Doublet Group distance statistics: 55283

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 6, 3, 1, 9, 6, 6, 1, 8, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.013, 0.030, 0.048, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.015, 0.034, 0.052, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.013, 0.041, 0.068, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.041 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.019, 0.049, 0.079, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.049 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.171, 0.394, 0.616, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.394 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.128, 0.353, 0.577, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.353 std_dev=0.224
C2'	A	0, 0.196, 0.424, 0.652, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.424 std_dev=0.228
O2'	A	0, 0.236, 0.468, 0.701, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.468 std_dev=0.232
O2'	B	0, 0.239, 0.475, 0.712, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.475 std_dev=0.236
N3	B	0, 0.200, 0.448, 0.696, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.448 std_dev=0.248
C2	B	0, 0.260, 0.526, 0.792, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.526 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.201, 0.480, 0.759, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.480 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.209, 0.490, 0.770, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.490 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.274, 0.557, 0.841, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.557 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.324, 0.616, 0.908, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.616 std_dev=0.292
N9	B	0, 0.253, 0.562, 0.872, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.562 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.299, 0.629, 0.959, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.629 std_dev=0.330
N6	B	0, 0.406, 0.737, 1.068, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.737 std_dev=0.331
C3'	B	0, 0.129, 0.473, 0.817, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.473 std_dev=0.344
C4'	A	0, 0.273, 0.643, 1.012, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.643 std_dev=0.369
C3'	A	0, 0.290, 0.671, 1.052, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.671 std_dev=0.381
O4'	B	0, 0.117, 0.501, 0.885, 2.009 max_d=2.009 avg_d=0.501 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.129, 0.531, 0.933, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.531 std_dev=0.402
O3'	B	0, 0.292, 0.705, 1.117, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.705 std_dev=0.413
C8	B	0, 0.367, 0.798, 1.229, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.798 std_dev=0.431
N7	B	0, 0.372, 0.832, 1.292, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.832 std_dev=0.460
O5'	B	0, 0.382, 0.859, 1.336, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.859 std_dev=0.477
O5'	A	0, 0.451, 0.996, 1.540, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.996 std_dev=0.545
C5'	B	0, 0.184, 0.739, 1.295, 2.924 max_d=2.924 avg_d=0.739 std_dev=0.556
C5'	A	0, 0.434, 0.997, 1.560, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.997 std_dev=0.563
O3'	A	0, 0.459, 1.064, 1.670, 1.781 max_d=1.781 avg_d=1.064 std_dev=0.605
OP2	A	0, 0.506, 1.131, 1.755, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.131 std_dev=0.625
P	A	0, 0.573, 1.312, 2.051, 2.142 max_d=2.142 avg_d=1.312 std_dev=0.739
P	B	0, 0.707, 1.653, 2.599, 3.091 max_d=3.091 avg_d=1.653 std_dev=0.946
OP1	A	0, 0.743, 1.750, 2.758, 2.869 max_d=2.869 avg_d=1.750 std_dev=1.007
OP2	B	0, 1.222, 2.840, 4.458, 4.738 max_d=4.738 avg_d=2.840 std_dev=1.618
OP1	B	0, 1.194, 3.053, 4.911, 4.944 max_d=4.944 avg_d=3.053 std_dev=1.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05
C2	0.03	0.00	0.22	0.22	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.31	0.07	0.09	0.02	0.10	0.16	0.11
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.13	0.01	0.09	0.01	0.13	0.06	0.18	0.25	0.20	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.12	0.08	0.06	0.05
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.02	0.16	0.09	0.20	0.26	0.20	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.09	0.06	0.06
C4	0.01	0.01	0.13	0.14	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.19	0.05	0.08	0.01	0.09	0.14	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.07	0.05	0.08	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.07	0.06	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.04	0.12	0.01	0.14	0.19	0.15
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.07	0.06	0.15	0.08	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.05	0.13	0.01	0.16	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.13	0.02	0.14	0.15	0.14
N1	0.02	0.01	0.18	0.20	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.29	0.07	0.11	0.01	0.13	0.20	0.15
N2	0.04	0.01	0.25	0.26	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.37	0.08	0.08	0.03	0.10	0.16	0.10
N3	0.03	0.01	0.20	0.20	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.27	0.07	0.07	0.01	0.08	0.13	0.09
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.15	0.02	0.17	0.21	0.18
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.08	0.02	0.08	0.11	0.09
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.09	0.04	0.06	0.04	0.10	0.05	0.15	0.23	0.16	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.09	0.09	0.05	0.04
O3'	0.02	0.31	0.03	0.01	0.19	0.03	0.18	0.04	0.23	0.09	0.29	0.37	0.27	0.11	0.08	0.03	0.00	0.02	0.09	0.23	0.14	0.10	0.10
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.08	0.05	0.08	0.07	0.07
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.08	0.02	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11	0.08	0.07	0.15	0.08	0.04	0.09	0.08	0.00	0.15	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.09	0.23	0.05	0.15	0.00	0.19	0.25	0.20
OP1	0.06	0.10	0.08	0.09	0.09	0.06	0.14	0.06	0.16	0.14	0.13	0.10	0.08	0.17	0.08	0.09	0.14	0.08	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.16	0.06	0.06	0.14	0.02	0.19	0.02	0.22	0.15	0.20	0.16	0.13	0.21	0.11	0.05	0.10	0.07	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.05	0.06	0.11	0.02	0.15	0.02	0.17	0.14	0.15	0.10	0.09	0.18	0.09	0.04	0.10	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.29	0.10	0.12	0.12	0.14	0.15	0.12	0.22	0.09	0.29	0.18	0.23	0.11	0.09	0.22	0.18	0.15	0.10	0.25	0.30	0.16
C2	0.16	0.15	0.09	0.09	0.15	0.13	0.24	0.12	0.30	0.19	0.28	0.12	0.38	0.25	0.14	0.21	0.12	0.19	0.26	0.78	0.67	0.47
C2'	0.15	0.15	0.07	0.07	0.10	0.13	0.10	0.12	0.12	0.11	0.15	0.11	0.12	0.10	0.11	0.12	0.11	0.18	0.11	0.20	0.38	0.14
C3'	0.17	0.17	0.07	0.09	0.09	0.18	0.09	0.18	0.12	0.11	0.16	0.11	0.12	0.09	0.11	0.16	0.13	0.21	0.10	0.25	0.25	0.07
C4	0.13	0.24	0.08	0.09	0.14	0.12	0.20	0.09	0.27	0.12	0.31	0.14	0.32	0.17	0.11	0.21	0.16	0.16	0.17	0.48	0.48	0.29
C4'	0.22	0.28	0.16	0.18	0.10	0.26	0.11	0.25	0.19	0.14	0.28	0.18	0.21	0.09	0.13	0.31	0.23	0.25	0.15	0.32	0.19	0.17
C5	0.13	0.23	0.08	0.11	0.14	0.12	0.20	0.10	0.28	0.12	0.30	0.14	0.32	0.18	0.11	0.21	0.18	0.16	0.15	0.45	0.47	0.28
C5'	0.25	0.31	0.21	0.25	0.11	0.33	0.12	0.34	0.22	0.17	0.32	0.19	0.25	0.11	0.15	0.36	0.31	0.30	0.24	0.51	0.31	0.31
C6	0.14	0.19	0.08	0.09	0.15	0.12	0.22	0.10	0.29	0.15	0.29	0.12	0.35	0.21	0.12	0.21	0.16	0.17	0.20	0.58	0.56	0.35
C8	0.13	0.27	0.11	0.15	0.13	0.15	0.17	0.14	0.24	0.09	0.30	0.17	0.27	0.12	0.09	0.20	0.24	0.15	0.10	0.23	0.31	0.15
N1	0.15	0.16	0.08	0.09	0.15	0.12	0.23	0.11	0.30	0.18	0.27	0.12	0.38	0.24	0.14	0.21	0.13	0.19	0.25	0.73	0.65	0.44
N2	0.18	0.11	0.11	0.12	0.16	0.15	0.26	0.16	0.31	0.23	0.24	0.13	0.41	0.29	0.17	0.22	0.12	0.22	0.32	0.96	0.78	0.57
N3	0.15	0.21	0.08	0.09	0.15	0.11	0.22	0.09	0.29	0.15	0.30	0.12	0.34	0.21	0.12	0.21	0.13	0.17	0.23	0.65	0.58	0.39
N7	0.13	0.25	0.10	0.14	0.14	0.14	0.18	0.13	0.26	0.10	0.30	0.16	0.30	0.15	0.10	0.20	0.23	0.15	0.11	0.29	0.37	0.19
N9	0.13	0.28	0.09	0.12	0.14	0.13	0.17	0.11	0.25	0.10	0.31	0.17	0.27	0.13	0.09	0.21	0.19	0.15	0.12	0.31	0.36	0.19
O2'	0.15	0.12	0.09	0.08	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.10	0.10	0.12	0.08	0.10	0.18	0.13	0.23	0.41	0.17
O3'	0.16	0.14	0.10	0.07	0.11	0.17	0.10	0.19	0.11	0.14	0.14	0.12	0.11	0.12	0.13	0.10	0.10	0.23	0.12	0.34	0.32	0.09
O4'	0.18	0.37	0.17	0.20	0.14	0.22	0.17	0.21	0.28	0.12	0.38	0.23	0.30	0.12	0.11	0.31	0.26	0.20	0.11	0.21	0.22	0.14
O5'	0.21	0.31	0.17	0.23	0.11	0.29	0.13	0.31	0.23	0.13	0.32	0.18	0.25	0.09	0.12	0.30	0.31	0.26	0.20	0.45	0.25	0.25
O6	0.14	0.19	0.08	0.10	0.15	0.13	0.22	0.10	0.29	0.16	0.28	0.12	0.36	0.22	0.13	0.21	0.18	0.17	0.19	0.57	0.56	0.35
OP1	0.29	0.31	0.24	0.31	0.14	0.41	0.14	0.44	0.23	0.22	0.33	0.19	0.26	0.15	0.20	0.35	0.38	0.37	0.36	0.77	0.46	0.47
OP2	0.20	0.30	0.17	0.24	0.10	0.30	0.13	0.32	0.24	0.12	0.33	0.17	0.27	0.08	0.11	0.29	0.33	0.26	0.22	0.49	0.25	0.27
P	0.23	0.33	0.20	0.27	0.11	0.34	0.13	0.37	0.26	0.14	0.36	0.19	0.29	0.08	0.13	0.32	0.35	0.29	0.26	0.57	0.34	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.57	0.25
C2	0.02	0.00	0.16	0.22	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.27	0.03	0.29	0.88	0.59	0.48
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.05	0.14	0.15	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.26	0.13
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.18	0.09	0.21	0.19	0.18	0.11	0.08	0.02	0.01	0.01	0.14	0.32	0.18	0.14
C4	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.16	0.02	0.27	0.80	0.62	0.46
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.28	0.36	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.17	0.02	0.31	1.07	0.67	0.55
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.15	0.10	0.17	0.16	0.10	0.05	0.03	0.02	0.01	0.40	0.31	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.18	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.23	0.03	0.34	1.18	0.67	0.58
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.27	0.87	0.70	0.50
N1	0.02	0.00	0.14	0.21	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.27	0.03	0.33	1.07	0.63	0.54
N3	0.02	0.00	0.15	0.19	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.22	0.03	0.25	0.71	0.58	0.42
N6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.23	0.03	0.36	1.35	0.70	0.63
N7	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.12	0.04	0.32	1.14	0.72	0.58
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.22	0.63	0.63	0.41
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.05	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.06	0.25	0.30	0.09
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.16	0.03	0.17	0.03	0.23	0.10	0.27	0.22	0.23	0.12	0.07	0.05	0.00	0.02	0.15	0.60	0.32	0.25
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.09	0.14	0.71	0.27
O5'	0.10	0.29	0.10	0.14	0.27	0.01	0.31	0.01	0.34	0.27	0.33	0.25	0.36	0.32	0.22	0.06	0.15	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.25	0.88	0.18	0.32	0.80	0.28	1.07	0.40	1.18	0.87	1.07	0.71	1.35	1.14	0.63	0.25	0.60	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.57	0.59	0.26	0.18	0.62	0.36	0.67	0.31	0.67	0.70	0.63	0.58	0.70	0.72	0.63	0.30	0.32	0.71	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.48	0.13	0.14	0.46	0.06	0.55	0.02	0.58	0.50	0.54	0.42	0.63	0.58	0.41	0.09	0.25	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00