Doublet Group distance statistics: 55291

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.012, 0.034, 0.055, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.009, 0.033, 0.056, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.009, 0.037, 0.065, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.005, 0.036, 0.067, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.036 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.011, 0.046, 0.082, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.046 std_dev=0.035
O6	A	0, 0.024, 0.062, 0.100, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.062 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.014, 0.069, 0.124, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.069 std_dev=0.055
C8	A	0, 0.015, 0.079, 0.144, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.079 std_dev=0.065
O4'	A	0, 0.025, 0.163, 0.301, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.163 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.049, 0.223, 0.397, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.223 std_dev=0.174
C2'	A	0, 0.019, 0.218, 0.417, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.218 std_dev=0.199
C2	B	0, 0.232, 0.446, 0.659, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.446 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.206, 0.428, 0.650, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.428 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.064, 0.324, 0.584, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.324 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.353, 0.651, 0.950, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.651 std_dev=0.298
O2'	A	0, 0.021, 0.320, 0.618, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.320 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.446, 0.762, 1.077, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.762 std_dev=0.316
C5'	A	0, 0.110, 0.473, 0.835, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.473 std_dev=0.362
C5	B	0, 0.457, 0.823, 1.189, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.823 std_dev=0.366
O3'	A	0, 0.116, 0.494, 0.872, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.494 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.272, 0.661, 1.050, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.661 std_dev=0.389
N6	B	0, 0.580, 1.033, 1.487, 1.702 max_d=1.702 avg_d=1.033 std_dev=0.453
N7	B	0, 0.649, 1.213, 1.778, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.213 std_dev=0.565
O5'	A	0, 0.190, 0.795, 1.400, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.795 std_dev=0.605
N9	B	0, 0.352, 1.022, 1.691, 2.357 max_d=2.357 avg_d=1.022 std_dev=0.670
C8	B	0, 0.561, 1.305, 2.049, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.305 std_dev=0.744
C3'	B	0, 0.355, 1.142, 1.929, 3.215 max_d=3.215 avg_d=1.142 std_dev=0.787
C4'	B	0, 0.534, 1.419, 2.304, 3.407 max_d=3.407 avg_d=1.419 std_dev=0.885
C1'	B	0, 0.275, 1.163, 2.051, 2.965 max_d=2.965 avg_d=1.163 std_dev=0.888
C2'	B	0, 0.169, 1.065, 1.961, 3.210 max_d=3.210 avg_d=1.065 std_dev=0.896
O3'	B	0, 0.413, 1.319, 2.224, 3.580 max_d=3.580 avg_d=1.319 std_dev=0.905
O4'	B	0, 0.491, 1.416, 2.341, 3.151 max_d=3.151 avg_d=1.416 std_dev=0.925
C5'	B	0, 0.647, 1.588, 2.529, 3.530 max_d=3.530 avg_d=1.588 std_dev=0.941
P	A	0, 0.305, 1.291, 2.277, 2.436 max_d=2.436 avg_d=1.291 std_dev=0.986
OP2	A	0, 0.279, 1.406, 2.533, 2.901 max_d=2.901 avg_d=1.406 std_dev=1.127
OP1	A	0, 0.399, 1.604, 2.809, 2.990 max_d=2.990 avg_d=1.604 std_dev=1.205
O2'	B	0, -0.046, 1.430, 2.906, 4.871 max_d=4.871 avg_d=1.430 std_dev=1.476
O5'	B	0, 1.268, 2.809, 4.350, 4.848 max_d=4.848 avg_d=2.809 std_dev=1.541
OP1	B	0, 1.559, 3.460, 5.362, 6.390 max_d=6.390 avg_d=3.460 std_dev=1.901
P	B	0, 1.397, 3.342, 5.286, 6.744 max_d=6.744 avg_d=3.342 std_dev=1.944
OP2	B	0, 1.306, 3.428, 5.551, 7.628 max_d=7.628 avg_d=3.428 std_dev=2.122

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.03	0.12	0.12	0.10
C2	0.05	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.15	0.06	0.23	0.01	0.27	0.36	0.22
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.03	0.06	0.02	0.06	0.10	0.06	0.12	0.11	0.10	0.04	0.00	0.02	0.01	0.11	0.08	0.18	0.19	0.10
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.17	0.10	0.15	0.12	0.16	0.08	0.01	0.01	0.02	0.13	0.14	0.25	0.21	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.22	0.02	0.23	0.30	0.20
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.02	0.26	0.01	0.29	0.36	0.27
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.12	0.09	0.09	0.17	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.16	0.10	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.11	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.15	0.03	0.27	0.01	0.33	0.42	0.29
C8	0.01	0.01	0.10	0.17	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.20	0.04	0.26	0.01	0.25	0.26	0.24
N1	0.04	0.00	0.06	0.10	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.04	0.26	0.01	0.31	0.41	0.27
N2	0.06	0.01	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.20	0.07	0.22	0.02	0.27	0.36	0.21
N3	0.05	0.01	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.14	0.05	0.21	0.02	0.23	0.30	0.19
N7	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.21	0.03	0.28	0.01	0.30	0.35	0.29
N9	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.02	0.20	0.02	0.19	0.22	0.17
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.13	0.10	0.08	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.09	0.12	0.10	0.05
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.15	0.03	0.15	0.20	0.13	0.20	0.14	0.21	0.09	0.03	0.00	0.02	0.16	0.19	0.35	0.26	0.23
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.13	0.03	0.20	0.16	0.20
O5'	0.11	0.23	0.11	0.13	0.22	0.01	0.26	0.00	0.27	0.26	0.26	0.22	0.21	0.28	0.20	0.03	0.16	0.13	0.00	0.29	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.14	0.02	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.19	0.03	0.29	0.00	0.37	0.45	0.33
OP1	0.12	0.27	0.18	0.25	0.23	0.08	0.29	0.10	0.33	0.25	0.31	0.27	0.23	0.30	0.19	0.12	0.35	0.20	0.03	0.37	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.36	0.19	0.21	0.30	0.04	0.36	0.02	0.42	0.26	0.41	0.36	0.30	0.35	0.22	0.10	0.26	0.16	0.02	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.22	0.10	0.17	0.20	0.03	0.27	0.01	0.29	0.24	0.27	0.21	0.19	0.29	0.17	0.05	0.23	0.20	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.55	0.22	0.37	0.37	0.16	0.85	0.14	0.92	0.30	0.27	0.38	0.13	0.41	0.17	0.34	0.73	0.50	0.97	0.83	0.86	0.85	0.89
C2	0.30	0.16	0.23	0.15	0.17	0.55	0.25	0.69	0.38	0.22	0.37	0.17	0.53	0.27	0.22	0.48	0.36	0.68	0.50	0.53	0.36	0.50
C2'	0.51	0.09	0.43	0.40	0.25	0.88	0.15	1.04	0.08	0.34	0.15	0.22	0.13	0.22	0.39	0.79	0.48	0.98	0.98	1.01	0.97	1.03
C3'	0.60	0.08	0.48	0.53	0.29	1.02	0.19	1.19	0.08	0.42	0.13	0.23	0.12	0.28	0.45	0.89	0.59	1.08	1.22	1.28	1.22	1.28
C4	0.41	0.18	0.32	0.26	0.11	0.71	0.17	0.81	0.36	0.19	0.41	0.13	0.51	0.17	0.24	0.65	0.44	0.83	0.68	0.73	0.62	0.72
C4'	0.59	0.19	0.37	0.48	0.20	0.99	0.14	1.08	0.22	0.34	0.29	0.14	0.30	0.21	0.38	0.76	0.57	1.05	1.07	1.13	1.14	1.14
C5	0.42	0.17	0.34	0.29	0.12	0.73	0.18	0.83	0.37	0.20	0.40	0.13	0.54	0.19	0.25	0.68	0.48	0.84	0.72	0.78	0.67	0.76
C5'	0.58	0.20	0.36	0.48	0.20	0.98	0.17	1.08	0.25	0.35	0.31	0.15	0.34	0.23	0.38	0.75	0.56	1.03	1.11	1.21	1.22	1.20
C6	0.37	0.15	0.29	0.24	0.15	0.67	0.23	0.78	0.38	0.21	0.38	0.15	0.56	0.24	0.23	0.61	0.45	0.77	0.64	0.70	0.55	0.67
C8	0.53	0.20	0.41	0.41	0.13	0.87	0.15	0.95	0.35	0.24	0.41	0.12	0.50	0.15	0.31	0.78	0.57	0.95	0.88	0.95	0.91	0.96
N1	0.32	0.15	0.25	0.17	0.17	0.59	0.26	0.72	0.39	0.23	0.36	0.16	0.55	0.28	0.22	0.52	0.39	0.70	0.55	0.59	0.41	0.55
N2	0.26	0.17	0.19	0.16	0.22	0.48	0.30	0.63	0.38	0.28	0.32	0.20	0.51	0.33	0.24	0.36	0.33	0.59	0.42	0.42	0.26	0.39
N3	0.34	0.17	0.26	0.18	0.13	0.61	0.20	0.73	0.36	0.18	0.40	0.15	0.50	0.20	0.21	0.54	0.37	0.74	0.56	0.59	0.46	0.58
N7	0.49	0.18	0.39	0.38	0.13	0.83	0.16	0.92	0.36	0.22	0.40	0.13	0.53	0.16	0.28	0.75	0.55	0.91	0.83	0.91	0.84	0.90
N9	0.50	0.20	0.37	0.35	0.13	0.81	0.14	0.89	0.34	0.22	0.40	0.12	0.48	0.14	0.29	0.74	0.50	0.92	0.80	0.85	0.80	0.86
O2'	0.50	0.09	0.44	0.39	0.30	0.83	0.24	1.00	0.12	0.40	0.10	0.23	0.11	0.31	0.42	0.76	0.45	0.98	0.91	0.90	0.94	0.96
O3'	0.68	0.11	0.59	0.66	0.41	1.11	0.35	1.35	0.21	0.57	0.11	0.28	0.19	0.46	0.57	1.05	0.68	1.12	1.49	1.57	1.49	1.55
O4'	0.64	0.25	0.38	0.47	0.21	0.96	0.21	0.99	0.35	0.35	0.41	0.15	0.46	0.25	0.40	0.74	0.61	1.05	0.93	0.96	1.02	1.01
O5'	0.61	0.13	0.39	0.46	0.21	0.99	0.12	1.10	0.21	0.33	0.26	0.19	0.33	0.18	0.39	0.81	0.54	1.05	1.12	1.23	1.19	1.20
O6	0.37	0.15	0.30	0.25	0.16	0.68	0.24	0.79	0.39	0.22	0.37	0.15	0.57	0.26	0.24	0.62	0.47	0.77	0.66	0.73	0.57	0.69
OP1	0.55	0.13	0.33	0.37	0.17	0.94	0.06	1.08	0.20	0.27	0.25	0.17	0.33	0.11	0.33	0.81	0.40	0.99	1.18	1.39	1.25	1.29
OP2	0.64	0.15	0.43	0.45	0.26	1.00	0.13	1.12	0.20	0.34	0.24	0.28	0.34	0.18	0.42	0.87	0.50	1.07	1.14	1.31	1.21	1.25
P	0.56	0.15	0.35	0.39	0.14	0.95	0.10	1.07	0.28	0.26	0.32	0.14	0.42	0.13	0.33	0.80	0.46	1.01	1.11	1.27	1.21	1.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.17	0.18	0.30	0.22
C2	0.04	0.00	0.33	0.19	0.01	0.32	0.01	0.54	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.42	0.22	0.46	0.36	0.37	0.29	0.37
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.17	0.02	0.09	0.15	0.16	0.17	0.26	0.32	0.11	0.09	0.02	0.00	0.04	0.02	0.25	0.29	0.58	0.42
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.17	0.00	0.20	0.03	0.22	0.18	0.22	0.16	0.23	0.21	0.13	0.03	0.01	0.02	0.40	0.36	0.60	0.49
C4	0.03	0.01	0.17	0.17	0.00	0.14	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.14	0.15	0.24	0.22	0.25	0.14	0.21
C4'	0.01	0.32	0.02	0.00	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.21	0.24	0.31	0.10	0.15	0.05	0.20	0.02	0.00	0.02	0.13	0.41	0.12
C5	0.02	0.01	0.09	0.20	0.01	0.07	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.12	0.15	0.12	0.36	0.40	0.30	0.33
C5'	0.07	0.54	0.15	0.03	0.28	0.01	0.21	0.00	0.31	0.24	0.46	0.50	0.27	0.19	0.10	0.10	0.14	0.02	0.01	0.26	0.41	0.02
C6	0.04	0.01	0.16	0.22	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.19	0.22	0.32	0.36	0.29	0.28
C8	0.02	0.02	0.17	0.18	0.01	0.21	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.44	0.10	0.21	0.64	0.66	0.50	0.62
N1	0.04	0.00	0.26	0.22	0.01	0.24	0.01	0.46	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.28	0.22	0.36	0.30	0.32	0.23	0.29
N3	0.04	0.00	0.32	0.16	0.00	0.31	0.01	0.50	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.42	0.21	0.46	0.30	0.31	0.29	0.33
N6	0.04	0.02	0.11	0.23	0.02	0.10	0.02	0.27	0.00	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.14	0.21	0.17	0.40	0.45	0.43	0.36
N7	0.02	0.02	0.09	0.21	0.00	0.15	0.00	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.35	0.13	0.10	0.61	0.66	0.55	0.60
N9	0.01	0.02	0.02	0.13	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.12	0.01	0.32	0.35	0.20	0.31
O2'	0.02	0.42	0.00	0.03	0.14	0.20	0.12	0.10	0.12	0.44	0.28	0.42	0.14	0.35	0.13	0.00	0.06	0.13	0.14	0.15	0.60	0.28
O3'	0.22	0.22	0.04	0.01	0.15	0.02	0.15	0.14	0.19	0.10	0.22	0.21	0.21	0.13	0.12	0.06	0.00	0.16	0.45	0.43	0.84	0.58
O4'	0.00	0.46	0.02	0.02	0.24	0.00	0.12	0.02	0.22	0.21	0.36	0.46	0.17	0.10	0.01	0.13	0.16	0.00	0.24	0.23	0.38	0.24
O5'	0.17	0.36	0.25	0.40	0.22	0.02	0.36	0.01	0.32	0.64	0.30	0.30	0.40	0.61	0.32	0.14	0.45	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.18	0.37	0.29	0.36	0.25	0.13	0.40	0.26	0.36	0.66	0.32	0.31	0.45	0.66	0.35	0.15	0.43	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.29	0.58	0.60	0.14	0.41	0.30	0.41	0.29	0.50	0.23	0.29	0.43	0.55	0.20	0.60	0.84	0.38	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.37	0.42	0.49	0.21	0.12	0.33	0.02	0.28	0.62	0.29	0.33	0.36	0.60	0.31	0.28	0.58	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00