Doublet Group distance statistics: 55294

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 10, 19, 20, 18, 11, 11, 10, 5, 2, 2, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.013, 0.024, 0.036, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.033, 0.049, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.021, 0.038, 0.056, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.038 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.041 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.025, 0.052, 0.080, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.052 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.029, 0.057, 0.085, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.057 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.035, 0.067, 0.100, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.067 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.007, 0.146, 0.285, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.146 std_dev=0.139
O4'	A	0, -0.019, 0.121, 0.262, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.121 std_dev=0.140
C2'	B	0, 0.232, 0.417, 0.603, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.417 std_dev=0.186
O2'	B	0, 0.186, 0.394, 0.602, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.394 std_dev=0.208
C3'	A	0, -0.028, 0.188, 0.404, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.188 std_dev=0.216
C3'	B	0, 0.328, 0.548, 0.769, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.548 std_dev=0.220
C1'	B	0, 0.305, 0.528, 0.751, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.528 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.036, 0.263, 0.490, 2.348 max_d=2.348 avg_d=0.263 std_dev=0.227
C4'	A	0, -0.005, 0.224, 0.453, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.224 std_dev=0.229
N1	B	0, 0.384, 0.618, 0.852, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.618 std_dev=0.234
O3'	A	0, 0.032, 0.302, 0.573, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.302 std_dev=0.270
C2	B	0, 0.313, 0.586, 0.859, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.586 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.397, 0.687, 0.977, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.687 std_dev=0.290
O3'	B	0, 0.344, 0.640, 0.935, 1.847 max_d=1.847 avg_d=0.640 std_dev=0.296
O2	B	0, 0.218, 0.516, 0.814, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.516 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.475, 0.773, 1.071, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.773 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.380, 0.678, 0.977, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.678 std_dev=0.298
O5'	B	0, 0.421, 0.722, 1.023, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.722 std_dev=0.301
N3	B	0, 0.335, 0.686, 1.038, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.686 std_dev=0.352
C5'	B	0, 0.497, 0.853, 1.208, 2.583 max_d=2.583 avg_d=0.853 std_dev=0.356
C5'	A	0, 0.010, 0.366, 0.722, 3.504 max_d=3.504 avg_d=0.366 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.506, 0.873, 1.240, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.873 std_dev=0.367
C4	B	0, 0.430, 0.816, 1.202, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.816 std_dev=0.386
P	B	0, 0.514, 0.905, 1.295, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.905 std_dev=0.390
OP1	B	0, 0.612, 1.094, 1.576, 3.131 max_d=3.131 avg_d=1.094 std_dev=0.482
N4	B	0, 0.410, 0.914, 1.418, 2.672 max_d=2.672 avg_d=0.914 std_dev=0.504
O5'	A	0, -0.072, 0.435, 0.942, 3.426 max_d=3.426 avg_d=0.435 std_dev=0.507
OP2	B	0, 0.315, 0.822, 1.329, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.822 std_dev=0.507
P	A	0, 0.036, 0.662, 1.287, 3.748 max_d=3.748 avg_d=0.662 std_dev=0.625
OP2	A	0, -0.004, 0.749, 1.503, 4.603 max_d=4.603 avg_d=0.749 std_dev=0.753
OP1	A	0, -0.032, 0.789, 1.610, 4.980 max_d=4.980 avg_d=0.789 std_dev=0.821

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.04	0.11	0.14	0.09
C2	0.04	0.00	0.11	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.13	0.10	0.16	0.01	0.14	0.32	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.06	0.10	0.13	0.10	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.12	0.08	0.23	0.23	0.17
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.08	0.09	0.06	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.10	0.25	0.18	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.05	0.19	0.02	0.16	0.31	0.19
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.11	0.05	0.11	0.07	0.10	0.04	0.09	0.02	0.00	0.02	0.08	0.11	0.09	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.04	0.27	0.02	0.26	0.43	0.30
C5'	0.02	0.10	0.03	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.19	0.11	0.12	0.08	0.20	0.09	0.06	0.05	0.01	0.01	0.18	0.13	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.06	0.27	0.01	0.28	0.47	0.32
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.09	0.06	0.31	0.02	0.29	0.37	0.30
N1	0.03	0.01	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.11	0.08	0.22	0.01	0.20	0.41	0.25
N2	0.05	0.01	0.13	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.16	0.11	0.14	0.02	0.13	0.29	0.14
N3	0.04	0.01	0.10	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.09	0.14	0.02	0.12	0.26	0.14
N7	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.04	0.34	0.03	0.34	0.49	0.37
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.19	0.03	0.16	0.25	0.17
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.09	0.09	0.10	0.06	0.12	0.11	0.14	0.19	0.14	0.11	0.05	0.00	0.06	0.08	0.07	0.12	0.20	0.24	0.14
O3'	0.06	0.13	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.05	0.08	0.09	0.11	0.16	0.11	0.09	0.04	0.06	0.00	0.04	0.14	0.09	0.27	0.25	0.17
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.08	0.11	0.09	0.04	0.01	0.08	0.04	0.00	0.09	0.07	0.11	0.16	0.13
O5'	0.08	0.16	0.12	0.14	0.19	0.02	0.27	0.01	0.27	0.31	0.22	0.14	0.14	0.34	0.19	0.07	0.14	0.09	0.00	0.32	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.01	0.08	0.10	0.02	0.08	0.02	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.12	0.09	0.07	0.32	0.00	0.34	0.55	0.38
OP1	0.11	0.14	0.23	0.25	0.16	0.11	0.26	0.13	0.28	0.29	0.20	0.13	0.12	0.34	0.16	0.20	0.27	0.11	0.02	0.34	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.32	0.23	0.18	0.31	0.09	0.43	0.13	0.47	0.37	0.41	0.29	0.26	0.49	0.25	0.24	0.25	0.16	0.02	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.17	0.15	0.19	0.03	0.30	0.02	0.32	0.30	0.25	0.14	0.14	0.37	0.17	0.14	0.17	0.13	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.16	0.14	0.16	0.16	0.22	0.16	0.23	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.14	0.20	0.26	0.19	0.21	0.19	0.20
C2	0.17	0.17	0.11	0.12	0.18	0.14	0.17	0.15	0.17	0.16	0.18	0.19	0.17	0.12	0.15	0.19	0.14	0.14	0.18	0.15
C2'	0.25	0.21	0.15	0.16	0.23	0.23	0.24	0.23	0.25	0.23	0.21	0.23	0.20	0.15	0.25	0.32	0.21	0.16	0.18	0.20
C3'	0.27	0.22	0.16	0.19	0.24	0.29	0.27	0.32	0.28	0.25	0.22	0.24	0.20	0.14	0.25	0.37	0.29	0.25	0.26	0.29
C4	0.16	0.15	0.12	0.13	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.17	0.16	0.12	0.17	0.20	0.14	0.14	0.16	0.14
C4'	0.29	0.24	0.22	0.25	0.25	0.36	0.27	0.40	0.28	0.26	0.24	0.25	0.23	0.21	0.27	0.39	0.33	0.35	0.31	0.35
C5	0.17	0.17	0.12	0.13	0.18	0.16	0.18	0.16	0.18	0.17	0.18	0.19	0.17	0.12	0.17	0.21	0.16	0.14	0.18	0.16
C5'	0.29	0.24	0.23	0.28	0.26	0.38	0.28	0.43	0.29	0.26	0.24	0.26	0.23	0.21	0.31	0.39	0.37	0.41	0.35	0.40
C6	0.18	0.18	0.12	0.12	0.20	0.16	0.20	0.17	0.20	0.18	0.20	0.21	0.18	0.12	0.15	0.22	0.16	0.14	0.20	0.17
C8	0.18	0.16	0.13	0.15	0.17	0.18	0.17	0.19	0.17	0.16	0.17	0.17	0.17	0.13	0.20	0.23	0.17	0.16	0.18	0.17
N1	0.18	0.18	0.12	0.12	0.20	0.16	0.20	0.17	0.20	0.18	0.20	0.21	0.18	0.12	0.15	0.22	0.16	0.15	0.20	0.17
N2	0.19	0.19	0.13	0.13	0.20	0.16	0.19	0.16	0.19	0.19	0.20	0.21	0.19	0.14	0.17	0.20	0.16	0.16	0.19	0.16
N3	0.15	0.15	0.11	0.11	0.16	0.13	0.15	0.13	0.15	0.14	0.16	0.17	0.16	0.12	0.15	0.18	0.13	0.13	0.16	0.13
N7	0.18	0.16	0.12	0.14	0.17	0.17	0.18	0.18	0.18	0.17	0.17	0.18	0.17	0.13	0.19	0.22	0.17	0.15	0.18	0.17
N9	0.17	0.16	0.13	0.15	0.16	0.18	0.16	0.18	0.16	0.16	0.16	0.17	0.17	0.13	0.19	0.22	0.16	0.16	0.17	0.17
O2'	0.33	0.29	0.23	0.25	0.30	0.33	0.31	0.32	0.31	0.31	0.29	0.30	0.28	0.22	0.33	0.41	0.28	0.24	0.24	0.27
O3'	0.38	0.34	0.25	0.28	0.38	0.40	0.41	0.43	0.41	0.37	0.34	0.38	0.30	0.22	0.31	0.48	0.41	0.33	0.37	0.41
O4'	0.24	0.21	0.21	0.23	0.22	0.30	0.22	0.32	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.21	0.25	0.32	0.26	0.30	0.26	0.28
O5'	0.23	0.18	0.20	0.26	0.20	0.32	0.23	0.37	0.24	0.21	0.18	0.20	0.17	0.18	0.31	0.33	0.32	0.36	0.32	0.35
O6	0.19	0.19	0.12	0.12	0.22	0.17	0.22	0.18	0.22	0.19	0.21	0.23	0.19	0.12	0.15	0.24	0.18	0.15	0.22	0.19
OP1	0.32	0.25	0.28	0.37	0.29	0.44	0.34	0.51	0.35	0.30	0.26	0.29	0.22	0.25	0.41	0.44	0.47	0.54	0.48	0.52
OP2	0.24	0.19	0.20	0.26	0.20	0.34	0.24	0.41	0.25	0.21	0.19	0.20	0.20	0.19	0.31	0.35	0.36	0.43	0.37	0.41
P	0.23	0.16	0.19	0.27	0.18	0.34	0.22	0.41	0.24	0.20	0.16	0.18	0.16	0.17	0.32	0.35	0.36	0.43	0.36	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.07	0.10	0.05
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.03	0.12	0.16	0.21	0.13
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.08	0.12	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.09	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.12	0.01	0.11	0.02	0.11	0.07	0.12	0.13	0.14	0.02	0.01	0.01	0.05	0.12	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.03	0.15	0.21	0.26	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.07	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.04	0.14	0.18	0.22	0.16
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.13	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.04	0.12	0.13	0.16	0.11
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.12	0.16	0.09
N3	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.14	0.20	0.25	0.16
N4	0.02	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.17	0.03	0.17	0.24	0.30	0.20
O2	0.04	0.01	0.12	0.14	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.17	0.05	0.12	0.17	0.21	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.00	0.05	0.04	0.04	0.12	0.09	0.05
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.14	0.03	0.13	0.04	0.12	0.07	0.16	0.17	0.17	0.05	0.00	0.02	0.08	0.16	0.14	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.07	0.07	0.09	0.06
O5'	0.05	0.12	0.04	0.05	0.15	0.02	0.14	0.01	0.12	0.09	0.14	0.17	0.12	0.04	0.08	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.16	0.11	0.12	0.21	0.07	0.18	0.07	0.13	0.12	0.20	0.24	0.17	0.12	0.16	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.21	0.09	0.10	0.26	0.05	0.22	0.04	0.16	0.16	0.25	0.30	0.21	0.09	0.14	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.13	0.05	0.06	0.18	0.02	0.16	0.02	0.11	0.09	0.16	0.20	0.13	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00