Doublet Group distance statistics: 55271

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 5, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.016, 0.034, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.003, 0.023, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.003, 0.021, 0.044, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.021 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.038, 0.077, 0.116, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.077 std_dev=0.039
N2	A	0, 0.008, 0.052, 0.096, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.052 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.043, 0.102, 0.162, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.102 std_dev=0.059
C4'	A	0, 0.098, 0.165, 0.232, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.165 std_dev=0.067
O2'	A	0, 0.067, 0.141, 0.215, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.141 std_dev=0.074
C3'	A	0, 0.054, 0.145, 0.235, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.145 std_dev=0.091
C5'	A	0, 0.249, 0.375, 0.502, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.375 std_dev=0.127
O3'	A	0, 0.048, 0.224, 0.400, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.224 std_dev=0.176
N6	B	0, 0.223, 0.401, 0.580, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.401 std_dev=0.178
C6	B	0, 0.219, 0.425, 0.632, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.425 std_dev=0.207
N1	B	0, 0.243, 0.456, 0.669, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.456 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.201, 0.440, 0.678, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.440 std_dev=0.239
C2	B	0, 0.255, 0.499, 0.743, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.499 std_dev=0.244
N7	B	0, 0.175, 0.432, 0.689, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.432 std_dev=0.257
C4	B	0, 0.220, 0.485, 0.750, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.485 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.248, 0.520, 0.791, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.520 std_dev=0.272
C8	B	0, 0.174, 0.469, 0.764, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.469 std_dev=0.295
OP1	A	0, 0.253, 0.548, 0.844, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.548 std_dev=0.295
P	B	0, 0.357, 0.664, 0.971, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.664 std_dev=0.307
N9	B	0, 0.200, 0.508, 0.816, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.508 std_dev=0.308
OP2	B	0, 0.432, 0.748, 1.064, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.748 std_dev=0.316
OP2	A	0, 0.453, 0.770, 1.087, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.770 std_dev=0.317
OP1	B	0, 0.243, 0.567, 0.891, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.567 std_dev=0.324
P	A	0, 0.190, 0.525, 0.861, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.525 std_dev=0.336
O3'	B	0, 0.412, 0.751, 1.090, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.751 std_dev=0.339
C5'	B	0, 0.349, 0.696, 1.042, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.696 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.233, 0.580, 0.927, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.580 std_dev=0.347
C3'	B	0, 0.335, 0.683, 1.031, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.683 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.343, 0.694, 1.046, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.694 std_dev=0.351
C4'	B	0, 0.318, 0.678, 1.038, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.678 std_dev=0.360
C2'	B	0, 0.297, 0.669, 1.041, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.669 std_dev=0.372
O4'	B	0, 0.228, 0.600, 0.972, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.600 std_dev=0.372
O2'	B	0, 0.244, 0.682, 1.120, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.682 std_dev=0.438
O5'	A	0, 0.567, 1.104, 1.642, 1.644 max_d=1.644 avg_d=1.104 std_dev=0.538

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.01	0.21	0.31	0.11
C2	0.05	0.00	0.08	0.09	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.09	0.04	0.34	0.02	0.26	0.33	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.02	0.21	0.31	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	0.13	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.20	0.30	0.03
C4	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.35	0.01	0.25	0.33	0.20
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.06	0.10	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.21	0.29	0.03
C5	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.41	0.01	0.24	0.32	0.23
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.08	0.11	0.09	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.20	0.27	0.02
C6	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.42	0.00	0.24	0.31	0.23
C8	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.41	0.02	0.23	0.31	0.22
N1	0.04	0.01	0.06	0.06	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.03	0.39	0.01	0.26	0.33	0.23
N2	0.06	0.01	0.11	0.13	0.02	0.10	0.02	0.11	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.11	0.14	0.06	0.32	0.03	0.27	0.34	0.21
N3	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.31	0.01	0.26	0.33	0.20
N7	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.44	0.02	0.23	0.30	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.33	0.01	0.24	0.32	0.19
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.21	0.30	0.05
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06	0.14	0.09	0.08	0.02	0.03	0.00	0.02	0.07	0.05	0.20	0.29	0.04
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.15	0.02	0.21	0.30	0.09
O5'	0.18	0.34	0.10	0.07	0.35	0.01	0.41	0.01	0.42	0.41	0.39	0.32	0.31	0.44	0.33	0.04	0.07	0.15	0.00	0.44	0.03	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.44	0.00	0.22	0.29	0.23
OP1	0.21	0.26	0.21	0.20	0.25	0.21	0.24	0.20	0.24	0.23	0.26	0.27	0.26	0.23	0.24	0.21	0.20	0.21	0.03	0.22	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.33	0.31	0.30	0.33	0.29	0.32	0.27	0.31	0.31	0.33	0.34	0.33	0.30	0.32	0.30	0.29	0.30	0.02	0.29	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.21	0.06	0.03	0.20	0.03	0.23	0.02	0.23	0.22	0.23	0.21	0.20	0.24	0.19	0.05	0.04	0.09	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.05	0.06	0.08	0.05	0.08	0.07	0.10	0.06	0.12	0.09	0.12	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.13	0.10	0.16	0.08
C2	0.05	0.09	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.05	0.09	0.07	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.14	0.09	0.13	0.09
C2'	0.05	0.13	0.04	0.05	0.08	0.04	0.08	0.06	0.12	0.05	0.14	0.10	0.13	0.07	0.06	0.05	0.05	0.04	0.13	0.09	0.16	0.07
C3'	0.09	0.17	0.08	0.09	0.12	0.07	0.13	0.09	0.16	0.09	0.18	0.14	0.18	0.10	0.10	0.09	0.08	0.07	0.14	0.10	0.19	0.08
C4	0.05	0.09	0.04	0.05	0.06	0.03	0.06	0.05	0.08	0.05	0.10	0.08	0.09	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.13	0.09	0.15	0.08
C4'	0.10	0.17	0.09	0.10	0.13	0.09	0.13	0.11	0.16	0.10	0.18	0.14	0.17	0.11	0.11	0.10	0.10	0.09	0.16	0.11	0.19	0.11
C5	0.06	0.09	0.05	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.10	0.08	0.10	0.06	0.06	0.06	0.04	0.07	0.12	0.09	0.13	0.08
C5'	0.16	0.22	0.15	0.16	0.18	0.15	0.19	0.16	0.21	0.16	0.23	0.20	0.22	0.17	0.17	0.15	0.16	0.14	0.20	0.15	0.24	0.16
C6	0.07	0.09	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.09	0.08	0.08	0.06	0.06	0.07	0.04	0.09	0.12	0.10	0.10	0.10
C8	0.09	0.11	0.07	0.06	0.09	0.07	0.09	0.07	0.10	0.09	0.11	0.10	0.11	0.09	0.09	0.08	0.05	0.09	0.12	0.12	0.14	0.09
N1	0.06	0.08	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.07	0.06	0.06	0.08	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.08	0.13	0.09	0.11	0.10
N2	0.07	0.10	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.09	0.09	0.05	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07	0.15	0.09	0.13	0.10
N3	0.04	0.09	0.04	0.05	0.06	0.03	0.05	0.06	0.07	0.04	0.10	0.07	0.07	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.14	0.08	0.15	0.08
N7	0.09	0.11	0.08	0.05	0.10	0.07	0.10	0.07	0.10	0.09	0.11	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.05	0.10	0.11	0.11	0.13	0.10
N9	0.06	0.10	0.05	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.06	0.11	0.08	0.10	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.13	0.10	0.15	0.08
O2'	0.05	0.12	0.03	0.05	0.07	0.03	0.07	0.06	0.10	0.05	0.13	0.09	0.12	0.06	0.05	0.04	0.05	0.04	0.13	0.09	0.16	0.07
O3'	0.08	0.16	0.06	0.07	0.10	0.06	0.11	0.08	0.15	0.07	0.17	0.13	0.17	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.12	0.12	0.17	0.07
O4'	0.08	0.11	0.06	0.06	0.09	0.06	0.09	0.08	0.11	0.08	0.12	0.09	0.12	0.08	0.08	0.07	0.06	0.07	0.12	0.12	0.15	0.09
O5'	0.50	0.50	0.49	0.51	0.50	0.49	0.50	0.48	0.50	0.50	0.50	0.50	0.50	0.51	0.50	0.50	0.51	0.47	0.52	0.44	0.54	0.48
O6	0.10	0.10	0.08	0.05	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.05	0.13	0.12	0.12	0.10	0.14
OP1	0.32	0.36	0.31	0.34	0.34	0.32	0.34	0.34	0.36	0.33	0.36	0.34	0.36	0.33	0.33	0.32	0.34	0.31	0.37	0.33	0.39	0.35
OP2	0.35	0.41	0.33	0.35	0.38	0.34	0.39	0.34	0.41	0.35	0.42	0.39	0.41	0.37	0.37	0.34	0.34	0.32	0.38	0.32	0.39	0.34
P	0.33	0.35	0.32	0.35	0.34	0.33	0.35	0.34	0.35	0.34	0.36	0.35	0.36	0.34	0.34	0.33	0.35	0.31	0.38	0.33	0.41	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.09	0.06
C2	0.04	0.00	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.09	0.04	0.13	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.09	0.04	0.12	0.04
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.12	0.06	0.12	0.04
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.12	0.06	0.13	0.04
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.04	0.10	0.05	0.10	0.05
N1	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.11	0.05	0.14	0.04
N3	0.04	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.08	0.04	0.12	0.05
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.09	0.14	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.12	0.07	0.11	0.04
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.04	0.11	0.05
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.08	0.05
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.07	0.12	0.10	0.06
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.09	0.07	0.08
O5'	0.04	0.09	0.02	0.04	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.10	0.11	0.08	0.15	0.12	0.08	0.02	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.04	0.09	0.07	0.04	0.05	0.12	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.13	0.09	0.08	0.12	0.05	0.12	0.02	0.13	0.10	0.14	0.12	0.14	0.11	0.11	0.08	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00