Doublet Group distance statistics: 55284

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 4, 1, 6, 6, 3, 1, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.005, 0.023, 0.040, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.011, 0.030, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.011, 0.036, 0.061, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.036 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.041 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.012, 0.041, 0.071, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.041 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.007, 0.045, 0.084, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.045 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.013, 0.063, 0.113, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.063 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.018, 0.124, 0.229, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.124 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.042, 0.176, 0.309, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.176 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.055, 0.224, 0.392, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.224 std_dev=0.169
C3'	A	0, 0.086, 0.283, 0.479, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.283 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.038, 0.242, 0.445, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.242 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.246, 0.491, 0.736, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.491 std_dev=0.245
C5'	A	0, 0.057, 0.349, 0.640, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.349 std_dev=0.291
O3'	A	0, 0.119, 0.420, 0.721, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.420 std_dev=0.301
C4	B	0, 0.275, 0.601, 0.927, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.601 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.279, 0.628, 0.976, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.628 std_dev=0.348
C2	B	0, 0.179, 0.541, 0.903, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.541 std_dev=0.362
O5'	A	0, 0.010, 0.412, 0.814, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.412 std_dev=0.402
N9	B	0, 0.271, 0.682, 1.092, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.682 std_dev=0.410
P	A	0, 0.072, 0.523, 0.975, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.523 std_dev=0.451
N1	B	0, 0.183, 0.637, 1.091, 2.739 max_d=2.739 avg_d=0.637 std_dev=0.454
C5	B	0, 0.253, 0.722, 1.190, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.722 std_dev=0.469
C2'	B	0, 0.268, 0.750, 1.231, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.750 std_dev=0.482
C6	B	0, 0.239, 0.722, 1.205, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.722 std_dev=0.483
OP2	A	0, 0.135, 0.623, 1.112, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.623 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.143, 0.639, 1.136, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.639 std_dev=0.497
O2'	B	0, 0.219, 0.724, 1.230, 2.071 max_d=2.071 avg_d=0.724 std_dev=0.506
N6	B	0, 0.244, 0.854, 1.464, 3.229 max_d=3.229 avg_d=0.854 std_dev=0.610
O4'	B	0, 0.175, 0.785, 1.395, 2.078 max_d=2.078 avg_d=0.785 std_dev=0.610
C8	B	0, 0.218, 0.843, 1.468, 2.463 max_d=2.463 avg_d=0.843 std_dev=0.625
N7	B	0, 0.221, 0.864, 1.507, 2.586 max_d=2.586 avg_d=0.864 std_dev=0.643
C3'	B	0, 0.154, 0.946, 1.738, 2.767 max_d=2.767 avg_d=0.946 std_dev=0.792
C4'	B	0, 0.086, 0.882, 1.678, 2.680 max_d=2.680 avg_d=0.882 std_dev=0.796
O3'	B	0, 0.113, 1.094, 2.076, 3.099 max_d=3.099 avg_d=1.094 std_dev=0.982
O5'	B	0, 0.082, 1.260, 2.438, 4.243 max_d=4.243 avg_d=1.260 std_dev=1.178
C5'	B	0, -0.015, 1.172, 2.360, 3.774 max_d=3.774 avg_d=1.172 std_dev=1.187
OP2	B	0, 0.088, 1.572, 3.057, 5.171 max_d=5.171 avg_d=1.572 std_dev=1.484
P	B	0, 0.037, 1.558, 3.078, 4.733 max_d=4.733 avg_d=1.558 std_dev=1.521
OP1	B	0, -0.040, 1.794, 3.629, 5.320 max_d=5.320 avg_d=1.794 std_dev=1.835

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.10	0.16	0.07
C2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.14	0.03	0.18	0.02	0.16	0.21	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.07	0.09	0.14	0.12	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.07	0.15	0.13	0.08
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.11	0.10	0.14	0.11	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.17	0.09	0.19	0.12	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.17	0.02	0.15	0.18	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.22	0.01	0.18	0.20	0.18
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.07	0.06	0.12	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.10	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.24	0.01	0.20	0.23	0.21
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.20	0.01	0.14	0.14	0.13
N1	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.11	0.02	0.21	0.02	0.19	0.23	0.19
N2	0.03	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.04	0.17	0.03	0.17	0.22	0.15
N3	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.03	0.15	0.02	0.15	0.19	0.13
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.24	0.01	0.19	0.19	0.19
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.15	0.02	0.12	0.16	0.10
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.13	0.18	0.14	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.09	0.12	0.14	0.05
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.13	0.11	0.19	0.13	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.19	0.11	0.24	0.15	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.02	0.09	0.21	0.10
O5'	0.08	0.18	0.11	0.17	0.17	0.01	0.22	0.01	0.24	0.20	0.21	0.17	0.15	0.24	0.15	0.05	0.19	0.11	0.00	0.26	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.09	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.09	0.11	0.02	0.26	0.00	0.24	0.26	0.24
OP1	0.10	0.16	0.15	0.19	0.15	0.09	0.18	0.10	0.20	0.14	0.19	0.17	0.15	0.19	0.12	0.12	0.24	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.21	0.13	0.12	0.18	0.15	0.20	0.16	0.23	0.14	0.23	0.22	0.19	0.19	0.16	0.14	0.15	0.21	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.08	0.12	0.14	0.03	0.18	0.01	0.21	0.13	0.19	0.15	0.13	0.19	0.10	0.05	0.16	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.17	0.23	0.31	0.13	0.21	0.15	0.26	0.17	0.14	0.18	0.15	0.17	0.15	0.13	0.21	0.47	0.15	0.26	0.60	0.34	0.42
C2	0.14	0.16	0.33	0.29	0.15	0.22	0.16	0.28	0.17	0.14	0.17	0.15	0.17	0.15	0.14	0.40	0.45	0.30	0.25	0.41	0.26	0.30
C2'	0.14	0.18	0.18	0.22	0.17	0.13	0.17	0.19	0.18	0.15	0.18	0.18	0.18	0.16	0.15	0.21	0.38	0.13	0.23	0.58	0.36	0.41
C3'	0.18	0.22	0.15	0.19	0.21	0.15	0.22	0.23	0.22	0.20	0.22	0.21	0.23	0.21	0.20	0.19	0.34	0.20	0.29	0.60	0.43	0.46
C4	0.13	0.16	0.31	0.32	0.14	0.22	0.14	0.26	0.16	0.13	0.17	0.15	0.16	0.14	0.13	0.36	0.49	0.24	0.20	0.51	0.27	0.35
C4'	0.14	0.16	0.15	0.22	0.12	0.20	0.13	0.30	0.15	0.14	0.17	0.13	0.16	0.13	0.12	0.17	0.35	0.19	0.37	0.64	0.44	0.51
C5	0.13	0.17	0.32	0.31	0.14	0.23	0.15	0.29	0.17	0.13	0.18	0.15	0.18	0.14	0.13	0.38	0.49	0.27	0.24	0.54	0.31	0.39
C5'	0.14	0.20	0.16	0.22	0.14	0.21	0.15	0.31	0.18	0.15	0.20	0.16	0.19	0.15	0.13	0.18	0.34	0.20	0.39	0.66	0.47	0.53
C6	0.14	0.19	0.33	0.30	0.15	0.25	0.16	0.33	0.19	0.13	0.20	0.15	0.20	0.15	0.13	0.41	0.48	0.31	0.27	0.51	0.31	0.39
C8	0.12	0.17	0.28	0.32	0.14	0.21	0.14	0.26	0.16	0.12	0.17	0.15	0.17	0.13	0.12	0.31	0.49	0.19	0.24	0.62	0.38	0.45
N1	0.14	0.18	0.33	0.29	0.15	0.24	0.17	0.32	0.19	0.14	0.20	0.15	0.20	0.16	0.14	0.41	0.46	0.32	0.29	0.46	0.30	0.36
N2	0.14	0.16	0.33	0.28	0.16	0.21	0.17	0.28	0.17	0.16	0.17	0.15	0.18	0.17	0.15	0.40	0.42	0.32	0.29	0.36	0.32	0.31
N3	0.14	0.16	0.32	0.31	0.14	0.21	0.15	0.25	0.16	0.14	0.16	0.15	0.16	0.14	0.14	0.37	0.46	0.26	0.20	0.43	0.23	0.28
N7	0.13	0.17	0.30	0.32	0.14	0.23	0.14	0.28	0.17	0.12	0.18	0.15	0.17	0.13	0.12	0.35	0.50	0.24	0.24	0.60	0.37	0.44
N9	0.12	0.17	0.28	0.32	0.14	0.21	0.14	0.24	0.16	0.13	0.17	0.15	0.16	0.14	0.13	0.30	0.49	0.18	0.22	0.58	0.33	0.40
O2'	0.20	0.18	0.12	0.20	0.18	0.20	0.17	0.26	0.17	0.17	0.18	0.19	0.18	0.17	0.18	0.19	0.34	0.23	0.30	0.59	0.36	0.43
O3'	0.28	0.29	0.12	0.15	0.31	0.20	0.32	0.28	0.32	0.32	0.30	0.29	0.33	0.33	0.30	0.18	0.32	0.32	0.36	0.59	0.50	0.50
O4'	0.14	0.22	0.22	0.30	0.16	0.22	0.18	0.29	0.21	0.18	0.23	0.18	0.22	0.18	0.15	0.19	0.45	0.15	0.33	0.65	0.39	0.48
O5'	0.09	0.20	0.20	0.23	0.13	0.14	0.14	0.22	0.18	0.10	0.21	0.16	0.19	0.12	0.09	0.20	0.36	0.12	0.29	0.58	0.40	0.44
O6	0.14	0.21	0.33	0.30	0.15	0.26	0.18	0.36	0.21	0.14	0.23	0.16	0.23	0.17	0.13	0.42	0.48	0.32	0.30	0.54	0.34	0.42
OP1	0.19	0.24	0.20	0.27	0.20	0.27	0.23	0.38	0.24	0.23	0.25	0.20	0.26	0.24	0.20	0.19	0.37	0.24	0.43	0.68	0.55	0.58
OP2	0.19	0.31	0.27	0.27	0.26	0.20	0.28	0.28	0.31	0.24	0.32	0.27	0.32	0.27	0.23	0.28	0.39	0.18	0.30	0.57	0.42	0.45
P	0.11	0.23	0.20	0.24	0.16	0.18	0.18	0.27	0.21	0.15	0.24	0.18	0.23	0.16	0.13	0.20	0.36	0.15	0.33	0.60	0.44	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.20	0.19	0.11
C2	0.04	0.00	0.27	0.21	0.01	0.15	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.29	0.29	0.22	0.37	0.35	0.54	0.39
C2'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.14	0.01	0.09	0.02	0.14	0.12	0.22	0.26	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.34	0.22	0.17
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.12	0.01	0.14	0.19	0.18	0.20	0.14	0.16	0.08	0.02	0.01	0.02	0.26	0.38	0.25	0.23
C4	0.02	0.01	0.14	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.12	0.34	0.33	0.51	0.37
C4'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.11	0.13	0.13	0.10	0.10	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.21	0.13	0.12
C5	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.13	0.07	0.42	0.44	0.68	0.52
C5'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.14	0.01	0.16	0.00	0.19	0.20	0.23	0.19	0.20	0.19	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.14	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.17	0.13	0.45	0.47	0.74	0.56
C8	0.01	0.02	0.12	0.19	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.09	0.20	0.11	0.43	0.42	0.60	0.48
N1	0.03	0.01	0.22	0.18	0.01	0.13	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.25	0.19	0.43	0.41	0.67	0.50
N3	0.03	0.01	0.26	0.20	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.27	0.26	0.21	0.32	0.30	0.44	0.32
N6	0.02	0.02	0.12	0.14	0.01	0.10	0.02	0.20	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.13	0.17	0.11	0.49	0.55	0.86	0.65
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.05	0.46	0.51	0.76	0.59
N9	0.00	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.30	0.29	0.41	0.31
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.15	0.05	0.10	0.05	0.16	0.09	0.24	0.27	0.13	0.05	0.04	0.00	0.06	0.06	0.10	0.39	0.13	0.21
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.14	0.03	0.13	0.04	0.17	0.20	0.25	0.26	0.17	0.18	0.06	0.06	0.00	0.03	0.21	0.48	0.22	0.26
O4'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.12	0.01	0.07	0.02	0.13	0.11	0.19	0.21	0.11	0.05	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.13	0.18	0.11
O5'	0.15	0.37	0.21	0.26	0.34	0.02	0.42	0.01	0.45	0.43	0.43	0.32	0.49	0.46	0.30	0.10	0.21	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.35	0.34	0.38	0.33	0.21	0.44	0.09	0.47	0.42	0.41	0.30	0.55	0.51	0.29	0.39	0.48	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.54	0.22	0.25	0.51	0.13	0.68	0.18	0.74	0.60	0.67	0.44	0.86	0.76	0.41	0.13	0.22	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.39	0.17	0.23	0.37	0.12	0.52	0.02	0.56	0.48	0.50	0.32	0.65	0.59	0.31	0.21	0.26	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00