Doublet Group distance statistics: 55324

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.007, 0.028, 0.050, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.012, 0.044, 0.075, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.044 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.045 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.038, 0.134, 0.230, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.134 std_dev=0.096
C3'	A	0, 0.053, 0.187, 0.320, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.187 std_dev=0.134
O3'	A	0, 0.042, 0.178, 0.313, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.178 std_dev=0.135
O2'	A	0, 0.057, 0.219, 0.380, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.219 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.070, 0.238, 0.406, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.238 std_dev=0.168
C5'	A	0, 0.087, 0.302, 0.517, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.302 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.084, 0.299, 0.515, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.299 std_dev=0.215
OP2	A	0, 0.120, 0.462, 0.803, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.462 std_dev=0.342
P	A	0, 0.174, 0.598, 1.023, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.598 std_dev=0.424
N1	B	0, 0.161, 0.598, 1.035, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.598 std_dev=0.437
C6	B	0, 0.172, 0.626, 1.079, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.626 std_dev=0.454
N6	B	0, 0.208, 0.814, 1.420, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.814 std_dev=0.606
C4	B	0, 0.252, 0.868, 1.484, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.868 std_dev=0.616
C2	B	0, 0.253, 0.942, 1.631, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.942 std_dev=0.689
C5	B	0, 0.274, 0.965, 1.655, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.965 std_dev=0.690
N3	B	0, 0.242, 0.935, 1.628, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.935 std_dev=0.693
O4'	B	0, 0.289, 1.006, 1.723, 1.622 max_d=1.622 avg_d=1.006 std_dev=0.717
C4'	B	0, 0.308, 1.066, 1.824, 1.698 max_d=1.698 avg_d=1.066 std_dev=0.758
C1'	B	0, 0.295, 1.061, 1.828, 1.783 max_d=1.783 avg_d=1.061 std_dev=0.766
N9	B	0, 0.334, 1.142, 1.949, 1.719 max_d=1.719 avg_d=1.142 std_dev=0.807
C5'	B	0, 0.337, 1.168, 1.998, 1.860 max_d=1.860 avg_d=1.168 std_dev=0.830
O2'	B	0, 0.349, 1.328, 2.307, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.328 std_dev=0.979
C2'	B	0, 0.389, 1.375, 2.361, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.375 std_dev=0.986
O5'	B	0, 0.403, 1.395, 2.386, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.395 std_dev=0.991
C3'	B	0, 0.421, 1.451, 2.480, 2.281 max_d=2.281 avg_d=1.451 std_dev=1.029
OP1	A	0, 0.431, 1.477, 2.523, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.477 std_dev=1.046
N7	B	0, 0.444, 1.565, 2.687, 2.571 max_d=2.571 avg_d=1.565 std_dev=1.122
C8	B	0, 0.463, 1.611, 2.759, 2.588 max_d=2.588 avg_d=1.611 std_dev=1.148
O3'	B	0, 0.494, 1.716, 2.938, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.716 std_dev=1.222
P	B	0, 0.715, 2.503, 4.291, 4.066 max_d=4.066 avg_d=2.503 std_dev=1.788
OP2	B	0, 0.871, 3.019, 5.167, 4.823 max_d=4.823 avg_d=3.019 std_dev=2.148
OP1	B	0, 0.889, 3.058, 5.227, 4.796 max_d=4.796 avg_d=3.058 std_dev=2.169

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.19	0.04	0.14
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.21	0.09	0.15
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.03	0.09
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.03	0.02	0.06	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02
C4	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.06	0.20	0.08	0.15
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.01	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04
C5	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.04	0.07	0.17	0.12	0.13
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.04	0.01	0.08	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.07	0.16	0.14	0.12
C8	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.07	0.15	0.08	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.06	0.19	0.12	0.14
N3	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.21	0.07	0.16
N6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.09	0.14	0.17	0.11
N7	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.09	0.14	0.12	0.12
N9	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.19	0.06	0.15
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05
O3'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.16	0.03	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.05	0.23	0.03	0.13
O5'	0.05	0.05	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.05	0.09	0.09	0.05	0.03	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.21	0.06	0.04	0.20	0.08	0.17	0.05	0.16	0.15	0.19	0.21	0.14	0.14	0.19	0.05	0.16	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.09	0.03	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.14	0.08	0.12	0.07	0.17	0.12	0.06	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.15	0.09	0.02	0.15	0.04	0.13	0.01	0.12	0.13	0.14	0.16	0.11	0.12	0.15	0.05	0.05	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.22	0.09	0.13	0.19	0.20	0.16	0.29	0.14	0.15	0.19	0.22	0.09	0.14	0.18	0.03	0.10	0.24	0.39	0.69	0.69	0.56
C2	0.07	0.06	0.15	0.10	0.05	0.08	0.06	0.19	0.04	0.08	0.06	0.05	0.04	0.08	0.07	0.17	0.15	0.13	0.28	0.47	0.50	0.42
C2'	0.20	0.29	0.13	0.16	0.21	0.22	0.15	0.30	0.13	0.14	0.22	0.27	0.04	0.11	0.19	0.08	0.14	0.26	0.39	0.67	0.64	0.53
C3'	0.22	0.30	0.16	0.18	0.21	0.23	0.14	0.29	0.12	0.14	0.22	0.29	0.03	0.10	0.20	0.11	0.16	0.26	0.39	0.66	0.62	0.51
C4	0.09	0.18	0.03	0.04	0.10	0.14	0.06	0.24	0.07	0.03	0.15	0.15	0.02	0.02	0.07	0.05	0.04	0.18	0.33	0.56	0.56	0.47
C4'	0.22	0.24	0.15	0.18	0.22	0.22	0.17	0.29	0.14	0.18	0.18	0.26	0.07	0.15	0.21	0.10	0.15	0.26	0.39	0.71	0.69	0.56
C5	0.06	0.19	0.05	0.01	0.06	0.11	0.00	0.21	0.03	0.05	0.15	0.15	0.06	0.08	0.02	0.06	0.05	0.14	0.29	0.47	0.46	0.39
C5'	0.22	0.25	0.17	0.19	0.21	0.22	0.15	0.29	0.13	0.16	0.18	0.27	0.06	0.13	0.21	0.12	0.17	0.26	0.38	0.70	0.67	0.54
C6	0.02	0.14	0.11	0.08	0.00	0.06	0.06	0.16	0.02	0.12	0.11	0.10	0.10	0.15	0.04	0.11	0.12	0.10	0.23	0.38	0.37	0.32
C8	0.14	0.26	0.06	0.09	0.14	0.17	0.07	0.26	0.09	0.03	0.21	0.23	0.01	0.01	0.11	0.03	0.06	0.21	0.34	0.56	0.54	0.45
N1	0.06	0.08	0.16	0.12	0.04	0.04	0.07	0.15	0.03	0.13	0.06	0.05	0.09	0.14	0.07	0.17	0.17	0.09	0.23	0.38	0.39	0.34
N3	0.09	0.10	0.08	0.05	0.08	0.13	0.08	0.23	0.08	0.07	0.10	0.10	0.06	0.07	0.08	0.11	0.08	0.17	0.33	0.57	0.60	0.50
N6	0.03	0.15	0.14	0.11	0.02	0.04	0.10	0.13	0.05	0.18	0.11	0.09	0.13	0.21	0.08	0.12	0.15	0.07	0.19	0.29	0.27	0.25
N7	0.10	0.24	0.01	0.04	0.10	0.14	0.03	0.23	0.05	0.04	0.19	0.20	0.05	0.07	0.06	0.01	0.01	0.17	0.30	0.49	0.46	0.39
N9	0.14	0.23	0.05	0.09	0.15	0.18	0.10	0.27	0.11	0.07	0.19	0.21	0.03	0.05	0.13	0.01	0.06	0.21	0.36	0.61	0.60	0.50
O2'	0.20	0.21	0.12	0.16	0.20	0.20	0.16	0.27	0.12	0.18	0.14	0.22	0.04	0.15	0.20	0.07	0.13	0.24	0.37	0.70	0.67	0.54
O3'	0.25	0.32	0.20	0.22	0.23	0.24	0.14	0.30	0.11	0.15	0.21	0.32	0.02	0.10	0.22	0.17	0.21	0.28	0.38	0.65	0.60	0.49
O4'	0.19	0.21	0.11	0.15	0.20	0.20	0.17	0.29	0.14	0.18	0.17	0.22	0.10	0.16	0.20	0.05	0.11	0.24	0.39	0.72	0.71	0.58
O5'	0.21	0.28	0.15	0.16	0.19	0.21	0.11	0.28	0.10	0.10	0.19	0.27	0.03	0.06	0.17	0.12	0.15	0.25	0.36	0.63	0.59	0.48
OP1	0.28	0.29	0.21	0.21	0.22	0.28	0.10	0.32	0.06	0.12	0.16	0.32	0.08	0.04	0.21	0.21	0.20	0.33	0.38	0.65	0.57	0.49
OP2	0.20	0.30	0.14	0.15	0.18	0.21	0.09	0.28	0.10	0.06	0.22	0.29	0.04	0.01	0.15	0.12	0.14	0.24	0.36	0.58	0.54	0.45
P	0.18	0.24	0.12	0.13	0.15	0.19	0.05	0.24	0.03	0.04	0.14	0.25	0.09	0.02	0.13	0.12	0.11	0.23	0.31	0.57	0.51	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.34	0.18	0.14
C2	0.03	0.00	0.17	0.13	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.18	0.06	0.16	0.43	0.41	0.30
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.10	0.06	0.15	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.41	0.19	0.16
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.11	0.10	0.12	0.01	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.40	0.14	0.14
C4	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.07	0.05	0.16	0.45	0.38	0.30
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.11	0.02	0.04	0.08	0.11	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.26	0.07	0.07
C5	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.03	0.07	0.23	0.52	0.49	0.39
C5'	0.01	0.06	0.02	0.04	0.08	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.11	0.03	0.19	0.19	0.08	0.04	0.08	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.10	0.04	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.07	0.08	0.25	0.53	0.52	0.41
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.22	0.53	0.41	0.36
N1	0.02	0.00	0.15	0.10	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.15	0.07	0.21	0.48	0.48	0.36
N3	0.03	0.00	0.16	0.12	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.16	0.05	0.12	0.40	0.35	0.25
N6	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.08	0.29	0.56	0.58	0.47
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.05	0.27	0.57	0.53	0.44
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.13	0.44	0.31	0.26
O2'	0.00	0.23	0.01	0.00	0.11	0.03	0.09	0.04	0.14	0.04	0.20	0.20	0.12	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.36	0.17	0.13
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.07	0.02	0.03	0.08	0.07	0.11	0.15	0.16	0.05	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.15	0.34	0.08	0.09
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.07	0.05	0.08	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.22	0.08	0.06
O5'	0.05	0.16	0.03	0.08	0.16	0.01	0.23	0.01	0.25	0.22	0.21	0.12	0.29	0.27	0.13	0.03	0.15	0.06	0.00	0.05	0.03	0.01
OP1	0.34	0.43	0.41	0.40	0.45	0.26	0.52	0.12	0.53	0.53	0.48	0.40	0.56	0.57	0.44	0.36	0.34	0.22	0.05	0.00	0.00	0.01
OP2	0.18	0.41	0.19	0.14	0.38	0.07	0.49	0.01	0.52	0.41	0.48	0.35	0.58	0.53	0.31	0.17	0.08	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.30	0.16	0.14	0.30	0.07	0.39	0.00	0.41	0.36	0.36	0.25	0.47	0.44	0.26	0.13	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00