Doublet Group distance statistics: 55286

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 3, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.015, 0.040, 0.065, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.008, 0.037, 0.065, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.037 std_dev=0.029
N7	A	0, -0.001, 0.032, 0.064, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.036, 0.116, 0.196, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.116 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.017, 0.134, 0.252, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.134 std_dev=0.117
C4'	A	0, 0.045, 0.177, 0.309, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.177 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.104, 0.261, 0.419, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.261 std_dev=0.157
C3'	A	0, 0.047, 0.215, 0.383, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.215 std_dev=0.168
O5'	A	0, 0.102, 0.312, 0.522, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.312 std_dev=0.210
C5'	A	0, 0.084, 0.315, 0.547, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.315 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.138, 0.372, 0.606, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.372 std_dev=0.234
O3'	A	0, 0.066, 0.329, 0.593, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.329 std_dev=0.264
C2	B	0, 0.133, 0.398, 0.662, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.398 std_dev=0.264
OP2	A	0, 0.199, 0.472, 0.746, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.472 std_dev=0.274
P	A	0, 0.161, 0.436, 0.711, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.436 std_dev=0.275
C4	B	0, 0.164, 0.510, 0.857, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.510 std_dev=0.347
N1	B	0, 0.161, 0.536, 0.911, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.536 std_dev=0.375
C1'	B	0, 0.209, 0.604, 0.998, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.604 std_dev=0.394
N9	B	0, 0.200, 0.626, 1.053, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.626 std_dev=0.426
OP1	A	0, 0.139, 0.572, 1.005, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.572 std_dev=0.433
O4'	B	0, 0.236, 0.693, 1.150, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.693 std_dev=0.457
C5	B	0, 0.204, 0.689, 1.173, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.689 std_dev=0.485
C6	B	0, 0.198, 0.690, 1.181, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.690 std_dev=0.491
C4'	B	0, 0.269, 0.820, 1.371, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.820 std_dev=0.551
C3'	B	0, 0.254, 0.823, 1.392, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.823 std_dev=0.569
C8	B	0, 0.242, 0.844, 1.445, 2.223 max_d=2.223 avg_d=0.844 std_dev=0.602
O5'	B	0, 0.291, 0.923, 1.554, 2.569 max_d=2.569 avg_d=0.923 std_dev=0.631
N7	B	0, 0.254, 0.899, 1.543, 2.491 max_d=2.491 avg_d=0.899 std_dev=0.645
C2'	B	0, 0.179, 0.831, 1.483, 2.238 max_d=2.238 avg_d=0.831 std_dev=0.652
N6	B	0, 0.222, 0.892, 1.563, 2.414 max_d=2.414 avg_d=0.892 std_dev=0.671
C5'	B	0, 0.269, 0.959, 1.649, 2.684 max_d=2.684 avg_d=0.959 std_dev=0.690
O3'	B	0, 0.147, 0.937, 1.727, 2.358 max_d=2.358 avg_d=0.937 std_dev=0.790
P	B	0, 0.256, 1.088, 1.920, 3.587 max_d=3.587 avg_d=1.088 std_dev=0.832
O2'	B	0, 0.035, 1.005, 1.975, 3.422 max_d=3.422 avg_d=1.005 std_dev=0.970
OP2	B	0, 0.211, 1.541, 2.870, 4.843 max_d=4.843 avg_d=1.541 std_dev=1.330
OP1	B	0, 0.004, 1.663, 3.323, 6.017 max_d=6.017 avg_d=1.663 std_dev=1.660

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.06
C2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.12	0.04	0.11	0.02	0.15	0.20	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.12	0.09	0.11	0.08	0.12	0.05	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.08	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.11	0.01	0.14	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.14	0.02	0.17	0.21	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.06	0.05	0.13	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.15	0.00	0.19	0.23	0.19
C8	0.02	0.03	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.14	0.05	0.15	0.02	0.15	0.16	0.15
N1	0.03	0.01	0.07	0.09	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.03	0.14	0.02	0.18	0.23	0.17
N2	0.05	0.01	0.11	0.11	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.14	0.15	0.06	0.10	0.03	0.15	0.20	0.13
N3	0.03	0.01	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.11	0.04	0.10	0.01	0.13	0.17	0.12
N7	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.05	0.17	0.03	0.19	0.22	0.19
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.12	0.14	0.10
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.09	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.10	0.04	0.11	0.14	0.11	0.15	0.11	0.15	0.05	0.03	0.00	0.02	0.15	0.13	0.12	0.18	0.13
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.04	0.09	0.13	0.08
O5'	0.06	0.11	0.04	0.10	0.11	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.14	0.10	0.10	0.17	0.10	0.05	0.15	0.10	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.09	0.01	0.05	0.02	0.10	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.13	0.04	0.16	0.00	0.21	0.24	0.20
OP1	0.08	0.15	0.07	0.08	0.14	0.08	0.17	0.09	0.19	0.15	0.18	0.15	0.13	0.19	0.12	0.08	0.12	0.09	0.02	0.21	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.20	0.07	0.11	0.18	0.04	0.21	0.02	0.23	0.16	0.23	0.20	0.17	0.22	0.14	0.07	0.18	0.13	0.02	0.24	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.04	0.07	0.13	0.02	0.17	0.02	0.19	0.15	0.17	0.13	0.12	0.19	0.10	0.05	0.13	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.20	0.63	0.30	0.15	0.22	0.14	0.21	0.18	0.19	0.24	0.14	0.21	0.15	0.20	0.60	0.43	0.21	0.26	0.57	0.39	0.20
C2	0.26	0.21	0.47	0.29	0.24	0.21	0.31	0.23	0.37	0.28	0.33	0.21	0.46	0.32	0.25	0.34	0.36	0.23	0.27	1.02	0.43	0.26
C2'	0.32	0.17	0.63	0.26	0.18	0.22	0.16	0.22	0.15	0.23	0.18	0.16	0.15	0.19	0.25	0.69	0.52	0.25	0.28	0.62	0.34	0.23
C3'	0.41	0.17	0.72	0.31	0.22	0.32	0.19	0.33	0.15	0.32	0.18	0.17	0.15	0.25	0.32	0.95	0.57	0.36	0.34	0.47	0.38	0.28
C4	0.27	0.21	0.56	0.26	0.19	0.18	0.22	0.18	0.28	0.21	0.30	0.18	0.35	0.22	0.21	0.51	0.43	0.20	0.25	0.83	0.35	0.21
C4'	0.38	0.17	0.75	0.37	0.19	0.36	0.18	0.36	0.15	0.31	0.18	0.13	0.16	0.24	0.29	0.90	0.52	0.33	0.36	0.34	0.45	0.29
C5	0.26	0.20	0.57	0.25	0.20	0.17	0.25	0.17	0.32	0.23	0.31	0.18	0.39	0.26	0.22	0.57	0.47	0.21	0.25	0.87	0.30	0.22
C5'	0.41	0.17	0.78	0.42	0.20	0.41	0.19	0.43	0.15	0.34	0.19	0.14	0.16	0.27	0.32	0.99	0.55	0.38	0.40	0.33	0.47	0.34
C6	0.25	0.20	0.53	0.24	0.22	0.17	0.30	0.18	0.36	0.26	0.33	0.18	0.47	0.31	0.23	0.51	0.45	0.21	0.25	0.98	0.31	0.25
C8	0.28	0.21	0.63	0.28	0.18	0.21	0.19	0.21	0.25	0.20	0.28	0.16	0.30	0.19	0.21	0.70	0.53	0.22	0.26	0.68	0.31	0.22
N1	0.25	0.20	0.48	0.26	0.24	0.19	0.32	0.21	0.39	0.29	0.34	0.20	0.50	0.35	0.24	0.40	0.41	0.23	0.26	1.05	0.37	0.27
N2	0.28	0.22	0.42	0.33	0.28	0.26	0.35	0.29	0.41	0.33	0.34	0.24	0.52	0.38	0.28	0.25	0.33	0.27	0.30	1.10	0.52	0.30
N3	0.27	0.21	0.51	0.29	0.21	0.20	0.25	0.21	0.30	0.23	0.31	0.20	0.37	0.25	0.23	0.38	0.36	0.22	0.26	0.90	0.43	0.22
N7	0.27	0.21	0.61	0.26	0.19	0.20	0.23	0.19	0.29	0.22	0.30	0.17	0.36	0.23	0.22	0.67	0.54	0.22	0.25	0.78	0.28	0.23
N9	0.27	0.21	0.61	0.27	0.17	0.19	0.18	0.19	0.23	0.19	0.27	0.16	0.28	0.18	0.21	0.61	0.46	0.21	0.25	0.69	0.34	0.20
O2'	0.27	0.15	0.60	0.26	0.17	0.20	0.16	0.20	0.13	0.23	0.15	0.12	0.14	0.20	0.23	0.56	0.47	0.20	0.26	0.55	0.37	0.21
O3'	0.48	0.18	0.73	0.33	0.28	0.40	0.26	0.41	0.19	0.40	0.17	0.20	0.19	0.33	0.39	1.10	0.63	0.45	0.40	0.44	0.42	0.35
O4'	0.31	0.20	0.69	0.36	0.15	0.30	0.14	0.30	0.17	0.24	0.22	0.12	0.19	0.19	0.23	0.70	0.46	0.26	0.32	0.42	0.45	0.25
O5'	0.36	0.18	0.74	0.37	0.17	0.35	0.15	0.35	0.15	0.28	0.21	0.13	0.17	0.20	0.27	0.97	0.59	0.33	0.34	0.38	0.40	0.28
O6	0.25	0.20	0.53	0.23	0.22	0.17	0.31	0.18	0.38	0.28	0.34	0.18	0.50	0.34	0.23	0.54	0.48	0.21	0.26	1.02	0.28	0.27
OP1	0.42	0.20	0.76	0.37	0.22	0.40	0.20	0.43	0.17	0.35	0.21	0.18	0.17	0.27	0.33	1.09	0.59	0.40	0.36	0.34	0.40	0.33
OP2	0.33	0.19	0.70	0.33	0.18	0.30	0.17	0.30	0.20	0.25	0.24	0.16	0.24	0.20	0.25	0.97	0.64	0.30	0.29	0.47	0.34	0.26
P	0.38	0.18	0.76	0.38	0.18	0.36	0.16	0.38	0.16	0.30	0.21	0.14	0.18	0.22	0.29	1.02	0.59	0.34	0.35	0.34	0.40	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.31	0.00	0.16	0.77	0.15	0.32
C2	0.03	0.00	0.23	0.19	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.30	0.12	0.20	1.02	0.51	0.32
C2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.19	0.11	0.11	0.18	0.23	0.09	0.06	0.02	0.00	0.03	0.02	0.49	0.76	0.39	0.59
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.22	0.00	0.31	0.02	0.31	0.34	0.26	0.15	0.36	0.37	0.22	0.02	0.01	0.02	0.22	0.27	0.21	0.17
C4	0.01	0.01	0.12	0.22	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.24	0.16	0.07	0.22	1.02	0.48	0.33
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.08	0.18	0.04	0.05	0.11	0.17	0.08	0.30	0.03	0.00	0.02	0.23	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.31	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.31	0.07	0.04	0.32	1.11	0.68	0.37
C5'	0.06	0.05	0.19	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.13	0.19	0.08	0.05	0.17	0.20	0.08	0.10	0.19	0.01	0.01	0.20	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.31	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.07	0.07	0.32	1.13	0.75	0.38
C8	0.02	0.01	0.11	0.34	0.01	0.18	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.28	0.18	0.08	0.34	1.09	0.57	0.37
N1	0.02	0.01	0.18	0.26	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.18	0.10	0.26	1.09	0.66	0.35
N3	0.03	0.01	0.23	0.15	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.34	0.12	0.17	0.96	0.40	0.31
N6	0.03	0.01	0.09	0.36	0.02	0.11	0.02	0.17	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.36	0.11	0.06	0.39	1.17	0.89	0.41
N7	0.02	0.01	0.06	0.37	0.00	0.17	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.33	0.20	0.05	0.39	1.15	0.77	0.40
N9	0.01	0.01	0.02	0.22	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.20	0.10	0.01	0.21	0.97	0.37	0.33
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.24	0.30	0.31	0.10	0.32	0.28	0.29	0.22	0.36	0.33	0.20	0.00	0.06	0.22	0.35	0.60	0.30	0.46
O3'	0.31	0.30	0.03	0.01	0.16	0.03	0.07	0.19	0.07	0.18	0.18	0.34	0.11	0.20	0.10	0.06	0.00	0.22	0.22	0.53	0.27	0.29
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.10	0.12	0.06	0.05	0.01	0.22	0.22	0.00	0.13	0.60	0.10	0.16
O5'	0.16	0.20	0.49	0.22	0.22	0.02	0.32	0.01	0.32	0.34	0.26	0.17	0.39	0.39	0.21	0.35	0.22	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.77	1.02	0.76	0.27	1.02	0.23	1.11	0.20	1.13	1.09	1.09	0.96	1.17	1.15	0.97	0.60	0.53	0.60	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.51	0.39	0.21	0.48	0.19	0.68	0.34	0.75	0.57	0.66	0.40	0.89	0.77	0.37	0.30	0.27	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.32	0.32	0.59	0.17	0.33	0.06	0.37	0.02	0.38	0.37	0.35	0.31	0.41	0.40	0.33	0.46	0.29	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00