Doublet Group distance statistics: 55295

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 4, 3, 6, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.018, 0.028, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.025, 0.043, 0.061, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.043 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.012, 0.030, 0.049, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.030 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.014, 0.036, 0.057, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.036 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.022, 0.049, 0.076, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.049 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.139, 0.252, 0.366, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.252 std_dev=0.113
O2'	A	0, 0.135, 0.249, 0.362, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.249 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.152, 0.289, 0.426, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.289 std_dev=0.137
C1'	B	0, 0.299, 0.464, 0.629, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.464 std_dev=0.165
C2'	B	0, 0.236, 0.403, 0.571, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.403 std_dev=0.168
O2'	B	0, 0.256, 0.424, 0.593, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.424 std_dev=0.168
N1	B	0, 0.343, 0.513, 0.682, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.513 std_dev=0.169
O4'	B	0, 0.346, 0.525, 0.703, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.525 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.324, 0.510, 0.696, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.510 std_dev=0.186
O3'	B	0, 0.323, 0.525, 0.728, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.525 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.247, 0.455, 0.663, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.455 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.273, 0.482, 0.691, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.482 std_dev=0.209
C4'	B	0, 0.282, 0.493, 0.705, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.493 std_dev=0.212
C3'	B	0, 0.270, 0.483, 0.696, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.483 std_dev=0.213
O2	B	0, 0.333, 0.548, 0.764, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.548 std_dev=0.215
C5'	B	0, 0.324, 0.547, 0.769, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.547 std_dev=0.223
N3	B	0, 0.338, 0.571, 0.804, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.571 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.384, 0.624, 0.864, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.624 std_dev=0.240
C6	B	0, 0.397, 0.648, 0.899, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.648 std_dev=0.251
O5'	B	0, 0.281, 0.540, 0.799, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.540 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.421, 0.690, 0.960, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.690 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.306, 0.586, 0.867, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.586 std_dev=0.281
N4	B	0, 0.390, 0.681, 0.973, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.681 std_dev=0.292
P	B	0, 0.331, 0.673, 1.015, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.673 std_dev=0.342
O5'	A	0, 0.404, 0.749, 1.095, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.749 std_dev=0.345
C5'	A	0, 0.480, 0.827, 1.175, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.827 std_dev=0.348
OP2	B	0, 0.253, 0.766, 1.279, 2.536 max_d=2.536 avg_d=0.766 std_dev=0.513
OP1	B	0, 0.396, 0.929, 1.462, 2.593 max_d=2.593 avg_d=0.929 std_dev=0.533
P	A	0, 0.470, 1.198, 1.926, 3.071 max_d=3.071 avg_d=1.198 std_dev=0.728
OP1	A	0, 1.143, 2.121, 3.098, 3.057 max_d=3.057 avg_d=2.121 std_dev=0.977
OP2	A	0, 0.008, 1.234, 2.461, 5.689 max_d=5.689 avg_d=1.234 std_dev=1.226

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.02	0.17	0.39	0.17
C2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.02	0.05	0.02	0.14	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.09	0.08	0.18	0.02	0.19	0.35	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.07	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.05	0.10	0.30	0.09
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.08	0.08	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.09	0.16	0.25	0.13
C4	0.01	0.02	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.21	0.02	0.18	0.32	0.13
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.41	0.15
C5	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.25	0.02	0.24	0.45	0.20
C5'	0.04	0.14	0.02	0.01	0.13	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.15	0.15	0.11	0.18	0.12	0.04	0.05	0.01	0.01	0.19	0.14	0.18	0.01
C6	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.05	0.25	0.01	0.24	0.48	0.20
C8	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.04	0.28	0.03	0.27	0.45	0.25
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.09	0.07	0.22	0.02	0.21	0.39	0.15
N2	0.06	0.01	0.10	0.08	0.03	0.07	0.03	0.15	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.09	0.10	0.11	0.16	0.03	0.21	0.39	0.18
N3	0.03	0.02	0.08	0.07	0.01	0.04	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.07	0.08	0.07	0.18	0.03	0.19	0.36	0.16
N7	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.29	0.04	0.32	0.60	0.31
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.22	0.02	0.17	0.27	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.07	0.04	0.13	0.52	0.18
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.05	0.09	0.10	0.08	0.07	0.03	0.04	0.00	0.02	0.25	0.10	0.21	0.40	0.19
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.11	0.07	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.19	0.04	0.27	0.52	0.29
O5'	0.15	0.18	0.13	0.19	0.21	0.01	0.25	0.01	0.25	0.28	0.22	0.16	0.18	0.29	0.22	0.07	0.25	0.19	0.00	0.26	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.02	0.07	0.02	0.19	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.10	0.04	0.26	0.00	0.28	0.61	0.26
OP1	0.17	0.19	0.10	0.16	0.18	0.13	0.24	0.14	0.24	0.27	0.21	0.21	0.19	0.32	0.17	0.13	0.21	0.27	0.02	0.28	0.00	0.04	0.01
OP2	0.39	0.35	0.30	0.25	0.32	0.41	0.45	0.18	0.48	0.45	0.39	0.39	0.36	0.60	0.27	0.52	0.40	0.52	0.02	0.61	0.04	0.00	0.03
P	0.17	0.15	0.09	0.13	0.13	0.15	0.20	0.01	0.20	0.25	0.15	0.18	0.16	0.31	0.13	0.18	0.19	0.29	0.01	0.26	0.01	0.03	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.14	0.18	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.15	0.17	0.13	0.24	0.17	0.13	0.26	0.23	0.13
C2	0.10	0.13	0.11	0.13	0.14	0.10	0.13	0.11	0.11	0.11	0.15	0.16	0.14	0.11	0.18	0.10	0.11	0.13	0.13	0.11
C2'	0.08	0.07	0.09	0.11	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.08	0.10	0.16	0.12	0.08	0.29	0.22	0.10
C3'	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.14	0.13	0.08	0.35	0.28	0.10
C4	0.11	0.14	0.12	0.15	0.15	0.10	0.13	0.10	0.12	0.12	0.15	0.16	0.16	0.12	0.21	0.12	0.10	0.17	0.12	0.10
C4'	0.14	0.13	0.15	0.19	0.13	0.16	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.14	0.26	0.17	0.14	0.37	0.33	0.14
C5	0.11	0.15	0.12	0.14	0.16	0.10	0.15	0.11	0.13	0.13	0.17	0.17	0.17	0.12	0.21	0.12	0.10	0.16	0.11	0.11
C5'	0.10	0.11	0.14	0.19	0.10	0.14	0.09	0.14	0.10	0.10	0.11	0.10	0.14	0.13	0.28	0.14	0.13	0.40	0.34	0.14
C6	0.11	0.16	0.12	0.13	0.18	0.11	0.16	0.12	0.14	0.13	0.18	0.19	0.17	0.12	0.20	0.13	0.11	0.14	0.11	0.11
C8	0.12	0.15	0.12	0.15	0.16	0.10	0.14	0.11	0.13	0.13	0.16	0.17	0.17	0.13	0.23	0.13	0.11	0.23	0.19	0.11
N1	0.11	0.15	0.11	0.13	0.16	0.11	0.15	0.11	0.13	0.13	0.17	0.18	0.15	0.11	0.18	0.12	0.11	0.13	0.13	0.11
N2	0.10	0.12	0.11	0.13	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.11	0.15	0.16	0.12	0.12	0.17	0.11	0.11	0.15	0.17	0.12
N3	0.11	0.14	0.13	0.15	0.14	0.10	0.13	0.11	0.12	0.12	0.15	0.15	0.15	0.11	0.20	0.11	0.11	0.14	0.12	0.11
N7	0.12	0.16	0.12	0.14	0.17	0.10	0.15	0.11	0.14	0.13	0.18	0.18	0.18	0.12	0.22	0.13	0.10	0.20	0.14	0.11
N9	0.13	0.15	0.13	0.16	0.15	0.11	0.14	0.11	0.13	0.13	0.16	0.16	0.17	0.13	0.23	0.13	0.11	0.22	0.18	0.11
O2'	0.15	0.13	0.11	0.12	0.13	0.13	0.13	0.12	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.10	0.15	0.19	0.10	0.29	0.25	0.10
O3'	0.14	0.12	0.12	0.10	0.14	0.13	0.15	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.11	0.11	0.11	0.17	0.13	0.41	0.34	0.14
O4'	0.17	0.18	0.18	0.22	0.17	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.18	0.18	0.19	0.17	0.29	0.18	0.16	0.32	0.29	0.15
O5'	0.15	0.16	0.13	0.13	0.15	0.11	0.15	0.12	0.15	0.15	0.16	0.16	0.16	0.14	0.24	0.18	0.10	0.41	0.28	0.13
O6	0.13	0.18	0.12	0.13	0.21	0.12	0.19	0.13	0.16	0.15	0.21	0.22	0.18	0.12	0.19	0.14	0.12	0.15	0.12	0.12
OP1	0.13	0.15	0.23	0.30	0.15	0.16	0.15	0.18	0.15	0.14	0.16	0.15	0.19	0.21	0.46	0.17	0.19	0.23	0.59	0.22
OP2	0.42	0.40	0.59	0.73	0.43	0.56	0.47	0.63	0.47	0.43	0.40	0.43	0.37	0.54	0.91	0.43	0.66	0.56	1.02	0.71
P	0.17	0.21	0.29	0.37	0.22	0.21	0.20	0.23	0.19	0.19	0.22	0.22	0.23	0.28	0.53	0.15	0.25	0.22	0.61	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.03	0.07	0.26	0.29	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.07	0.07	0.09	0.02	0.01	0.02	0.08	0.14	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.10	0.42	0.44	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.13	0.11	0.02
C5	0.03	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.05	0.11	0.43	0.44	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.07	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.20	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.09	0.33	0.33	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.23	0.25	0.08
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.09	0.35	0.38	0.11
N4	0.03	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.48	0.49	0.14
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.04	0.07	0.20	0.24	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.08	0.00	0.04	0.03	0.04	0.12	0.07	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.04	0.08	0.07	0.11	0.04	0.00	0.01	0.12	0.28	0.21	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.09	0.09	0.09
O5'	0.04	0.07	0.05	0.08	0.10	0.02	0.11	0.01	0.09	0.07	0.09	0.10	0.07	0.04	0.12	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.26	0.08	0.14	0.42	0.13	0.43	0.20	0.33	0.23	0.35	0.48	0.20	0.12	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.29	0.07	0.11	0.44	0.11	0.44	0.18	0.33	0.25	0.38	0.49	0.24	0.07	0.21	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.09	0.13	0.02	0.14	0.02	0.11	0.08	0.11	0.14	0.08	0.05	0.15	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00