Doublet Group distance statistics: 55281

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 8, 4, 6, 3, 8, 9, 4, 8, 3, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.015, 0.032, 0.050, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.017, 0.038, 0.060, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.016, 0.043, 0.069, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.043 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.015, 0.046, 0.076, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.046 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.029, 0.068, 0.107, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.068 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.033, 0.079, 0.125, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.079 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.086, 0.198, 0.311, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.198 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.002, 0.123, 0.243, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.123 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.124, 0.292, 0.459, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.292 std_dev=0.168
C4'	A	0, 0.101, 0.278, 0.455, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.278 std_dev=0.177
C3'	A	0, 0.134, 0.324, 0.514, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.324 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.247, 0.463, 0.679, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.463 std_dev=0.216
C4	B	0, 0.289, 0.574, 0.858, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.574 std_dev=0.284
O3'	A	0, 0.219, 0.513, 0.806, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.513 std_dev=0.293
C5'	A	0, 0.112, 0.412, 0.712, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.412 std_dev=0.300
C2	B	0, 0.259, 0.563, 0.867, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.563 std_dev=0.304
O5'	A	0, 0.145, 0.451, 0.756, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.451 std_dev=0.305
O2'	B	0, 0.315, 0.638, 0.961, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.638 std_dev=0.323
C2'	B	0, 0.299, 0.650, 1.000, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.650 std_dev=0.350
N9	B	0, 0.283, 0.636, 0.988, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.636 std_dev=0.352
C1'	B	0, 0.240, 0.602, 0.964, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.602 std_dev=0.362
C5	B	0, 0.331, 0.732, 1.134, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.732 std_dev=0.401
N1	B	0, 0.316, 0.722, 1.128, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.722 std_dev=0.406
C6	B	0, 0.349, 0.794, 1.239, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.794 std_dev=0.445
C8	B	0, 0.310, 0.802, 1.293, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.802 std_dev=0.492
C3'	B	0, 0.376, 0.882, 1.388, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.882 std_dev=0.506
N7	B	0, 0.350, 0.858, 1.365, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.858 std_dev=0.507
P	A	0, 0.093, 0.602, 1.112, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.602 std_dev=0.509
O4'	B	0, 0.300, 0.817, 1.335, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.817 std_dev=0.517
N6	B	0, 0.410, 0.975, 1.539, 2.380 max_d=2.380 avg_d=0.975 std_dev=0.564
O3'	B	0, 0.483, 1.048, 1.614, 1.956 max_d=1.956 avg_d=1.048 std_dev=0.565
C4'	B	0, 0.357, 0.930, 1.503, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.930 std_dev=0.573
OP2	A	0, 0.017, 0.720, 1.424, 3.085 max_d=3.085 avg_d=0.720 std_dev=0.703
OP1	A	0, 0.076, 0.809, 1.542, 2.941 max_d=2.941 avg_d=0.809 std_dev=0.733
C5'	B	0, 0.447, 1.206, 1.964, 2.685 max_d=2.685 avg_d=1.206 std_dev=0.758
O5'	B	0, 0.485, 1.310, 2.135, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.310 std_dev=0.825
P	B	0, 0.618, 1.905, 3.192, 3.905 max_d=3.905 avg_d=1.905 std_dev=1.287
OP2	B	0, 0.653, 2.079, 3.504, 4.406 max_d=4.406 avg_d=2.079 std_dev=1.425
OP1	B	0, 0.677, 2.206, 3.734, 4.419 max_d=4.419 avg_d=2.206 std_dev=1.528

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.12	0.02	0.19	0.20	0.14
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.18	0.03	0.23	0.02	0.35	0.42	0.27
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.08	0.06	0.11	0.15	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.08	0.17	0.17	0.13
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.12	0.13	0.13	0.16	0.13	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.21	0.13	0.23	0.16	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.25	0.01	0.36	0.39	0.27
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.07	0.08	0.06	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.15	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.31	0.01	0.46	0.51	0.36
C5'	0.03	0.09	0.02	0.03	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.17	0.12	0.09	0.08	0.18	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.17	0.15	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.03	0.32	0.01	0.49	0.56	0.38
C8	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.32	0.02	0.43	0.44	0.34
N1	0.03	0.01	0.11	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.03	0.28	0.02	0.43	0.50	0.33
N2	0.04	0.01	0.15	0.16	0.02	0.08	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.22	0.04	0.21	0.03	0.32	0.39	0.24
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.03	0.21	0.01	0.30	0.35	0.23
N7	0.01	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.35	0.02	0.52	0.56	0.41
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.23	0.02	0.32	0.33	0.24
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.13	0.19	0.14	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.10	0.15	0.12	0.09
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.04	0.15	0.14	0.17	0.22	0.16	0.15	0.07	0.04	0.00	0.02	0.21	0.17	0.32	0.22	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.04	0.18	0.22	0.16
O5'	0.12	0.23	0.15	0.21	0.25	0.02	0.31	0.01	0.32	0.32	0.28	0.21	0.21	0.35	0.23	0.07	0.21	0.11	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.10	0.17	0.04	0.35	0.00	0.55	0.63	0.43
OP1	0.19	0.35	0.17	0.23	0.36	0.12	0.46	0.15	0.49	0.43	0.43	0.32	0.30	0.52	0.32	0.15	0.32	0.18	0.02	0.55	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.42	0.17	0.16	0.39	0.15	0.51	0.23	0.56	0.44	0.50	0.39	0.35	0.56	0.33	0.12	0.22	0.22	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.27	0.13	0.17	0.27	0.05	0.36	0.02	0.38	0.34	0.33	0.24	0.23	0.41	0.24	0.09	0.19	0.16	0.01	0.43	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.16	0.20	0.22	0.14	0.18	0.15	0.17	0.16	0.16	0.17	0.14	0.17	0.16	0.15	0.21	0.27	0.16	0.24	0.27	0.35	0.22
C2	0.29	0.30	0.19	0.20	0.32	0.27	0.36	0.31	0.37	0.35	0.36	0.28	0.40	0.37	0.32	0.19	0.19	0.35	0.42	0.40	0.67	0.55
C2'	0.19	0.15	0.14	0.14	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.17	0.14	0.15	0.22	0.24	0.21	0.35	0.26
C3'	0.21	0.13	0.18	0.18	0.13	0.21	0.12	0.21	0.12	0.16	0.13	0.12	0.12	0.14	0.16	0.19	0.21	0.25	0.22	0.28	0.28	0.21
C4	0.17	0.21	0.13	0.14	0.19	0.14	0.21	0.14	0.24	0.19	0.24	0.18	0.27	0.21	0.18	0.16	0.20	0.21	0.25	0.20	0.44	0.32
C4'	0.24	0.15	0.28	0.32	0.16	0.30	0.17	0.31	0.16	0.23	0.16	0.14	0.17	0.21	0.21	0.29	0.37	0.26	0.32	0.47	0.37	0.31
C5	0.16	0.23	0.14	0.15	0.20	0.14	0.24	0.14	0.28	0.20	0.28	0.19	0.31	0.23	0.18	0.17	0.23	0.21	0.25	0.19	0.44	0.31
C5'	0.26	0.16	0.33	0.40	0.18	0.37	0.20	0.40	0.18	0.26	0.18	0.14	0.20	0.24	0.23	0.33	0.48	0.30	0.39	0.64	0.47	0.42
C6	0.21	0.27	0.14	0.14	0.26	0.17	0.31	0.20	0.35	0.28	0.34	0.23	0.39	0.31	0.24	0.16	0.20	0.26	0.31	0.25	0.54	0.41
C8	0.16	0.19	0.22	0.26	0.13	0.20	0.16	0.19	0.20	0.15	0.22	0.14	0.23	0.16	0.13	0.25	0.35	0.18	0.24	0.30	0.35	0.22
N1	0.27	0.30	0.17	0.18	0.31	0.24	0.36	0.29	0.39	0.35	0.37	0.27	0.44	0.38	0.30	0.17	0.18	0.33	0.39	0.37	0.65	0.53
N2	0.36	0.35	0.26	0.29	0.39	0.37	0.44	0.43	0.45	0.45	0.42	0.32	0.48	0.47	0.40	0.24	0.25	0.44	0.53	0.56	0.82	0.70
N3	0.23	0.24	0.16	0.16	0.25	0.21	0.27	0.23	0.28	0.27	0.27	0.23	0.29	0.28	0.25	0.17	0.18	0.28	0.34	0.29	0.55	0.44
N7	0.15	0.21	0.19	0.22	0.15	0.17	0.19	0.15	0.24	0.15	0.25	0.16	0.28	0.18	0.14	0.22	0.31	0.18	0.22	0.24	0.37	0.23
N9	0.14	0.18	0.17	0.19	0.13	0.15	0.15	0.14	0.18	0.14	0.20	0.14	0.20	0.15	0.13	0.20	0.27	0.16	0.22	0.23	0.36	0.22
O2'	0.18	0.13	0.16	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15	0.13	0.16	0.13	0.13	0.13	0.15	0.16	0.14	0.15	0.19	0.25	0.21	0.36	0.27
O3'	0.26	0.13	0.23	0.23	0.17	0.27	0.16	0.27	0.14	0.23	0.13	0.14	0.14	0.19	0.22	0.24	0.23	0.32	0.26	0.30	0.30	0.28
O4'	0.23	0.21	0.31	0.35	0.21	0.30	0.23	0.31	0.23	0.25	0.22	0.19	0.24	0.25	0.23	0.30	0.41	0.24	0.34	0.47	0.43	0.33
O5'	0.23	0.18	0.29	0.35	0.14	0.33	0.15	0.35	0.16	0.21	0.19	0.14	0.17	0.18	0.19	0.31	0.44	0.27	0.35	0.57	0.40	0.35
O6	0.21	0.28	0.14	0.15	0.26	0.17	0.32	0.20	0.37	0.28	0.36	0.24	0.43	0.33	0.24	0.16	0.21	0.27	0.31	0.25	0.54	0.41
OP1	0.35	0.28	0.43	0.56	0.21	0.55	0.23	0.60	0.26	0.30	0.31	0.20	0.29	0.26	0.27	0.47	0.70	0.44	0.56	0.91	0.61	0.62
OP2	0.23	0.24	0.26	0.34	0.16	0.32	0.18	0.35	0.23	0.19	0.27	0.17	0.26	0.18	0.18	0.29	0.44	0.28	0.33	0.58	0.39	0.35
P	0.24	0.24	0.31	0.40	0.17	0.37	0.19	0.41	0.23	0.22	0.27	0.17	0.26	0.21	0.20	0.32	0.52	0.29	0.39	0.71	0.47	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.15	0.12	0.25	0.19
C2	0.04	0.00	0.14	0.16	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.20	0.06	0.30	0.27	0.58	0.42
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.09	0.07	0.12	0.13	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.20	0.19	0.13
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.14	0.13	0.15	0.14	0.15	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.20	0.25	0.20	0.16
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.31	0.27	0.56	0.42
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.06	0.09	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.17	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.40	0.41	0.72	0.55
C5'	0.04	0.11	0.03	0.03	0.13	0.01	0.19	0.00	0.19	0.21	0.15	0.10	0.22	0.23	0.13	0.05	0.06	0.03	0.01	0.09	0.15	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.17	0.04	0.40	0.44	0.77	0.58
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.14	0.05	0.41	0.39	0.63	0.52
N1	0.04	0.01	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.19	0.05	0.36	0.36	0.70	0.51
N3	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.06	0.27	0.21	0.49	0.36
N6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.02	0.09	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.18	0.04	0.44	0.53	0.87	0.65
N7	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.44	0.49	0.79	0.62
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.29	0.23	0.47	0.37
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.11	0.12	0.07	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.08	0.27	0.11	0.07
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.06	0.17	0.14	0.19	0.17	0.18	0.15	0.07	0.06	0.00	0.02	0.18	0.40	0.29	0.25
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.12	0.15	0.21	0.18
O5'	0.15	0.30	0.16	0.20	0.31	0.02	0.40	0.01	0.40	0.41	0.36	0.27	0.44	0.44	0.29	0.08	0.18	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.27	0.20	0.25	0.27	0.17	0.41	0.09	0.44	0.39	0.36	0.21	0.53	0.49	0.23	0.27	0.40	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.58	0.19	0.20	0.56	0.08	0.72	0.15	0.77	0.63	0.70	0.49	0.87	0.79	0.47	0.11	0.29	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.42	0.13	0.16	0.42	0.05	0.55	0.02	0.58	0.52	0.51	0.36	0.65	0.62	0.37	0.07	0.25	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00