Doublet Group distance statistics: 55269

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 9, 9, 6, 6, 3, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.022, 0.029, 0.036, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.029 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.040, 0.050, 0.059, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.050 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.051, 0.062, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.062 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.058, 0.073, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.073 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.063, 0.080, 0.096, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.080 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.043, 0.061, 0.079, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.061 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.044 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.117, 0.140, 0.164, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.140 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.053, 0.083, 0.114, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.083 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.011, 0.046, 0.081, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.046 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.011, 0.049, 0.087, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.049 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.105, 0.159, 0.213, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.159 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.121, 0.212, 0.304, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.212 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.155, 0.267, 0.380, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.267 std_dev=0.112
C3'	A	0, 0.180, 0.317, 0.454, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.317 std_dev=0.137
O2'	A	0, 0.300, 0.449, 0.598, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.449 std_dev=0.149
C5'	A	0, 0.245, 0.428, 0.612, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.428 std_dev=0.183
O5'	A	0, 0.222, 0.424, 0.626, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.424 std_dev=0.202
O3'	A	0, 0.349, 0.570, 0.792, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.570 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.665, 0.900, 1.136, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.900 std_dev=0.236
N7	B	0, 0.652, 0.901, 1.149, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.901 std_dev=0.248
C8	B	0, 0.711, 0.991, 1.272, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.991 std_dev=0.281
C4	B	0, 0.694, 0.978, 1.261, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.978 std_dev=0.284
N9	B	0, 0.739, 1.031, 1.324, 1.518 max_d=1.518 avg_d=1.031 std_dev=0.292
N3	B	0, 0.723, 1.019, 1.315, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.019 std_dev=0.296
C6	B	0, 0.568, 0.866, 1.163, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.866 std_dev=0.297
C2	B	0, 0.699, 1.004, 1.309, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.004 std_dev=0.305
O5'	B	0, 0.853, 1.176, 1.500, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.176 std_dev=0.323
OP1	B	0, 0.392, 0.717, 1.042, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.717 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.811, 1.140, 1.470, 1.688 max_d=1.688 avg_d=1.140 std_dev=0.329
OP1	A	0, 0.299, 0.629, 0.960, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.629 std_dev=0.330
P	B	0, 0.664, 0.999, 1.335, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.999 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.838, 1.179, 1.520, 1.760 max_d=1.760 avg_d=1.179 std_dev=0.341
N1	B	0, 0.587, 0.941, 1.294, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.941 std_dev=0.353
C5'	B	0, 0.924, 1.281, 1.638, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.281 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.843, 1.203, 1.563, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.203 std_dev=0.360
O4'	B	0, 0.856, 1.230, 1.605, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.230 std_dev=0.375
P	A	0, 0.567, 0.947, 1.327, 2.148 max_d=2.148 avg_d=0.947 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.872, 1.255, 1.638, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.255 std_dev=0.383
N6	B	0, 0.402, 0.791, 1.180, 2.357 max_d=2.357 avg_d=0.791 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.978, 1.426, 1.874, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.426 std_dev=0.448
O2'	B	0, 0.837, 1.382, 1.926, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.382 std_dev=0.545
OP2	A	0, 1.041, 1.652, 2.263, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.652 std_dev=0.611
OP2	B	0, 0.501, 1.208, 1.914, 4.208 max_d=4.208 avg_d=1.208 std_dev=0.706

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.02	0.12	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.02	0.13	0.01	0.20	0.28	0.19
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.08	0.06	0.18	0.19	0.12
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.08	0.12	0.09	0.07	0.03	0.04	0.02	0.03	0.08	0.06	0.19	0.21	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.12	0.01	0.18	0.21	0.16
C4'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.07	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.09	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.14	0.01	0.21	0.24	0.19
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.07	0.07	0.06	0.13	0.07	0.03	0.04	0.03	0.01	0.10	0.04	0.05	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.09	0.02	0.15	0.00	0.23	0.29	0.22
C8	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.16	0.02	0.18	0.16	0.16
N1	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02	0.14	0.00	0.22	0.30	0.21
N2	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.17	0.01	0.14	0.01	0.21	0.30	0.20
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.02	0.12	0.01	0.18	0.24	0.16
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.16	0.02	0.21	0.22	0.20
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.11	0.01	0.15	0.15	0.12
O2'	0.03	0.12	0.02	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.08	0.03	0.11	0.13	0.11	0.04	0.03	0.00	0.09	0.04	0.07	0.08	0.17	0.17	0.10
O3'	0.03	0.14	0.03	0.02	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.10	0.12	0.17	0.12	0.09	0.04	0.09	0.00	0.02	0.09	0.09	0.21	0.26	0.15
O4'	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.02	0.07	0.09	0.06
O5'	0.07	0.13	0.08	0.08	0.12	0.03	0.14	0.01	0.15	0.16	0.14	0.14	0.12	0.16	0.11	0.07	0.09	0.07	0.00	0.16	0.03	0.06	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.02	0.16	0.00	0.26	0.31	0.25
OP1	0.12	0.20	0.18	0.19	0.18	0.09	0.21	0.04	0.23	0.18	0.22	0.21	0.18	0.21	0.15	0.17	0.21	0.07	0.03	0.26	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.28	0.19	0.21	0.21	0.07	0.24	0.05	0.29	0.16	0.30	0.30	0.24	0.22	0.15	0.17	0.26	0.09	0.06	0.31	0.02	0.00	0.03
P	0.07	0.19	0.12	0.13	0.16	0.03	0.19	0.02	0.22	0.16	0.21	0.20	0.16	0.20	0.12	0.10	0.15	0.06	0.01	0.25	0.01	0.03	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.34	0.18	0.20	0.15	0.20	0.21	0.20	0.21	0.21	0.20	0.21	0.20	0.21	0.57	0.19	0.17	0.27	0.17	0.94	0.40
C2	0.19	0.27	0.27	0.17	0.25	0.14	0.27	0.19	0.29	0.21	0.28	0.25	0.29	0.25	0.21	0.44	0.19	0.19	0.27	0.20	0.96	0.46
C2'	0.25	0.20	0.37	0.19	0.21	0.17	0.20	0.23	0.20	0.23	0.20	0.21	0.22	0.21	0.23	0.63	0.20	0.17	0.27	0.16	0.91	0.37
C3'	0.28	0.19	0.40	0.20	0.21	0.18	0.19	0.25	0.19	0.25	0.20	0.21	0.21	0.21	0.24	0.69	0.19	0.17	0.30	0.17	0.93	0.39
C4	0.19	0.22	0.28	0.16	0.20	0.13	0.21	0.18	0.22	0.19	0.22	0.21	0.23	0.20	0.19	0.50	0.17	0.16	0.28	0.18	0.97	0.45
C4'	0.25	0.20	0.38	0.19	0.21	0.17	0.20	0.23	0.20	0.23	0.20	0.20	0.21	0.20	0.23	0.65	0.19	0.17	0.28	0.16	0.93	0.39
C5	0.16	0.20	0.24	0.14	0.17	0.11	0.18	0.16	0.20	0.16	0.20	0.18	0.21	0.16	0.16	0.45	0.15	0.14	0.29	0.21	0.96	0.48
C5'	0.28	0.22	0.40	0.21	0.23	0.19	0.21	0.26	0.22	0.26	0.22	0.23	0.23	0.22	0.25	0.69	0.20	0.19	0.32	0.18	0.97	0.43
C6	0.14	0.20	0.20	0.15	0.16	0.11	0.17	0.16	0.20	0.14	0.21	0.18	0.22	0.14	0.14	0.39	0.15	0.14	0.29	0.26	0.95	0.50
C8	0.19	0.19	0.28	0.15	0.18	0.12	0.17	0.17	0.18	0.18	0.19	0.18	0.19	0.16	0.18	0.52	0.16	0.15	0.29	0.18	0.97	0.46
N1	0.15	0.25	0.21	0.15	0.20	0.10	0.23	0.16	0.27	0.15	0.27	0.22	0.29	0.19	0.16	0.38	0.16	0.15	0.28	0.25	0.95	0.49
N2	0.23	0.31	0.30	0.20	0.29	0.18	0.31	0.21	0.33	0.26	0.33	0.29	0.33	0.30	0.26	0.43	0.23	0.23	0.26	0.19	0.95	0.44
N3	0.21	0.25	0.31	0.19	0.24	0.16	0.25	0.21	0.26	0.23	0.26	0.24	0.26	0.24	0.23	0.50	0.20	0.19	0.28	0.17	0.96	0.43
N7	0.17	0.19	0.24	0.14	0.17	0.11	0.16	0.17	0.18	0.16	0.19	0.18	0.19	0.15	0.17	0.47	0.15	0.15	0.30	0.21	0.96	0.48
N9	0.20	0.20	0.30	0.16	0.19	0.13	0.19	0.19	0.20	0.19	0.20	0.20	0.21	0.19	0.19	0.53	0.17	0.16	0.28	0.17	0.96	0.44
O2'	0.24	0.21	0.36	0.22	0.22	0.19	0.21	0.23	0.21	0.23	0.21	0.22	0.22	0.22	0.23	0.59	0.25	0.21	0.25	0.17	0.82	0.30
O3'	0.30	0.17	0.43	0.20	0.20	0.19	0.18	0.26	0.18	0.25	0.18	0.19	0.21	0.20	0.25	0.74	0.18	0.17	0.29	0.16	0.88	0.35
O4'	0.22	0.20	0.34	0.18	0.20	0.15	0.19	0.21	0.20	0.21	0.20	0.20	0.20	0.19	0.21	0.58	0.19	0.17	0.27	0.17	0.94	0.41
O5'	0.36	0.27	0.47	0.30	0.30	0.28	0.28	0.34	0.26	0.33	0.26	0.29	0.26	0.29	0.33	0.75	0.30	0.27	0.43	0.25	1.04	0.53
O6	0.16	0.18	0.20	0.19	0.15	0.15	0.15	0.19	0.17	0.17	0.19	0.17	0.19	0.15	0.16	0.35	0.19	0.16	0.31	0.30	0.92	0.53
OP1	0.35	0.38	0.41	0.37	0.33	0.32	0.34	0.33	0.39	0.33	0.41	0.35	0.43	0.32	0.33	0.66	0.38	0.34	0.41	0.24	0.89	0.43
OP2	0.58	0.44	0.66	0.55	0.49	0.51	0.45	0.54	0.41	0.52	0.42	0.48	0.40	0.46	0.53	0.91	0.58	0.51	0.66	0.42	1.14	0.69
P	0.45	0.37	0.53	0.41	0.38	0.38	0.36	0.41	0.35	0.41	0.36	0.39	0.36	0.36	0.41	0.78	0.42	0.38	0.52	0.30	1.04	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.25	0.23	0.32	0.26
C2	0.02	0.00	0.14	0.06	0.01	0.15	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.08	0.18	0.47	0.50	0.65	0.59
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.03	0.04	0.14	0.07	0.08	0.11	0.14	0.05	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.29	0.31	0.37	0.28
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.04	0.09	0.11	0.07	0.05	0.11	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.06	0.17	0.22	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.09	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.10	0.43	0.40	0.62	0.52
C4'	0.01	0.15	0.03	0.01	0.09	0.00	0.06	0.01	0.09	0.06	0.13	0.14	0.08	0.03	0.02	0.14	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.05	0.43	0.42	0.77	0.59
C5'	0.09	0.33	0.14	0.04	0.26	0.01	0.26	0.00	0.30	0.13	0.33	0.30	0.29	0.19	0.17	0.04	0.11	0.01	0.01	0.18	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.09	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.08	0.46	0.48	0.82	0.65
C8	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.07	0.10	0.32	0.26	0.67	0.44
N1	0.02	0.00	0.11	0.07	0.01	0.13	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.05	0.14	0.48	0.52	0.76	0.65
N3	0.02	0.00	0.14	0.05	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.09	0.19	0.44	0.44	0.56	0.52
N6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.06	0.45	0.49	0.91	0.67
N7	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.07	0.06	0.37	0.34	0.81	0.55
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.36	0.30	0.54	0.41
O2'	0.03	0.18	0.01	0.02	0.06	0.14	0.05	0.04	0.05	0.20	0.12	0.18	0.06	0.16	0.06	0.00	0.05	0.09	0.21	0.25	0.34	0.23
O3'	0.10	0.08	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.11	0.03	0.07	0.05	0.09	0.05	0.07	0.03	0.05	0.00	0.12	0.14	0.20	0.46	0.29
O4'	0.01	0.18	0.02	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.10	0.14	0.19	0.06	0.06	0.01	0.09	0.12	0.00	0.14	0.16	0.13	0.10
O5'	0.25	0.47	0.29	0.06	0.43	0.02	0.43	0.01	0.46	0.32	0.48	0.44	0.45	0.37	0.36	0.21	0.14	0.14	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.23	0.50	0.31	0.17	0.40	0.16	0.42	0.18	0.48	0.26	0.52	0.44	0.49	0.34	0.30	0.25	0.20	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.65	0.37	0.22	0.62	0.19	0.77	0.19	0.82	0.67	0.76	0.56	0.91	0.81	0.54	0.34	0.46	0.13	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.26	0.59	0.28	0.10	0.52	0.03	0.59	0.01	0.65	0.44	0.65	0.52	0.67	0.55	0.41	0.23	0.29	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00