Doublet Group distance statistics: 55262

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.002 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.002, 0.024, 0.046, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.034, 0.125, 0.217, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.125 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.031, 0.132, 0.233, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.132 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.038, 0.148, 0.257, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.148 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.059, 0.202, 0.344, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.202 std_dev=0.143
C3'	A	0, 0.062, 0.222, 0.382, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.222 std_dev=0.160
C5'	A	0, 0.101, 0.346, 0.591, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.346 std_dev=0.245
O3'	A	0, 0.093, 0.341, 0.589, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.341 std_dev=0.248
O5'	A	0, 0.120, 0.449, 0.779, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.449 std_dev=0.330
N3	B	0, 0.085, 0.478, 0.870, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.478 std_dev=0.393
C2	B	0, 0.111, 0.523, 0.935, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.523 std_dev=0.412
C4	B	0, -0.012, 0.401, 0.814, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.401 std_dev=0.413
N4	B	0, 0.029, 0.445, 0.861, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.445 std_dev=0.416
P	A	0, 0.169, 0.607, 1.044, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.607 std_dev=0.437
C5	B	0, -0.048, 0.390, 0.828, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.390 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.103, 0.542, 0.982, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.542 std_dev=0.440
C3'	B	0, 0.133, 0.576, 1.018, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.576 std_dev=0.443
O2	B	0, 0.176, 0.621, 1.067, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.621 std_dev=0.446
N1	B	0, 0.035, 0.484, 0.933, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.484 std_dev=0.449
OP2	A	0, 0.166, 0.643, 1.120, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.643 std_dev=0.477
C6	B	0, -0.079, 0.398, 0.876, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.398 std_dev=0.477
O3'	B	0, 0.161, 0.644, 1.128, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.644 std_dev=0.484
C1'	B	0, 0.092, 0.587, 1.082, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.587 std_dev=0.495
O5'	B	0, 0.212, 0.725, 1.238, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.725 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.213, 0.741, 1.269, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.741 std_dev=0.528
O2'	B	0, 0.117, 0.656, 1.195, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.656 std_dev=0.539
C5'	B	0, 0.202, 0.743, 1.285, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.743 std_dev=0.541
C4'	B	0, 0.164, 0.705, 1.247, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.705 std_dev=0.542
O4'	B	0, 0.119, 0.668, 1.217, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.668 std_dev=0.549
OP2	B	0, 0.182, 0.732, 1.282, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.732 std_dev=0.550
P	B	0, 0.221, 0.772, 1.322, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.772 std_dev=0.550
OP1	B	0, 0.237, 0.915, 1.593, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.915 std_dev=0.678

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02
C2	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.09	0.03	0.04	0.07	0.11	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.11	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.09	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.08	0.04	0.08	0.05
C4	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.00	0.05	0.09	0.14	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.04	0.07	0.11	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01
C6	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.03	0.05	0.07	0.05
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.08	0.04
N3	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.06	0.09	0.14	0.08
N4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.07	0.00	0.07	0.12	0.16	0.11
O2	0.00	0.00	0.11	0.12	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.13	0.04	0.05	0.08	0.12	0.06
O2'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.09	0.07	0.13	0.06	0.00	0.00	0.12	0.09	0.12	0.10
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03
O5'	0.00	0.04	0.04	0.08	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.06	0.07	0.05	0.04	0.12	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.00	0.07	0.02	0.04	0.09	0.02	0.07	0.03	0.05	0.03	0.09	0.12	0.08	0.04	0.09	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.11	0.05	0.08	0.14	0.02	0.11	0.00	0.07	0.08	0.14	0.16	0.12	0.05	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.05	0.04	0.08	0.11	0.06	0.03	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.14	0.05	0.06	0.07	0.06	0.05	0.10	0.07	0.04	0.16	0.09	0.19	0.05	0.05	0.05	0.22	0.29	0.47	0.33
C2	0.10	0.07	0.08	0.06	0.11	0.07	0.19	0.12	0.17	0.11	0.06	0.10	0.07	0.08	0.05	0.09	0.22	0.38	0.50	0.36
C2'	0.04	0.15	0.04	0.06	0.07	0.06	0.06	0.10	0.07	0.04	0.17	0.09	0.22	0.04	0.05	0.05	0.23	0.29	0.47	0.33
C3'	0.05	0.17	0.04	0.08	0.09	0.08	0.04	0.12	0.05	0.06	0.18	0.10	0.24	0.04	0.07	0.06	0.26	0.28	0.46	0.33
C4	0.06	0.06	0.05	0.09	0.01	0.13	0.07	0.20	0.06	0.04	0.05	0.05	0.09	0.05	0.09	0.09	0.31	0.51	0.58	0.47
C4'	0.03	0.16	0.02	0.05	0.07	0.04	0.06	0.07	0.07	0.04	0.17	0.09	0.24	0.03	0.04	0.03	0.19	0.19	0.38	0.25
C5	0.14	0.18	0.10	0.14	0.14	0.19	0.09	0.26	0.07	0.14	0.18	0.14	0.20	0.10	0.11	0.17	0.39	0.52	0.62	0.52
C5'	0.05	0.17	0.04	0.05	0.09	0.04	0.06	0.06	0.07	0.06	0.16	0.09	0.24	0.03	0.04	0.04	0.17	0.14	0.32	0.21
C6	0.14	0.23	0.10	0.13	0.17	0.16	0.09	0.21	0.07	0.15	0.24	0.17	0.25	0.09	0.09	0.15	0.34	0.42	0.57	0.45
N1	0.05	0.11	0.05	0.07	0.05	0.09	0.07	0.14	0.07	0.04	0.13	0.07	0.15	0.05	0.06	0.06	0.26	0.36	0.52	0.38
N3	0.09	0.07	0.07	0.07	0.12	0.09	0.18	0.15	0.16	0.10	0.06	0.12	0.06	0.06	0.07	0.08	0.24	0.44	0.52	0.40
N4	0.06	0.04	0.06	0.10	0.03	0.15	0.07	0.23	0.05	0.04	0.02	0.06	0.06	0.06	0.11	0.10	0.32	0.58	0.59	0.50
O2	0.16	0.15	0.12	0.07	0.21	0.09	0.25	0.09	0.23	0.18	0.15	0.20	0.12	0.11	0.04	0.14	0.17	0.33	0.46	0.31
O2'	0.04	0.15	0.03	0.06	0.07	0.06	0.05	0.10	0.06	0.04	0.17	0.09	0.23	0.04	0.04	0.04	0.22	0.28	0.47	0.32
O3'	0.04	0.15	0.05	0.09	0.07	0.09	0.04	0.13	0.05	0.05	0.16	0.08	0.23	0.04	0.10	0.06	0.27	0.28	0.46	0.32
O4'	0.04	0.16	0.04	0.05	0.08	0.05	0.06	0.08	0.07	0.04	0.18	0.09	0.23	0.05	0.04	0.04	0.18	0.21	0.40	0.26
O5'	0.08	0.08	0.08	0.04	0.07	0.03	0.13	0.00	0.16	0.08	0.09	0.07	0.13	0.07	0.02	0.06	0.13	0.11	0.26	0.16
OP1	0.04	0.08	0.05	0.02	0.05	0.01	0.08	0.04	0.10	0.04	0.09	0.06	0.14	0.07	0.01	0.02	0.12	0.06	0.17	0.10
OP2	0.02	0.09	0.02	0.02	0.05	0.04	0.05	0.07	0.07	0.01	0.10	0.06	0.13	0.04	0.02	0.04	0.17	0.14	0.20	0.16
P	0.03	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.04	0.10	0.03	0.09	0.05	0.13	0.05	0.01	0.01	0.13	0.08	0.19	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.07
C2	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.07	0.13	0.26	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.16	0.07
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.09	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.13	0.07
C4	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.11	0.27	0.39	0.27
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00
C5	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.11	0.30	0.41	0.31
C5'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.06	0.08	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.00	0.02	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.08	0.23	0.32	0.25
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.12	0.24	0.16
N3	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.19	0.33	0.21
N4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.30	0.41	0.29
O2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.04	0.05	0.07	0.22	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.03	0.02	0.02	0.08	0.09	0.02
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.01	0.07	0.03	0.11	0.03	0.00	0.01	0.06	0.03	0.10	0.04
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01
O5'	0.00	0.07	0.04	0.06	0.11	0.01	0.11	0.01	0.08	0.05	0.09	0.12	0.05	0.02	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.02	0.13	0.01	0.01	0.27	0.04	0.30	0.05	0.23	0.12	0.19	0.30	0.07	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.26	0.16	0.13	0.39	0.04	0.41	0.01	0.32	0.24	0.33	0.41	0.22	0.09	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.16	0.07	0.07	0.27	0.00	0.31	0.01	0.25	0.16	0.21	0.29	0.11	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00