Doublet Group distance statistics: 55323

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.001, 0.027, 0.054, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.041 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.001, 0.036, 0.070, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.036 std_dev=0.035
O4'	A	0, -0.018, 0.109, 0.236, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.109 std_dev=0.127
C2'	A	0, 0.007, 0.179, 0.350, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.179 std_dev=0.172
C4'	A	0, -0.002, 0.181, 0.363, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.181 std_dev=0.182
C4	B	0, 0.001, 0.203, 0.404, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.203 std_dev=0.201
N9	B	0, 0.007, 0.220, 0.433, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.220 std_dev=0.213
C5	B	0, -0.006, 0.214, 0.435, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.214 std_dev=0.221
C8	B	0, 0.014, 0.238, 0.462, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.238 std_dev=0.224
N3	B	0, 0.024, 0.255, 0.485, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.255 std_dev=0.230
N7	B	0, -0.035, 0.201, 0.437, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.201 std_dev=0.236
C3'	A	0, 0.013, 0.261, 0.509, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.261 std_dev=0.248
C1'	B	0, 0.024, 0.283, 0.543, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.283 std_dev=0.260
C2'	B	0, 0.025, 0.285, 0.545, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.285 std_dev=0.260
O2'	A	0, 0.001, 0.268, 0.536, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.268 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.028, 0.308, 0.588, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.308 std_dev=0.280
C6	B	0, 0.021, 0.311, 0.601, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.311 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.024, 0.319, 0.615, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.319 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.002, 0.315, 0.627, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.315 std_dev=0.312
P	A	0, 0.004, 0.322, 0.641, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.322 std_dev=0.319
O3'	A	0, 0.018, 0.373, 0.728, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.373 std_dev=0.355
N1	B	0, -0.006, 0.350, 0.707, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.350 std_dev=0.357
C3'	B	0, 0.023, 0.382, 0.741, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.382 std_dev=0.359
C5'	A	0, -0.003, 0.359, 0.721, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.359 std_dev=0.362
N6	B	0, 0.022, 0.387, 0.752, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.387 std_dev=0.365
OP1	A	0, 0.001, 0.381, 0.761, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.381 std_dev=0.380
C4'	B	0, 0.025, 0.415, 0.806, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.415 std_dev=0.391
O5'	A	0, -0.010, 0.395, 0.801, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.395 std_dev=0.406
O3'	B	0, 0.007, 0.434, 0.860, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.434 std_dev=0.426
OP2	A	0, 0.010, 0.442, 0.874, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.442 std_dev=0.432
C5'	B	0, 0.014, 0.449, 0.885, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.449 std_dev=0.435
O5'	B	0, 0.002, 0.523, 1.044, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.523 std_dev=0.521
P	B	0, -0.057, 0.521, 1.098, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.521 std_dev=0.578
OP2	B	0, -0.057, 0.573, 1.203, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.573 std_dev=0.630
OP1	B	0, -0.098, 0.566, 1.230, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.566 std_dev=0.664

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.30	0.04	0.11
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.04	0.04	0.26	0.10	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.08	0.07
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.02	0.07	0.04	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.03
C4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.02	0.06	0.26	0.10	0.07
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.23	0.04	0.07
C5	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.09	0.23	0.14	0.05
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.07	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.11	0.08	0.00
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.08	0.23	0.14	0.05
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.10	0.21	0.14	0.05
N1	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03	0.06	0.24	0.13	0.05
N3	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.04	0.04	0.27	0.08	0.07
N6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.11	0.22	0.15	0.05
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.11	0.19	0.16	0.04
N9	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.07	0.26	0.09	0.08
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.07	0.12	0.03	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.27	0.06	0.08
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.10	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.06	0.11	0.14	0.03
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.28	0.01	0.12
O5'	0.03	0.04	0.00	0.01	0.06	0.02	0.09	0.00	0.08	0.10	0.06	0.04	0.11	0.11	0.07	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.30	0.26	0.25	0.19	0.26	0.23	0.23	0.11	0.23	0.21	0.24	0.27	0.22	0.19	0.26	0.27	0.11	0.28	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.10	0.08	0.12	0.10	0.04	0.14	0.08	0.14	0.14	0.13	0.08	0.15	0.16	0.09	0.06	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.06	0.07	0.03	0.07	0.07	0.05	0.00	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.08	0.08	0.03	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.07	0.12	0.10	0.02	0.08	0.04	0.12	0.16	0.05	0.18	0.02	0.26	0.01	0.06	0.20	0.17	0.06	0.19	0.14	0.08	0.11
C2	0.05	0.18	0.08	0.06	0.07	0.08	0.04	0.15	0.06	0.06	0.16	0.13	0.08	0.08	0.04	0.14	0.11	0.04	0.15	0.09	0.07	0.09
C2'	0.15	0.05	0.15	0.15	0.09	0.14	0.06	0.17	0.09	0.14	0.11	0.08	0.17	0.10	0.13	0.22	0.22	0.13	0.22	0.20	0.12	0.16
C3'	0.18	0.07	0.18	0.18	0.08	0.15	0.05	0.13	0.10	0.17	0.15	0.04	0.18	0.12	0.15	0.27	0.27	0.14	0.24	0.20	0.11	0.16
C4	0.06	0.05	0.09	0.08	0.03	0.08	0.04	0.15	0.08	0.05	0.02	0.07	0.18	0.07	0.04	0.17	0.13	0.04	0.15	0.09	0.06	0.08
C4'	0.17	0.16	0.19	0.18	0.04	0.14	0.04	0.09	0.17	0.13	0.25	0.05	0.25	0.06	0.12	0.28	0.27	0.13	0.24	0.18	0.11	0.15
C5	0.07	0.06	0.10	0.09	0.04	0.10	0.05	0.18	0.08	0.05	0.03	0.08	0.17	0.08	0.05	0.17	0.13	0.06	0.14	0.10	0.09	0.09
C5'	0.16	0.22	0.19	0.17	0.07	0.13	0.07	0.06	0.20	0.12	0.29	0.11	0.26	0.05	0.11	0.28	0.26	0.13	0.23	0.17	0.12	0.15
C6	0.06	0.12	0.09	0.09	0.06	0.11	0.05	0.20	0.06	0.06	0.07	0.10	0.12	0.09	0.05	0.16	0.12	0.07	0.14	0.10	0.10	0.10
C8	0.08	0.05	0.12	0.10	0.02	0.09	0.06	0.16	0.15	0.04	0.15	0.03	0.24	0.05	0.05	0.20	0.15	0.05	0.15	0.10	0.10	0.10
N1	0.05	0.17	0.08	0.07	0.06	0.10	0.04	0.18	0.06	0.06	0.14	0.13	0.08	0.08	0.04	0.15	0.11	0.05	0.14	0.09	0.08	0.09
N3	0.05	0.13	0.08	0.06	0.05	0.07	0.03	0.13	0.02	0.05	0.08	0.11	0.13	0.08	0.04	0.15	0.12	0.03	0.16	0.10	0.06	0.09
N6	0.07	0.12	0.10	0.11	0.06	0.13	0.06	0.22	0.06	0.07	0.08	0.11	0.11	0.09	0.06	0.16	0.12	0.08	0.15	0.13	0.13	0.12
N7	0.08	0.03	0.11	0.11	0.04	0.11	0.06	0.19	0.12	0.05	0.09	0.05	0.21	0.07	0.05	0.19	0.14	0.06	0.15	0.11	0.12	0.11
N9	0.08	0.03	0.11	0.09	0.02	0.08	0.05	0.14	0.14	0.03	0.13	0.03	0.24	0.05	0.04	0.19	0.15	0.04	0.16	0.10	0.07	0.09
O2'	0.19	0.11	0.18	0.18	0.16	0.19	0.13	0.23	0.09	0.20	0.11	0.14	0.12	0.16	0.19	0.20	0.23	0.18	0.25	0.25	0.16	0.21
O3'	0.17	0.09	0.17	0.17	0.08	0.15	0.06	0.13	0.08	0.20	0.15	0.03	0.14	0.15	0.16	0.24	0.27	0.15	0.24	0.22	0.10	0.16
O4'	0.14	0.17	0.17	0.14	0.07	0.09	0.08	0.05	0.21	0.08	0.27	0.07	0.29	0.05	0.10	0.26	0.22	0.10	0.22	0.15	0.09	0.13
O5'	0.22	0.30	0.25	0.23	0.17	0.20	0.17	0.15	0.26	0.14	0.35	0.21	0.30	0.11	0.17	0.32	0.30	0.21	0.27	0.20	0.19	0.20
OP1	0.31	0.31	0.30	0.28	0.26	0.27	0.26	0.26	0.27	0.34	0.34	0.26	0.27	0.30	0.30	0.34	0.31	0.27	0.28	0.26	0.19	0.24
OP2	0.15	0.25	0.18	0.18	0.04	0.14	0.07	0.11	0.22	0.13	0.32	0.11	0.28	0.05	0.10	0.25	0.24	0.11	0.16	0.10	0.06	0.08
P	0.15	0.25	0.17	0.16	0.07	0.13	0.09	0.10	0.21	0.14	0.31	0.12	0.26	0.09	0.11	0.25	0.22	0.11	0.16	0.11	0.05	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.15	0.17	0.13	0.12
C2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.12	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.17	0.20	0.06	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.12	0.08	0.07
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.12	0.14	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.17	0.18	0.07	0.11
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.11	0.11	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.04	0.15	0.17	0.05	0.10
C5'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.17	0.05	0.19	0.15	0.19	0.10	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.03	0.04	0.16	0.18	0.04	0.11
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.16	0.02	0.17	0.19	0.13	0.13
N1	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.04	0.17	0.20	0.06	0.13
N3	0.02	0.00	0.10	0.14	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.17	0.19	0.06	0.13
N6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.05	0.15	0.18	0.04	0.10
N7	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.13	0.03	0.15	0.16	0.08	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.18	0.19	0.12	0.13
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.11	0.06	0.05
O3'	0.08	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.16	0.04	0.08	0.05	0.13	0.08	0.04	0.00	0.04	0.07	0.02	0.13	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.16	0.17	0.15	0.13
O5'	0.15	0.17	0.10	0.02	0.17	0.02	0.15	0.00	0.16	0.17	0.17	0.17	0.15	0.15	0.18	0.08	0.07	0.16	0.00	0.04	0.05	0.01
OP1	0.17	0.20	0.12	0.03	0.18	0.06	0.17	0.04	0.18	0.19	0.20	0.19	0.18	0.16	0.19	0.11	0.02	0.17	0.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.05	0.10	0.04	0.13	0.06	0.06	0.04	0.08	0.12	0.06	0.13	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.14	0.07	0.04	0.11	0.02	0.10	0.01	0.11	0.13	0.13	0.13	0.10	0.10	0.13	0.05	0.08	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00