Doublet Group distance statistics: 55315

back

Distances from reference structure (by RMSD)

6, 8, 7, 1, 8, 6, 5, 5, 9, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.002, 0.014, 0.030, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C5	A	0, -0.002, 0.016, 0.035, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.016 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.018 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.001, 0.020, 0.040, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.020 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.003, 0.028, 0.053, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.028 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.005, 0.033, 0.060, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.033 std_dev=0.027
N6	A	0, -0.003, 0.033, 0.069, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.033 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.024, 0.149, 0.274, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.149 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.039, 0.171, 0.303, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.171 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.047, 0.217, 0.387, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.217 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.080, 0.298, 0.516, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.298 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.072, 0.317, 0.561, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.317 std_dev=0.244
C6	B	0, 0.138, 0.393, 0.647, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.393 std_dev=0.254
C4	B	0, 0.163, 0.431, 0.699, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.431 std_dev=0.268
N6	B	0, 0.122, 0.390, 0.659, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.390 std_dev=0.269
C5	B	0, 0.143, 0.413, 0.682, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.413 std_dev=0.269
N3	B	0, 0.174, 0.455, 0.736, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.455 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.156, 0.449, 0.742, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.449 std_dev=0.293
O3'	A	0, 0.122, 0.421, 0.721, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.421 std_dev=0.300
C2	B	0, 0.166, 0.476, 0.786, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.476 std_dev=0.310
N9	B	0, 0.188, 0.502, 0.817, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.502 std_dev=0.315
N7	B	0, 0.165, 0.497, 0.829, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.497 std_dev=0.332
C1'	B	0, 0.210, 0.555, 0.899, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.555 std_dev=0.344
C8	B	0, 0.184, 0.552, 0.921, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.552 std_dev=0.369
C5'	A	0, 0.112, 0.536, 0.961, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.536 std_dev=0.424
C2'	B	0, 0.164, 0.597, 1.030, 2.505 max_d=2.505 avg_d=0.597 std_dev=0.433
O4'	B	0, 0.213, 0.656, 1.099, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.656 std_dev=0.443
O5'	A	0, 0.085, 0.554, 1.022, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.554 std_dev=0.468
O2'	B	0, 0.145, 0.655, 1.165, 3.042 max_d=3.042 avg_d=0.655 std_dev=0.510
C3'	B	0, 0.175, 0.686, 1.197, 3.088 max_d=3.088 avg_d=0.686 std_dev=0.511
C4'	B	0, 0.206, 0.735, 1.264, 3.071 max_d=3.071 avg_d=0.735 std_dev=0.529
O3'	B	0, 0.217, 0.772, 1.326, 3.042 max_d=3.042 avg_d=0.772 std_dev=0.554
C5'	B	0, 0.128, 0.853, 1.578, 4.854 max_d=4.854 avg_d=0.853 std_dev=0.725
OP1	A	0, 0.124, 0.852, 1.580, 3.123 max_d=3.123 avg_d=0.852 std_dev=0.728
P	A	0, 0.005, 0.866, 1.726, 3.239 max_d=3.239 avg_d=0.866 std_dev=0.861
O5'	B	0, 0.058, 0.981, 1.904, 5.752 max_d=5.752 avg_d=0.981 std_dev=0.923
P	B	0, 0.035, 1.104, 2.172, 6.907 max_d=6.907 avg_d=1.104 std_dev=1.069
OP1	B	0, 0.004, 1.282, 2.560, 8.633 max_d=8.633 avg_d=1.282 std_dev=1.278
OP2	B	0, -0.085, 1.216, 2.518, 8.789 max_d=8.789 avg_d=1.216 std_dev=1.302
OP2	A	0, -0.190, 1.179, 2.548, 4.581 max_d=4.581 avg_d=1.179 std_dev=1.369

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.14	0.26	0.13
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.02	0.08	0.02	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.19	0.04	0.26	0.33	0.39	0.31
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.06	0.10	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.16	0.50	0.20
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.02	0.14	0.13	0.16	0.15	0.16	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.14	0.21	0.63	0.27
C4	0.02	0.02	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.23	0.29	0.32	0.24
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.13	0.16	0.10	0.07	0.16	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.39	0.10
C5	0.01	0.02	0.04	0.13	0.00	0.13	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.32	0.38	0.36	0.29
C5'	0.04	0.16	0.02	0.02	0.17	0.01	0.25	0.00	0.26	0.27	0.21	0.13	0.31	0.30	0.15	0.04	0.05	0.01	0.01	0.16	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.13	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.16	0.04	0.35	0.43	0.40	0.35
C8	0.03	0.02	0.06	0.13	0.01	0.16	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.07	0.28	0.31	0.37	0.20
N1	0.03	0.00	0.10	0.16	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.18	0.04	0.32	0.39	0.40	0.35
N3	0.04	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.17	0.04	0.20	0.27	0.36	0.26
N6	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.16	0.01	0.31	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.17	0.06	0.41	0.50	0.45	0.41
N7	0.02	0.02	0.04	0.14	0.01	0.17	0.01	0.30	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.15	0.07	0.35	0.41	0.44	0.27
N9	0.00	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.18	0.23	0.27	0.17
O2'	0.01	0.17	0.01	0.02	0.09	0.04	0.06	0.04	0.10	0.04	0.15	0.16	0.08	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.05	0.17	0.58	0.20
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.05	0.16	0.14	0.18	0.17	0.17	0.15	0.07	0.04	0.00	0.02	0.15	0.33	0.94	0.41
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.04	0.06	0.07	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.15	0.26	0.21
O5'	0.06	0.26	0.10	0.14	0.23	0.02	0.32	0.01	0.35	0.28	0.32	0.20	0.41	0.35	0.18	0.05	0.15	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.33	0.16	0.21	0.29	0.13	0.38	0.16	0.43	0.31	0.39	0.27	0.50	0.41	0.23	0.17	0.33	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.39	0.50	0.63	0.32	0.39	0.36	0.30	0.40	0.37	0.40	0.36	0.45	0.44	0.27	0.58	0.94	0.26	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.31	0.20	0.27	0.24	0.10	0.29	0.02	0.35	0.20	0.35	0.26	0.41	0.27	0.17	0.20	0.41	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.19	0.23	0.28	0.13	0.17	0.12	0.21	0.14	0.11	0.18	0.16	0.19	0.12	0.12	0.21	0.27	0.12	0.42	0.44	0.70	0.43
C2	0.14	0.19	0.17	0.22	0.14	0.18	0.13	0.24	0.14	0.16	0.19	0.16	0.13	0.16	0.14	0.23	0.22	0.15	0.44	0.55	0.85	0.51
C2'	0.14	0.14	0.24	0.27	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.13	0.11	0.14	0.19	0.15	0.12	0.23	0.26	0.12	0.39	0.44	0.62	0.38
C3'	0.18	0.17	0.28	0.28	0.14	0.17	0.14	0.17	0.14	0.14	0.13	0.18	0.20	0.15	0.15	0.29	0.28	0.16	0.38	0.41	0.57	0.35
C4	0.12	0.17	0.18	0.26	0.12	0.17	0.12	0.24	0.12	0.13	0.15	0.15	0.14	0.14	0.12	0.20	0.25	0.13	0.45	0.52	0.81	0.50
C4'	0.25	0.21	0.36	0.36	0.19	0.25	0.14	0.23	0.12	0.16	0.14	0.23	0.16	0.13	0.20	0.38	0.37	0.22	0.42	0.39	0.60	0.38
C5	0.13	0.17	0.18	0.27	0.12	0.19	0.12	0.25	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.14	0.12	0.20	0.27	0.13	0.48	0.55	0.85	0.54
C5'	0.30	0.23	0.42	0.42	0.21	0.31	0.14	0.28	0.13	0.18	0.15	0.27	0.18	0.13	0.23	0.47	0.45	0.27	0.44	0.39	0.61	0.39
C6	0.14	0.17	0.17	0.25	0.13	0.19	0.13	0.26	0.13	0.15	0.16	0.15	0.12	0.15	0.13	0.22	0.26	0.14	0.49	0.58	0.89	0.55
C8	0.13	0.18	0.22	0.30	0.13	0.19	0.12	0.25	0.14	0.12	0.17	0.16	0.18	0.13	0.12	0.20	0.30	0.13	0.47	0.52	0.80	0.51
N1	0.14	0.18	0.17	0.23	0.14	0.18	0.14	0.25	0.14	0.16	0.18	0.16	0.13	0.16	0.14	0.24	0.23	0.15	0.47	0.57	0.88	0.54
N3	0.13	0.17	0.17	0.23	0.12	0.17	0.12	0.23	0.12	0.14	0.16	0.15	0.12	0.15	0.12	0.21	0.23	0.13	0.43	0.51	0.81	0.48
N6	0.14	0.17	0.18	0.26	0.14	0.20	0.13	0.27	0.13	0.16	0.16	0.15	0.12	0.16	0.14	0.23	0.27	0.15	0.51	0.60	0.92	0.58
N7	0.13	0.18	0.20	0.29	0.13	0.19	0.12	0.26	0.13	0.13	0.16	0.16	0.15	0.13	0.12	0.20	0.29	0.13	0.49	0.55	0.85	0.54
N9	0.13	0.18	0.21	0.28	0.13	0.18	0.12	0.23	0.14	0.12	0.17	0.16	0.18	0.13	0.12	0.20	0.27	0.13	0.45	0.49	0.77	0.48
O2'	0.16	0.16	0.27	0.27	0.14	0.16	0.15	0.17	0.15	0.15	0.14	0.16	0.19	0.16	0.15	0.26	0.27	0.15	0.39	0.42	0.53	0.34
O3'	0.25	0.24	0.32	0.29	0.21	0.23	0.20	0.22	0.19	0.21	0.20	0.25	0.23	0.21	0.22	0.35	0.30	0.25	0.39	0.43	0.48	0.32
O4'	0.18	0.21	0.28	0.32	0.16	0.21	0.14	0.24	0.16	0.14	0.20	0.19	0.20	0.13	0.15	0.27	0.32	0.17	0.43	0.41	0.68	0.42
O5'	0.23	0.19	0.36	0.36	0.15	0.24	0.11	0.21	0.13	0.12	0.13	0.21	0.21	0.11	0.16	0.40	0.39	0.19	0.42	0.40	0.65	0.39
OP1	0.23	0.17	0.40	0.43	0.15	0.29	0.13	0.28	0.16	0.13	0.15	0.20	0.24	0.14	0.16	0.45	0.50	0.21	0.46	0.44	0.55	0.41
OP2	0.49	0.52	0.48	0.48	0.47	0.44	0.45	0.44	0.46	0.43	0.49	0.52	0.47	0.43	0.46	0.49	0.48	0.48	0.40	0.42	0.71	0.45
P	0.22	0.20	0.38	0.42	0.16	0.27	0.16	0.27	0.20	0.15	0.19	0.20	0.28	0.17	0.17	0.40	0.48	0.19	0.46	0.46	0.64	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.19	0.26	0.09
C2	0.03	0.00	0.20	0.22	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.23	0.07	0.29	0.35	0.47	0.27
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.03	0.10	0.09	0.16	0.20	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.22	0.17	0.14
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.01	0.15	0.02	0.17	0.13	0.20	0.20	0.17	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.25	0.29	0.14	0.18
C4	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.30	0.33	0.46	0.25
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.08	0.09	0.09	0.11	0.05	0.10	0.02	0.00	0.02	0.12	0.24	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.02	0.39	0.41	0.61	0.36
C5'	0.02	0.12	0.03	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.20	0.13	0.10	0.18	0.20	0.10	0.08	0.05	0.01	0.01	0.15	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.40	0.43	0.65	0.38
C8	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.12	0.07	0.41	0.37	0.55	0.33
N1	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.20	0.05	0.35	0.40	0.57	0.33
N3	0.03	0.00	0.20	0.20	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.20	0.07	0.25	0.31	0.39	0.22
N6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.16	0.03	0.44	0.48	0.76	0.44
N7	0.01	0.02	0.05	0.14	0.01	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.13	0.04	0.45	0.44	0.69	0.41
N9	0.00	0.02	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.28	0.29	0.40	0.21
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.10	0.11	0.08	0.11	0.16	0.13	0.16	0.12	0.16	0.07	0.00	0.04	0.08	0.07	0.17	0.18	0.08
O3'	0.06	0.23	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.15	0.12	0.20	0.20	0.16	0.13	0.05	0.04	0.00	0.03	0.23	0.42	0.19	0.21
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.05	0.07	0.03	0.04	0.01	0.08	0.03	0.00	0.08	0.19	0.32	0.15
O5'	0.11	0.29	0.18	0.25	0.30	0.02	0.39	0.01	0.40	0.41	0.35	0.25	0.44	0.45	0.28	0.07	0.23	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.19	0.35	0.22	0.29	0.33	0.12	0.41	0.15	0.43	0.37	0.40	0.31	0.48	0.44	0.29	0.17	0.42	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.47	0.17	0.14	0.46	0.24	0.61	0.30	0.65	0.55	0.57	0.39	0.76	0.69	0.40	0.18	0.19	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.27	0.14	0.18	0.25	0.05	0.36	0.02	0.38	0.33	0.33	0.22	0.44	0.41	0.21	0.08	0.21	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00