Doublet Group distance statistics: 55259

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.012, 0.045, 0.078, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.045 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.010, 0.060, 0.110, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.060 std_dev=0.050
C5	B	0, 0.111, 0.246, 0.380, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.246 std_dev=0.135
C6	B	0, 0.129, 0.285, 0.440, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.285 std_dev=0.156
O4'	A	0, 0.012, 0.180, 0.348, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.180 std_dev=0.168
C2'	A	0, -0.011, 0.172, 0.355, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.172 std_dev=0.183
O2'	A	0, 0.059, 0.266, 0.473, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.266 std_dev=0.207
C4'	A	0, 0.051, 0.265, 0.478, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.265 std_dev=0.213
C5'	B	0, 0.198, 0.424, 0.649, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.424 std_dev=0.226
C3'	A	0, 0.019, 0.291, 0.563, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.291 std_dev=0.272
C4'	B	0, 0.214, 0.495, 0.775, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.495 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.039, 0.331, 0.624, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.331 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.162, 0.455, 0.748, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.455 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.183, 0.501, 0.819, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.501 std_dev=0.318
C4	B	0, 0.025, 0.347, 0.668, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.347 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.101, 0.438, 0.775, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.438 std_dev=0.337
C5'	A	0, 0.095, 0.445, 0.795, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.445 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.125, 0.500, 0.875, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.500 std_dev=0.375
N4	B	0, 0.050, 0.437, 0.824, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.437 std_dev=0.387
C2	B	0, 0.082, 0.490, 0.898, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.490 std_dev=0.408
O3'	B	0, 0.229, 0.639, 1.050, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.639 std_dev=0.411
O3'	A	0, 0.008, 0.425, 0.841, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.425 std_dev=0.416
N3	B	0, 0.085, 0.520, 0.955, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.520 std_dev=0.435
O2'	B	0, 0.161, 0.616, 1.071, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.616 std_dev=0.455
P	A	0, 0.189, 0.685, 1.181, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.685 std_dev=0.496
O2	B	0, 0.147, 0.657, 1.167, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.657 std_dev=0.510
OP2	B	0, 0.127, 0.715, 1.302, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.715 std_dev=0.587
OP2	A	0, 0.187, 0.780, 1.373, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.780 std_dev=0.593
O5'	A	0, 0.100, 0.705, 1.310, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.705 std_dev=0.605
P	B	0, 0.096, 0.736, 1.375, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.736 std_dev=0.640
OP1	A	0, 0.121, 0.779, 1.437, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.779 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.157, 0.857, 1.558, 2.132 max_d=2.132 avg_d=0.857 std_dev=0.700
O5'	B	0, -0.002, 0.758, 1.518, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.758 std_dev=0.760

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.11	0.10	0.51	0.19
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.32	0.23	0.44	0.23
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.07	0.06	0.11	0.00	0.02	0.01	0.20	0.20	0.37	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.15	0.07	0.08	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.28	0.29	0.25	0.17
C4	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.52	0.36	0.41	0.34
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.04	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.10	0.39	0.08
C5	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.17	0.02	0.57	0.39	0.42	0.38
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.13	0.00	0.17	0.00	0.15	0.07	0.08	0.15	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.13	0.34	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.16	0.01	0.49	0.32	0.44	0.31
N1	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.32	0.22	0.46	0.23
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.03	0.42	0.29	0.42	0.27
N4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.57	0.40	0.42	0.38
O2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.13	0.02	0.21	0.16	0.46	0.20
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.05	0.03	0.05	0.14	0.40	0.11
O3'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.13	0.03	0.17	0.02	0.16	0.07	0.10	0.15	0.13	0.05	0.00	0.03	0.20	0.38	0.14	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.10	0.58	0.24
O5'	0.11	0.32	0.20	0.28	0.52	0.02	0.57	0.01	0.49	0.32	0.42	0.57	0.21	0.05	0.20	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.23	0.20	0.29	0.36	0.10	0.39	0.13	0.32	0.22	0.29	0.40	0.16	0.14	0.38	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.44	0.37	0.25	0.41	0.39	0.42	0.34	0.44	0.46	0.42	0.42	0.46	0.40	0.14	0.58	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.23	0.14	0.17	0.34	0.08	0.38	0.01	0.31	0.23	0.27	0.38	0.20	0.11	0.16	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.29	0.30	0.18	0.09	0.19	0.08	0.13	0.16	0.25	0.20	0.07	0.41	0.37	0.20	0.25	0.63	0.54	0.35	0.44
C2	0.28	0.37	0.26	0.17	0.20	0.15	0.11	0.11	0.17	0.27	0.35	0.17	0.46	0.30	0.21	0.22	0.64	0.47	0.35	0.43
C2'	0.29	0.31	0.28	0.15	0.12	0.16	0.08	0.03	0.15	0.24	0.25	0.10	0.44	0.39	0.20	0.22	0.59	0.53	0.29	0.41
C3'	0.26	0.19	0.30	0.19	0.03	0.20	0.09	0.12	0.15	0.18	0.14	0.06	0.31	0.45	0.26	0.22	0.52	0.54	0.18	0.37
C4	0.20	0.32	0.24	0.19	0.27	0.10	0.13	0.09	0.15	0.22	0.36	0.30	0.36	0.28	0.26	0.14	0.63	0.41	0.35	0.42
C4'	0.24	0.10	0.26	0.11	0.08	0.15	0.11	0.08	0.12	0.13	0.05	0.13	0.20	0.45	0.15	0.19	0.44	0.47	0.17	0.30
C5	0.26	0.31	0.32	0.25	0.25	0.16	0.16	0.06	0.20	0.25	0.32	0.25	0.34	0.36	0.32	0.18	0.71	0.51	0.41	0.50
C5'	0.36	0.16	0.40	0.28	0.19	0.32	0.23	0.26	0.25	0.24	0.14	0.22	0.16	0.62	0.30	0.34	0.37	0.46	0.06	0.25
C6	0.32	0.33	0.36	0.26	0.19	0.19	0.15	0.06	0.22	0.29	0.29	0.17	0.38	0.41	0.31	0.24	0.72	0.57	0.41	0.52
N1	0.31	0.35	0.31	0.20	0.16	0.18	0.12	0.10	0.19	0.28	0.29	0.13	0.43	0.36	0.24	0.24	0.67	0.53	0.37	0.47
N3	0.23	0.35	0.23	0.16	0.25	0.10	0.12	0.10	0.15	0.24	0.38	0.25	0.42	0.26	0.22	0.17	0.62	0.41	0.33	0.40
N4	0.14	0.27	0.21	0.18	0.28	0.08	0.12	0.14	0.09	0.16	0.34	0.36	0.32	0.24	0.27	0.08	0.57	0.32	0.29	0.35
O2	0.30	0.37	0.25	0.17	0.17	0.17	0.10	0.14	0.17	0.27	0.33	0.13	0.49	0.29	0.19	0.24	0.62	0.46	0.35	0.42
O2'	0.31	0.34	0.27	0.14	0.16	0.19	0.11	0.11	0.17	0.27	0.28	0.12	0.49	0.35	0.15	0.26	0.58	0.53	0.32	0.41
O3'	0.21	0.19	0.23	0.18	0.05	0.19	0.08	0.16	0.13	0.14	0.16	0.07	0.31	0.39	0.25	0.18	0.46	0.53	0.13	0.34
O4'	0.24	0.12	0.27	0.13	0.06	0.14	0.06	0.08	0.09	0.15	0.05	0.13	0.20	0.40	0.18	0.18	0.55	0.52	0.31	0.39
O5'	0.06	0.13	0.04	0.12	0.26	0.09	0.31	0.16	0.25	0.14	0.18	0.31	0.17	0.09	0.02	0.08	0.31	0.49	0.16	0.28
OP1	0.02	0.08	0.04	0.02	0.05	0.04	0.09	0.11	0.09	0.03	0.07	0.06	0.14	0.12	0.01	0.03	0.39	0.77	0.32	0.49
OP2	0.23	0.39	0.25	0.10	0.30	0.04	0.24	0.16	0.24	0.30	0.38	0.28	0.46	0.19	0.02	0.10	0.47	0.64	0.31	0.48
P	0.05	0.12	0.06	0.01	0.04	0.03	0.08	0.08	0.08	0.07	0.10	0.05	0.20	0.06	0.01	0.02	0.37	0.61	0.18	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.17	0.16	0.31	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.31	0.22	0.35	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.06	0.02	0.04	0.06	0.09	0.00	0.01	0.01	0.25	0.31	0.17	0.14
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.05	0.09	0.03	0.01	0.01	0.32	0.41	0.09	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.39	0.26	0.36	0.28
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.03	0.09	0.02	0.00	0.02	0.16	0.30	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.40	0.26	0.35	0.29
C5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.15	0.01	0.16	0.00	0.13	0.09	0.12	0.16	0.07	0.09	0.04	0.02	0.01	0.19	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.38	0.24	0.34	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.30	0.21	0.33	0.20
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.35	0.24	0.36	0.25
N4	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.39	0.27	0.36	0.29
O2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.04	0.26	0.21	0.34	0.20
O2'	0.02	0.03	0.00	0.03	0.06	0.09	0.05	0.09	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.00	0.03	0.06	0.16	0.29	0.19	0.11
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.10	0.03	0.00	0.01	0.25	0.49	0.04	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.08	0.08	0.39	0.17
O5'	0.17	0.31	0.25	0.32	0.39	0.02	0.40	0.01	0.38	0.30	0.35	0.39	0.26	0.16	0.25	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.22	0.31	0.41	0.26	0.16	0.26	0.19	0.24	0.21	0.24	0.27	0.21	0.29	0.49	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.35	0.17	0.09	0.36	0.30	0.35	0.34	0.34	0.33	0.36	0.36	0.34	0.19	0.04	0.39	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.22	0.14	0.22	0.28	0.04	0.29	0.01	0.24	0.20	0.25	0.29	0.20	0.11	0.25	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00