Doublet Group distance statistics: 55263

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.009, 0.044, 0.078, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.044 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.080, 0.433, 0.786, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.433 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.144, 0.505, 0.865, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.505 std_dev=0.361
P	A	0, 0.149, 0.541, 0.932, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.541 std_dev=0.391
C2'	A	0, 0.125, 0.528, 0.931, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.528 std_dev=0.403
OP1	A	0, 0.112, 0.517, 0.922, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.517 std_dev=0.405
C3'	B	0, 0.196, 0.671, 1.147, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.671 std_dev=0.475
O3'	B	0, 0.151, 0.659, 1.166, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.659 std_dev=0.508
OP2	A	0, 0.163, 0.672, 1.180, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.672 std_dev=0.508
N4	B	0, 0.218, 0.746, 1.273, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.746 std_dev=0.528
C4	B	0, 0.218, 0.746, 1.274, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.746 std_dev=0.528
C5	B	0, 0.224, 0.766, 1.308, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.766 std_dev=0.542
N3	B	0, 0.226, 0.772, 1.318, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.772 std_dev=0.546
C2'	B	0, 0.217, 0.767, 1.316, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.767 std_dev=0.550
C6	B	0, 0.231, 0.789, 1.348, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.789 std_dev=0.558
C4'	B	0, 0.209, 0.767, 1.326, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.767 std_dev=0.558
N1	B	0, 0.231, 0.789, 1.348, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.789 std_dev=0.559
C2	B	0, 0.231, 0.791, 1.352, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.791 std_dev=0.560
C1'	B	0, 0.236, 0.807, 1.378, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.807 std_dev=0.571
O2	B	0, 0.249, 0.850, 1.451, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.850 std_dev=0.601
O4'	B	0, 0.228, 0.838, 1.447, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.838 std_dev=0.609
O2'	B	0, 0.233, 0.845, 1.457, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.845 std_dev=0.612
C4'	A	0, 0.201, 0.832, 1.463, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.832 std_dev=0.631
C5'	B	0, 0.221, 0.895, 1.568, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.895 std_dev=0.673
C3'	A	0, 0.314, 1.071, 1.829, 1.622 max_d=1.622 avg_d=1.071 std_dev=0.757
C5'	A	0, 0.069, 0.837, 1.606, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.837 std_dev=0.768
O5'	B	0, 0.333, 1.176, 2.018, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.176 std_dev=0.843
O2'	A	0, 0.335, 1.222, 2.108, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.222 std_dev=0.886
OP2	B	0, 0.373, 1.402, 2.431, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.402 std_dev=1.029
P	B	0, 0.338, 1.378, 2.418, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.378 std_dev=1.040
O3'	A	0, 0.559, 1.953, 3.346, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.953 std_dev=1.393
OP1	B	0, 0.547, 1.968, 3.390, 3.307 max_d=3.307 avg_d=1.968 std_dev=1.422

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.24	0.00	0.20	0.20	0.26	0.20
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.21	0.04	0.27	0.23	0.20	0.23
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.09	0.17	0.11	0.02	0.06	0.04	0.15	0.00	0.00	0.02	0.43	0.41	0.39	0.39
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.20	0.00	0.25	0.03	0.23	0.13	0.14	0.22	0.05	0.01	0.00	0.01	0.28	0.23	0.17	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.20	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.06	0.05	0.29	0.21	0.19	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.16	0.08	0.06	0.13	0.04	0.17	0.03	0.01	0.02	0.06	0.32	0.02
C5	0.02	0.00	0.09	0.25	0.00	0.16	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.14	0.11	0.30	0.20	0.21	0.20
C5'	0.07	0.10	0.17	0.03	0.22	0.01	0.27	0.00	0.23	0.12	0.15	0.25	0.04	0.01	0.14	0.02	0.01	0.11	0.44	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.23	0.00	0.16	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.12	0.12	0.29	0.21	0.24	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.03	0.26	0.22	0.23	0.22
N3	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.14	0.01	0.28	0.23	0.20	0.23
N4	0.02	0.00	0.04	0.22	0.00	0.13	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.07	0.06	0.29	0.20	0.18	0.19
O2	0.04	0.00	0.15	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.35	0.10	0.25	0.24	0.20	0.24
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.24	0.17	0.28	0.01	0.25	0.14	0.17	0.26	0.05	0.00	0.06	0.12	0.28	0.29	0.45	0.30
O3'	0.24	0.21	0.00	0.00	0.06	0.03	0.14	0.14	0.12	0.11	0.14	0.07	0.35	0.06	0.00	0.18	0.22	0.29	0.22	0.17
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.12	0.03	0.01	0.06	0.10	0.12	0.18	0.00	0.05	0.06	0.26	0.07
O5'	0.20	0.27	0.43	0.28	0.29	0.02	0.30	0.01	0.29	0.26	0.28	0.29	0.25	0.28	0.22	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.20	0.23	0.41	0.23	0.21	0.06	0.20	0.11	0.21	0.22	0.23	0.20	0.24	0.29	0.29	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.20	0.39	0.17	0.19	0.32	0.21	0.44	0.24	0.23	0.20	0.18	0.20	0.45	0.22	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.23	0.39	0.16	0.21	0.02	0.20	0.02	0.21	0.22	0.23	0.19	0.24	0.30	0.17	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.26	0.04	0.14	0.26	0.07	0.21	0.11	0.17	0.19	0.29	0.28	0.29	0.05	0.27	0.06	0.10	0.34	0.54	0.05
C2	0.06	0.16	0.17	0.23	0.22	0.17	0.14	0.20	0.09	0.08	0.24	0.26	0.15	0.19	0.30	0.08	0.31	0.52	0.91	0.27
C2'	0.05	0.25	0.09	0.26	0.25	0.20	0.17	0.27	0.11	0.14	0.29	0.29	0.29	0.10	0.42	0.06	0.20	0.30	0.54	0.13
C3'	0.13	0.25	0.13	0.21	0.35	0.18	0.34	0.22	0.28	0.23	0.31	0.39	0.19	0.10	0.32	0.13	0.16	0.19	0.50	0.18
C4	0.16	0.09	0.20	0.22	0.15	0.21	0.04	0.22	0.08	0.10	0.14	0.24	0.10	0.22	0.24	0.17	0.31	0.68	0.99	0.25
C4'	0.10	0.19	0.10	0.13	0.26	0.13	0.26	0.14	0.22	0.18	0.23	0.28	0.14	0.10	0.24	0.09	0.11	0.19	0.27	0.16
C5	0.19	0.17	0.20	0.22	0.20	0.21	0.14	0.23	0.13	0.16	0.20	0.26	0.18	0.23	0.21	0.19	0.22	0.60	0.77	0.15
C5'	0.14	0.20	0.15	0.18	0.29	0.21	0.29	0.20	0.25	0.20	0.25	0.31	0.15	0.19	0.31	0.16	0.18	0.25	0.20	0.28
C6	0.14	0.21	0.14	0.17	0.24	0.15	0.18	0.17	0.14	0.16	0.24	0.27	0.22	0.18	0.23	0.12	0.13	0.47	0.63	0.08
N1	0.04	0.21	0.09	0.18	0.24	0.12	0.17	0.16	0.11	0.12	0.26	0.27	0.21	0.13	0.28	0.02	0.18	0.44	0.71	0.12
N3	0.10	0.06	0.20	0.23	0.17	0.18	0.08	0.21	0.06	0.04	0.17	0.25	0.05	0.22	0.28	0.12	0.35	0.63	1.04	0.31
N4	0.21	0.10	0.23	0.23	0.07	0.24	0.09	0.25	0.17	0.17	0.07	0.18	0.11	0.25	0.21	0.22	0.35	0.80	1.09	0.31
O2	0.14	0.20	0.22	0.26	0.22	0.20	0.16	0.23	0.14	0.15	0.25	0.24	0.20	0.23	0.34	0.15	0.36	0.49	0.94	0.33
O2'	0.18	0.27	0.08	0.16	0.14	0.07	0.07	0.17	0.06	0.17	0.24	0.15	0.40	0.14	0.28	0.09	0.17	0.35	0.46	0.16
O3'	0.08	0.07	0.10	0.18	0.11	0.16	0.14	0.20	0.10	0.05	0.07	0.16	0.15	0.18	0.28	0.11	0.08	0.08	0.40	0.11
O4'	0.11	0.20	0.08	0.11	0.23	0.08	0.22	0.10	0.19	0.18	0.23	0.25	0.17	0.07	0.21	0.08	0.07	0.25	0.37	0.07
O5'	0.21	0.20	0.23	0.09	0.31	0.11	0.32	0.06	0.26	0.21	0.25	0.36	0.18	0.38	0.02	0.16	0.20	0.24	0.27	0.25
OP1	0.03	0.08	0.07	0.02	0.19	0.07	0.19	0.12	0.14	0.08	0.14	0.23	0.03	0.13	0.01	0.04	0.29	0.36	0.39	0.37
OP2	0.03	0.07	0.14	0.04	0.20	0.15	0.25	0.31	0.19	0.09	0.13	0.24	0.06	0.19	0.02	0.10	0.09	0.36	0.36	0.19
P	0.06	0.09	0.11	0.01	0.21	0.03	0.22	0.11	0.17	0.10	0.15	0.24	0.05	0.18	0.00	0.01	0.22	0.28	0.20	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.46	0.34	0.23
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.34	0.67	0.81	0.38
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.13	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.06	0.08	0.08	0.05	0.00	0.00	0.01	0.14	0.19	0.08	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.40	0.77	1.16	0.43
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.20	0.03
C5	0.02	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.40	0.74	1.14	0.41
C5'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.13	0.37	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.38	0.65	0.86	0.36
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.32	0.61	0.68	0.34
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.39	0.75	1.02	0.43
N4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.05	0.40	0.80	1.28	0.44
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.02	0.31	0.64	0.70	0.36
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.21	0.04	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.11	0.02	0.12	0.04	0.10	0.06	0.10	0.13	0.07	0.04	0.00	0.02	0.34	0.22	0.38	0.36
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.23	0.37	0.23	0.27
O5'	0.20	0.34	0.00	0.14	0.40	0.01	0.40	0.00	0.38	0.32	0.39	0.40	0.31	0.06	0.34	0.23	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.46	0.67	0.32	0.19	0.77	0.07	0.74	0.13	0.65	0.61	0.75	0.80	0.64	0.21	0.22	0.37	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.81	0.13	0.08	1.16	0.20	1.14	0.37	0.86	0.68	1.02	1.28	0.70	0.04	0.38	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.38	0.04	0.15	0.43	0.03	0.41	0.01	0.36	0.34	0.43	0.44	0.36	0.04	0.36	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00