Doublet Group distance statistics: 55340

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 11, 7, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, -0.001, 0.005, 0.012, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.005 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, -0.002, 0.010, 0.022, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.010 std_dev=0.012
C6	A	0, -0.004, 0.008, 0.020, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.008 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.001, 0.027, 0.052, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.027 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.031 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.009, 0.017, 0.044, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.017 std_dev=0.026
O6	A	0, -0.032, 0.033, 0.098, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.033 std_dev=0.065
N1	B	0, 0.152, 0.248, 0.344, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.248 std_dev=0.096
C6	B	0, 0.138, 0.277, 0.417, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.277 std_dev=0.140
C1'	B	0, 0.146, 0.291, 0.436, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.291 std_dev=0.145
O4'	A	0, -0.046, 0.103, 0.251, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.103 std_dev=0.149
C2	B	0, 0.152, 0.303, 0.455, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.303 std_dev=0.152
C5	B	0, 0.134, 0.307, 0.481, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.307 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.149, 0.330, 0.512, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.330 std_dev=0.182
C4	B	0, 0.121, 0.311, 0.500, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.311 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.026, 0.218, 0.409, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.218 std_dev=0.191
C2'	A	0, -0.042, 0.150, 0.341, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.150 std_dev=0.192
O4'	B	0, 0.148, 0.373, 0.597, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.373 std_dev=0.224
O2	B	0, 0.131, 0.378, 0.625, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.378 std_dev=0.247
C2'	B	0, 0.074, 0.337, 0.600, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.337 std_dev=0.263
O2'	B	0, 0.157, 0.438, 0.718, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.438 std_dev=0.280
C3'	A	0, -0.017, 0.266, 0.548, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.266 std_dev=0.282
N4	B	0, 0.106, 0.391, 0.675, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.391 std_dev=0.285
O2'	A	0, -0.046, 0.251, 0.549, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.251 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.112, 0.443, 0.773, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.443 std_dev=0.330
C3'	B	0, 0.063, 0.396, 0.730, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.396 std_dev=0.333
C5'	A	0, 0.016, 0.366, 0.717, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.366 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.221, 0.644, 1.068, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.644 std_dev=0.423
O5'	A	0, 0.004, 0.445, 0.887, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.445 std_dev=0.442
O3'	A	0, -0.023, 0.422, 0.868, 2.302 max_d=2.302 avg_d=0.422 std_dev=0.445
O3'	B	0, 0.080, 0.528, 0.975, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.528 std_dev=0.447
O5'	B	0, 0.288, 0.743, 1.198, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.743 std_dev=0.455
P	A	0, 0.029, 0.509, 0.989, 2.471 max_d=2.471 avg_d=0.509 std_dev=0.480
OP2	A	0, 0.101, 0.608, 1.115, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.608 std_dev=0.507
OP1	A	0, -0.180, 0.666, 1.511, 4.453 max_d=4.453 avg_d=0.666 std_dev=0.845
P	B	0, 0.032, 0.963, 1.893, 3.869 max_d=3.869 avg_d=0.963 std_dev=0.931
OP2	B	0, -0.239, 0.911, 2.062, 4.616 max_d=4.616 avg_d=0.911 std_dev=1.150
OP1	B	0, -0.025, 1.222, 2.468, 5.471 max_d=5.471 avg_d=1.222 std_dev=1.246

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.09	0.04	0.41	0.20	0.22
C2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.03	0.14	0.02	0.69	0.27	0.31
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.14	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.28	0.10	0.13
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.14	0.07	0.14	0.10	0.13	0.05	0.01	0.02	0.05	0.03	0.09	0.13	0.08	0.05
C4	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.02	0.12	0.03	0.67	0.27	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.09	0.04	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.05	0.08	0.05	0.07
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.13	0.04	0.76	0.31	0.31
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05	0.11	0.05	0.05	0.04	0.03	0.00	0.09	0.15	0.08	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.15	0.00	0.79	0.33	0.33
C8	0.00	0.00	0.07	0.14	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.02	0.13	0.07	0.67	0.29	0.28
N1	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.03	0.14	0.02	0.76	0.30	0.32
N2	0.01	0.01	0.14	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.21	0.03	0.15	0.05	0.67	0.26	0.30
N3	0.01	0.01	0.12	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.14	0.02	0.13	0.01	0.63	0.26	0.29
N7	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.14	0.02	0.14	0.08	0.76	0.32	0.30
N9	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.05	0.59	0.25	0.27
O2'	0.03	0.14	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.11	0.19	0.14	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.07	0.18	0.10	0.09
O3'	0.04	0.15	0.02	0.02	0.06	0.04	0.07	0.04	0.08	0.15	0.10	0.21	0.14	0.14	0.05	0.03	0.00	0.06	0.07	0.10	0.19	0.16	0.11
O4'	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.06	0.00	0.11	0.04	0.31	0.21	0.22
O5'	0.09	0.14	0.04	0.03	0.12	0.01	0.13	0.00	0.15	0.13	0.14	0.15	0.13	0.14	0.10	0.04	0.07	0.11	0.00	0.17	0.02	0.00	0.00
O6	0.04	0.02	0.05	0.09	0.03	0.05	0.04	0.09	0.00	0.07	0.02	0.05	0.01	0.08	0.05	0.07	0.10	0.04	0.17	0.00	0.83	0.40	0.35
OP1	0.41	0.69	0.28	0.13	0.67	0.08	0.76	0.15	0.79	0.67	0.76	0.67	0.63	0.76	0.59	0.18	0.19	0.31	0.02	0.83	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.27	0.10	0.08	0.27	0.05	0.31	0.08	0.33	0.29	0.30	0.26	0.26	0.32	0.25	0.10	0.16	0.21	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.31	0.13	0.05	0.29	0.07	0.31	0.02	0.33	0.28	0.32	0.30	0.29	0.30	0.27	0.09	0.11	0.22	0.00	0.35	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.16	0.16	0.16	0.14	0.18	0.21	0.15	0.13	0.16	0.20	0.20	0.18	0.19	0.13	0.37	0.88	1.21	0.83
C2	0.18	0.18	0.23	0.27	0.18	0.22	0.13	0.26	0.12	0.14	0.19	0.25	0.23	0.25	0.33	0.16	0.31	0.56	0.97	0.57
C2'	0.17	0.19	0.19	0.18	0.23	0.16	0.25	0.23	0.21	0.17	0.19	0.30	0.23	0.21	0.21	0.16	0.44	0.92	1.28	0.90
C3'	0.16	0.19	0.18	0.16	0.19	0.17	0.24	0.25	0.21	0.16	0.19	0.23	0.23	0.20	0.18	0.16	0.49	1.05	1.34	0.99
C4	0.13	0.14	0.16	0.18	0.13	0.16	0.14	0.22	0.12	0.12	0.12	0.18	0.17	0.18	0.21	0.12	0.34	0.74	1.12	0.72
C4'	0.14	0.17	0.15	0.13	0.17	0.14	0.22	0.23	0.20	0.15	0.17	0.20	0.20	0.17	0.14	0.15	0.41	1.03	1.28	0.94
C5	0.11	0.10	0.14	0.15	0.06	0.16	0.09	0.23	0.10	0.10	0.06	0.11	0.13	0.15	0.16	0.12	0.33	0.76	1.11	0.73
C5'	0.18	0.19	0.17	0.13	0.19	0.17	0.23	0.23	0.22	0.18	0.20	0.20	0.22	0.20	0.12	0.20	0.37	1.07	1.22	0.92
C6	0.14	0.11	0.16	0.18	0.09	0.18	0.09	0.25	0.10	0.11	0.09	0.14	0.15	0.18	0.18	0.14	0.31	0.63	0.99	0.62
C8	0.09	0.11	0.11	0.12	0.08	0.14	0.10	0.23	0.10	0.09	0.11	0.11	0.14	0.12	0.12	0.11	0.37	0.94	1.20	0.86
N1	0.17	0.15	0.21	0.26	0.14	0.22	0.10	0.28	0.10	0.13	0.16	0.19	0.20	0.23	0.30	0.16	0.31	0.54	0.92	0.54
N2	0.20	0.21	0.25	0.30	0.22	0.24	0.16	0.27	0.13	0.16	0.23	0.29	0.27	0.29	0.38	0.18	0.30	0.49	0.92	0.51
N3	0.16	0.17	0.21	0.23	0.18	0.19	0.16	0.23	0.13	0.14	0.17	0.26	0.22	0.22	0.28	0.14	0.32	0.65	1.06	0.65
N7	0.09	0.08	0.10	0.12	0.07	0.15	0.07	0.24	0.08	0.07	0.08	0.13	0.10	0.11	0.12	0.11	0.36	0.89	1.17	0.82
N9	0.12	0.14	0.14	0.15	0.11	0.14	0.15	0.22	0.13	0.11	0.12	0.15	0.17	0.16	0.17	0.12	0.36	0.85	1.18	0.81
O2'	0.19	0.22	0.20	0.20	0.28	0.18	0.28	0.23	0.24	0.20	0.24	0.37	0.25	0.22	0.24	0.19	0.43	0.87	1.27	0.88
O3'	0.19	0.22	0.21	0.20	0.24	0.21	0.29	0.30	0.25	0.20	0.22	0.29	0.26	0.23	0.22	0.21	0.57	1.11	1.40	1.06
O4'	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13	0.13	0.18	0.21	0.15	0.12	0.14	0.15	0.17	0.15	0.15	0.12	0.35	0.94	1.19	0.85
O5'	0.25	0.27	0.23	0.17	0.26	0.21	0.27	0.24	0.26	0.25	0.28	0.27	0.28	0.26	0.16	0.26	0.35	1.08	1.18	0.91
O6	0.15	0.11	0.20	0.19	0.12	0.20	0.14	0.28	0.12	0.11	0.09	0.17	0.16	0.22	0.17	0.16	0.31	0.61	0.91	0.58
OP1	0.94	0.86	0.93	0.90	0.83	0.92	0.92	0.86	0.95	0.92	0.80	0.74	0.84	0.94	0.89	0.96	0.56	0.78	0.79	0.63
OP2	0.29	0.34	0.29	0.25	0.35	0.23	0.28	0.24	0.27	0.30	0.37	0.40	0.36	0.30	0.26	0.25	0.44	1.20	1.09	0.96
P	0.44	0.43	0.41	0.36	0.42	0.38	0.44	0.35	0.45	0.43	0.43	0.43	0.42	0.43	0.34	0.44	0.23	0.99	0.98	0.77

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.00	0.14	0.20	0.49	0.20
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.22	0.35	0.77	0.41
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.16	0.42	0.08
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.02	0.06	0.05	0.09	0.09	0.10	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.35	0.06
C4	0.03	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.36	0.64	0.99	0.66
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.18	0.20	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.39	0.71	1.01	0.71
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.09	0.12	0.06	0.06	0.03	0.01	0.00	0.15	0.12	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.36	0.56	0.88	0.59
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.25	0.37	0.73	0.41
N3	0.03	0.00	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.28	0.49	0.90	0.53
N4	0.03	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.38	0.73	1.04	0.72
O2	0.04	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.12	0.03	0.15	0.23	0.66	0.28
O2'	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.00	0.02	0.07	0.09	0.35	0.22	0.15
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.06	0.06	0.10	0.10	0.12	0.02	0.00	0.02	0.23	0.27	0.23	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.00	0.19	0.22	0.36	0.19
O5'	0.14	0.22	0.02	0.09	0.36	0.02	0.39	0.00	0.36	0.25	0.28	0.38	0.15	0.09	0.23	0.19	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.20	0.35	0.16	0.13	0.64	0.18	0.71	0.15	0.56	0.37	0.49	0.73	0.23	0.35	0.27	0.22	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.49	0.77	0.42	0.35	0.99	0.20	1.01	0.12	0.88	0.73	0.90	1.04	0.66	0.22	0.23	0.36	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.41	0.08	0.06	0.66	0.04	0.71	0.01	0.59	0.41	0.53	0.72	0.28	0.15	0.17	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00