Doublet Group distance statistics: 55255

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.019, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.024 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.011, 0.045, 0.078, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.045 std_dev=0.034
N4	A	0, 0.024, 0.066, 0.107, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.066 std_dev=0.041
C6	B	0, 0.217, 0.391, 0.564, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.391 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.185, 0.362, 0.539, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.362 std_dev=0.177
C2	B	0, 0.151, 0.333, 0.515, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.333 std_dev=0.182
C2'	A	0, 0.047, 0.230, 0.413, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.230 std_dev=0.183
O4'	A	0, 0.042, 0.225, 0.409, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.225 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.119, 0.312, 0.504, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.312 std_dev=0.193
C5	B	0, 0.201, 0.393, 0.586, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.393 std_dev=0.193
C4	B	0, 0.141, 0.339, 0.538, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.339 std_dev=0.199
O5'	A	0, 0.206, 0.416, 0.626, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.416 std_dev=0.210
N4	B	0, 0.193, 0.404, 0.614, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.404 std_dev=0.210
O2'	A	0, 0.118, 0.340, 0.562, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.340 std_dev=0.222
O2	B	0, 0.176, 0.402, 0.627, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.402 std_dev=0.225
O3'	A	0, 0.150, 0.423, 0.696, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.423 std_dev=0.273
C2'	B	0, 0.194, 0.473, 0.752, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.473 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.070, 0.353, 0.637, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.353 std_dev=0.283
C1'	B	0, 0.148, 0.447, 0.745, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.447 std_dev=0.299
C4'	A	0, 0.065, 0.372, 0.679, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.372 std_dev=0.307
C3'	B	0, 0.243, 0.586, 0.928, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.586 std_dev=0.343
P	A	0, 0.235, 0.635, 1.034, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.635 std_dev=0.400
O3'	B	0, 0.271, 0.689, 1.106, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.689 std_dev=0.418
O2'	B	0, 0.177, 0.597, 1.017, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.597 std_dev=0.420
O4'	B	0, 0.114, 0.539, 0.964, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.539 std_dev=0.425
O5'	B	0, 0.321, 0.761, 1.201, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.761 std_dev=0.440
C4'	B	0, 0.173, 0.616, 1.058, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.616 std_dev=0.443
P	B	0, 0.582, 1.073, 1.564, 1.503 max_d=1.503 avg_d=1.073 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.251, 0.764, 1.277, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.764 std_dev=0.513
OP2	A	0, 0.335, 0.850, 1.366, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.850 std_dev=0.516
OP2	B	0, 0.617, 1.170, 1.723, 1.862 max_d=1.862 avg_d=1.170 std_dev=0.553
OP1	B	0, 0.683, 1.284, 1.885, 1.818 max_d=1.818 avg_d=1.284 std_dev=0.601
OP1	A	0, 0.274, 0.876, 1.477, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.876 std_dev=0.601
C5'	A	0, 0.068, 0.747, 1.426, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.747 std_dev=0.679

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.34	0.09
C2	0.03	0.00	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.16	0.16	0.44	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.08	0.02	0.04	0.05	0.13	0.00	0.03	0.01	0.23	0.23	0.18	0.13
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.10	0.06	0.13	0.10	0.19	0.02	0.01	0.01	0.33	0.31	0.11	0.21
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.05	0.22	0.28	0.48	0.24
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.11	0.00	0.11	0.01	0.09	0.05	0.09	0.12	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.10	0.29	0.03
C5	0.03	0.01	0.07	0.10	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.08	0.24	0.27	0.47	0.24
C5'	0.03	0.19	0.03	0.05	0.26	0.01	0.24	0.00	0.18	0.14	0.24	0.29	0.17	0.04	0.07	0.01	0.01	0.10	0.33	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.07	0.21	0.20	0.43	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.16	0.14	0.41	0.14
N3	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.12	0.02	0.19	0.23	0.47	0.20
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.12	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.06	0.24	0.33	0.50	0.27
O2	0.07	0.00	0.13	0.19	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.14	0.18	0.06	0.15	0.13	0.41	0.14
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.10	0.10	0.14	0.00	0.07	0.05	0.07	0.19	0.22	0.04
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.09	0.03	0.11	0.07	0.11	0.05	0.12	0.10	0.18	0.07	0.00	0.02	0.27	0.36	0.12	0.23
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.06	0.05	0.02	0.00	0.08	0.08	0.38	0.14
O5'	0.08	0.16	0.23	0.33	0.22	0.01	0.24	0.01	0.21	0.16	0.19	0.24	0.15	0.07	0.27	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.08	0.16	0.23	0.31	0.28	0.10	0.27	0.10	0.20	0.14	0.23	0.33	0.13	0.19	0.36	0.08	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.44	0.18	0.11	0.48	0.29	0.47	0.33	0.43	0.41	0.47	0.50	0.41	0.22	0.12	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.16	0.13	0.21	0.24	0.03	0.24	0.02	0.18	0.14	0.20	0.27	0.14	0.04	0.23	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.14	0.14	0.26	0.12	0.23	0.15	0.16	0.14	0.23	0.30	0.19	0.27	0.14	0.14	0.16	0.15	0.23	0.18
C2	0.14	0.12	0.13	0.10	0.25	0.09	0.22	0.12	0.14	0.11	0.18	0.33	0.16	0.24	0.11	0.10	0.14	0.13	0.23	0.17
C2'	0.12	0.15	0.10	0.18	0.27	0.13	0.26	0.21	0.18	0.12	0.22	0.33	0.18	0.24	0.23	0.09	0.24	0.24	0.33	0.27
C3'	0.13	0.16	0.16	0.28	0.25	0.24	0.27	0.32	0.23	0.16	0.21	0.28	0.15	0.22	0.34	0.17	0.32	0.31	0.37	0.34
C4	0.13	0.10	0.18	0.12	0.18	0.10	0.17	0.08	0.07	0.08	0.09	0.30	0.18	0.26	0.14	0.11	0.07	0.11	0.18	0.11
C4'	0.15	0.20	0.16	0.20	0.24	0.17	0.23	0.21	0.20	0.17	0.24	0.26	0.21	0.23	0.22	0.15	0.20	0.15	0.23	0.19
C5	0.15	0.13	0.21	0.12	0.22	0.11	0.21	0.08	0.10	0.10	0.14	0.30	0.19	0.28	0.14	0.13	0.08	0.11	0.21	0.13
C5'	0.30	0.26	0.31	0.33	0.22	0.34	0.24	0.34	0.27	0.27	0.23	0.19	0.31	0.36	0.36	0.33	0.27	0.17	0.23	0.23
C6	0.13	0.13	0.16	0.08	0.26	0.08	0.24	0.11	0.15	0.10	0.20	0.31	0.19	0.27	0.08	0.10	0.14	0.14	0.25	0.18
N1	0.15	0.13	0.14	0.11	0.27	0.10	0.24	0.14	0.16	0.12	0.21	0.32	0.16	0.25	0.11	0.11	0.16	0.15	0.24	0.19
N3	0.12	0.09	0.14	0.08	0.20	0.06	0.18	0.08	0.08	0.06	0.12	0.31	0.17	0.24	0.10	0.07	0.09	0.10	0.19	0.13
N4	0.16	0.14	0.21	0.17	0.12	0.14	0.14	0.11	0.10	0.12	0.10	0.23	0.20	0.27	0.19	0.15	0.10	0.14	0.17	0.11
O2	0.18	0.15	0.16	0.14	0.25	0.13	0.23	0.16	0.16	0.14	0.20	0.32	0.18	0.25	0.15	0.14	0.16	0.15	0.23	0.19
O2'	0.22	0.19	0.15	0.12	0.26	0.11	0.22	0.12	0.15	0.15	0.24	0.33	0.26	0.32	0.15	0.17	0.14	0.15	0.24	0.18
O3'	0.14	0.16	0.17	0.28	0.25	0.24	0.26	0.33	0.22	0.16	0.21	0.28	0.15	0.24	0.35	0.17	0.32	0.32	0.37	0.34
O4'	0.13	0.18	0.12	0.16	0.26	0.12	0.23	0.16	0.17	0.14	0.25	0.29	0.18	0.24	0.15	0.11	0.16	0.16	0.20	0.17
O5'	0.17	0.12	0.22	0.05	0.25	0.06	0.26	0.09	0.19	0.11	0.19	0.31	0.14	0.45	0.01	0.10	0.15	0.16	0.28	0.18
OP1	0.04	0.07	0.08	0.03	0.14	0.09	0.21	0.18	0.17	0.04	0.07	0.17	0.18	0.15	0.03	0.06	0.11	0.21	0.23	0.17
OP2	0.15	0.22	0.25	0.04	0.31	0.16	0.34	0.36	0.29	0.22	0.26	0.34	0.22	0.27	0.01	0.10	0.32	0.38	0.39	0.37
P	0.08	0.04	0.14	0.01	0.16	0.06	0.22	0.17	0.19	0.08	0.07	0.19	0.10	0.22	0.01	0.02	0.13	0.16	0.22	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.10	0.11	0.25	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.16	0.00	0.03	0.00	0.07	0.07	0.14	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.02	0.11	0.03	0.05	0.06	0.14	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.17	0.25	0.38	0.28
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.20	0.29	0.39	0.31
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.14	0.08	0.07	0.13	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.19	0.22	0.29	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.12	0.12	0.22	0.16
N3	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.13	0.18	0.32	0.23
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.19	0.30	0.42	0.32
O2	0.03	0.00	0.16	0.14	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.20	0.03	0.07	0.05	0.20	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.02	0.06	0.04	0.15	0.00	0.05	0.04	0.04	0.07	0.09	0.04
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.07	0.02	0.13	0.03	0.12	0.03	0.08	0.09	0.20	0.05	0.00	0.02	0.10	0.16	0.15	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.07	0.09	0.05	0.08
O5'	0.05	0.10	0.07	0.08	0.17	0.02	0.20	0.01	0.19	0.12	0.13	0.19	0.07	0.04	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.03	0.11	0.07	0.10	0.25	0.05	0.29	0.07	0.22	0.12	0.18	0.30	0.05	0.07	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.25	0.14	0.13	0.38	0.03	0.39	0.02	0.29	0.22	0.32	0.42	0.20	0.09	0.15	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.07	0.09	0.28	0.02	0.31	0.03	0.24	0.16	0.23	0.32	0.13	0.04	0.12	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00