Doublet Group distance statistics: 55270

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 5, 2, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.018, 0.049, 0.081, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.049 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.001, 0.035, 0.069, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.035 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.021, 0.061, 0.102, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.061 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.058, 0.175, 0.292, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.175 std_dev=0.117
C2'	A	0, 0.056, 0.216, 0.376, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.216 std_dev=0.160
C4'	A	0, 0.115, 0.279, 0.443, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.279 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.099, 0.302, 0.505, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.302 std_dev=0.203
C3'	A	0, 0.092, 0.310, 0.528, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.310 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.354, 0.592, 0.830, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.592 std_dev=0.238
N7	B	0, 0.302, 0.541, 0.779, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.541 std_dev=0.239
C8	B	0, 0.334, 0.579, 0.823, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.579 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.305, 0.552, 0.800, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.552 std_dev=0.248
C1'	B	0, 0.378, 0.642, 0.905, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.642 std_dev=0.264
C4	B	0, 0.328, 0.594, 0.860, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.594 std_dev=0.266
O4'	B	0, 0.368, 0.657, 0.945, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.657 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.378, 0.669, 0.960, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.669 std_dev=0.291
N6	B	0, 0.253, 0.546, 0.839, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.546 std_dev=0.293
C6	B	0, 0.278, 0.572, 0.867, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.572 std_dev=0.295
O3'	A	0, 0.112, 0.409, 0.706, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.409 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.388, 0.693, 0.997, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.693 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.363, 0.675, 0.987, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.675 std_dev=0.312
O5'	A	0, 0.204, 0.517, 0.830, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.517 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.413, 0.736, 1.058, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.736 std_dev=0.322
C5'	B	0, 0.427, 0.760, 1.093, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.760 std_dev=0.333
N3	B	0, 0.336, 0.671, 1.006, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.671 std_dev=0.335
C5'	A	0, 0.227, 0.575, 0.924, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.575 std_dev=0.349
P	B	0, 0.384, 0.753, 1.121, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.753 std_dev=0.368
N1	B	0, 0.302, 0.671, 1.040, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.671 std_dev=0.369
O3'	B	0, 0.371, 0.748, 1.125, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.748 std_dev=0.377
C2	B	0, 0.333, 0.714, 1.096, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.714 std_dev=0.381
OP1	B	0, 0.343, 0.755, 1.168, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.755 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.361, 0.805, 1.249, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.805 std_dev=0.444
OP2	B	0, 0.406, 0.882, 1.357, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.882 std_dev=0.475
P	A	0, -0.055, 0.793, 1.641, 3.110 max_d=3.110 avg_d=0.793 std_dev=0.848
OP1	A	0, -0.059, 1.141, 2.341, 4.590 max_d=4.590 avg_d=1.141 std_dev=1.200
OP2	A	0, -0.427, 1.179, 2.785, 5.649 max_d=5.649 avg_d=1.179 std_dev=1.606

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.01	0.28	0.24	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.02	0.30	0.02	0.70	0.67	0.49
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.13	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.17	0.05	0.50	0.32	0.18
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.05	0.12	0.09	0.16	0.13	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.22	0.06	0.68	0.34	0.26
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.30	0.01	0.61	0.66	0.47
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.22	0.47	0.12
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02	0.36	0.01	0.71	0.97	0.63
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.13	0.12	0.10	0.15	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.15	0.30	0.28	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.38	0.00	0.79	1.07	0.69
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.34	0.02	0.53	0.83	0.54
N1	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.35	0.01	0.78	0.90	0.61
N2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.21	0.03	0.29	0.03	0.71	0.59	0.46
N3	0.03	0.00	0.11	0.13	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02	0.26	0.01	0.61	0.52	0.40
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.38	0.02	0.67	1.10	0.68
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.26	0.01	0.48	0.53	0.38
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.10	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.05	0.08	0.29	0.58	0.15
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.04	0.07	0.12	0.11	0.21	0.15	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.17	0.08	0.76	0.54	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.02	0.16	0.29	0.13
O5'	0.13	0.30	0.17	0.22	0.30	0.02	0.36	0.01	0.38	0.34	0.35	0.29	0.26	0.38	0.26	0.05	0.17	0.08	0.00	0.41	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.08	0.02	0.41	0.00	0.85	1.26	0.78
OP1	0.28	0.70	0.50	0.68	0.61	0.22	0.71	0.30	0.79	0.53	0.78	0.71	0.61	0.67	0.48	0.29	0.76	0.16	0.02	0.85	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.67	0.32	0.34	0.66	0.47	0.97	0.28	1.07	0.83	0.90	0.59	0.52	1.10	0.53	0.58	0.54	0.29	0.01	1.26	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.49	0.18	0.26	0.47	0.12	0.63	0.02	0.69	0.54	0.61	0.46	0.40	0.68	0.38	0.15	0.23	0.13	0.01	0.78	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.08	0.15	0.08	0.09	0.12	0.08	0.31	0.08	0.14	0.09	0.08	0.10	0.11	0.12	0.16	0.08	0.14	0.42	0.31	0.20	0.25
C2	0.14	0.14	0.17	0.11	0.13	0.14	0.14	0.34	0.16	0.15	0.17	0.13	0.20	0.14	0.14	0.17	0.11	0.15	0.43	0.27	0.23	0.25
C2'	0.12	0.12	0.17	0.09	0.10	0.13	0.09	0.35	0.11	0.12	0.13	0.11	0.12	0.10	0.11	0.18	0.09	0.11	0.40	0.32	0.19	0.24
C3'	0.12	0.13	0.18	0.13	0.10	0.18	0.08	0.39	0.11	0.13	0.14	0.11	0.12	0.11	0.11	0.20	0.14	0.12	0.41	0.34	0.23	0.27
C4	0.14	0.08	0.16	0.10	0.09	0.15	0.08	0.34	0.08	0.15	0.09	0.08	0.11	0.11	0.13	0.17	0.10	0.15	0.43	0.28	0.21	0.25
C4'	0.12	0.11	0.17	0.10	0.10	0.15	0.09	0.35	0.10	0.14	0.11	0.10	0.11	0.12	0.12	0.18	0.10	0.12	0.41	0.32	0.20	0.25
C5	0.16	0.07	0.17	0.14	0.11	0.18	0.09	0.36	0.06	0.17	0.07	0.09	0.08	0.14	0.15	0.19	0.13	0.16	0.43	0.28	0.24	0.25
C5'	0.20	0.20	0.23	0.19	0.20	0.24	0.20	0.41	0.20	0.22	0.21	0.20	0.21	0.22	0.21	0.25	0.19	0.20	0.41	0.32	0.22	0.26
C6	0.17	0.07	0.19	0.17	0.12	0.21	0.10	0.38	0.06	0.19	0.07	0.10	0.10	0.16	0.16	0.21	0.17	0.18	0.43	0.27	0.26	0.26
C8	0.15	0.08	0.16	0.11	0.11	0.16	0.10	0.35	0.07	0.16	0.08	0.10	0.07	0.14	0.14	0.18	0.11	0.15	0.43	0.28	0.22	0.25
N1	0.14	0.10	0.17	0.14	0.09	0.18	0.09	0.37	0.13	0.16	0.13	0.09	0.18	0.11	0.13	0.18	0.14	0.15	0.43	0.27	0.26	0.26
N2	0.18	0.20	0.20	0.13	0.19	0.14	0.20	0.32	0.22	0.19	0.22	0.19	0.24	0.20	0.18	0.19	0.13	0.18	0.43	0.27	0.22	0.25
N3	0.14	0.12	0.17	0.10	0.12	0.14	0.12	0.33	0.13	0.15	0.14	0.12	0.16	0.13	0.14	0.17	0.10	0.15	0.43	0.29	0.21	0.25
N7	0.17	0.10	0.18	0.15	0.13	0.19	0.13	0.37	0.09	0.18	0.09	0.12	0.08	0.16	0.17	0.20	0.14	0.17	0.43	0.28	0.23	0.25
N9	0.14	0.07	0.15	0.09	0.09	0.14	0.08	0.34	0.07	0.15	0.08	0.08	0.08	0.12	0.13	0.17	0.09	0.14	0.43	0.29	0.21	0.25
O2'	0.18	0.15	0.23	0.14	0.15	0.12	0.13	0.29	0.14	0.17	0.15	0.15	0.14	0.14	0.16	0.22	0.12	0.16	0.38	0.31	0.15	0.22
O3'	0.12	0.17	0.20	0.15	0.11	0.19	0.09	0.40	0.12	0.12	0.17	0.14	0.13	0.09	0.11	0.22	0.16	0.10	0.40	0.35	0.25	0.28
O4'	0.13	0.08	0.15	0.08	0.09	0.13	0.08	0.31	0.07	0.14	0.08	0.08	0.08	0.12	0.12	0.16	0.08	0.15	0.43	0.31	0.20	0.25
O5'	0.36	0.43	0.38	0.32	0.40	0.29	0.40	0.35	0.42	0.37	0.44	0.41	0.43	0.38	0.37	0.39	0.32	0.32	0.46	0.28	0.23	0.27
O6	0.23	0.11	0.24	0.23	0.18	0.26	0.18	0.40	0.10	0.25	0.09	0.15	0.08	0.24	0.23	0.26	0.23	0.23	0.43	0.28	0.30	0.28
OP1	0.86	1.05	0.96	0.90	0.94	0.76	0.92	0.72	0.99	0.81	1.05	1.00	0.98	0.84	0.87	0.99	0.93	0.74	0.78	0.54	0.62	0.62
OP2	0.94	1.35	0.93	0.78	1.14	0.70	1.16	0.62	1.32	0.92	1.41	1.23	1.38	1.01	0.99	0.97	0.74	0.80	0.61	0.35	0.38	0.39
P	0.63	0.86	0.66	0.57	0.74	0.49	0.75	0.48	0.83	0.61	0.89	0.80	0.85	0.66	0.66	0.69	0.56	0.53	0.53	0.30	0.29	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.10	0.31	0.13
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.04	0.26	0.12	0.30	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.08	0.32	0.13
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.09	0.08	0.06	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.12	0.08	0.33	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.05	0.02	0.28	0.12	0.30	0.16
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.04	0.03	0.08	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.18	0.26	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.34	0.16	0.29	0.19
C5'	0.05	0.11	0.03	0.03	0.15	0.01	0.23	0.00	0.22	0.28	0.17	0.09	0.27	0.30	0.16	0.06	0.03	0.03	0.01	0.22	0.33	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.34	0.17	0.29	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.05	0.35	0.15	0.28	0.19
N1	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.03	0.30	0.15	0.29	0.18
N3	0.03	0.00	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.05	0.24	0.11	0.31	0.15
N6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.03	0.37	0.19	0.29	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.11	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.04	0.37	0.18	0.28	0.21
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.28	0.11	0.30	0.16
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.10	0.06	0.09	0.06	0.12	0.05	0.14	0.14	0.11	0.07	0.04	0.00	0.05	0.05	0.06	0.13	0.27	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.07	0.09	0.08	0.08	0.09	0.10	0.04	0.05	0.00	0.01	0.19	0.14	0.29	0.12
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.21	0.13	0.31	0.13
O5'	0.19	0.26	0.13	0.12	0.28	0.02	0.34	0.01	0.34	0.35	0.30	0.24	0.37	0.37	0.28	0.06	0.19	0.21	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.10	0.12	0.08	0.08	0.12	0.18	0.16	0.22	0.17	0.15	0.15	0.11	0.19	0.18	0.11	0.13	0.14	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.30	0.32	0.33	0.30	0.26	0.29	0.33	0.29	0.28	0.29	0.31	0.29	0.28	0.30	0.27	0.29	0.31	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.13	0.13	0.16	0.03	0.19	0.02	0.20	0.19	0.18	0.15	0.22	0.21	0.16	0.07	0.12	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00