Doublet Group distance statistics: 55275

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.011, 0.038, 0.065, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.013, 0.047, 0.082, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.047 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.016, 0.058, 0.100, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.058 std_dev=0.042
C2	A	0, 0.018, 0.061, 0.104, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.061 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.021, 0.072, 0.123, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.072 std_dev=0.051
O2'	A	0, 0.033, 0.114, 0.195, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.114 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.028, 0.113, 0.197, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.113 std_dev=0.084
O4'	B	0, 0.035, 0.122, 0.209, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.122 std_dev=0.087
N2	A	0, 0.041, 0.144, 0.247, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.144 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.041, 0.166, 0.290, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.166 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.042, 0.173, 0.305, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.173 std_dev=0.131
O3'	A	0, 0.048, 0.202, 0.356, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.202 std_dev=0.154
C5	B	0, 0.083, 0.356, 0.628, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.356 std_dev=0.273
C5'	A	0, 0.109, 0.384, 0.658, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.384 std_dev=0.274
N1	B	0, 0.117, 0.402, 0.688, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.402 std_dev=0.285
C6	B	0, 0.076, 0.363, 0.649, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.363 std_dev=0.287
C4	B	0, 0.122, 0.417, 0.713, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.417 std_dev=0.296
N7	B	0, 0.107, 0.437, 0.766, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.437 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.136, 0.472, 0.808, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.472 std_dev=0.336
C8	B	0, 0.138, 0.486, 0.834, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.486 std_dev=0.348
N9	B	0, 0.147, 0.502, 0.856, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.502 std_dev=0.355
N3	B	0, 0.148, 0.513, 0.878, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.513 std_dev=0.365
N6	B	0, 0.101, 0.487, 0.874, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.487 std_dev=0.386
O5'	A	0, 0.160, 0.553, 0.946, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.553 std_dev=0.393
C1'	B	0, 0.213, 0.730, 1.246, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.730 std_dev=0.517
C4'	B	0, 0.236, 0.805, 1.374, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.805 std_dev=0.569
OP1	A	0, 0.251, 0.870, 1.488, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.870 std_dev=0.619
P	A	0, 0.302, 1.036, 1.770, 1.601 max_d=1.601 avg_d=1.036 std_dev=0.734
C2'	B	0, 0.407, 1.400, 2.394, 2.199 max_d=2.199 avg_d=1.400 std_dev=0.993
C5'	B	0, 0.430, 1.488, 2.546, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.488 std_dev=1.058
OP2	A	0, 0.435, 1.549, 2.662, 2.571 max_d=2.571 avg_d=1.549 std_dev=1.114
C3'	B	0, 0.467, 1.601, 2.736, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.601 std_dev=1.135
O5'	B	0, 0.456, 1.687, 2.917, 2.902 max_d=2.902 avg_d=1.687 std_dev=1.231
O2'	B	0, 0.578, 2.003, 3.427, 3.192 max_d=3.192 avg_d=2.003 std_dev=1.424
O3'	B	0, 0.606, 2.079, 3.551, 3.223 max_d=3.223 avg_d=2.079 std_dev=1.472
OP2	B	0, 0.760, 2.692, 4.624, 4.444 max_d=4.444 avg_d=2.692 std_dev=1.932
P	B	0, 0.806, 2.776, 4.747, 4.373 max_d=4.373 avg_d=2.776 std_dev=1.971
OP1	B	0, 1.075, 3.671, 6.267, 5.517 max_d=5.517 avg_d=3.671 std_dev=2.596

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.13	0.13	0.07
C2	0.05	0.00	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.04	0.18	0.01	0.21	0.29	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.09	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.21	0.16	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.07	0.11	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.24	0.19	0.10
C4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.17	0.01	0.18	0.22	0.18
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.16	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.19	0.01	0.17	0.23	0.20
C5'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.19	0.01	0.19	0.26	0.22
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.18	0.02	0.14	0.16	0.15
N1	0.04	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03	0.19	0.01	0.20	0.29	0.23
N2	0.07	0.01	0.09	0.11	0.03	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.10	0.06	0.19	0.02	0.23	0.31	0.23
N3	0.05	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.07	0.04	0.17	0.01	0.20	0.25	0.18
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.19	0.02	0.16	0.20	0.20
N9	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.15	0.17	0.13
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.19	0.13	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.10	0.07	0.04	0.03	0.03	0.00	0.01	0.07	0.04	0.29	0.26	0.12
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.19	0.10
O5'	0.07	0.18	0.05	0.04	0.17	0.00	0.19	0.01	0.19	0.18	0.19	0.19	0.17	0.19	0.15	0.03	0.07	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.19	0.00	0.18	0.25	0.23
OP1	0.13	0.21	0.21	0.24	0.18	0.16	0.17	0.13	0.19	0.14	0.20	0.23	0.20	0.16	0.15	0.19	0.29	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.29	0.16	0.19	0.22	0.07	0.23	0.04	0.26	0.16	0.29	0.31	0.25	0.20	0.17	0.13	0.26	0.19	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.08	0.10	0.18	0.03	0.20	0.02	0.22	0.15	0.23	0.23	0.18	0.20	0.13	0.05	0.12	0.10	0.01	0.23	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.07	0.40	0.43	0.12	0.24	0.09	0.32	0.04	0.17	0.05	0.10	0.04	0.12	0.17	0.49	0.42	0.02	0.40	0.62	0.62	0.51
C2	0.14	0.07	0.36	0.38	0.10	0.22	0.11	0.37	0.09	0.16	0.08	0.08	0.12	0.14	0.13	0.39	0.32	0.04	0.52	0.84	0.90	0.74
C2'	0.25	0.08	0.44	0.45	0.14	0.24	0.10	0.27	0.04	0.19	0.04	0.13	0.01	0.12	0.19	0.56	0.49	0.04	0.32	0.45	0.46	0.36
C3'	0.29	0.12	0.44	0.45	0.17	0.25	0.12	0.26	0.06	0.21	0.08	0.17	0.03	0.14	0.22	0.57	0.49	0.10	0.29	0.37	0.37	0.32
C4	0.16	0.06	0.34	0.36	0.10	0.21	0.08	0.34	0.05	0.15	0.05	0.08	0.06	0.11	0.13	0.38	0.32	0.03	0.44	0.71	0.73	0.62
C4'	0.26	0.10	0.42	0.43	0.15	0.24	0.11	0.28	0.06	0.19	0.06	0.15	0.03	0.13	0.20	0.53	0.46	0.07	0.33	0.47	0.46	0.39
C5	0.13	0.04	0.27	0.28	0.07	0.18	0.05	0.34	0.03	0.12	0.04	0.07	0.05	0.09	0.11	0.28	0.22	0.01	0.45	0.72	0.74	0.65
C5'	0.31	0.16	0.44	0.45	0.21	0.29	0.16	0.32	0.11	0.24	0.11	0.21	0.05	0.19	0.26	0.54	0.47	0.13	0.37	0.49	0.48	0.43
C6	0.10	0.05	0.23	0.25	0.07	0.18	0.06	0.36	0.05	0.11	0.06	0.06	0.07	0.09	0.09	0.21	0.16	0.01	0.49	0.78	0.80	0.72
C8	0.14	0.03	0.27	0.29	0.07	0.18	0.04	0.30	0.02	0.12	0.04	0.06	0.06	0.07	0.11	0.31	0.25	0.02	0.39	0.63	0.63	0.56
N1	0.11	0.06	0.28	0.30	0.08	0.20	0.09	0.39	0.08	0.13	0.07	0.07	0.11	0.13	0.11	0.28	0.22	0.03	0.54	0.85	0.89	0.78
N2	0.13	0.08	0.38	0.41	0.10	0.22	0.12	0.38	0.12	0.16	0.10	0.08	0.15	0.16	0.12	0.42	0.35	0.08	0.54	0.92	1.00	0.79
N3	0.17	0.07	0.38	0.40	0.10	0.22	0.10	0.34	0.08	0.16	0.07	0.09	0.09	0.13	0.14	0.44	0.37	0.04	0.46	0.75	0.78	0.63
N7	0.12	0.03	0.23	0.24	0.05	0.16	0.03	0.31	0.03	0.10	0.04	0.05	0.07	0.06	0.09	0.24	0.19	0.01	0.41	0.67	0.67	0.60
N9	0.17	0.05	0.34	0.36	0.10	0.21	0.07	0.31	0.03	0.15	0.04	0.08	0.05	0.10	0.14	0.40	0.33	0.03	0.40	0.65	0.65	0.55
O2'	0.26	0.09	0.49	0.51	0.15	0.26	0.11	0.28	0.05	0.20	0.05	0.14	0.01	0.14	0.20	0.63	0.56	0.04	0.34	0.44	0.46	0.35
O3'	0.31	0.14	0.46	0.47	0.19	0.26	0.13	0.22	0.07	0.21	0.08	0.19	0.02	0.14	0.24	0.62	0.55	0.11	0.22	0.23	0.23	0.19
O4'	0.20	0.07	0.38	0.40	0.11	0.23	0.08	0.31	0.04	0.16	0.06	0.10	0.06	0.11	0.16	0.46	0.40	0.04	0.39	0.61	0.59	0.50
O5'	0.38	0.22	0.48	0.49	0.28	0.36	0.23	0.41	0.17	0.31	0.18	0.28	0.12	0.25	0.33	0.56	0.50	0.21	0.45	0.58	0.56	0.53
O6	0.07	0.06	0.15	0.17	0.05	0.15	0.04	0.36	0.04	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.10	0.07	0.01	0.49	0.78	0.77	0.73
OP1	0.46	0.26	0.54	0.54	0.33	0.41	0.26	0.45	0.18	0.37	0.19	0.33	0.09	0.29	0.39	0.63	0.58	0.29	0.49	0.57	0.57	0.54
OP2	0.62	0.37	0.70	0.70	0.46	0.59	0.38	0.64	0.27	0.51	0.28	0.46	0.16	0.41	0.54	0.77	0.71	0.47	0.69	0.78	0.78	0.76
P	0.50	0.32	0.58	0.58	0.38	0.46	0.31	0.51	0.24	0.41	0.25	0.38	0.15	0.34	0.43	0.66	0.60	0.33	0.55	0.64	0.64	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.16	0.19	0.21	0.18
C2	0.02	0.00	0.10	0.05	0.01	0.15	0.01	0.39	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.30	0.24	0.18	0.46	0.64	0.56	0.63
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.03	0.09	0.06	0.10	0.03	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.24	0.20	0.16
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.10	0.01	0.06	0.07	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.20	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.01	0.32	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.18	0.14	0.10	0.41	0.53	0.50	0.54
C4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.16	0.07	0.17	0.12	0.18	0.11	0.07	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.09	0.06	0.48	0.66	0.62	0.67
C5'	0.08	0.39	0.06	0.02	0.32	0.01	0.37	0.00	0.42	0.22	0.43	0.33	0.45	0.31	0.22	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00
C6	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.16	0.00	0.42	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.09	0.52	0.77	0.69	0.75
C8	0.02	0.02	0.09	0.10	0.00	0.07	0.01	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.09	0.34	0.42	0.47	0.45
N1	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.17	0.01	0.43	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.26	0.20	0.15	0.51	0.75	0.65	0.73
N3	0.02	0.00	0.10	0.06	0.00	0.12	0.02	0.33	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.27	0.23	0.18	0.40	0.52	0.47	0.53
N6	0.03	0.03	0.03	0.07	0.02	0.18	0.01	0.45	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.16	0.10	0.08	0.54	0.86	0.76	0.82
N7	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.11	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.43	0.61	0.62	0.62
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.33	0.37	0.38	0.40
O2'	0.00	0.30	0.00	0.01	0.18	0.01	0.13	0.06	0.19	0.07	0.26	0.27	0.16	0.03	0.05	0.00	0.02	0.02	0.13	0.28	0.22	0.16
O3'	0.07	0.24	0.02	0.00	0.14	0.00	0.09	0.00	0.13	0.03	0.20	0.23	0.10	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.07	0.18	0.12	0.06
O4'	0.00	0.18	0.02	0.01	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.09	0.15	0.18	0.08	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.05	0.07	0.01
O5'	0.16	0.46	0.13	0.08	0.41	0.02	0.48	0.00	0.52	0.34	0.51	0.40	0.54	0.43	0.33	0.13	0.07	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.19	0.64	0.24	0.20	0.53	0.08	0.66	0.03	0.77	0.42	0.75	0.52	0.86	0.61	0.37	0.28	0.18	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.56	0.20	0.11	0.50	0.05	0.62	0.02	0.69	0.47	0.65	0.47	0.76	0.62	0.38	0.22	0.12	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.63	0.16	0.07	0.54	0.02	0.67	0.00	0.75	0.45	0.73	0.53	0.82	0.62	0.40	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00