Doublet Group distance statistics: 55305

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 6, 0, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.017, 0.027, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.025, 0.044, 0.062, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.044 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.014, 0.033, 0.051, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.021, 0.042, 0.063, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.042 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.006, 0.027, 0.048, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.029, 0.051, 0.073, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.051 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.015, 0.041, 0.068, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.041 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.008, 0.035, 0.061, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.011, 0.067, 0.123, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.067 std_dev=0.056
O3'	A	0, 0.068, 0.356, 0.644, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.356 std_dev=0.288
C4	B	0, 0.107, 0.432, 0.756, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.432 std_dev=0.325
N1	B	0, 0.148, 0.489, 0.830, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.489 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.058, 0.405, 0.752, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.405 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.141, 0.495, 0.848, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.495 std_dev=0.354
C2	B	0, 0.079, 0.435, 0.792, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.435 std_dev=0.356
C6	B	0, 0.159, 0.520, 0.882, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.520 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.085, 0.466, 0.847, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.466 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.192, 0.616, 1.039, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.616 std_dev=0.424
N7	B	0, 0.153, 0.585, 1.017, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.585 std_dev=0.432
C8	B	0, 0.124, 0.563, 1.003, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.563 std_dev=0.439
N2	B	0, 0.032, 0.480, 0.927, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.480 std_dev=0.448
C1'	B	0, 0.009, 0.463, 0.917, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.463 std_dev=0.454
C2'	B	0, 0.024, 0.486, 0.947, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.486 std_dev=0.461
C3'	A	0, -0.146, 0.332, 0.810, 2.289 max_d=2.289 avg_d=0.332 std_dev=0.478
O4'	A	0, -0.236, 0.259, 0.755, 2.311 max_d=2.311 avg_d=0.259 std_dev=0.496
C2'	A	0, -0.227, 0.284, 0.795, 2.389 max_d=2.389 avg_d=0.284 std_dev=0.511
C3'	B	0, 0.070, 0.610, 1.149, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.610 std_dev=0.540
O2'	B	0, 0.011, 0.560, 1.109, 2.595 max_d=2.595 avg_d=0.560 std_dev=0.549
O4'	B	0, -0.009, 0.558, 1.126, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.558 std_dev=0.568
C4'	A	0, -0.241, 0.352, 0.944, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.352 std_dev=0.593
O3'	B	0, 0.143, 0.745, 1.347, 2.562 max_d=2.562 avg_d=0.745 std_dev=0.602
C4'	B	0, 0.030, 0.643, 1.256, 2.557 max_d=2.557 avg_d=0.643 std_dev=0.613
C5'	B	0, 0.138, 0.804, 1.470, 2.631 max_d=2.631 avg_d=0.804 std_dev=0.666
O5'	B	0, 0.207, 0.913, 1.619, 2.795 max_d=2.795 avg_d=0.913 std_dev=0.706
O2'	A	0, -0.322, 0.531, 1.384, 4.044 max_d=4.044 avg_d=0.531 std_dev=0.853
OP1	A	0, 0.464, 1.419, 2.373, 4.355 max_d=4.355 avg_d=1.419 std_dev=0.955
O5'	A	0, -0.442, 0.592, 1.625, 4.821 max_d=4.821 avg_d=0.592 std_dev=1.033
C5'	A	0, -0.520, 0.602, 1.725, 5.231 max_d=5.231 avg_d=0.602 std_dev=1.123
P	B	0, 0.057, 1.203, 2.349, 4.598 max_d=4.598 avg_d=1.203 std_dev=1.146
OP2	B	0, 0.097, 1.285, 2.472, 5.178 max_d=5.178 avg_d=1.285 std_dev=1.187
P	A	0, -0.433, 0.826, 2.086, 5.997 max_d=5.997 avg_d=0.826 std_dev=1.259
OP1	B	0, 0.033, 1.346, 2.658, 5.076 max_d=5.076 avg_d=1.346 std_dev=1.313
OP2	A	0, 0.137, 1.753, 3.369, 7.665 max_d=7.665 avg_d=1.753 std_dev=1.616

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.10	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.19	0.04	0.36	0.22	0.09
C2	0.07	0.00	0.27	0.25	0.01	0.16	0.01	0.31	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.25	0.12	0.09	0.09	0.02	0.64	0.21	0.36
C2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.15	0.01	0.06	0.06	0.11	0.15	0.20	0.32	0.29	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.35	0.08	0.56	0.51	0.34
C3'	0.01	0.25	0.01	0.00	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.15	0.18	0.31	0.25	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.06	0.71	0.36	0.35
C4	0.03	0.01	0.15	0.12	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.14	0.06	0.04	0.15	0.02	0.51	0.23	0.18
C4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.14	0.11	0.20	0.16	0.11	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.42	0.08	0.11
C5	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.04	0.27	0.02	0.53	0.34	0.20
C5'	0.04	0.31	0.06	0.01	0.13	0.01	0.11	0.00	0.13	0.30	0.23	0.40	0.29	0.25	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.13	0.30	0.22	0.02
C6	0.04	0.01	0.11	0.09	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.14	0.06	0.05	0.21	0.01	0.62	0.31	0.26
C8	0.02	0.02	0.15	0.15	0.01	0.14	0.01	0.30	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.07	0.08	0.50	0.03	0.34	0.53	0.30
N1	0.05	0.01	0.20	0.18	0.02	0.11	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.20	0.10	0.07	0.10	0.02	0.66	0.23	0.32
N2	0.10	0.01	0.32	0.31	0.03	0.20	0.02	0.40	0.03	0.04	0.03	0.00	0.03	0.02	0.05	0.29	0.15	0.13	0.15	0.05	0.69	0.25	0.44
N3	0.07	0.01	0.29	0.25	0.01	0.16	0.01	0.29	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.25	0.12	0.09	0.08	0.02	0.59	0.17	0.30
N7	0.01	0.02	0.10	0.11	0.01	0.11	0.01	0.25	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.06	0.45	0.03	0.48	0.53	0.30
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.27	0.03	0.36	0.30	0.10
O2'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.14	0.01	0.10	0.05	0.14	0.11	0.20	0.29	0.25	0.09	0.04	0.00	0.03	0.02	0.37	0.12	0.70	0.63	0.41
O3'	0.03	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.07	0.10	0.15	0.12	0.06	0.03	0.03	0.00	0.04	0.12	0.06	0.77	0.28	0.33
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.07	0.13	0.09	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.06	0.45	0.11	0.18
O5'	0.19	0.09	0.35	0.22	0.15	0.01	0.27	0.01	0.21	0.50	0.10	0.15	0.08	0.45	0.27	0.37	0.12	0.06	0.00	0.27	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.08	0.06	0.02	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.12	0.06	0.06	0.27	0.00	0.66	0.37	0.27
OP1	0.36	0.64	0.56	0.71	0.51	0.42	0.53	0.30	0.62	0.34	0.66	0.69	0.59	0.48	0.36	0.70	0.77	0.45	0.02	0.66	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.21	0.51	0.36	0.23	0.08	0.34	0.22	0.31	0.53	0.23	0.25	0.17	0.53	0.30	0.63	0.28	0.11	0.02	0.37	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.36	0.34	0.35	0.18	0.11	0.20	0.02	0.26	0.30	0.32	0.44	0.30	0.30	0.10	0.41	0.33	0.18	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.22	0.28	0.20	0.13	0.14	0.14	0.18	0.12	0.25	0.15	0.32	0.21	0.24	0.14	0.47	0.29	0.18	0.50	0.14	0.78	0.82	0.81
C2	0.28	0.17	0.18	0.19	0.20	0.25	0.22	0.27	0.17	0.32	0.15	0.26	0.16	0.28	0.27	0.17	0.19	0.34	0.37	0.18	0.55	0.41	0.51
C2'	0.36	0.24	0.25	0.32	0.36	0.39	0.45	0.48	0.41	0.57	0.31	0.19	0.24	0.55	0.44	0.23	0.24	0.48	0.84	0.45	0.99	1.05	1.05
C3'	0.30	0.30	0.15	0.21	0.43	0.25	0.56	0.39	0.54	0.66	0.41	0.21	0.28	0.69	0.47	0.23	0.17	0.39	0.88	0.61	0.97	1.25	1.14
C4	0.20	0.18	0.19	0.17	0.14	0.21	0.17	0.26	0.13	0.30	0.13	0.30	0.16	0.27	0.21	0.29	0.20	0.30	0.47	0.15	0.71	0.64	0.70
C4'	0.19	0.21	0.17	0.18	0.35	0.16	0.51	0.21	0.50	0.60	0.35	0.11	0.18	0.65	0.38	0.43	0.38	0.27	0.66	0.60	0.78	1.17	0.99
C5	0.21	0.18	0.18	0.19	0.15	0.23	0.18	0.27	0.14	0.29	0.14	0.30	0.15	0.26	0.22	0.23	0.21	0.30	0.47	0.15	0.75	0.64	0.71
C5'	0.40	0.53	0.16	0.16	0.68	0.19	0.89	0.31	0.90	0.94	0.72	0.38	0.47	1.04	0.69	0.31	0.28	0.44	0.81	1.03	0.82	1.33	1.08
C6	0.25	0.19	0.19	0.21	0.18	0.25	0.20	0.28	0.17	0.30	0.17	0.29	0.16	0.27	0.24	0.20	0.23	0.32	0.44	0.18	0.69	0.55	0.64
C8	0.15	0.20	0.21	0.18	0.12	0.18	0.15	0.24	0.11	0.27	0.13	0.32	0.17	0.24	0.17	0.33	0.23	0.23	0.51	0.13	0.84	0.81	0.82
N1	0.28	0.19	0.20	0.22	0.21	0.26	0.22	0.28	0.19	0.31	0.18	0.28	0.17	0.28	0.27	0.20	0.22	0.34	0.39	0.19	0.60	0.45	0.55
N2	0.31	0.19	0.20	0.20	0.25	0.24	0.24	0.26	0.20	0.31	0.18	0.24	0.21	0.28	0.30	0.17	0.20	0.33	0.29	0.20	0.43	0.30	0.38
N3	0.23	0.17	0.18	0.17	0.16	0.21	0.19	0.26	0.15	0.31	0.13	0.27	0.15	0.28	0.24	0.26	0.19	0.33	0.42	0.16	0.60	0.50	0.58
N7	0.18	0.19	0.19	0.18	0.13	0.21	0.16	0.26	0.12	0.28	0.14	0.31	0.16	0.25	0.19	0.26	0.22	0.27	0.50	0.14	0.82	0.75	0.78
N9	0.15	0.20	0.22	0.17	0.12	0.17	0.15	0.23	0.12	0.27	0.13	0.31	0.18	0.25	0.17	0.37	0.23	0.24	0.50	0.14	0.78	0.76	0.78
O2'	0.30	0.30	0.33	0.47	0.28	0.54	0.31	0.61	0.30	0.38	0.30	0.33	0.27	0.35	0.31	0.31	0.48	0.42	0.81	0.31	1.07	0.90	0.99
O3'	0.15	0.23	0.18	0.15	0.22	0.15	0.29	0.23	0.29	0.34	0.25	0.26	0.22	0.37	0.22	0.37	0.25	0.16	0.65	0.34	0.95	1.14	1.06
O4'	0.14	0.10	0.35	0.34	0.14	0.24	0.26	0.19	0.23	0.36	0.12	0.20	0.12	0.39	0.19	0.59	0.53	0.19	0.48	0.31	0.69	0.92	0.82
O5'	0.19	0.28	0.17	0.16	0.43	0.14	0.65	0.20	0.66	0.71	0.47	0.15	0.22	0.82	0.45	0.46	0.36	0.24	0.67	0.81	0.78	1.26	0.99
O6	0.26	0.20	0.21	0.23	0.20	0.27	0.21	0.29	0.19	0.30	0.19	0.29	0.17	0.27	0.25	0.22	0.25	0.33	0.44	0.20	0.71	0.55	0.65
OP1	0.66	0.64	0.51	0.56	0.77	0.63	0.92	0.75	0.92	0.98	0.78	0.52	0.62	1.03	0.81	0.43	0.48	0.71	0.92	1.01	1.13	1.35	1.23
OP2	0.34	0.49	0.21	0.17	0.58	0.20	0.81	0.25	0.85	0.81	0.68	0.40	0.42	0.95	0.57	0.45	0.36	0.36	0.65	1.01	0.76	1.24	0.97
P	0.40	0.53	0.20	0.20	0.65	0.25	0.86	0.34	0.89	0.86	0.72	0.39	0.46	0.98	0.64	0.30	0.24	0.40	0.72	1.02	0.81	1.24	1.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.14	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.17	0.03	0.11	0.02	0.18	0.37	0.17
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.14	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.18	0.25	0.10
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.08	0.11	0.16	0.12	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.23	0.28	0.16
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.12	0.01	0.17	0.34	0.17
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.05	0.16	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.16	0.01	0.22	0.42	0.24
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.07	0.08	0.07	0.09	0.05	0.07	0.04	0.02	0.01	0.09	0.10	0.04	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.10	0.02	0.15	0.01	0.25	0.46	0.27
C8	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.19	0.02	0.20	0.33	0.21
N1	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.13	0.02	0.21	0.43	0.22
N2	0.04	0.01	0.14	0.16	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.12	0.21	0.04	0.10	0.03	0.17	0.36	0.15
N3	0.02	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.15	0.03	0.10	0.02	0.16	0.31	0.14
N7	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.08	0.03	0.20	0.02	0.26	0.43	0.27
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.13	0.02	0.14	0.27	0.13
O2'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.04	0.09	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.03	0.06	0.05	0.07	0.22	0.15	0.06
O3'	0.02	0.17	0.01	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.10	0.09	0.15	0.21	0.15	0.08	0.04	0.03	0.00	0.02	0.20	0.10	0.30	0.30	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.03	0.17	0.13	0.14
O5'	0.07	0.11	0.10	0.17	0.12	0.02	0.16	0.01	0.15	0.19	0.13	0.10	0.10	0.20	0.13	0.05	0.20	0.12	0.00	0.17	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.10	0.03	0.17	0.00	0.29	0.51	0.31
OP1	0.14	0.18	0.18	0.23	0.17	0.16	0.22	0.10	0.25	0.20	0.21	0.17	0.16	0.26	0.14	0.22	0.30	0.17	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.37	0.25	0.28	0.34	0.08	0.42	0.04	0.46	0.33	0.43	0.36	0.31	0.43	0.27	0.15	0.30	0.13	0.03	0.51	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.17	0.10	0.16	0.17	0.05	0.24	0.03	0.27	0.21	0.22	0.15	0.14	0.27	0.13	0.06	0.19	0.14	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00