Doublet Group distance statistics: 55258

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N4	A	0, 0.015, 0.028, 0.042, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.028 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.015
O4'	A	0, 0.110, 0.276, 0.441, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.276 std_dev=0.165
C2'	A	0, 0.138, 0.305, 0.471, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.305 std_dev=0.167
O2'	A	0, 0.214, 0.402, 0.590, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.402 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.165, 0.413, 0.661, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.413 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.215, 0.480, 0.744, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.480 std_dev=0.264
C6	B	0, 0.339, 0.663, 0.987, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.663 std_dev=0.324
C3'	B	0, 0.396, 0.750, 1.105, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.750 std_dev=0.355
N1	B	0, 0.368, 0.733, 1.098, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.733 std_dev=0.365
O3'	A	0, 0.371, 0.743, 1.116, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.743 std_dev=0.373
C5	B	0, 0.363, 0.740, 1.117, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.740 std_dev=0.377
O4'	B	0, 0.440, 0.817, 1.195, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.817 std_dev=0.378
C4'	B	0, 0.456, 0.844, 1.231, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.844 std_dev=0.388
O5'	A	0, 0.297, 0.689, 1.081, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.689 std_dev=0.392
C1'	B	0, 0.405, 0.799, 1.193, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.799 std_dev=0.394
C2'	B	0, 0.367, 0.770, 1.172, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.770 std_dev=0.403
C5'	A	0, 0.286, 0.692, 1.098, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.692 std_dev=0.406
O3'	B	0, 0.428, 0.851, 1.274, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.851 std_dev=0.423
OP2	A	0, 0.381, 0.806, 1.230, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.806 std_dev=0.424
P	A	0, 0.421, 0.849, 1.277, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.849 std_dev=0.428
C2	B	0, 0.381, 0.815, 1.248, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.815 std_dev=0.433
C5'	B	0, 0.490, 0.924, 1.359, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.924 std_dev=0.435
C4	B	0, 0.391, 0.825, 1.260, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.825 std_dev=0.435
N3	B	0, 0.376, 0.827, 1.279, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.827 std_dev=0.451
O2'	B	0, 0.431, 0.930, 1.429, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.930 std_dev=0.499
N4	B	0, 0.476, 0.988, 1.500, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.988 std_dev=0.512
O2	B	0, 0.432, 0.947, 1.462, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.947 std_dev=0.515
OP1	A	0, 0.516, 1.112, 1.708, 1.985 max_d=1.985 avg_d=1.112 std_dev=0.596
OP1	B	0, 0.775, 1.725, 2.674, 2.673 max_d=2.673 avg_d=1.725 std_dev=0.949
O5'	B	0, 0.478, 1.565, 2.653, 2.976 max_d=2.976 avg_d=1.565 std_dev=1.088
P	B	0, 0.819, 1.944, 3.069, 3.306 max_d=3.306 avg_d=1.944 std_dev=1.125
OP2	B	0, 0.854, 2.484, 4.113, 3.866 max_d=3.866 avg_d=2.484 std_dev=1.629

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.09	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.15	0.01	0.14	0.18	0.26	0.18
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.10	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.04	0.05
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.11	0.01	0.09	0.02	0.08	0.08	0.13	0.11	0.14	0.02	0.00	0.02	0.07	0.10	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.16	0.26	0.36	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.00	0.01	0.10	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.05	0.15	0.23	0.34	0.23
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.09	0.11	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.11	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.13	0.16	0.25	0.18
N1	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.12	0.14	0.21	0.15
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.18	0.02	0.16	0.23	0.33	0.23
N4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.17	0.30	0.40	0.27
O2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.17	0.02	0.14	0.17	0.24	0.17
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.05	0.08	0.00	0.07	0.04	0.02	0.09	0.03	0.03
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.17	0.03	0.14	0.04	0.10	0.08	0.18	0.18	0.17	0.07	0.00	0.03	0.12	0.14	0.20	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.09	0.10	0.11	0.08
O5'	0.07	0.14	0.05	0.07	0.16	0.01	0.15	0.01	0.13	0.12	0.16	0.17	0.14	0.02	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.18	0.09	0.10	0.26	0.10	0.23	0.11	0.16	0.14	0.23	0.30	0.17	0.09	0.14	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.26	0.04	0.09	0.36	0.03	0.34	0.04	0.25	0.21	0.33	0.40	0.24	0.03	0.20	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.05	0.05	0.25	0.02	0.23	0.01	0.18	0.15	0.23	0.27	0.17	0.03	0.11	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.30	0.24	0.18	0.35	0.19	0.33	0.17	0.30	0.28	0.33	0.37	0.28	0.31	0.20	0.24	0.72	0.79	0.69	0.61
C2	0.17	0.16	0.18	0.14	0.26	0.13	0.29	0.14	0.25	0.19	0.17	0.30	0.20	0.23	0.17	0.18	0.82	0.79	0.81	0.66
C2'	0.24	0.27	0.25	0.15	0.31	0.16	0.28	0.13	0.25	0.25	0.31	0.34	0.29	0.35	0.18	0.21	0.76	0.88	0.81	0.73
C3'	0.21	0.20	0.25	0.13	0.21	0.13	0.18	0.13	0.17	0.18	0.22	0.25	0.23	0.38	0.16	0.17	0.71	0.89	0.78	0.73
C4	0.12	0.17	0.14	0.12	0.08	0.09	0.17	0.14	0.16	0.12	0.18	0.07	0.23	0.17	0.17	0.13	0.86	0.78	0.84	0.68
C4'	0.30	0.28	0.31	0.20	0.28	0.22	0.26	0.19	0.25	0.27	0.28	0.29	0.28	0.43	0.22	0.26	0.64	0.82	0.61	0.62
C5	0.11	0.14	0.14	0.12	0.05	0.10	0.13	0.14	0.15	0.10	0.14	0.07	0.20	0.16	0.17	0.12	0.85	0.76	0.77	0.68
C5'	0.27	0.21	0.29	0.19	0.21	0.21	0.20	0.19	0.21	0.22	0.21	0.22	0.20	0.41	0.21	0.24	0.58	0.82	0.54	0.60
C6	0.15	0.10	0.17	0.13	0.15	0.13	0.21	0.14	0.21	0.15	0.09	0.16	0.15	0.20	0.17	0.16	0.80	0.77	0.72	0.65
N1	0.19	0.18	0.19	0.15	0.27	0.15	0.29	0.14	0.26	0.21	0.20	0.29	0.19	0.24	0.17	0.19	0.78	0.78	0.74	0.64
N3	0.14	0.14	0.16	0.12	0.14	0.11	0.23	0.14	0.20	0.14	0.12	0.16	0.22	0.20	0.17	0.15	0.85	0.79	0.85	0.67
N4	0.12	0.23	0.12	0.11	0.22	0.08	0.16	0.15	0.15	0.14	0.28	0.25	0.27	0.14	0.17	0.11	0.85	0.78	0.88	0.68
O2	0.20	0.20	0.19	0.14	0.32	0.14	0.33	0.14	0.27	0.22	0.24	0.38	0.21	0.25	0.17	0.19	0.80	0.80	0.81	0.65
O2'	0.30	0.36	0.28	0.19	0.39	0.21	0.35	0.17	0.31	0.31	0.40	0.43	0.38	0.37	0.21	0.26	0.70	0.85	0.77	0.67
O3'	0.25	0.25	0.28	0.14	0.23	0.15	0.18	0.15	0.16	0.20	0.26	0.27	0.30	0.45	0.17	0.19	0.68	0.93	0.81	0.75
O4'	0.30	0.30	0.29	0.22	0.32	0.24	0.31	0.21	0.30	0.31	0.31	0.32	0.28	0.35	0.22	0.28	0.65	0.75	0.57	0.56
O5'	0.15	0.14	0.19	0.07	0.18	0.04	0.16	0.10	0.15	0.14	0.16	0.20	0.13	0.26	0.02	0.09	0.59	0.83	0.59	0.63
OP1	0.06	0.08	0.12	0.03	0.14	0.12	0.12	0.24	0.07	0.03	0.12	0.18	0.09	0.22	0.02	0.08	0.38	0.87	0.52	0.53
OP2	0.13	0.23	0.07	0.09	0.30	0.18	0.28	0.29	0.23	0.20	0.28	0.33	0.20	0.09	0.02	0.18	0.59	0.96	0.64	0.71
P	0.03	0.11	0.08	0.02	0.16	0.08	0.14	0.18	0.09	0.07	0.15	0.20	0.09	0.16	0.01	0.05	0.48	0.84	0.50	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.13	0.49	0.53	0.09
C2	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.32	0.61	0.69	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.27	0.49	0.33	0.18
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.06	0.06	0.10	0.09	0.11	0.03	0.01	0.01	0.39	0.55	0.25	0.32
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.10	0.02	0.40	0.72	0.84	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.07	0.08	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.27	0.35	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.37	0.77	0.87	0.15
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.20	0.00	0.20	0.00	0.17	0.12	0.18	0.22	0.10	0.03	0.05	0.01	0.01	0.21	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.32	0.71	0.79	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.27	0.61	0.67	0.09
N3	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.37	0.67	0.78	0.12
N4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.08	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.02	0.42	0.73	0.88	0.14
O2	0.03	0.01	0.06	0.11	0.02	0.03	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.10	0.03	0.28	0.56	0.62	0.08
O2'	0.01	0.07	0.01	0.03	0.07	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.09	0.08	0.09	0.00	0.06	0.06	0.06	0.37	0.34	0.09
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.08	0.05	0.05	0.04	0.11	0.12	0.10	0.06	0.00	0.02	0.35	0.66	0.31	0.39
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.00	0.10	0.46	0.58	0.23
O5'	0.13	0.32	0.27	0.39	0.40	0.01	0.37	0.01	0.32	0.27	0.37	0.42	0.28	0.06	0.35	0.10	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.49	0.61	0.49	0.55	0.72	0.27	0.77	0.21	0.71	0.61	0.67	0.73	0.56	0.37	0.66	0.46	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.53	0.69	0.33	0.25	0.84	0.35	0.87	0.39	0.79	0.67	0.78	0.88	0.62	0.34	0.31	0.58	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.09	0.18	0.32	0.13	0.05	0.15	0.02	0.14	0.09	0.12	0.14	0.08	0.09	0.39	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00