Doublet Group distance statistics: 55337

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 2, 0, 8, 6, 6, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C5	A	0, -0.001, 0.020, 0.040, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, -0.001, 0.019, 0.040, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.019 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.002, 0.026, 0.050, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.026 std_dev=0.024
C2	A	0, -0.007, 0.018, 0.043, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.018 std_dev=0.025
N3	A	0, -0.002, 0.025, 0.052, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.025 std_dev=0.027
C1'	A	0, -0.004, 0.024, 0.051, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.024 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N9	A	0, -0.001, 0.034, 0.069, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.034 std_dev=0.035
O6	A	0, 0.002, 0.038, 0.074, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.038 std_dev=0.036
N2	A	0, -0.003, 0.036, 0.074, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.036 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.001, 0.045, 0.089, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.045 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.041, 0.214, 0.388, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.214 std_dev=0.173
C2'	A	0, 0.094, 0.271, 0.447, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.271 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.023, 0.236, 0.450, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.236 std_dev=0.214
C4	B	0, 0.286, 0.503, 0.721, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.503 std_dev=0.217
N4	B	0, 0.279, 0.506, 0.734, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.506 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.305, 0.545, 0.785, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.545 std_dev=0.240
N1	B	0, 0.345, 0.592, 0.840, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.592 std_dev=0.248
N3	B	0, 0.299, 0.558, 0.816, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.558 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.128, 0.390, 0.652, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.390 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.310, 0.574, 0.837, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.574 std_dev=0.264
C6	B	0, 0.333, 0.604, 0.875, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.604 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.333, 0.607, 0.880, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.607 std_dev=0.274
O2'	A	0, 0.128, 0.403, 0.678, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.403 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.243, 0.521, 0.800, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.521 std_dev=0.279
C1'	B	0, 0.398, 0.685, 0.972, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.685 std_dev=0.287
C3'	B	0, 0.379, 0.680, 0.981, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.680 std_dev=0.301
O2'	B	0, 0.370, 0.691, 1.012, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.691 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.320, 0.651, 0.983, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.651 std_dev=0.331
P	A	0, 0.381, 0.713, 1.045, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.713 std_dev=0.332
O3'	B	0, 0.401, 0.740, 1.078, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.740 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.455, 0.800, 1.145, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.800 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.476, 0.838, 1.201, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.838 std_dev=0.363
C5'	A	0, 0.082, 0.457, 0.832, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.457 std_dev=0.375
OP2	A	0, 0.418, 0.797, 1.176, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.797 std_dev=0.379
O5'	B	0, 0.478, 0.861, 1.243, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.861 std_dev=0.382
OP1	A	0, 0.453, 0.851, 1.249, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.851 std_dev=0.398
C5'	B	0, 0.537, 0.954, 1.371, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.954 std_dev=0.417
O3'	A	0, 0.176, 0.598, 1.021, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.598 std_dev=0.423
P	B	0, 0.591, 1.077, 1.563, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.077 std_dev=0.486
OP2	B	0, 0.506, 1.000, 1.494, 2.341 max_d=2.341 avg_d=1.000 std_dev=0.494
OP1	B	0, 0.694, 1.281, 1.867, 2.693 max_d=2.693 avg_d=1.281 std_dev=0.586

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.02	0.17	0.13	0.13
C2	0.05	0.00	0.13	0.16	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.22	0.13	0.29	0.01	0.29	0.30	0.28
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.09	0.08	0.11	0.15	0.13	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.10	0.13	0.13	0.10
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.02	0.16	0.13	0.15	0.17	0.15	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.19	0.18	0.19	0.18	0.17
C4	0.03	0.01	0.08	0.13	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.15	0.06	0.25	0.01	0.23	0.23	0.22
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.10	0.06	0.09	0.10	0.09	0.08	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.11	0.12	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.04	0.26	0.02	0.24	0.26	0.24
C5'	0.04	0.23	0.03	0.02	0.20	0.01	0.21	0.00	0.23	0.14	0.23	0.23	0.21	0.18	0.14	0.05	0.03	0.02	0.01	0.23	0.19	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.21	0.06	0.28	0.00	0.27	0.30	0.27
C8	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.14	0.03	0.20	0.04	0.20	0.20	0.18
N1	0.04	0.00	0.11	0.15	0.02	0.09	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.22	0.10	0.29	0.00	0.29	0.31	0.29
N2	0.06	0.01	0.15	0.17	0.01	0.10	0.02	0.23	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.25	0.15	0.29	0.01	0.32	0.33	0.31
N3	0.06	0.00	0.13	0.15	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.19	0.13	0.28	0.02	0.25	0.24	0.24
N7	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.08	0.00	0.18	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.17	0.02	0.24	0.04	0.22	0.24	0.22
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.20	0.02	0.20	0.19	0.18
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.07	0.09	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.03	0.06	0.08	0.07	0.10	0.15	0.08
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.15	0.01	0.18	0.03	0.21	0.14	0.22	0.25	0.19	0.17	0.09	0.03	0.00	0.02	0.31	0.23	0.28	0.30	0.28
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.03	0.10	0.15	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.22	0.05	0.24	0.17	0.19
O5'	0.15	0.29	0.10	0.19	0.25	0.02	0.26	0.01	0.28	0.20	0.29	0.29	0.28	0.24	0.20	0.08	0.31	0.22	0.00	0.28	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.11	0.02	0.23	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.23	0.05	0.28	0.00	0.28	0.31	0.28
OP1	0.17	0.29	0.13	0.19	0.23	0.12	0.24	0.19	0.27	0.20	0.29	0.32	0.25	0.22	0.20	0.10	0.28	0.24	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.30	0.13	0.18	0.23	0.13	0.26	0.21	0.30	0.20	0.31	0.33	0.24	0.24	0.19	0.15	0.30	0.17	0.02	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.28	0.10	0.17	0.22	0.02	0.24	0.01	0.27	0.18	0.29	0.31	0.24	0.22	0.18	0.08	0.28	0.19	0.01	0.28	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.22	0.21	0.14	0.15	0.15	0.22	0.14	0.23	0.19	0.20	0.18	0.37	0.29	0.13	0.18	0.20	0.31	0.31	0.25
C2	0.24	0.30	0.26	0.25	0.25	0.23	0.24	0.26	0.25	0.24	0.31	0.26	0.34	0.27	0.26	0.21	0.30	0.44	0.40	0.37
C2'	0.16	0.22	0.15	0.07	0.16	0.07	0.17	0.10	0.17	0.14	0.23	0.18	0.35	0.25	0.12	0.10	0.12	0.21	0.22	0.16
C3'	0.13	0.26	0.15	0.16	0.20	0.16	0.17	0.20	0.14	0.14	0.28	0.23	0.37	0.25	0.21	0.14	0.17	0.15	0.20	0.15
C4	0.22	0.27	0.23	0.20	0.15	0.19	0.20	0.21	0.21	0.20	0.27	0.17	0.36	0.26	0.20	0.18	0.26	0.38	0.38	0.33
C4'	0.15	0.24	0.16	0.13	0.22	0.13	0.21	0.14	0.20	0.15	0.26	0.24	0.36	0.27	0.13	0.14	0.14	0.19	0.22	0.16
C5	0.22	0.26	0.23	0.22	0.15	0.21	0.21	0.26	0.22	0.21	0.26	0.15	0.33	0.25	0.22	0.20	0.31	0.43	0.44	0.38
C5'	0.25	0.37	0.26	0.24	0.33	0.24	0.30	0.24	0.27	0.27	0.37	0.34	0.46	0.35	0.22	0.26	0.23	0.18	0.28	0.21
C6	0.22	0.25	0.23	0.24	0.19	0.24	0.22	0.30	0.23	0.21	0.27	0.19	0.30	0.25	0.25	0.21	0.35	0.48	0.50	0.44
C8	0.23	0.26	0.21	0.18	0.18	0.19	0.23	0.21	0.23	0.22	0.25	0.20	0.36	0.25	0.17	0.20	0.27	0.37	0.39	0.33
N1	0.22	0.27	0.25	0.25	0.24	0.25	0.23	0.31	0.24	0.22	0.29	0.26	0.31	0.26	0.27	0.22	0.35	0.49	0.49	0.44
N2	0.28	0.32	0.29	0.28	0.30	0.27	0.29	0.30	0.30	0.29	0.33	0.30	0.35	0.29	0.30	0.27	0.32	0.45	0.37	0.38
N3	0.23	0.29	0.25	0.21	0.20	0.19	0.21	0.21	0.23	0.22	0.29	0.22	0.36	0.28	0.22	0.18	0.25	0.37	0.35	0.31
N7	0.22	0.26	0.22	0.21	0.18	0.21	0.24	0.25	0.24	0.22	0.25	0.18	0.33	0.25	0.20	0.21	0.31	0.42	0.44	0.38
N9	0.22	0.27	0.22	0.17	0.15	0.17	0.21	0.19	0.22	0.21	0.25	0.17	0.38	0.27	0.16	0.19	0.24	0.35	0.36	0.30
O2'	0.24	0.21	0.20	0.10	0.18	0.12	0.23	0.10	0.24	0.21	0.19	0.19	0.32	0.30	0.10	0.18	0.14	0.22	0.25	0.19
O3'	0.16	0.24	0.18	0.24	0.21	0.24	0.18	0.29	0.16	0.15	0.26	0.23	0.34	0.28	0.30	0.19	0.25	0.17	0.23	0.21
O4'	0.16	0.22	0.18	0.14	0.19	0.14	0.22	0.14	0.22	0.12	0.24	0.23	0.38	0.26	0.16	0.13	0.19	0.33	0.30	0.24
O5'	0.16	0.22	0.17	0.07	0.14	0.06	0.19	0.05	0.21	0.16	0.20	0.14	0.34	0.19	0.02	0.10	0.11	0.25	0.22	0.16
O6	0.22	0.25	0.24	0.25	0.20	0.26	0.23	0.33	0.24	0.21	0.26	0.21	0.29	0.24	0.26	0.23	0.38	0.52	0.53	0.48
OP1	0.08	0.16	0.11	0.02	0.07	0.07	0.12	0.16	0.13	0.07	0.14	0.08	0.26	0.17	0.01	0.05	0.10	0.24	0.16	0.13
OP2	0.09	0.19	0.04	0.08	0.12	0.15	0.15	0.22	0.15	0.10	0.18	0.13	0.27	0.04	0.02	0.15	0.14	0.26	0.18	0.15
P	0.04	0.15	0.07	0.01	0.07	0.05	0.12	0.11	0.13	0.05	0.13	0.07	0.26	0.10	0.01	0.03	0.07	0.23	0.16	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.11	0.08
C2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.11	0.13	0.19	0.13
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.07	0.04	0.18	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.10	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.02	0.11	0.02	0.07	0.04	0.17	0.02	0.01	0.01	0.08	0.16	0.12	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.16	0.20	0.25	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.03	0.05	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.10	0.04	0.19	0.22	0.25	0.20
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.12	0.06	0.07	0.12	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.04	0.17	0.18	0.20	0.16
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.12	0.16	0.12
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.13	0.17	0.22	0.16
N4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.17	0.23	0.27	0.21
O2	0.03	0.01	0.18	0.17	0.02	0.06	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.21	0.04	0.10	0.11	0.17	0.12
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.07	0.05	0.15	0.00	0.02	0.04	0.06	0.11	0.08	0.06
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.11	0.02	0.10	0.06	0.21	0.02	0.00	0.01	0.11	0.23	0.17	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.07	0.08	0.12	0.11
O5'	0.07	0.11	0.06	0.08	0.16	0.02	0.19	0.01	0.17	0.12	0.13	0.17	0.10	0.06	0.11	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.13	0.13	0.16	0.20	0.06	0.22	0.05	0.18	0.12	0.17	0.23	0.11	0.11	0.23	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.10	0.12	0.25	0.04	0.25	0.02	0.20	0.16	0.22	0.27	0.17	0.08	0.17	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.06	0.09	0.19	0.03	0.20	0.02	0.16	0.12	0.16	0.21	0.12	0.06	0.14	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00