Doublet Group distance statistics: 55331

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 3, 3, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.013, 0.024, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.040, 0.072, 0.103, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.072 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.035, 0.069, 0.103, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.069 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.006, 0.116, 0.227, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.116 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.038, 0.161, 0.285, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.161 std_dev=0.124
O2	B	0, 0.245, 0.420, 0.594, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.420 std_dev=0.174
C2'	B	0, 0.066, 0.251, 0.436, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.251 std_dev=0.185
O2'	B	0, 0.134, 0.333, 0.531, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.333 std_dev=0.198
C2	B	0, 0.152, 0.361, 0.570, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.361 std_dev=0.209
O2'	A	0, 0.047, 0.262, 0.477, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.262 std_dev=0.215
C4'	A	0, 0.055, 0.272, 0.490, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.272 std_dev=0.218
O3'	B	0, 0.212, 0.437, 0.661, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.437 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.087, 0.331, 0.574, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.331 std_dev=0.244
C3'	B	0, 0.129, 0.384, 0.640, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.384 std_dev=0.256
C1'	B	0, 0.103, 0.361, 0.620, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.361 std_dev=0.259
N3	B	0, 0.153, 0.416, 0.679, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.416 std_dev=0.263
N1	B	0, 0.124, 0.391, 0.658, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.391 std_dev=0.267
C5'	A	0, 0.053, 0.383, 0.712, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.383 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.216, 0.561, 0.905, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.561 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.118, 0.467, 0.817, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.467 std_dev=0.349
C4	B	0, 0.178, 0.529, 0.880, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.529 std_dev=0.351
O3'	A	0, 0.174, 0.540, 0.905, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.540 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.261, 0.636, 1.012, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.636 std_dev=0.376
O4	B	0, 0.239, 0.632, 1.026, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.632 std_dev=0.393
O4'	B	0, 0.094, 0.500, 0.906, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.500 std_dev=0.406
C5'	B	0, 0.121, 0.684, 1.247, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.684 std_dev=0.563
O5'	B	0, 0.091, 0.755, 1.418, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.755 std_dev=0.664
OP2	A	0, 0.881, 1.652, 2.423, 2.787 max_d=2.787 avg_d=1.652 std_dev=0.771
OP2	B	0, 0.118, 1.009, 1.900, 2.564 max_d=2.564 avg_d=1.009 std_dev=0.891
P	B	0, 0.064, 0.962, 1.860, 2.581 max_d=2.581 avg_d=0.962 std_dev=0.898
O5'	A	0, -0.023, 0.901, 1.824, 2.721 max_d=2.721 avg_d=0.901 std_dev=0.924
OP1	B	0, 0.080, 1.141, 2.202, 3.175 max_d=3.175 avg_d=1.141 std_dev=1.061
P	A	0, -0.121, 1.119, 2.360, 3.519 max_d=3.519 avg_d=1.119 std_dev=1.240
OP1	A	0, 0.202, 1.632, 3.061, 4.400 max_d=4.400 avg_d=1.632 std_dev=1.430

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02	0.01	0.16	0.29	0.22	0.16
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.10	0.02	0.40	0.47	0.44	0.41
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.15	0.00	0.03	0.01	0.26	0.31	0.35	0.29
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.07	0.11	0.13	0.15	0.03	0.01	0.01	0.31	0.34	0.40	0.35
C4	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.13	0.03	0.61	0.77	0.63	0.65
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.06	0.09	0.09	0.07	0.02	0.00	0.02	0.19	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.12	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.04	0.64	0.82	0.62	0.65
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.17	0.01	0.20	0.00	0.17	0.08	0.12	0.19	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.22	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.03	0.55	0.64	0.51	0.51
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.39	0.45	0.40	0.37
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.12	0.02	0.51	0.61	0.55	0.54
N4	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.14	0.03	0.66	0.87	0.70	0.73
O2	0.05	0.01	0.15	0.15	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.22	0.17	0.05	0.29	0.37	0.36	0.32
O2'	0.03	0.13	0.00	0.03	0.08	0.07	0.04	0.07	0.03	0.05	0.13	0.09	0.22	0.00	0.07	0.07	0.13	0.30	0.28	0.19
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.13	0.02	0.15	0.03	0.13	0.06	0.12	0.14	0.17	0.07	0.00	0.01	0.21	0.26	0.41	0.29
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.01	0.00	0.11	0.25	0.17	0.13
O5'	0.16	0.40	0.26	0.31	0.61	0.02	0.64	0.01	0.55	0.39	0.51	0.66	0.29	0.13	0.21	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.29	0.47	0.31	0.34	0.77	0.19	0.82	0.22	0.64	0.45	0.61	0.87	0.37	0.30	0.26	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.44	0.35	0.40	0.63	0.08	0.62	0.06	0.51	0.40	0.55	0.70	0.36	0.28	0.41	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.41	0.29	0.35	0.65	0.05	0.65	0.02	0.51	0.37	0.54	0.73	0.32	0.19	0.29	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.12	0.21	0.19	0.09	0.18	0.10	0.17	0.16	0.18	0.20	0.12	0.33	0.22	0.16	0.14	0.21	0.20	0.15
C2	0.19	0.17	0.10	0.15	0.17	0.12	0.16	0.10	0.17	0.16	0.17	0.19	0.11	0.29	0.18	0.21	0.09	0.17	0.11	0.08
C2'	0.19	0.19	0.17	0.24	0.20	0.13	0.19	0.14	0.18	0.18	0.20	0.20	0.14	0.37	0.22	0.19	0.16	0.18	0.19	0.15
C3'	0.23	0.22	0.14	0.20	0.22	0.13	0.22	0.13	0.22	0.22	0.22	0.24	0.14	0.35	0.23	0.24	0.13	0.17	0.16	0.12
C4	0.20	0.17	0.10	0.15	0.17	0.13	0.16	0.12	0.16	0.17	0.17	0.20	0.11	0.26	0.19	0.22	0.10	0.14	0.15	0.09
C4'	0.18	0.19	0.11	0.22	0.19	0.09	0.19	0.12	0.17	0.17	0.19	0.22	0.12	0.37	0.21	0.17	0.17	0.27	0.23	0.18
C5	0.19	0.17	0.10	0.17	0.19	0.12	0.18	0.10	0.17	0.17	0.18	0.21	0.09	0.28	0.23	0.20	0.12	0.17	0.20	0.13
C5'	0.26	0.25	0.09	0.16	0.24	0.09	0.24	0.08	0.23	0.24	0.24	0.29	0.15	0.31	0.25	0.24	0.11	0.24	0.18	0.13
C6	0.18	0.17	0.10	0.18	0.20	0.10	0.19	0.09	0.17	0.16	0.18	0.21	0.09	0.30	0.23	0.19	0.13	0.19	0.21	0.14
N1	0.18	0.17	0.10	0.18	0.18	0.10	0.17	0.09	0.16	0.16	0.18	0.20	0.11	0.31	0.20	0.19	0.11	0.18	0.17	0.11
N3	0.20	0.17	0.10	0.14	0.16	0.14	0.16	0.13	0.17	0.17	0.17	0.19	0.10	0.26	0.18	0.23	0.10	0.16	0.10	0.08
N4	0.21	0.17	0.11	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.18	0.17	0.20	0.14	0.22	0.18	0.23	0.11	0.13	0.14	0.10
O2	0.19	0.17	0.11	0.15	0.17	0.13	0.18	0.12	0.18	0.17	0.17	0.19	0.15	0.29	0.18	0.21	0.10	0.20	0.10	0.10
O2'	0.19	0.23	0.28	0.39	0.24	0.25	0.22	0.28	0.20	0.21	0.24	0.25	0.22	0.52	0.26	0.20	0.30	0.34	0.33	0.30
O3'	0.22	0.22	0.17	0.24	0.22	0.15	0.21	0.17	0.21	0.22	0.22	0.24	0.15	0.40	0.23	0.23	0.17	0.21	0.19	0.16
O4'	0.17	0.16	0.09	0.19	0.18	0.08	0.18	0.10	0.17	0.15	0.17	0.20	0.14	0.32	0.21	0.16	0.16	0.26	0.23	0.17
O5'	0.59	0.62	0.32	0.10	0.54	0.30	0.51	0.19	0.52	0.57	0.59	0.71	0.43	0.21	0.54	0.55	0.10	0.18	0.09	0.08
OP1	0.69	0.81	0.44	0.32	0.70	0.38	0.63	0.32	0.63	0.71	0.79	0.93	0.51	0.42	0.71	0.62	0.33	0.37	0.34	0.32
OP2	0.67	0.67	0.39	0.23	0.59	0.42	0.57	0.34	0.59	0.64	0.63	0.75	0.47	0.26	0.58	0.66	0.27	0.28	0.29	0.27
P	0.65	0.68	0.34	0.12	0.56	0.35	0.53	0.24	0.55	0.62	0.63	0.79	0.45	0.23	0.55	0.62	0.14	0.18	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.08	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.03	0.12	0.12	0.16	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.02	0.11	0.01	0.12	0.03	0.04	0.14	0.00	0.03	0.08	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.19	0.07	0.09	0.13	0.01	0.01	0.17	0.01	0.04	0.10	0.07	0.04
C4	0.03	0.02	0.07	0.15	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.18	0.01	0.05	0.14	0.12	0.15	0.12
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.05	0.06	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03
C5	0.03	0.01	0.11	0.20	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.24	0.01	0.05	0.15	0.11	0.13	0.11
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.11	0.05	0.08	0.07	0.05	0.03	0.13	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.12	0.19	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.21	0.01	0.04	0.12	0.09	0.14	0.09
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.03	0.02	0.10	0.10	0.15	0.11
N3	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.11	0.02	0.03	0.13	0.13	0.16	0.12
O2	0.04	0.01	0.14	0.13	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.18	0.15	0.04	0.05	0.14	0.15	0.17	0.13
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.07	0.05	0.07	0.02	0.07	0.18	0.00	0.04	0.06	0.03	0.02	0.09	0.05	0.03
O3'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.18	0.01	0.24	0.03	0.21	0.08	0.11	0.15	0.04	0.00	0.20	0.02	0.09	0.17	0.15	0.11
O4	0.04	0.03	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.20	0.00	0.05	0.16	0.14	0.15	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.00	0.07	0.07	0.14	0.10
O5'	0.08	0.12	0.04	0.04	0.14	0.01	0.15	0.01	0.12	0.10	0.13	0.14	0.02	0.09	0.16	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.08	0.10	0.12	0.06	0.11	0.06	0.09	0.10	0.13	0.15	0.09	0.17	0.14	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.16	0.06	0.07	0.15	0.05	0.13	0.03	0.14	0.15	0.16	0.17	0.05	0.15	0.15	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.04	0.04	0.12	0.03	0.11	0.02	0.09	0.11	0.12	0.13	0.03	0.11	0.13	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00