Doublet Group distance statistics: 55292

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.004, 0.010, 0.024, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C5	A	0, -0.002, 0.015, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.015 std_dev=0.016
C1'	A	0, -0.005, 0.013, 0.031, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.013 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.003, 0.025, 0.046, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.025 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.004, 0.027, 0.049, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.027 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.031 std_dev=0.024
N9	A	0, -0.002, 0.024, 0.051, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.024 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.003, 0.031, 0.058, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.031 std_dev=0.027
O4'	A	0, -0.069, 0.132, 0.332, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.132 std_dev=0.200
C2'	A	0, -0.073, 0.152, 0.377, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.152 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.080, 0.341, 0.601, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.341 std_dev=0.260
O2'	A	0, -0.076, 0.199, 0.474, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.199 std_dev=0.275
C4'	A	0, -0.091, 0.204, 0.499, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.204 std_dev=0.295
C3'	A	0, -0.122, 0.242, 0.605, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.242 std_dev=0.363
N3	B	0, 0.017, 0.420, 0.824, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.420 std_dev=0.403
C4	B	0, 0.006, 0.431, 0.855, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.431 std_dev=0.425
N9	B	0, -0.011, 0.438, 0.887, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.438 std_dev=0.449
C5'	A	0, -0.126, 0.366, 0.857, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.366 std_dev=0.491
C2	B	0, -0.021, 0.472, 0.966, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.472 std_dev=0.493
C8	B	0, -0.019, 0.481, 0.982, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.481 std_dev=0.501
C1'	B	0, -0.078, 0.429, 0.936, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.429 std_dev=0.507
C5	B	0, -0.026, 0.484, 0.993, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.484 std_dev=0.509
N7	B	0, -0.020, 0.512, 1.044, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.512 std_dev=0.532
O3'	A	0, -0.184, 0.369, 0.923, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.369 std_dev=0.554
N1	B	0, -0.057, 0.532, 1.121, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.532 std_dev=0.589
C6	B	0, -0.060, 0.534, 1.128, 1.969 max_d=1.969 avg_d=0.534 std_dev=0.594
O2'	B	0, -0.123, 0.493, 1.108, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.493 std_dev=0.615
O5'	A	0, -0.185, 0.459, 1.103, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.459 std_dev=0.644
N6	B	0, -0.093, 0.612, 1.317, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.612 std_dev=0.705
O4'	B	0, -0.259, 0.491, 1.242, 2.714 max_d=2.714 avg_d=0.491 std_dev=0.750
C3'	B	0, -0.323, 0.483, 1.288, 2.883 max_d=2.883 avg_d=0.483 std_dev=0.806
P	A	0, -0.283, 0.562, 1.407, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.562 std_dev=0.845
C4'	B	0, -0.379, 0.533, 1.444, 3.245 max_d=3.245 avg_d=0.533 std_dev=0.911
C5'	B	0, -0.442, 0.641, 1.724, 3.789 max_d=3.789 avg_d=0.641 std_dev=1.083
O3'	B	0, -0.551, 0.595, 1.740, 4.018 max_d=4.018 avg_d=0.595 std_dev=1.145
OP1	A	0, -0.469, 0.776, 2.020, 3.597 max_d=3.597 avg_d=0.776 std_dev=1.245
O5'	B	0, -0.466, 0.799, 2.064, 3.395 max_d=3.395 avg_d=0.799 std_dev=1.265
OP2	A	0, -0.539, 0.854, 2.247, 4.108 max_d=4.108 avg_d=0.854 std_dev=1.393
P	B	0, -0.538, 0.925, 2.388, 4.391 max_d=4.391 avg_d=0.925 std_dev=1.463
OP2	B	0, -0.500, 0.975, 2.451, 4.435 max_d=4.435 avg_d=0.975 std_dev=1.475
OP1	B	0, -0.726, 1.056, 2.837, 5.545 max_d=5.545 avg_d=1.056 std_dev=1.781

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.01	0.09	0.56	0.23
C2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.21	0.03	0.34	0.02	0.30	0.90	0.44
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.10	0.16	0.14	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.05	0.23	0.37	0.21
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.17	0.12	0.19	0.15	0.15	0.06	0.02	0.01	0.01	0.30	0.10	0.40	0.22	0.26
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.02	0.36	0.02	0.31	0.88	0.44
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.23	0.06
C5	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.47	0.02	0.44	1.06	0.56
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.06	0.14	0.04	0.07	0.05	0.13	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.25	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.49	0.01	0.49	1.13	0.60
C8	0.02	0.02	0.07	0.17	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.03	0.49	0.03	0.40	0.96	0.52
N1	0.02	0.01	0.10	0.12	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.16	0.03	0.43	0.01	0.41	1.04	0.53
N2	0.04	0.01	0.16	0.19	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.28	0.05	0.30	0.03	0.26	0.85	0.40
N3	0.03	0.01	0.14	0.15	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.03	0.29	0.02	0.23	0.80	0.38
N7	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.02	0.54	0.03	0.50	1.12	0.61
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.34	0.02	0.26	0.79	0.38
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.08	0.14	0.11	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.06	0.04	0.11	0.21	0.06
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.02	0.12	0.18	0.16	0.28	0.19	0.17	0.05	0.05	0.00	0.01	0.25	0.12	0.48	0.11	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.04	0.09	0.49	0.21
O5'	0.15	0.34	0.21	0.30	0.36	0.01	0.47	0.01	0.49	0.49	0.43	0.30	0.29	0.54	0.34	0.06	0.25	0.06	0.00	0.54	0.03	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.10	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.12	0.04	0.54	0.00	0.58	1.23	0.67
OP1	0.09	0.30	0.23	0.40	0.31	0.11	0.44	0.25	0.49	0.40	0.41	0.26	0.23	0.50	0.26	0.11	0.48	0.09	0.03	0.58	0.00	0.02	0.01
OP2	0.56	0.90	0.37	0.22	0.88	0.23	1.06	0.25	1.13	0.96	1.04	0.85	0.80	1.12	0.79	0.21	0.11	0.49	0.01	1.23	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.44	0.21	0.26	0.44	0.06	0.56	0.02	0.60	0.52	0.53	0.40	0.38	0.61	0.38	0.06	0.24	0.21	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.08	0.17	0.86	0.12	0.96	0.11	1.13	0.06	0.23	0.08	0.07	0.05	0.17	0.22	0.40	1.12	0.67	1.30	1.59	1.34	1.37
C2	0.25	0.12	0.10	0.58	0.11	0.89	0.09	1.01	0.11	0.15	0.14	0.10	0.12	0.11	0.17	0.42	0.91	0.75	0.85	1.02	0.76	0.83
C2'	0.11	0.21	0.11	0.61	0.15	0.72	0.15	0.98	0.17	0.12	0.20	0.18	0.18	0.12	0.12	0.72	0.79	0.40	1.19	1.48	1.22	1.27
C3'	0.16	0.28	0.16	0.51	0.23	0.54	0.22	0.81	0.25	0.17	0.27	0.26	0.25	0.20	0.19	0.77	0.68	0.24	1.09	1.43	1.15	1.19
C4	0.28	0.12	0.10	0.74	0.10	0.96	0.08	1.11	0.08	0.17	0.12	0.08	0.09	0.11	0.18	0.43	1.08	0.74	1.08	1.30	1.03	1.09
C4'	0.10	0.17	0.06	0.71	0.06	0.69	0.05	0.92	0.10	0.08	0.15	0.12	0.10	0.05	0.06	0.52	0.89	0.39	1.22	1.61	1.35	1.35
C5	0.28	0.14	0.10	0.71	0.12	0.95	0.10	1.10	0.12	0.17	0.15	0.11	0.13	0.12	0.19	0.41	1.08	0.74	1.06	1.28	0.98	1.07
C5'	0.08	0.19	0.07	0.70	0.07	0.66	0.07	0.86	0.12	0.07	0.18	0.14	0.12	0.04	0.04	0.49	0.90	0.35	1.18	1.57	1.31	1.31
C6	0.28	0.15	0.11	0.64	0.14	0.92	0.13	1.07	0.15	0.17	0.17	0.13	0.16	0.13	0.19	0.40	1.02	0.75	0.95	1.14	0.84	0.93
C8	0.29	0.12	0.12	0.80	0.11	0.96	0.09	1.13	0.09	0.19	0.13	0.08	0.10	0.13	0.19	0.40	1.14	0.71	1.22	1.50	1.20	1.27
N1	0.26	0.15	0.11	0.58	0.14	0.88	0.13	1.01	0.15	0.16	0.17	0.14	0.16	0.13	0.18	0.40	0.93	0.74	0.85	1.01	0.72	0.82
N2	0.21	0.13	0.12	0.45	0.10	0.78	0.09	0.91	0.12	0.12	0.14	0.09	0.13	0.10	0.14	0.40	0.75	0.72	0.72	0.85	0.60	0.67
N3	0.26	0.11	0.09	0.68	0.09	0.95	0.07	1.07	0.08	0.15	0.12	0.07	0.08	0.10	0.17	0.46	1.00	0.75	0.98	1.17	0.93	0.98
N7	0.29	0.14	0.11	0.76	0.12	0.96	0.10	1.13	0.12	0.19	0.15	0.10	0.13	0.13	0.20	0.40	1.12	0.73	1.15	1.41	1.09	1.18
N9	0.28	0.11	0.12	0.80	0.10	0.96	0.08	1.12	0.07	0.19	0.11	0.07	0.07	0.13	0.19	0.42	1.12	0.70	1.20	1.46	1.19	1.24
O2'	0.12	0.17	0.11	0.60	0.13	0.66	0.12	0.96	0.13	0.12	0.16	0.15	0.14	0.11	0.11	0.73	0.67	0.35	1.24	1.60	1.34	1.38
O3'	0.39	0.39	0.35	0.30	0.39	0.30	0.39	0.58	0.38	0.37	0.38	0.40	0.39	0.38	0.38	0.96	0.40	0.18	0.93	1.31	1.03	1.07
O4'	0.32	0.10	0.24	0.91	0.15	0.92	0.14	1.10	0.09	0.28	0.10	0.10	0.08	0.22	0.25	0.30	1.15	0.63	1.33	1.68	1.43	1.44
O5'	0.22	0.31	0.18	0.82	0.16	0.77	0.15	0.97	0.20	0.20	0.29	0.23	0.18	0.16	0.17	0.37	1.02	0.49	1.27	1.69	1.39	1.41
O6	0.28	0.17	0.11	0.63	0.16	0.91	0.15	1.06	0.17	0.18	0.19	0.15	0.19	0.15	0.20	0.38	1.01	0.74	0.92	1.11	0.79	0.90
OP1	0.32	0.24	0.38	0.97	0.08	0.81	0.10	1.00	0.06	0.34	0.20	0.13	0.05	0.25	0.25	0.38	1.21	0.50	1.32	1.84	1.50	1.51
OP2	0.30	0.90	0.25	0.49	0.60	0.51	0.61	0.76	0.75	0.34	0.89	0.76	0.76	0.45	0.41	0.74	0.72	0.27	1.06	1.49	1.12	1.17
P	0.13	0.42	0.10	0.76	0.18	0.70	0.17	0.91	0.28	0.10	0.40	0.31	0.27	0.08	0.09	0.43	0.98	0.41	1.22	1.67	1.34	1.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.22	0.00	0.31	0.50	0.20	0.24
C2	0.05	0.00	0.15	0.09	0.01	0.30	0.00	0.40	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.29	0.34	0.29	0.30	0.10	0.13
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.14	0.09	0.05	0.13	0.15	0.09	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.40	0.77	0.59	0.51
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.21	0.01	0.18	0.32	0.10	0.09	0.24	0.32	0.16	0.01	0.01	0.03	0.04	0.56	0.32	0.22
C4	0.03	0.01	0.10	0.11	0.00	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.16	0.39	0.42	0.17	0.26
C4'	0.01	0.30	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.01	0.07	0.27	0.20	0.30	0.06	0.22	0.06	0.20	0.02	0.01	0.01	0.33	0.21	0.05
C5	0.02	0.00	0.07	0.21	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.05	0.06	0.51	0.50	0.37	0.42
C5'	0.04	0.40	0.14	0.01	0.15	0.01	0.03	0.00	0.09	0.31	0.28	0.39	0.04	0.25	0.04	0.06	0.15	0.02	0.01	0.25	0.20	0.02
C6	0.02	0.00	0.09	0.18	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.13	0.45	0.44	0.36	0.37
C8	0.02	0.02	0.05	0.32	0.01	0.27	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.36	0.15	0.19	0.71	0.69	0.46	0.60
N1	0.04	0.01	0.13	0.10	0.01	0.20	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.19	0.25	0.32	0.30	0.18	0.19
N3	0.05	0.00	0.15	0.09	0.01	0.30	0.01	0.39	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.30	0.35	0.31	0.36	0.15	0.17
N6	0.02	0.01	0.09	0.24	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.15	0.05	0.07	0.55	0.55	0.54	0.51
N7	0.02	0.01	0.02	0.32	0.01	0.22	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.32	0.15	0.12	0.71	0.69	0.57	0.64
N9	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.07	0.01	0.46	0.51	0.20	0.33
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.02	0.20	0.14	0.06	0.08	0.36	0.07	0.20	0.15	0.32	0.13	0.00	0.04	0.14	0.32	0.76	0.69	0.49
O3'	0.22	0.29	0.02	0.01	0.15	0.02	0.05	0.15	0.07	0.15	0.19	0.30	0.05	0.15	0.07	0.04	0.00	0.14	0.15	0.37	0.26	0.03
O4'	0.00	0.34	0.01	0.03	0.16	0.01	0.06	0.02	0.13	0.19	0.25	0.35	0.07	0.12	0.01	0.14	0.14	0.00	0.24	0.36	0.08	0.17
O5'	0.31	0.29	0.40	0.04	0.39	0.01	0.51	0.01	0.45	0.71	0.32	0.31	0.55	0.71	0.46	0.32	0.15	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.50	0.30	0.77	0.56	0.42	0.33	0.50	0.25	0.44	0.69	0.30	0.36	0.55	0.69	0.51	0.76	0.37	0.36	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.10	0.59	0.32	0.17	0.21	0.37	0.20	0.36	0.46	0.18	0.15	0.54	0.57	0.20	0.69	0.26	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.13	0.51	0.22	0.26	0.05	0.42	0.02	0.37	0.60	0.19	0.17	0.51	0.64	0.33	0.49	0.03	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00