Doublet Group distance statistics: 55332

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.009, 0.034, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.013, 0.048, 0.082, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.048 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.025, 0.096, 0.168, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.096 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.058, 0.201, 0.344, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.201 std_dev=0.143
O2'	A	0, 0.061, 0.223, 0.385, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.223 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.083, 0.283, 0.484, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.283 std_dev=0.201
N1	B	0, 0.045, 0.261, 0.477, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.261 std_dev=0.216
C3'	A	0, 0.103, 0.355, 0.607, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.355 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.105, 0.373, 0.642, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.373 std_dev=0.268
C2	B	0, 0.113, 0.398, 0.683, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.398 std_dev=0.285
O3'	A	0, 0.129, 0.442, 0.754, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.442 std_dev=0.313
O2	B	0, 0.132, 0.461, 0.789, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.461 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.138, 0.499, 0.860, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.499 std_dev=0.361
C1'	B	0, 0.175, 0.602, 1.029, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.602 std_dev=0.427
C5'	A	0, 0.190, 0.657, 1.124, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.657 std_dev=0.467
C5	B	0, 0.184, 0.661, 1.138, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.661 std_dev=0.477
O5'	A	0, 0.199, 0.685, 1.172, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.685 std_dev=0.486
N3	B	0, 0.240, 0.821, 1.402, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.821 std_dev=0.581
P	A	0, 0.236, 0.833, 1.430, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.833 std_dev=0.597
C2'	B	0, 0.243, 0.887, 1.531, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.887 std_dev=0.644
C4	B	0, 0.269, 0.924, 1.578, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.924 std_dev=0.655
O2'	B	0, 0.255, 0.945, 1.636, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.945 std_dev=0.690
O4'	B	0, 0.309, 1.059, 1.809, 1.638 max_d=1.638 avg_d=1.059 std_dev=0.750
O4	B	0, 0.394, 1.349, 2.303, 2.071 max_d=2.071 avg_d=1.349 std_dev=0.955
C3'	B	0, 0.388, 1.373, 2.357, 2.260 max_d=2.260 avg_d=1.373 std_dev=0.984
C4'	B	0, 0.426, 1.477, 2.528, 2.362 max_d=2.362 avg_d=1.477 std_dev=1.051
OP1	A	0, 0.463, 1.581, 2.699, 2.403 max_d=2.403 avg_d=1.581 std_dev=1.118
O5'	B	0, 0.440, 1.579, 2.719, 2.645 max_d=2.645 avg_d=1.579 std_dev=1.139
OP2	A	0, 0.478, 1.631, 2.785, 2.458 max_d=2.458 avg_d=1.631 std_dev=1.154
OP1	B	0, 0.436, 1.614, 2.791, 2.776 max_d=2.776 avg_d=1.614 std_dev=1.177
P	B	0, 0.487, 1.741, 2.995, 2.904 max_d=2.904 avg_d=1.741 std_dev=1.254
C5'	B	0, 0.522, 1.806, 3.091, 2.875 max_d=2.875 avg_d=1.806 std_dev=1.284
O3'	B	0, 0.559, 1.940, 3.321, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.940 std_dev=1.381
OP2	B	0, 0.559, 1.957, 3.354, 3.176 max_d=3.176 avg_d=1.957 std_dev=1.398

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.26	0.06	0.06
C2	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.36	0.23	0.07
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.07	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01
C4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.12	0.52	0.37	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.16	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.11	0.53	0.40	0.09
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.03	0.05	0.12	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.08	0.43	0.31	0.06
N1	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.35	0.21	0.06
N3	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.09	0.45	0.30	0.11
N4	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.02	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.15	0.55	0.43	0.13
O2	0.05	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.29	0.19	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.11	0.03
O3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.26	0.18	0.01
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.29	0.03	0.08
O5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.12	0.02	0.11	0.01	0.08	0.04	0.09	0.15	0.05	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.26	0.36	0.09	0.10	0.52	0.08	0.53	0.03	0.43	0.35	0.45	0.55	0.29	0.08	0.26	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.23	0.03	0.06	0.37	0.16	0.40	0.25	0.31	0.21	0.30	0.43	0.19	0.11	0.18	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.03	0.01	0.11	0.03	0.09	0.02	0.06	0.06	0.11	0.13	0.05	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.12	0.14	0.09	0.09	0.08	0.12	0.06	0.15	0.14	0.11	0.16	0.12	0.14	0.07	0.19	0.10	0.10	0.11	0.10
C2	0.17	0.12	0.14	0.08	0.08	0.13	0.11	0.12	0.15	0.14	0.11	0.17	0.09	0.04	0.07	0.22	0.16	0.16	0.17	0.17
C2'	0.18	0.14	0.16	0.13	0.13	0.09	0.17	0.08	0.19	0.17	0.12	0.16	0.17	0.22	0.12	0.20	0.11	0.12	0.10	0.10
C3'	0.18	0.15	0.13	0.09	0.18	0.07	0.22	0.06	0.22	0.19	0.15	0.13	0.12	0.18	0.18	0.21	0.11	0.13	0.10	0.11
C4	0.11	0.10	0.13	0.12	0.08	0.09	0.05	0.10	0.08	0.09	0.11	0.14	0.10	0.10	0.08	0.12	0.17	0.17	0.18	0.19
C4'	0.18	0.13	0.12	0.08	0.14	0.07	0.18	0.06	0.19	0.17	0.11	0.12	0.10	0.15	0.12	0.21	0.11	0.12	0.11	0.11
C5	0.09	0.10	0.12	0.09	0.08	0.05	0.06	0.05	0.08	0.09	0.11	0.13	0.06	0.06	0.08	0.09	0.13	0.14	0.14	0.15
C5'	0.19	0.14	0.12	0.05	0.17	0.07	0.21	0.05	0.21	0.19	0.14	0.11	0.06	0.10	0.16	0.21	0.13	0.14	0.14	0.14
C6	0.13	0.12	0.13	0.08	0.09	0.06	0.09	0.05	0.12	0.13	0.11	0.15	0.05	0.02	0.07	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14
N1	0.16	0.12	0.13	0.08	0.09	0.08	0.11	0.07	0.14	0.14	0.11	0.16	0.08	0.05	0.07	0.18	0.13	0.13	0.14	0.14
N3	0.15	0.10	0.12	0.10	0.06	0.13	0.07	0.14	0.10	0.10	0.10	0.16	0.08	0.06	0.06	0.19	0.18	0.18	0.19	0.20
N4	0.10	0.11	0.18	0.18	0.11	0.11	0.07	0.13	0.09	0.09	0.13	0.12	0.14	0.19	0.11	0.10	0.21	0.21	0.22	0.23
O2	0.23	0.15	0.19	0.13	0.12	0.19	0.16	0.18	0.20	0.19	0.14	0.20	0.19	0.11	0.10	0.30	0.19	0.19	0.20	0.20
O2'	0.19	0.16	0.22	0.22	0.12	0.15	0.15	0.15	0.17	0.17	0.14	0.20	0.25	0.33	0.11	0.20	0.15	0.15	0.14	0.14
O3'	0.18	0.16	0.14	0.13	0.22	0.09	0.26	0.09	0.24	0.20	0.17	0.14	0.15	0.25	0.23	0.20	0.11	0.13	0.09	0.10
O4'	0.16	0.12	0.13	0.07	0.09	0.07	0.13	0.06	0.16	0.15	0.10	0.14	0.09	0.11	0.07	0.19	0.11	0.10	0.12	0.11
O5'	0.21	0.19	0.14	0.07	0.23	0.07	0.25	0.05	0.24	0.22	0.20	0.16	0.06	0.04	0.23	0.22	0.16	0.18	0.17	0.17
OP1	0.47	0.55	0.48	0.38	0.56	0.28	0.54	0.23	0.51	0.52	0.57	0.56	0.38	0.29	0.58	0.40	0.37	0.32	0.40	0.36
OP2	0.24	0.31	0.26	0.28	0.31	0.29	0.26	0.29	0.25	0.26	0.33	0.34	0.29	0.33	0.32	0.20	0.22	0.15	0.23	0.19
P	0.23	0.24	0.19	0.13	0.26	0.10	0.27	0.08	0.26	0.25	0.24	0.22	0.10	0.04	0.26	0.22	0.19	0.21	0.20	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.12	0.06	0.10
C2	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.04	0.03	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.06	0.02	0.20	0.25	0.22	0.27
C2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.10	0.08
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.13	0.00	0.13	0.01	0.11	0.07	0.10	0.05	0.02	0.01	0.14	0.00	0.05	0.03	0.10	0.05
C4	0.05	0.04	0.05	0.13	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.14	0.00	0.06	0.31	0.41	0.34	0.44
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.12	0.05	0.07	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.06	0.03	0.06	0.13	0.01	0.14	0.00	0.24	0.01	0.05	0.00	0.04	0.05	0.15	0.02	0.07	0.32	0.43	0.30	0.44
C5'	0.03	0.11	0.02	0.01	0.22	0.01	0.24	0.00	0.21	0.12	0.16	0.06	0.05	0.02	0.24	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01
C6	0.03	0.02	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.21	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.12	0.02	0.06	0.27	0.35	0.20	0.34
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.05	0.05	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.04	0.02	0.18	0.24	0.16	0.24
N3	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.07	0.00	0.16	0.04	0.01	0.00	0.04	0.06	0.11	0.04	0.03	0.26	0.33	0.29	0.36
O2	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.09	0.05	0.08	0.00	0.16	0.18	0.19	0.22
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.01	0.06	0.09	0.00	0.00	0.06	0.06	0.06	0.05	0.09	0.07
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.14	0.01	0.15	0.02	0.12	0.08	0.11	0.05	0.00	0.00	0.16	0.01	0.04	0.09	0.14	0.02
O4	0.06	0.06	0.06	0.14	0.00	0.12	0.02	0.24	0.02	0.04	0.04	0.08	0.06	0.16	0.00	0.06	0.34	0.46	0.39	0.48
O4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.00	0.02	0.11	0.05	0.03
O5'	0.07	0.20	0.07	0.05	0.31	0.01	0.32	0.00	0.27	0.18	0.26	0.16	0.06	0.04	0.34	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.12	0.25	0.04	0.03	0.41	0.05	0.43	0.06	0.35	0.24	0.33	0.18	0.05	0.09	0.46	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.22	0.10	0.10	0.34	0.02	0.30	0.03	0.20	0.16	0.29	0.19	0.09	0.14	0.39	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.27	0.08	0.05	0.44	0.02	0.44	0.01	0.34	0.24	0.36	0.22	0.07	0.02	0.48	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00