Doublet Group distance statistics: 55257

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.022, 0.041, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.005, 0.015, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.014, 0.044, 0.075, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.044 std_dev=0.031
O2	A	0, -0.016, 0.046, 0.108, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.046 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.039, 0.116, 0.193, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.116 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.034, 0.118, 0.202, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.118 std_dev=0.084
O2'	A	0, 0.069, 0.175, 0.281, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.175 std_dev=0.106
C4'	A	0, 0.034, 0.153, 0.273, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.153 std_dev=0.120
C3'	A	0, 0.030, 0.164, 0.297, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.164 std_dev=0.133
O5'	A	0, 0.100, 0.261, 0.422, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.261 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.118, 0.299, 0.480, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.299 std_dev=0.181
C5'	A	0, 0.050, 0.237, 0.423, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.237 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.240, 0.460, 0.681, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.460 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.246, 0.469, 0.691, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.469 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.265, 0.499, 0.734, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.499 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.256, 0.502, 0.748, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.502 std_dev=0.246
P	A	0, 0.107, 0.361, 0.614, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.361 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.305, 0.570, 0.834, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.570 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.227, 0.493, 0.759, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.493 std_dev=0.266
N4	B	0, 0.229, 0.503, 0.777, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.503 std_dev=0.274
OP1	A	0, 0.142, 0.416, 0.691, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.416 std_dev=0.275
N3	B	0, 0.291, 0.568, 0.846, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.568 std_dev=0.277
O4'	B	0, 0.242, 0.522, 0.801, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.522 std_dev=0.279
C4'	B	0, 0.211, 0.499, 0.787, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.499 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.150, 0.445, 0.740, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.445 std_dev=0.295
O2'	B	0, 0.134, 0.430, 0.726, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.430 std_dev=0.296
C5'	B	0, 0.250, 0.551, 0.851, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.551 std_dev=0.301
C3'	B	0, 0.164, 0.467, 0.769, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.467 std_dev=0.302
O2	B	0, 0.332, 0.645, 0.958, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.645 std_dev=0.313
O3'	B	0, 0.105, 0.424, 0.743, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.424 std_dev=0.319
OP2	A	0, 0.146, 0.514, 0.883, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.514 std_dev=0.368
O5'	B	0, 1.190, 2.284, 3.379, 3.242 max_d=3.242 avg_d=2.284 std_dev=1.094
P	B	0, 1.713, 3.209, 4.705, 4.462 max_d=4.462 avg_d=3.209 std_dev=1.496
OP1	B	0, 1.647, 3.172, 4.696, 4.616 max_d=4.616 avg_d=3.172 std_dev=1.524
OP2	B	0, 2.075, 3.821, 5.567, 5.071 max_d=5.071 avg_d=3.821 std_dev=1.746

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.10	0.08
C2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.03	0.10	0.10	0.18	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.08	0.08	0.13	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.08	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.08	0.08	0.12	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.10	0.05
C4	0.03	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.01	0.16	0.20	0.28	0.21
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.17	0.21	0.27	0.22
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.07	0.11	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.07	0.02	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.14	0.14	0.19	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.09	0.09	0.15	0.12
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.13	0.15	0.24	0.17
N4	0.03	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02	0.17	0.23	0.31	0.24
O2	0.08	0.00	0.13	0.12	0.01	0.11	0.02	0.09	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.14	0.13	0.08	0.08	0.08	0.15	0.12
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.08	0.08	0.14	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.06	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.05	0.10	0.11	0.13	0.02	0.00	0.01	0.06	0.20	0.13	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.12	0.12
O5'	0.04	0.10	0.04	0.04	0.16	0.01	0.17	0.01	0.14	0.09	0.13	0.17	0.08	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.10	0.11	0.14	0.20	0.08	0.21	0.07	0.14	0.09	0.15	0.23	0.08	0.11	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.18	0.08	0.10	0.28	0.04	0.27	0.02	0.19	0.15	0.24	0.31	0.15	0.06	0.13	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.03	0.05	0.21	0.04	0.22	0.03	0.16	0.12	0.17	0.24	0.12	0.04	0.09	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.15	0.23	0.27	0.20	0.27	0.24	0.33	0.28	0.22	0.20	0.22	0.14	0.20	0.24	0.25	0.42	0.48	0.55	0.47
C2	0.22	0.14	0.21	0.26	0.18	0.28	0.27	0.35	0.29	0.21	0.17	0.21	0.14	0.18	0.22	0.25	0.51	0.61	0.67	0.60
C2'	0.19	0.15	0.18	0.21	0.21	0.21	0.24	0.27	0.25	0.19	0.20	0.24	0.15	0.20	0.17	0.20	0.37	0.46	0.56	0.45
C3'	0.15	0.16	0.15	0.14	0.18	0.14	0.18	0.20	0.19	0.13	0.21	0.22	0.21	0.23	0.11	0.14	0.30	0.40	0.51	0.37
C4	0.17	0.12	0.19	0.23	0.14	0.26	0.13	0.33	0.20	0.12	0.19	0.26	0.15	0.19	0.22	0.20	0.53	0.69	0.73	0.65
C4'	0.15	0.19	0.15	0.16	0.18	0.15	0.15	0.20	0.16	0.13	0.24	0.22	0.26	0.23	0.17	0.13	0.25	0.33	0.41	0.30
C5	0.17	0.15	0.21	0.24	0.20	0.25	0.09	0.32	0.17	0.10	0.24	0.29	0.18	0.21	0.23	0.19	0.50	0.64	0.67	0.60
C5'	0.20	0.27	0.20	0.07	0.20	0.07	0.13	0.11	0.14	0.18	0.28	0.23	0.34	0.31	0.10	0.12	0.16	0.26	0.32	0.20
C6	0.18	0.13	0.20	0.24	0.18	0.26	0.15	0.33	0.21	0.12	0.23	0.25	0.18	0.20	0.21	0.21	0.47	0.56	0.61	0.54
N1	0.21	0.12	0.21	0.26	0.17	0.28	0.23	0.35	0.27	0.19	0.19	0.22	0.14	0.19	0.22	0.24	0.48	0.56	0.61	0.55
N3	0.20	0.11	0.19	0.24	0.13	0.27	0.22	0.35	0.26	0.17	0.16	0.21	0.14	0.18	0.21	0.23	0.53	0.67	0.72	0.64
N4	0.16	0.14	0.19	0.23	0.17	0.25	0.08	0.33	0.16	0.11	0.21	0.28	0.17	0.19	0.23	0.19	0.53	0.75	0.77	0.69
O2	0.27	0.21	0.25	0.29	0.23	0.31	0.31	0.37	0.32	0.27	0.21	0.22	0.20	0.21	0.26	0.29	0.52	0.61	0.67	0.60
O2'	0.23	0.20	0.21	0.24	0.24	0.24	0.27	0.29	0.28	0.23	0.23	0.26	0.18	0.20	0.21	0.23	0.37	0.43	0.54	0.43
O3'	0.15	0.17	0.15	0.11	0.19	0.11	0.18	0.17	0.18	0.14	0.21	0.23	0.22	0.25	0.09	0.13	0.26	0.37	0.50	0.34
O4'	0.19	0.16	0.21	0.27	0.18	0.25	0.17	0.30	0.20	0.16	0.23	0.22	0.21	0.21	0.27	0.20	0.35	0.41	0.46	0.39
O5'	0.19	0.30	0.22	0.05	0.24	0.03	0.14	0.11	0.13	0.20	0.32	0.26	0.36	0.26	0.02	0.11	0.15	0.31	0.36	0.23
OP1	0.08	0.22	0.13	0.01	0.16	0.07	0.07	0.18	0.05	0.10	0.24	0.19	0.30	0.18	0.01	0.02	0.16	0.26	0.30	0.19
OP2	0.05	0.14	0.06	0.05	0.13	0.18	0.11	0.31	0.12	0.07	0.16	0.15	0.19	0.06	0.01	0.13	0.25	0.43	0.43	0.36
P	0.06	0.19	0.12	0.01	0.14	0.07	0.07	0.17	0.06	0.08	0.21	0.17	0.25	0.14	0.00	0.02	0.15	0.28	0.30	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.14	0.13	0.07	0.08
C2	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.13	0.01	0.26	0.25	0.22	0.23
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.08	0.04	0.15	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.07	0.06
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.11	0.07	0.16	0.02	0.00	0.01	0.11	0.15	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.36	0.38	0.40	0.39
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.05	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.10	0.14	0.05
C5	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.39	0.40	0.41	0.42
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.07	0.09	0.11	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.15	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.35	0.33	0.28	0.33
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.26	0.24	0.18	0.22
N3	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.31	0.32	0.32	0.31
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.39	0.43	0.47	0.44
O2	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.18	0.02	0.20	0.20	0.17	0.17
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.04	0.11	0.00	0.02	0.05	0.03	0.08	0.12	0.08
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.09	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.14	0.10	0.18	0.02	0.00	0.01	0.12	0.13	0.11	0.06
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.12	0.13	0.12	0.04
O5'	0.14	0.26	0.09	0.11	0.36	0.01	0.39	0.01	0.35	0.26	0.31	0.39	0.20	0.03	0.12	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.13	0.25	0.12	0.15	0.38	0.10	0.40	0.15	0.33	0.24	0.32	0.43	0.20	0.08	0.13	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.22	0.07	0.08	0.40	0.14	0.41	0.16	0.28	0.18	0.32	0.47	0.17	0.12	0.11	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.23	0.06	0.08	0.39	0.05	0.42	0.02	0.33	0.22	0.31	0.44	0.17	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00