Doublet Group distance statistics: 55339

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 5, 7, 8, 2, 2, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.011, 0.029, 0.047, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.029 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.016, 0.037, 0.057, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.033 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.040 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.001, 0.022, 0.043, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.022 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.029 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.048 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.002, 0.055, 0.108, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.055 std_dev=0.053
C6	B	0, 0.288, 0.497, 0.706, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.497 std_dev=0.209
C5	B	0, 0.302, 0.522, 0.743, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.522 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.276, 0.500, 0.723, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.500 std_dev=0.224
C4	B	0, 0.309, 0.534, 0.759, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.534 std_dev=0.225
O4'	A	0, 0.050, 0.281, 0.512, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.281 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.323, 0.561, 0.799, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.561 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.318, 0.558, 0.798, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.558 std_dev=0.240
C2'	B	0, 0.342, 0.600, 0.857, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.600 std_dev=0.257
C1'	B	0, 0.289, 0.562, 0.834, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.562 std_dev=0.273
N4	B	0, 0.330, 0.608, 0.886, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.608 std_dev=0.278
C2'	A	0, 0.019, 0.311, 0.604, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.311 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.308, 0.602, 0.896, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.602 std_dev=0.294
C3'	A	0, 0.159, 0.453, 0.747, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.453 std_dev=0.294
O4'	B	0, 0.300, 0.595, 0.890, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.595 std_dev=0.295
C4'	A	0, 0.141, 0.437, 0.733, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.437 std_dev=0.296
P	A	0, 0.255, 0.560, 0.865, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.560 std_dev=0.305
O2	B	0, 0.363, 0.669, 0.976, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.669 std_dev=0.306
O5'	A	0, 0.276, 0.583, 0.890, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.583 std_dev=0.307
C4'	B	0, 0.329, 0.644, 0.958, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.644 std_dev=0.315
O5'	B	0, 0.319, 0.664, 1.010, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.664 std_dev=0.346
OP1	A	0, 0.414, 0.761, 1.108, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.761 std_dev=0.347
C5'	B	0, 0.351, 0.705, 1.058, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.705 std_dev=0.353
O2'	B	0, 0.385, 0.749, 1.113, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.749 std_dev=0.364
OP2	A	0, 0.314, 0.679, 1.045, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.679 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.323, 0.734, 1.145, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.734 std_dev=0.411
O2'	A	0, 0.161, 0.591, 1.022, 2.331 max_d=2.331 avg_d=0.591 std_dev=0.430
P	B	0, 0.231, 0.717, 1.203, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.717 std_dev=0.486
C5'	A	0, 0.157, 0.648, 1.139, 2.790 max_d=2.790 avg_d=0.648 std_dev=0.491
OP1	B	0, 0.326, 0.863, 1.401, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.863 std_dev=0.537
OP2	B	0, 0.132, 0.731, 1.329, 2.204 max_d=2.204 avg_d=0.731 std_dev=0.599
O3'	A	0, 0.558, 1.171, 1.784, 2.178 max_d=2.178 avg_d=1.171 std_dev=0.613

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.08	0.05	0.01	0.00	0.03	0.31	0.00	0.14	0.03	0.45	0.11	0.16
C2	0.06	0.00	0.24	0.19	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.46	0.14	0.22	0.01	0.38	0.14	0.16
C2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.11	0.03	0.06	0.16	0.10	0.15	0.17	0.30	0.24	0.11	0.03	0.01	0.10	0.02	0.44	0.08	0.46	0.41	0.39
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.11	0.12	0.15	0.25	0.18	0.11	0.06	0.03	0.01	0.01	0.31	0.12	0.38	0.33	0.24
C4	0.03	0.01	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.32	0.07	0.25	0.01	0.38	0.14	0.15
C4'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.06	0.15	0.09	0.10	0.04	0.13	0.05	0.01	0.02	0.08	0.33	0.12	0.09
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.25	0.05	0.34	0.01	0.35	0.19	0.19
C5'	0.06	0.11	0.16	0.02	0.12	0.01	0.18	0.00	0.18	0.22	0.14	0.12	0.10	0.24	0.13	0.08	0.16	0.02	0.01	0.22	0.23	0.18	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.11	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.29	0.08	0.35	0.01	0.34	0.21	0.21
C8	0.02	0.01	0.15	0.12	0.00	0.11	0.01	0.22	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.15	0.07	0.37	0.03	0.36	0.19	0.18
N1	0.04	0.01	0.17	0.15	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.20	0.39	0.11	0.29	0.01	0.35	0.18	0.18
N2	0.08	0.01	0.30	0.25	0.02	0.15	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.34	0.54	0.17	0.19	0.02	0.40	0.15	0.17
N3	0.05	0.01	0.24	0.18	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.24	0.45	0.13	0.19	0.01	0.40	0.13	0.16
N7	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.10	0.00	0.24	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.21	0.15	0.04	0.41	0.03	0.34	0.23	0.23
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.24	0.01	0.25	0.02	0.41	0.13	0.15
O2'	0.03	0.26	0.01	0.03	0.12	0.13	0.14	0.08	0.16	0.22	0.20	0.34	0.24	0.21	0.10	0.00	0.12	0.08	0.42	0.17	0.52	0.44	0.45
O3'	0.31	0.46	0.10	0.01	0.32	0.05	0.25	0.16	0.29	0.15	0.39	0.54	0.45	0.15	0.24	0.12	0.00	0.21	0.29	0.25	0.39	0.40	0.28
O4'	0.00	0.14	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.11	0.17	0.13	0.04	0.01	0.08	0.21	0.00	0.18	0.08	0.48	0.18	0.25
O5'	0.14	0.22	0.44	0.31	0.25	0.02	0.34	0.01	0.35	0.37	0.29	0.19	0.19	0.41	0.25	0.42	0.29	0.18	0.00	0.40	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.22	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.17	0.25	0.08	0.40	0.00	0.35	0.25	0.26
OP1	0.45	0.38	0.46	0.38	0.38	0.33	0.35	0.23	0.34	0.36	0.35	0.40	0.40	0.34	0.41	0.52	0.39	0.48	0.02	0.35	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.14	0.41	0.33	0.14	0.12	0.19	0.18	0.21	0.19	0.18	0.15	0.13	0.23	0.13	0.44	0.40	0.18	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.16	0.39	0.24	0.15	0.09	0.19	0.02	0.21	0.18	0.18	0.17	0.16	0.23	0.15	0.45	0.28	0.25	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.26	0.23	0.21	0.34	0.21	0.37	0.23	0.30	0.22	0.30	0.39	0.28	0.25	0.23	0.20	0.23	0.33	0.32	0.22
C2	0.24	0.31	0.25	0.20	0.32	0.19	0.29	0.22	0.25	0.25	0.34	0.39	0.36	0.27	0.22	0.19	0.24	0.38	0.32	0.28
C2'	0.37	0.31	0.37	0.43	0.28	0.45	0.32	0.45	0.34	0.33	0.29	0.28	0.33	0.37	0.43	0.42	0.45	0.32	0.41	0.35
C3'	0.17	0.19	0.18	0.19	0.26	0.23	0.30	0.28	0.24	0.17	0.22	0.30	0.20	0.19	0.23	0.21	0.26	0.48	0.39	0.34
C4	0.19	0.26	0.21	0.18	0.30	0.16	0.31	0.19	0.24	0.20	0.29	0.37	0.31	0.24	0.20	0.14	0.18	0.33	0.24	0.20
C4'	0.22	0.18	0.26	0.27	0.23	0.29	0.29	0.33	0.25	0.18	0.19	0.28	0.23	0.30	0.30	0.25	0.30	0.58	0.37	0.38
C5	0.23	0.26	0.25	0.23	0.24	0.21	0.25	0.22	0.21	0.20	0.26	0.31	0.33	0.29	0.25	0.18	0.23	0.34	0.27	0.23
C5'	0.33	0.22	0.34	0.39	0.21	0.43	0.30	0.48	0.31	0.26	0.19	0.23	0.28	0.36	0.39	0.39	0.44	0.68	0.42	0.50
C6	0.28	0.30	0.30	0.26	0.21	0.25	0.23	0.25	0.23	0.25	0.27	0.28	0.39	0.34	0.28	0.24	0.27	0.36	0.33	0.29
C8	0.18	0.26	0.20	0.20	0.30	0.19	0.32	0.22	0.25	0.19	0.29	0.34	0.32	0.24	0.22	0.15	0.20	0.32	0.23	0.19
N1	0.28	0.33	0.28	0.24	0.27	0.23	0.26	0.24	0.24	0.27	0.33	0.32	0.40	0.32	0.25	0.23	0.27	0.39	0.35	0.30
N2	0.25	0.34	0.25	0.21	0.35	0.20	0.30	0.23	0.26	0.27	0.37	0.42	0.38	0.28	0.22	0.20	0.26	0.42	0.35	0.32
N3	0.20	0.28	0.22	0.18	0.33	0.17	0.33	0.19	0.25	0.22	0.32	0.40	0.31	0.24	0.21	0.15	0.20	0.35	0.26	0.22
N7	0.21	0.24	0.24	0.25	0.25	0.23	0.25	0.24	0.20	0.17	0.26	0.32	0.33	0.28	0.29	0.18	0.23	0.32	0.25	0.22
N9	0.18	0.26	0.21	0.17	0.32	0.16	0.35	0.19	0.27	0.20	0.30	0.37	0.29	0.24	0.20	0.14	0.17	0.31	0.23	0.17
O2'	0.70	0.65	0.59	0.64	0.62	0.75	0.71	0.77	0.75	0.70	0.61	0.55	0.63	0.57	0.56	0.80	0.82	0.50	0.79	0.72
O3'	0.21	0.27	0.20	0.25	0.41	0.30	0.40	0.38	0.29	0.23	0.36	0.50	0.26	0.22	0.28	0.27	0.32	0.66	0.43	0.42
O4'	0.27	0.24	0.34	0.31	0.29	0.29	0.33	0.29	0.29	0.23	0.25	0.34	0.29	0.39	0.34	0.25	0.23	0.48	0.30	0.28
O5'	0.20	0.26	0.22	0.22	0.28	0.27	0.31	0.34	0.27	0.21	0.27	0.31	0.32	0.25	0.25	0.24	0.32	0.37	0.35	0.28
O6	0.33	0.33	0.35	0.32	0.20	0.30	0.22	0.30	0.24	0.29	0.26	0.26	0.43	0.40	0.34	0.30	0.31	0.37	0.36	0.32
OP1	0.35	0.41	0.38	0.20	0.38	0.16	0.39	0.15	0.38	0.36	0.40	0.40	0.49	0.48	0.13	0.24	0.15	0.38	0.22	0.20
OP2	0.20	0.16	0.20	0.16	0.18	0.31	0.25	0.44	0.23	0.15	0.15	0.20	0.25	0.34	0.17	0.27	0.41	0.55	0.46	0.46
P	0.18	0.19	0.22	0.15	0.18	0.21	0.22	0.25	0.20	0.15	0.18	0.20	0.28	0.32	0.22	0.18	0.21	0.35	0.25	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.10	0.15	0.22	0.16
C2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.09	0.05	0.19	0.24	0.33	0.26
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.05	0.16	0.00	0.02	0.01	0.06	0.15	0.18	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.02	0.13	0.05	0.08	0.10	0.11	0.02	0.01	0.01	0.07	0.19	0.14	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.26	0.34	0.42	0.34
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.11	0.09	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.04	0.26	0.35	0.40	0.34
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.10	0.15	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.11	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.05	0.23	0.29	0.33	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.18	0.23	0.30	0.24
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.04	0.23	0.29	0.38	0.31
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.03	0.27	0.38	0.45	0.37
O2	0.05	0.00	0.16	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.19	0.16	0.08	0.16	0.20	0.31	0.23
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.10	0.07	0.19	0.00	0.04	0.04	0.04	0.16	0.14	0.07
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.15	0.05	0.14	0.05	0.09	0.12	0.16	0.04	0.00	0.03	0.14	0.29	0.18	0.16
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.08	0.04	0.03	0.00	0.09	0.16	0.19	0.16
O5'	0.10	0.19	0.06	0.07	0.26	0.02	0.26	0.01	0.23	0.18	0.23	0.27	0.16	0.04	0.14	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.24	0.15	0.19	0.34	0.11	0.35	0.11	0.29	0.23	0.29	0.38	0.20	0.16	0.29	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.33	0.18	0.14	0.42	0.09	0.40	0.03	0.33	0.30	0.38	0.45	0.31	0.14	0.18	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.26	0.10	0.09	0.34	0.05	0.34	0.02	0.28	0.24	0.31	0.37	0.23	0.07	0.16	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00