	0.18	0.25	0.21	0.23	0.21	0.25	0.26	0.21	0.17	0.14	0.20	0.25	0.31	0.36	0.30
O2'	0.25	0.27	0.21	0.17	0.22	0.19	0.21	0.18	0.22	0.25	0.26	0.21	0.32	0.25	0.13	0.23	0.23	0.29	0.31	0.26
O3'	0.15	0.17	0.16	0.11	0.14	0.12	0.12	0.09	0.10	0.12	0.17	0.18	0.25	0.24	0.10	0.13	0.13	0.23	0.24	0.17
O4'	0.20	0.16	0.21	0.20	0.15	0.21	0.16	0.21	0.17	0.17	0.15	0.17	0.22	0.24	0.19	0.20	0.25	0.32	0.33	0.28
O5'	0.72	0.40	0.85	0.78	0.16	0.78	0.21	0.65	0.36	0.49	0.21	0.19	0.51	1.01	0.87	0.72	0.55	0.54	0.35	0.47
OP1	0.37	0.25	0.62	0.70	0.84	0.73	0.75	0.61	0.38	0.11	0.60	1.10	0.08	1.01	1.18	0.45	0.29	0.45	0.25	0.16
OP2	0.57	0.40	0.61	0.66	0.26	0.65	0.29	0.60	0.39	0.46	0.31	0.21	0.45	0.66	0.70	0.60	0.59	0.56	0.43	0.53
P	0.78	0.34	0.92	1.00	0.14	1.00	0.15	0.88	0.32	0.47	0.12	0.30	0.47	1.12	1.27	0.85	0.69	0.70	0.33	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.02
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.04
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.11	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.04	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.13	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.13	0.13	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.16	0.15	0.13	0.13
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.09	0.04	0.06	0.09	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.14	0.12	0.08	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.09	0.05	0.04
N3	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.09	0.10	0.10	0.08
N4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.14	0.14	0.15	0.14
O2	0.04	0.00	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.02	0.02	0.13	0.08	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.10	0.04	0.06	0.09	0.11	0.02	0.00	0.01	0.09	0.22	0.18	0.13
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.09	0.08
O5'	0.04	0.06	0.04	0.06	0.13	0.01	0.16	0.01	0.14	0.08	0.09	0.14	0.04	0.02	0.09	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.08	0.15	0.18	0.13	0.10	0.15	0.07	0.12	0.09	0.10	0.14	0.07	0.13	0.22	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.06	0.11	0.13	0.13	0.03	0.13	0.01	0.08	0.05	0.10	0.15	0.05	0.08	0.18	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.06	0.09	0.12	0.02	0.13	0.02	0.09	0.04	0.08	0.14	0.03	0.03	0.13	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00