Doublet Group distance statistics: 55285

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 7, 4, 3, 4, 2, 3, 0, 2, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.023, 0.035, 0.048, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.035 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.027, 0.040, 0.052, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.040 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.025, 0.038, 0.051, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.038 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.029, 0.044, 0.059, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.044 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.026, 0.044, 0.061, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.044 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.032, 0.052, 0.073, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.052 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.026, 0.053, 0.080, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.053 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.029, 0.058, 0.088, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.058 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.033, 0.065, 0.097, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.065 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.095, 0.128, 0.162, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.128 std_dev=0.033
O2'	A	0, 0.257, 0.376, 0.495, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.376 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.333, 0.458, 0.583, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.458 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.382, 0.560, 0.738, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.560 std_dev=0.178
C2'	B	0, 0.277, 0.519, 0.761, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.519 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.568, 0.813, 1.059, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.813 std_dev=0.245
C4'	A	0, 0.535, 0.807, 1.079, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.807 std_dev=0.272
N3	B	0, 0.229, 0.524, 0.820, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.524 std_dev=0.295
C1'	B	0, 0.123, 0.424, 0.725, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.424 std_dev=0.301
C2	B	0, 0.401, 0.712, 1.022, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.712 std_dev=0.310
O2'	B	0, 0.318, 0.654, 0.990, 2.203 max_d=2.203 avg_d=0.654 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.865, 1.228, 1.590, 2.080 max_d=2.080 avg_d=1.228 std_dev=0.362
C3'	B	0, 0.033, 0.399, 0.766, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.399 std_dev=0.366
O4'	B	0, 0.063, 0.435, 0.807, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.435 std_dev=0.372
C4	B	0, 0.319, 0.692, 1.065, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.692 std_dev=0.373
N9	B	0, 0.206, 0.596, 0.987, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.596 std_dev=0.390
N1	B	0, 0.661, 1.072, 1.483, 1.949 max_d=1.949 avg_d=1.072 std_dev=0.411
O3'	B	0, 0.123, 0.540, 0.957, 2.570 max_d=2.570 avg_d=0.540 std_dev=0.417
O5'	A	0, 0.908, 1.327, 1.747, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.327 std_dev=0.420
C5'	A	0, 0.891, 1.314, 1.736, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.314 std_dev=0.423
C4'	B	0, -0.010, 0.440, 0.891, 2.662 max_d=2.662 avg_d=0.440 std_dev=0.451
C5	B	0, 0.578, 1.073, 1.568, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.073 std_dev=0.495
C6	B	0, 0.774, 1.287, 1.799, 2.461 max_d=2.461 avg_d=1.287 std_dev=0.512
C8	B	0, 0.345, 0.892, 1.439, 2.231 max_d=2.231 avg_d=0.892 std_dev=0.547
C5'	B	0, 0.056, 0.652, 1.247, 3.531 max_d=3.531 avg_d=0.652 std_dev=0.596
N7	B	0, 0.596, 1.202, 1.808, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.202 std_dev=0.606
N6	B	0, 1.074, 1.707, 2.340, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.707 std_dev=0.633
OP2	A	0, 1.564, 2.213, 2.862, 3.856 max_d=3.856 avg_d=2.213 std_dev=0.649
P	A	0, 1.473, 2.132, 2.792, 3.680 max_d=3.680 avg_d=2.132 std_dev=0.659
OP1	A	0, 1.894, 2.667, 3.440, 4.451 max_d=4.451 avg_d=2.667 std_dev=0.773
P	B	0, 1.520, 2.428, 3.335, 4.727 max_d=4.727 avg_d=2.428 std_dev=0.908
OP2	B	0, 2.546, 3.492, 4.439, 4.794 max_d=4.794 avg_d=3.492 std_dev=0.947
O5'	B	0, 0.160, 1.177, 2.194, 3.443 max_d=3.443 avg_d=1.177 std_dev=1.017
OP1	B	0, 1.447, 2.506, 3.566, 6.214 max_d=6.214 avg_d=2.506 std_dev=1.060

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.03	0.12	0.16	0.08
C2	0.03	0.00	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.21	0.05	0.16	0.01	0.37	0.20	0.15
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.01	0.09	0.06	0.12	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.11	0.11	0.05
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.17	0.12	0.18	0.20	0.15	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.07	0.18	0.15	0.09	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.15	0.02	0.33	0.19	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.07	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.10	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.02	0.19	0.02	0.43	0.25	0.20
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.10	0.09	0.07	0.14	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.15	0.15	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.21	0.03	0.21	0.01	0.48	0.28	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.19	0.02	0.33	0.22	0.18
N1	0.02	0.00	0.12	0.18	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.22	0.04	0.19	0.01	0.45	0.25	0.19
N2	0.03	0.01	0.15	0.20	0.01	0.08	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.24	0.06	0.15	0.01	0.36	0.19	0.14
N3	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.05	0.13	0.02	0.31	0.18	0.13
N7	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.03	0.21	0.02	0.44	0.28	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.03	0.26	0.17	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.04	0.08	0.12	0.09	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.07	0.12	0.10	0.05
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.13	0.02	0.16	0.04	0.21	0.14	0.22	0.24	0.17	0.16	0.08	0.04	0.00	0.01	0.12	0.23	0.26	0.16	0.15
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.03	0.08	0.20	0.10
O5'	0.08	0.16	0.05	0.07	0.15	0.01	0.19	0.01	0.21	0.19	0.19	0.15	0.13	0.21	0.13	0.04	0.12	0.07	0.00	0.23	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.18	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.23	0.03	0.23	0.00	0.54	0.32	0.25
OP1	0.12	0.37	0.11	0.15	0.33	0.10	0.43	0.15	0.48	0.33	0.45	0.36	0.31	0.44	0.26	0.12	0.26	0.08	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.20	0.11	0.09	0.19	0.12	0.25	0.12	0.28	0.22	0.25	0.19	0.18	0.28	0.17	0.10	0.16	0.20	0.03	0.32	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.05	0.08	0.14	0.03	0.20	0.02	0.22	0.18	0.19	0.14	0.13	0.23	0.13	0.05	0.15	0.10	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.16	0.30	0.40	0.12	0.41	0.12	0.43	0.11	0.23	0.15	0.12	0.11	0.18	0.19	0.34	0.51	0.32	0.47	1.28	0.51	0.86
C2	0.29	0.17	0.31	0.32	0.11	0.37	0.10	0.34	0.13	0.19	0.18	0.10	0.14	0.13	0.20	0.40	0.37	0.34	0.37	0.87	0.22	0.54
C2'	0.13	0.28	0.16	0.30	0.14	0.33	0.13	0.37	0.19	0.12	0.26	0.23	0.18	0.11	0.10	0.17	0.44	0.20	0.40	1.42	0.76	1.03
C3'	0.13	0.27	0.14	0.28	0.15	0.28	0.14	0.35	0.18	0.13	0.24	0.23	0.17	0.12	0.12	0.12	0.43	0.17	0.42	1.54	0.94	1.13
C4	0.28	0.15	0.33	0.37	0.11	0.41	0.09	0.40	0.10	0.20	0.16	0.10	0.11	0.14	0.19	0.42	0.46	0.34	0.41	1.16	0.43	0.79
C4'	0.19	0.17	0.23	0.37	0.13	0.35	0.14	0.42	0.13	0.23	0.16	0.14	0.14	0.20	0.18	0.20	0.51	0.25	0.47	1.38	0.68	0.94
C5	0.29	0.15	0.33	0.37	0.11	0.41	0.09	0.40	0.11	0.19	0.17	0.09	0.13	0.13	0.20	0.42	0.46	0.35	0.41	1.19	0.51	0.84
C5'	0.19	0.18	0.24	0.38	0.14	0.35	0.15	0.42	0.14	0.24	0.17	0.15	0.16	0.21	0.18	0.20	0.52	0.24	0.47	1.40	0.72	0.97
C6	0.29	0.15	0.33	0.35	0.12	0.40	0.10	0.37	0.13	0.19	0.18	0.10	0.16	0.13	0.20	0.43	0.43	0.35	0.37	1.07	0.42	0.75
C8	0.27	0.15	0.32	0.39	0.11	0.42	0.10	0.43	0.11	0.21	0.16	0.10	0.13	0.15	0.19	0.39	0.50	0.34	0.46	1.38	0.66	0.98
N1	0.29	0.16	0.31	0.32	0.12	0.37	0.11	0.35	0.14	0.19	0.19	0.10	0.16	0.13	0.20	0.41	0.38	0.34	0.35	0.92	0.28	0.61
N2	0.29	0.20	0.29	0.28	0.13	0.34	0.13	0.31	0.16	0.19	0.21	0.12	0.17	0.15	0.20	0.35	0.31	0.34	0.37	0.67	0.25	0.38
N3	0.29	0.17	0.32	0.35	0.10	0.39	0.09	0.37	0.10	0.20	0.17	0.10	0.11	0.13	0.20	0.42	0.41	0.35	0.40	0.99	0.28	0.64
N7	0.28	0.15	0.33	0.39	0.12	0.42	0.10	0.42	0.12	0.20	0.17	0.10	0.14	0.14	0.20	0.41	0.49	0.35	0.44	1.33	0.65	0.96
N9	0.26	0.15	0.32	0.39	0.11	0.41	0.10	0.42	0.11	0.21	0.16	0.11	0.11	0.16	0.19	0.39	0.49	0.33	0.45	1.28	0.54	0.89
O2'	0.13	0.27	0.11	0.29	0.13	0.34	0.11	0.40	0.17	0.12	0.24	0.23	0.16	0.09	0.09	0.12	0.43	0.22	0.44	1.38	0.69	0.97
O3'	0.19	0.33	0.12	0.21	0.23	0.22	0.20	0.31	0.24	0.16	0.30	0.30	0.23	0.16	0.18	0.14	0.34	0.18	0.49	1.67	1.21	1.29
O4'	0.25	0.16	0.31	0.42	0.17	0.40	0.18	0.44	0.15	0.27	0.16	0.15	0.16	0.24	0.23	0.30	0.54	0.31	0.50	1.28	0.51	0.83
O5'	0.14	0.22	0.20	0.34	0.11	0.33	0.11	0.39	0.15	0.16	0.21	0.17	0.16	0.14	0.12	0.20	0.49	0.20	0.45	1.46	0.81	1.05
O6	0.29	0.16	0.33	0.35	0.13	0.40	0.12	0.37	0.15	0.19	0.19	0.12	0.18	0.14	0.20	0.43	0.43	0.35	0.37	1.08	0.46	0.76
OP1	0.15	0.32	0.19	0.37	0.17	0.36	0.18	0.45	0.24	0.18	0.31	0.24	0.25	0.18	0.14	0.18	0.55	0.22	0.52	1.54	0.92	1.12
OP2	0.17	0.24	0.20	0.29	0.14	0.29	0.14	0.34	0.18	0.14	0.23	0.19	0.19	0.13	0.13	0.22	0.40	0.22	0.43	1.50	0.90	1.12
P	0.16	0.19	0.24	0.37	0.12	0.34	0.14	0.40	0.16	0.20	0.20	0.14	0.18	0.19	0.15	0.22	0.52	0.22	0.46	1.45	0.79	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.36	0.40	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.03	0.52	0.31	1.12	0.48
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.10	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.57	0.33	0.18
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.12	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.05	0.03	0.01	0.01	0.33	0.52	0.37	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.53	0.31	1.11	0.53
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.05	0.09	0.08	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.55	0.19	0.32
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.65	0.52	1.50	0.84
C5'	0.03	0.07	0.01	0.03	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.06	0.15	0.15	0.08	0.04	0.07	0.02	0.01	0.22	0.25	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.12	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.02	0.66	0.55	1.61	0.88
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.66	0.55	1.37	0.84
N1	0.03	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.02	0.61	0.41	1.42	0.71
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.12	0.03	0.45	0.30	0.91	0.35
N6	0.04	0.01	0.09	0.14	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.09	0.16	0.04	0.70	0.70	1.84	1.06
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.13	0.02	0.72	0.72	1.70	1.04
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.49	0.28	0.94	0.46
O2'	0.01	0.13	0.00	0.03	0.07	0.05	0.06	0.04	0.09	0.03	0.12	0.13	0.09	0.02	0.02	0.00	0.06	0.05	0.10	0.87	0.18	0.51
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.08	0.03	0.11	0.07	0.14	0.11	0.14	0.12	0.16	0.13	0.05	0.06	0.00	0.02	0.23	0.80	0.16	0.36
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.32	0.25	0.15
O5'	0.26	0.52	0.28	0.33	0.53	0.01	0.65	0.01	0.66	0.66	0.61	0.45	0.70	0.72	0.49	0.10	0.23	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.31	0.57	0.52	0.31	0.55	0.52	0.22	0.55	0.55	0.41	0.30	0.70	0.72	0.28	0.87	0.80	0.32	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	1.12	0.33	0.37	1.11	0.19	1.50	0.25	1.61	1.37	1.42	0.91	1.84	1.70	0.94	0.18	0.16	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.48	0.18	0.17	0.53	0.32	0.84	0.01	0.88	0.84	0.71	0.35	1.06	1.04	0.46	0.51	0.36	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00