Doublet Group distance statistics: 55297

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 3, 1, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.013, 0.034, 0.054, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.034 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.010, 0.038, 0.065, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.038 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.001, 0.029, 0.057, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.029 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.020, 0.097, 0.174, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.097 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.039, 0.151, 0.264, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.151 std_dev=0.113
C4'	A	0, 0.041, 0.156, 0.270, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.156 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.054, 0.208, 0.362, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.208 std_dev=0.154
O2'	A	0, 0.070, 0.229, 0.389, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.229 std_dev=0.160
O3'	A	0, 0.079, 0.293, 0.507, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.293 std_dev=0.214
O5'	A	0, 0.117, 0.340, 0.564, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.340 std_dev=0.224
P	A	0, 0.145, 0.391, 0.637, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.391 std_dev=0.246
C5'	A	0, 0.056, 0.314, 0.573, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.314 std_dev=0.258
OP1	A	0, 0.138, 0.417, 0.696, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.417 std_dev=0.279
C5	B	0, 0.206, 0.497, 0.789, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.497 std_dev=0.292
C4	B	0, 0.266, 0.576, 0.887, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.576 std_dev=0.310
N4	B	0, 0.344, 0.659, 0.975, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.659 std_dev=0.316
C6	B	0, 0.145, 0.466, 0.786, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.466 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.174, 0.511, 0.849, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.511 std_dev=0.337
N3	B	0, 0.253, 0.612, 0.970, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.612 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.210, 0.575, 0.940, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.575 std_dev=0.365
C2	B	0, 0.197, 0.571, 0.944, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.571 std_dev=0.374
C2'	B	0, 0.180, 0.561, 0.942, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.561 std_dev=0.381
O2	B	0, 0.231, 0.641, 1.052, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.641 std_dev=0.411
O2'	B	0, 0.179, 0.600, 1.021, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.600 std_dev=0.421
O5'	B	0, 0.250, 0.686, 1.123, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.686 std_dev=0.436
OP2	A	0, 0.094, 0.533, 0.971, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.533 std_dev=0.439
O4'	B	0, 0.213, 0.661, 1.110, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.661 std_dev=0.448
C3'	B	0, 0.182, 0.649, 1.117, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.649 std_dev=0.468
OP1	B	0, 0.360, 0.885, 1.409, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.885 std_dev=0.524
P	B	0, 0.284, 0.811, 1.337, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.811 std_dev=0.527
C4'	B	0, 0.175, 0.704, 1.233, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.704 std_dev=0.529
O3'	B	0, 0.158, 0.688, 1.217, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.688 std_dev=0.530
OP2	B	0, 0.259, 0.868, 1.476, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.868 std_dev=0.608
C5'	B	0, 0.131, 0.831, 1.531, 2.909 max_d=2.909 avg_d=0.831 std_dev=0.700

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.02	0.05	0.37	0.13
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.19	0.01	0.07	0.32	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.09	0.08	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.13	0.08	0.16	0.23	0.02
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.10	0.10	0.12	0.10	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.20	0.10	0.25	0.17	0.12
C4	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.19	0.01	0.07	0.34	0.10
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.28	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.23	0.01	0.10	0.31	0.09
C5'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.09	0.12	0.09	0.09	0.12	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.14	0.14	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.25	0.00	0.11	0.29	0.10
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.23	0.02	0.09	0.36	0.10
N1	0.03	0.00	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.22	0.01	0.09	0.30	0.09
N2	0.04	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.04	0.17	0.01	0.07	0.32	0.09
N3	0.03	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.16	0.01	0.06	0.34	0.10
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.26	0.02	0.11	0.31	0.09
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.17	0.01	0.06	0.36	0.11
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.04	0.07	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.15	0.26	0.06
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.17	0.13	0.34	0.20	0.18
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.02	0.08	0.42	0.19
O5'	0.09	0.19	0.13	0.20	0.19	0.02	0.23	0.01	0.25	0.23	0.22	0.17	0.16	0.26	0.17	0.04	0.17	0.09	0.00	0.27	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.13	0.02	0.27	0.00	0.13	0.26	0.10
OP1	0.05	0.07	0.16	0.25	0.07	0.11	0.10	0.14	0.11	0.09	0.09	0.07	0.06	0.11	0.06	0.15	0.34	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.32	0.23	0.17	0.34	0.28	0.31	0.25	0.29	0.36	0.30	0.32	0.34	0.31	0.36	0.26	0.20	0.42	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.10	0.02	0.12	0.10	0.06	0.09	0.01	0.10	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.06	0.18	0.19	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.10	0.08	0.17	0.09	0.08	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.10	0.15	0.10	0.35	0.11	0.08	0.26	0.18	0.12
C2	0.13	0.09	0.18	0.24	0.13	0.15	0.15	0.18	0.14	0.11	0.10	0.14	0.14	0.15	0.34	0.15	0.12	0.22	0.25	0.15
C2'	0.14	0.15	0.06	0.11	0.11	0.12	0.10	0.15	0.10	0.12	0.14	0.11	0.19	0.07	0.28	0.17	0.12	0.29	0.27	0.17
C3'	0.15	0.17	0.05	0.13	0.13	0.15	0.11	0.20	0.12	0.14	0.17	0.13	0.22	0.07	0.31	0.19	0.13	0.32	0.25	0.17
C4	0.11	0.08	0.12	0.19	0.09	0.11	0.11	0.13	0.10	0.08	0.08	0.10	0.14	0.10	0.35	0.14	0.09	0.24	0.23	0.13
C4'	0.11	0.11	0.10	0.21	0.09	0.15	0.10	0.22	0.10	0.09	0.10	0.09	0.16	0.09	0.39	0.12	0.09	0.34	0.16	0.16
C5	0.11	0.08	0.13	0.20	0.09	0.12	0.11	0.14	0.11	0.09	0.08	0.11	0.13	0.11	0.35	0.14	0.09	0.25	0.24	0.14
C5'	0.12	0.12	0.10	0.23	0.08	0.16	0.10	0.25	0.10	0.09	0.10	0.08	0.18	0.10	0.42	0.13	0.12	0.38	0.15	0.19
C6	0.12	0.09	0.16	0.23	0.12	0.13	0.14	0.16	0.13	0.10	0.10	0.14	0.12	0.12	0.36	0.14	0.11	0.23	0.25	0.15
C8	0.11	0.08	0.08	0.17	0.07	0.09	0.09	0.11	0.09	0.08	0.07	0.08	0.14	0.09	0.34	0.12	0.08	0.26	0.22	0.13
N1	0.12	0.10	0.18	0.24	0.14	0.15	0.15	0.18	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.14	0.35	0.15	0.12	0.22	0.26	0.15
N2	0.13	0.10	0.21	0.25	0.16	0.17	0.17	0.20	0.16	0.12	0.12	0.17	0.15	0.17	0.32	0.15	0.14	0.21	0.26	0.16
N3	0.12	0.08	0.15	0.21	0.10	0.13	0.12	0.15	0.11	0.09	0.08	0.11	0.15	0.13	0.34	0.15	0.10	0.23	0.23	0.14
N7	0.10	0.08	0.10	0.19	0.08	0.10	0.10	0.12	0.10	0.08	0.07	0.09	0.13	0.09	0.35	0.13	0.09	0.26	0.24	0.14
N9	0.11	0.09	0.08	0.17	0.07	0.09	0.09	0.11	0.09	0.08	0.07	0.09	0.15	0.09	0.34	0.13	0.08	0.26	0.21	0.13
O2'	0.13	0.16	0.07	0.15	0.13	0.14	0.11	0.18	0.11	0.13	0.15	0.13	0.19	0.07	0.27	0.14	0.14	0.32	0.27	0.18
O3'	0.16	0.21	0.07	0.16	0.19	0.21	0.17	0.29	0.16	0.17	0.22	0.19	0.25	0.08	0.30	0.21	0.20	0.36	0.28	0.22
O4'	0.12	0.11	0.12	0.22	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13	0.11	0.10	0.14	0.15	0.13	0.40	0.11	0.12	0.30	0.14	0.14
O5'	0.13	0.14	0.08	0.14	0.12	0.08	0.12	0.11	0.11	0.12	0.14	0.13	0.18	0.10	0.31	0.14	0.09	0.22	0.20	0.11
O6	0.12	0.10	0.16	0.23	0.14	0.14	0.15	0.17	0.13	0.11	0.11	0.16	0.11	0.13	0.36	0.14	0.11	0.23	0.26	0.15
OP1	0.15	0.13	0.10	0.19	0.11	0.17	0.13	0.23	0.14	0.13	0.12	0.11	0.17	0.11	0.34	0.17	0.13	0.35	0.17	0.19
OP2	0.37	0.36	0.37	0.39	0.34	0.34	0.34	0.32	0.35	0.36	0.35	0.33	0.39	0.37	0.48	0.38	0.36	0.27	0.47	0.32
P	0.16	0.14	0.12	0.16	0.10	0.12	0.10	0.12	0.12	0.13	0.12	0.09	0.19	0.14	0.32	0.18	0.16	0.21	0.26	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.14	0.18	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.02	0.20	0.20	0.22	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.06	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.03	0.01	0.16	0.27	0.23	0.17
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.03	0.11	0.07	0.11	0.11	0.13	0.02	0.01	0.01	0.23	0.34	0.28	0.25
C4	0.02	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.26	0.21	0.22	0.20
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.15	0.20	0.06
C5	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.04	0.26	0.20	0.20	0.19
C5'	0.03	0.11	0.03	0.03	0.15	0.01	0.16	0.00	0.14	0.10	0.13	0.16	0.09	0.07	0.05	0.01	0.01	0.10	0.23	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.04	0.23	0.17	0.18	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.18	0.17	0.19	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.11	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.23	0.22	0.23	0.18
N4	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.27	0.23	0.24	0.22
O2	0.03	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.14	0.04	0.17	0.21	0.23	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.07	0.06	0.10	0.29	0.25	0.17
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.14	0.01	0.16	0.05	0.14	0.06	0.12	0.16	0.14	0.07	0.00	0.01	0.25	0.50	0.46	0.39
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.10	0.08	0.23	0.11
O5'	0.09	0.20	0.16	0.23	0.26	0.03	0.26	0.01	0.23	0.18	0.23	0.27	0.17	0.10	0.25	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.20	0.27	0.34	0.21	0.15	0.20	0.10	0.17	0.17	0.22	0.23	0.21	0.29	0.50	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.22	0.23	0.28	0.22	0.20	0.20	0.23	0.18	0.19	0.23	0.24	0.23	0.25	0.46	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.17	0.25	0.20	0.06	0.19	0.01	0.15	0.13	0.18	0.22	0.15	0.17	0.39	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00